Cancer Cell：一體化的腎透明細(xì)胞癌代謝圖譜

陳　煒 介評

(西安交通大學(xué)第一附屬醫(yī)院泌尿外科,陜西西安　710061)

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Cancer Cell：一體化的腎透明細(xì)胞癌代謝圖譜

陳煒 介評

(西安交通大學(xué)第一附屬醫(yī)院泌尿外科,陜西西安710061)

腎細(xì)胞癌；代謝圖譜；代謝產(chǎn)物；代謝組學(xué)分析

代謝失調(diào)是腫瘤的重要標(biāo)志，腫瘤通過重組其代謝過程以產(chǎn)生足夠的能量和生物合成原料以供應(yīng)惡性細(xì)胞增殖所需，為腫瘤的診斷、治療和預(yù)后提供了契機(jī)。最近甚至有研究表明，病理性的代謝中間產(chǎn)物(如延胡索酸鹽和2-羥戊二酸)的積聚會(huì)導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生。腎透明細(xì)胞癌作為最常見的腎癌類型，其細(xì)胞富含脂質(zhì)和糖原，提示發(fā)病過程中脂肪和糖代謝發(fā)生了顯著改變。然而，在目前絕大多數(shù)的大型腫瘤分析研究中，包括TCGA，采用轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)研究腫瘤代謝。盡管特定代謝通路的基因表達(dá)變化與腎透明細(xì)胞癌的臨床侵襲性相關(guān)，但尚無大樣本的代謝組學(xué)數(shù)據(jù)支持之前將代謝與腎腫瘤的發(fā)病機(jī)制和/或進(jìn)展聯(lián)系起來的觀點(diǎn)。對此，來自Memorial Sloan Kettering Cancer Cente的研究人員通過臨床標(biāo)本檢測及對患者隨訪資料的研究，在Cancer Cell雜志發(fā)表論文，首次報(bào)道了腎透明細(xì)胞癌的大樣本、跨組學(xué)、系統(tǒng)性代謝特征分析結(jié)果(HAKIMI AA, REZNIK E, LEE CH,et al. An integrated metabolic atlas of clear cell renal cell carcinoma. cancer cell,2016，29(1):104-116)。

研究人員通過對138組配對的、囊括了所有分級和分期的腎透明細(xì)胞癌/正常腎組織標(biāo)本進(jìn)行質(zhì)譜分析，檢測了這些標(biāo)本中高達(dá)877種代謝產(chǎn)物的含量，經(jīng)過統(tǒng)計(jì)學(xué)處理，找出含量有顯著差別的代謝物，然后進(jìn)行KEGG通路分析及分層研究，并且開發(fā)了一套分析管道和可視化工具(代謝圖)，以橋接TCGA轉(zhuǎn)錄組學(xué)與代謝組學(xué)數(shù)據(jù)，構(gòu)建一體化的通路水平的代謝圖譜。……