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木通屬植物種質資源的SRAP分析

2016-05-14 08:41:20黃佩蓓陳世華王飛曾賢
湖北農業科學 2016年7期

黃佩蓓 陳世華 王飛 曾賢

摘要:采用SRAP標記技術,對木通屬25份藥用植物材料進行遺傳多樣性分析。結果表明,在選用的12對引物中,共檢測到173條多態性條帶,多態性比率達83.2%,相似系數變化范圍為0.275 8~0.931 0,UPGMA聚類分析將25個供試樣品分為二類:五葉木通為一類,白木通和三葉木通聚為一類:SRAP標記適合木通屬植物的遺傳多樣性、親緣關系分析。

關鍵詞:木通屬;相關序列擴增多態性(SRAP);遺傳多樣性

木通屬植物作為中國傳統中藥材,目前國內外研究的主要有3種:木通(俗稱五葉木通)、三葉木通及其變種白木通。隨著分子標記技術的發展,近年來RAPD、AFLP分子標記技術相繼成功應用于木通屬植物的研究,但RAPD穩定性差、擴增產率低,AFLP技術復雜,使其應用受限。SRAP(Sequence-related amplified polymorphism,相關序列擴增多態性)是一種新型的分子標記技術,它結合了RAPD和AFLP分析的優點,操作簡便、結果穩定、中等產率、成本低,目前已被廣泛應用,但利用SRAP標記技術分析木通屬植物遺傳多樣性的研究尚未見報道。為此,運用SRAP標記技術分析25份木通屬藥用植物的遺傳多樣性,旨在為木通屬藥用植物的選種栽培提供參考,并探討SRAP標記在木通屬藥用植物種質資源研究中的可行性。

1.材料與方法

1.1材料

供試材料均采自江西省境內,由江西中醫藥大學賴學文教授鑒定。具體材料名稱及來源地見表1。

1.2方法

1.2.1DNA提取 取新鮮嫩葉約0.1 g,參照王飛等的方法分別提取不同材料的總DNA。

1.2.2SRAP分析 SRAP引物采用Li等公布的序列,由上海生物工程技術服務有限公司合成(表2)。

SRAP-PCR反應體系(25 μL總體積):模板DNA90 ng,dNTPs 200 μmol/L,Taq DNA聚合酶1 u,引物0.4 μmol/L,10xPCR Buffer 2.5 μL,其余用ddH2O補齊。SRAP-PCR擴增反應程序:94℃預變性3 min;94℃1 min,35℃1 min,72℃2 min,5個循環;94℃1 min,55℃1 min,72℃1 min,35個循環:72℃延伸10 min;4℃保存。PCR擴增產物用2%的瓊脂糖凝膠電泳檢測,在紫外凝膠成像系統上觀察和記錄。

1.2.3數據處理 根據PCR擴增結果,每個樣品的擴增帶數按有帶賦值為“1”(強帶和弱帶同記),無帶為“0”,建立“1”和“0”型數據。利用NTSYS軟件計算相似系數,用UPGMA進行聚類分析,構建樹狀圖。

2.結果與分析

2.1SRAP多態性分析

采用42對引物組合對25份木通屬植物材料進行擴增,其中12對引物組合可擴增出清晰的多態性條帶,擴增結果及多態性信息見表3。從表3可以看出,共檢測到清晰條帶208條,其中多態性條帶173條,平均每對引物產生14.4條多態性條帶,平均多態率為83.2%,表明木通屬植物具有較為豐富的遺傳多樣性。不同引物組合擴增條帶大小集中在100~1 400bp。

引物組合Me4-Em8擴增結果見圖1。圖1表明,SRAP分子標記能檢測出較多的木通屬植物的遺傳位點,獲得多態性相對較好的PCR結果,SRAP標記適合木通屬植物的遺傳多樣性分析。

2.2聚類分析

采用NTSYS-PC軟件對這些擴增條帶進行遺傳差異的統計學分析,其相似系數結果見表4,聚類分析結果見圖2。

從表4可以看出,25份供試材料的相似系數變化范圍在0.275 8-0.931 0之間。白木通和三葉木通的相似系數在0.517 2~0.758 6之間,均值為0.637 9:白木通和五葉木通的相似系數在0.275 8-0.620 6之間,均值為0.448 2:而三葉木通和五葉木通的相似系數在0.310 3-0.689 6之間,均值為0.500 0。由相似系數可以看出,三葉木通和白木通的遺傳相似系數最大,二者親緣關系較近:白木通與五葉木通的遺傳相似系數最小,二者親緣關系較遠。

從圖2可以看出,根據SRAP標記得到25份材料的聚類結果顯示,在相似系數0.45處可將參試材料分為2類,白木通和三葉木通聚為一類,五葉木通聚為一類:白木通與三葉木通聚為一類后,最終和五葉木通聚為一類。大部分來自相同或相似生態地理環境的能聚為一類,表現地域相似性,如來自廬山的白木通聚為一類(C2、C3),來自井岡山的白木通聚為一類(c4、v5),來自南昌梅嶺的三葉木通聚為一類(V8、V9、V10和V11、V12、V14、),三清山的聚為一類(V16、V17),云居山的聚為一類(V18、V19)。

3.小結

試驗采用12對SRAP標記引物對25個木通屬植物樣品基因組DNA進行擴增,得到清晰條帶208條,多態性條帶173條,多態性比率為83.2%,表明SRAP技術對木通屬植物的擴增具有較高的效率,適于其種質遺傳變異檢測,是一種有效、可靠的分子標記,將為進一步開展木通屬種質資源的鑒定及其良種選育工作奠定基礎。

聚類分析結果表明,3種木通屬植物有明顯的界限,白木通聚為一類,三葉木通聚為一類,五葉木通聚為一類,白木通與三葉木通聚為一類后,最終和五葉木通聚為一類:此結果與傳統分類結果相符。

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