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五倍子蜂蜜TaqMan探針實時熒光定量PCR檢測方法的建立

2016-07-03 14:17:50夏明星孔德英張學健滕少娜鄧朝暉夏曉華李應國
貴州農(nóng)業(yè)科學 2016年8期
關鍵詞:植物檢測方法

孫 濤,夏明星,孔德英,張學健,滕少娜,鄧朝暉,夏曉華,李應國*

(1.重慶出入境檢驗檢疫局,重慶400020;2.國家中藥材物種鑒定及質(zhì)量安全檢測重點實驗室,重慶400020;3.萬州出入境檢驗檢疫局,重慶404100;4.重慶峰谷美地生態(tài)養(yǎng)蜂有限公司,重慶404100)

五倍子蜂蜜TaqMan探針實時熒光定量PCR檢測方法的建立

孫 濤1,2,夏明星3,孔德英1,2,張學健4,滕少娜1,2,鄧朝暉1,2,夏曉華4,李應國3*

(1.重慶出入境檢驗檢疫局,重慶400020;2.國家中藥材物種鑒定及質(zhì)量安全檢測重點實驗室,重慶400020;3.萬州出入境檢驗檢疫局,重慶404100;4.重慶峰谷美地生態(tài)養(yǎng)蜂有限公司,重慶404100)

為五倍子蜂蜜的鑒定檢測提供技術支撐,利用TaqMan探針實時熒光定量PCR技術,以五倍子樹基因組中ITS基因為靶序列,設計并篩選出特異性引物探針,通過特異性、靈敏度和重復性等試驗,建立五倍子蜂蜜TaqMan探針實時熒光PCR檢測方法。結果表明:建立的方法特異性良好,生成的標準曲線有良好的線性關系,相關系數(shù)(R2)為0.998,最低檢測限為0.2pg DNA/反應。該方法特異性強、靈敏度高、結果可靠。

五倍子樹;蜂蜜;檢測;TaqMan實時熒光定量PCR

蜂蜜是蜜蜂采集植物的花蜜、分泌物或蜜露,與自身分泌物結合經(jīng)充分釀造而成的天然甜物質(zhì)[1]。蜂蜜含有豐富的必需氨基酸、維生素、多酚類、類黃酮類、多糖、活性酶和類胡蘿卜素等活性物質(zhì),具有多種生理功能,如抗氧化、抗菌、加速創(chuàng)傷修復和增強免疫等[2-3]。根據(jù)國際食品法典委員會蜂蜜標準、歐盟蜂蜜指令及其他相關規(guī)定,蜂蜜種類可按照來源、生產(chǎn)方式或外觀劃分[4-5]。一般是按照蜜蜂所采集的蜜源植物劃分,主要蜜源是單一植物的稱作單花種蜂蜜,采自多種植物的為雜花蜜或百花蜜。不同蜜源植物來源的蜂蜜成分主要取決于植物類型、花期、氣候、蜂群強弱以及取蜜時間等,不僅在感官和內(nèi)在品質(zhì)上有一定差異,其營養(yǎng)效果也不同。傳統(tǒng)方法難以辨別蜂蜜種類,容易造成蜂蜜市場價格混亂,且品種標識混淆[6]。因此,有必要開展蜂蜜種類鑒定研究。

五倍子蜂蜜是蜜蜂采自五倍子樹的花粉釀制而成,為中藥材蜜種,也是難得的森林蜜種,具有解毒、殺菌和止腹瀉等作用,對肺腎雙虛、脾腎虛寒、氣促喘乏、痰火郁肺有良好輔療效果,特別適合虛汗、肺虛、腎虛、久瀉久痢、痔血和便血等人的日常食療保健之用,市場需求量較大。五倍子蜂蜜市場售價是普通蜂蜜價格的3~5倍,市場上常出現(xiàn)廉價蜂蜜假冒五倍子蜂蜜的現(xiàn)象,極大地損害了消費者的利益,因此亟待建立切實可靠的五倍子蜂蜜鑒別技術。

近年來,實時熒光定量PCR技術以其靈敏度高、速度快、特異性強的優(yōu)點在基因表達水平分析、多態(tài)性研究、物種特異性檢測等方面得到廣泛應用[710]。TaqMan探針法[11-14]作為高度特異的實時熒光定量PCR技術,其核心是利用Taq酶的3′~5′外切核酸酶活性,切斷位于2條引物之間僅與模板特異性結合的探針,產(chǎn)生熒光信號,儀器通過收集分析信號進行結果判定,其結果準確、分辨率更高。鑒于此,筆者利用TaqMan熒光探針技術,建立一種特異性檢測五倍子蜂蜜蜜源成分的實時熒光PCR方法,旨在為五倍子蜂蜜的檢測提供技術支撐。

