Illumina Miseq平臺深度測定酸奶中微生物多樣性

智楠楠,宗 凱,楊捷琳,姚 劍,*,魏兆軍

(1.安徽出入境檢驗檢疫局技術中心,安徽合肥 230032;2.上海出入境檢驗檢疫局,上海 200135;3.合肥工業大學食品科學與工程學院,安徽合肥 230009)

Illumina Miseq平臺深度測定酸奶中微生物多樣性

智楠楠1,3,宗 凱1,楊捷琳2,姚 劍1,*,魏兆軍3,*

(1.安徽出入境檢驗檢疫局技術中心,安徽合肥 230032;2.上海出入境檢驗檢疫局,上海 200135;3.合肥工業大學食品科學與工程學院,安徽合肥 230009)

目的:建立Illumina Miseq深度測序篩查酸奶中微生物的方法,分析酸奶中微生物的多樣性。方法:以9種酸奶樣品為研究對象,提取酸奶中細菌基因組DNA,應用高通量測序技術測定細菌的 16s rDNA v1-v3 變異區序列,得到9種樣品中微生物群體分布和豐度、以及不同樣品間的菌種差異與進化關系。結果:酸奶中微生物主要為厚壁菌門(Firmicutes),占據99.6%之高,其中厚壁菌門主要以鏈球菌屬(Streptococcus、87.1%)、乳桿菌屬(Lactobacillus、10.3%)、乳球菌屬(Lactococcus、0.3%)組成,9種酸奶中有3種同時含有鏈球菌屬和乳桿菌屬,其余6種樣品中鏈球菌屬幾乎占據全部(>97%)。結論:Illumina Miseq 深度測序技術可快速精確深入掌握酸奶中微生物多樣性,結果對比顯示不同酸奶菌種同質化程度高,其中鏈球菌屬占絕對優勢,同時發現部分酸奶標簽標示不符。

Illumina Miseq,酸奶,微生物,多樣性

乳酸菌(lactic acid becteria)是一類能在可利用的碳水化合物發酵過程中產生大量乳酸的細菌的總稱[1]。乳酸菌添加到牛奶或羊奶中可發酵制得酸奶,具有改善腹瀉、改善人體腸道菌群平衡、提高營養物質生物利用度、增強機體免疫和抗癌的獨特功能[2-6]。但調查發現目前市場上銷售的眾多酸奶中,在乳酸菌的標示上問題較多[7],存在食品安全隱患,故對此類產品進行菌群鑒別尤為重要。