1 材料與方法

1.1 蜂蜜與蜜源

成熟五倍子蜂蜜,由重慶蜂谷美地生態(tài)養(yǎng)蜂有限公司提供。蜜源植物為五倍子樹、紅麩楊、青麩楊和白背麩楊,由重慶市藥用植物研究所提供。油菜蜜、棗花蜜、荊條蜜、益母草蜜、柑橘蜜和荔枝蜜,由重慶蜂谷美地生態(tài)養(yǎng)蜂有限公司提供。

1.2 引物與探針

從美國國立生物技術信息中心(NCBI)網(wǎng)站基因庫(GenBank)下載鹽膚木屬所有物種的ITS基因序列,并進行同源性分析,用Primer Premier 5.0軟件分析設計引物和探針,篩選得到針對五倍子樹的特異性引物探針。正向引物RCF:5′-AAACCTG CCTAGCAGAACGA-3′,反向引物RCR:5′-TAA GATTTCCTTGGCGCAAT-3′,探針RCPRO:5′-ACACGTGYTGCGCTGGGCGTCGGTCGTA-3′,探針兩端分別用FAM和TAMRA標記,引物和探針由上海生工生物合成及標記。

1.3 蜂蜜及蜜源植物樣本DNA的提取

蜂蜜DNA提取:稱取蜂蜜樣品10g放入有磁力攪拌子的50mL小燒杯中,加滅菌雙蒸水20mL,40℃恒溫振蕩20min,使蜂蜜樣品和水充分混合均勻,轉(zhuǎn)移至50mL離心管;12 000r/min離心10min,迅速倒掉上清液,保留沉淀;用去離子水2mL沖洗離心管管壁上的沉淀,轉(zhuǎn)入2mL離心管中,12 000r/min離心10min,棄上清液,保留沉淀[15]。然后用磁珠法植物基因組DNA提取試劑盒提取DNA。

蜜源植物樣本DNA提取:五倍子樹、青麩楊、紅麩楊的葉片DNA用磁珠法植物基因組DNA提取試劑盒提取。

1.4 五倍子蜂蜜TaqMan探針實時熒光定量PCR檢測體系的建立

1.4.1 PCR反應 采用經(jīng)過優(yōu)化后的最佳反應體系和條件。總反應體系20μL:2×定量熒光PCR反應預混液(TaqMan Mix)10μL、上下游引物(10μmol/L)各0.4μL、TaqMan探針(10μmol/L)0.8μL、DNA 4μL、滅菌去離子水4.4μL。熒光定量PCR反應條件:95℃30s;95℃5s,60℃30s,40個循環(huán)。試驗過程中觀察PCR熒光擴增曲線,根據(jù)循環(huán)數(shù)(Ct)值進行結果判定。

1.4.2 特異性檢測 以五倍子樹近緣種及常見蜂蜜蜜源植物的DNA作為模板,包括五倍子樹、白背麩楊、紅麩楊、青麩楊、油菜、棗、荊條和益母草,以五倍子樹的DNA為陽性對照,滅菌去離子水為空白對照,按照PCR反應的體系及條件進行實時熒光PCR反應,分析該方法的特異性。

1.4.3 靈敏度檢測 用滅菌去離子水將提取的五倍子樹基因組DNA(濃度為5×103pg/μL)10倍梯度稀釋成7個濃度,分別為5×103~5×10-3pg/μL,取4μL作為模板按照PCR反應的方法進行靈敏度檢測。

1.4.4 重復性試驗 分別取上述稀釋后的五倍子樹基因組DNA作為模板,進行熒光定量PCR反應。在同一個試驗中,每個濃度DNA做3次重復,以分析組內(nèi)差異。再以相同DNA為模板,在不同時間段進行3次獨立重復試驗,以分析組間差異。通過計算變異系數(shù)驗證該方法的穩(wěn)定性。

1.4.5 標準曲線的建立 分別取上述稀釋后的五倍子樹基因組DNA作為模板,每個濃度重復3次試驗,同時以滅菌去離子水為陰性對照。按照PCR反應的方法進行實時熒光PCR反應。經(jīng)Stepone plus熒光定量PCR儀軟件自動分析得到熒光定量PCR方法的標準曲線。

1.4.6 蜂蜜樣本實測 為評價建立方法對蜂蜜樣本檢測的實用性,分別以五倍子蜂蜜、油菜蜜、棗花蜜、荊條蜜、益母草蜜、荔枝蜜和柑橘蜜的DNA為模板,按照PCR反應的方法進行實時熒光定量PCR反應。

2 結果與分析

2.1 特異性及靈敏度

從圖1可知,TaqMan探針實時熒光定量PCR方法檢測五倍子樹、五倍子蜂蜜呈典型的陽性反應,Ct值分別為22.49、22.40和31.87、31.02,呈特異性S形熒光擴增曲線;檢測白背麩楊、紅麩楊、青麩楊、油菜、棗、荊條和益母草均為典型的陰性反應,未見特異性熒光擴增曲線,均無熒光值增長。表明,所建立的五倍子TaqMan探針實時熒光定量PCR檢測方法具有較強的特異性。

TaqMan探針實時熒光定量PCR方法具有較佳的線性檢測范圍,當DNA濃度為0.05pg/μL時,仍能夠獲得強的熒光信號,產(chǎn)生良好的特異性熒光擴增曲線,故最低檢測限是0.2pg DNA/反應。說明,該檢測方法具有較高的靈敏度。

圖1 TaqMan探針實時熒光定量PCR方法的特異性(左)及靈敏度(右)圖譜Fig.1 Specificity(left)and Sensitivity(right)graph of the TaqMan real-time PCR assay

2.2 重復性

從表中看出,組內(nèi)重復Ct值變異系數(shù)為0.33%~1.46%,組間變異系數(shù)為0.48%~ 3.53%,均在合理范圍。表明,建立的五倍子蜂蜜TaqMan探針實時熒光定量PCR檢測方法的穩(wěn)定性良好。

表TaqMan探針實時熒光定量PCR方法檢測五倍子樹的重復性結果Table Repetitive experimental results of the TaqMan real-time PCR assay for detecting nutgall tree

圖2 TaqMan探針實時熒光定量PCR方法檢測五倍子樹的標準曲線Fig.2 Standard curve map of the TaqMan real-time PCR assay for detecting nutgall tree

2.3 標準曲線

從圖2看出,標準曲線中Ct值和DNA濃度間呈良好的線性關系,實時熒光定量PCR檢測五倍子DNA的線性范圍是103~10-2,標準曲線的相關系數(shù)(R2)為0.998(y=-3.747x+29.482),擴增效率為84.876%。表明,建立的實時熒光定量PCR檢測方法有6個數(shù)量級的線性檢測范圍,進一步說明該檢測方法具有很高的靈敏度。

2.4 樣品實測結果

對重慶峰谷美地生態(tài)養(yǎng)蜂有限公司五倍子蜂蜜生產(chǎn)基地的30份五倍子蜂蜜樣品及市購的五倍子蜜、油菜蜜等進行實時熒光定量PCR檢測。結果表明,所有五倍子蜂蜜檢測結果均為陽性,油菜蜜、棗花蜜、荊條蜜、益母草蜜、荔枝蜜和柑橘蜜檢測結果均為陰性(圖3)。說明檢測方法的準確度高。

圖3 TaqMan探針實時熒光定量PCR方法對樣品的實測結果Fig.3 Samples measured drawing of the TaqMan realtime PCR assay for sample detection

3 結論與討論

目前,國內(nèi)外對蜂蜜真?zhèn)蔚蔫b別主要集中在淀粉類、糖類、代糖類等添加物上,即通過離子色譜法、穩(wěn)定碳同位素比率法、液相色譜示差折光法等檢測蜂蜜中碳-4-植物糖、淀粉糖等的含量,并已形成多種國家標準方法[16-17]。但是,對于蜜源成分的檢測及研究較少。對蜂蜜蜜源成分的檢測常用方法為蜂蜜中植物花粉含量的測定[18],即通過顯微鏡觀察蜂蜜中蜜源植物的花粉并計數(shù),計算蜜源植物花粉數(shù)占總花粉數(shù)的比率來確定花粉含量及濃度。這種方法對生物分類學要求較高,必須先認識蜜源植物花粉,且費時費力,而且五倍子蜂蜜中植物花粉的含量及濃度并未收入GB/T 23194-2008蜂蜜中植物花粉的測定方法[18]標準中,不適用于五倍子蜂蜜的檢測。

本研究通過分子生物學方法,利用TaqMan探針實時熒光定量PCR技術,選取五倍子樹基因組中ITS序列較為保守的區(qū)域,設計針對五倍子樹的特異性TaqMan引物探針,建立了五倍子樹TaqMa探針實時熒光定量PCR檢測方法,并成功應用于五倍子蜂蜜的快速檢測。該方法對植物分類學要求不高,有分子生物學基礎的人員均可進行檢測操作,方法簡便,特異性良好,生成的標準曲線有良好的線性關系,相關系數(shù)(R2)為0.998;靈敏度高,最低檢測限為0.2pg DNA/反應。本方法解決了樣品是否含有五倍子蜂蜜的問題,而對于是否是其純蜂蜜需進一步研究。

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(責任編輯:馮 衛(wèi))

Establishment of a TaqMan real-time PCR Assay for Detecting the Chinese Gall Honey

SUN Tao1,2,XIA Mingxing3,KONG Deying1,2,ZHANG Xuejian4,TENG Shaona1,2,DENG Zhaohui1,2,XIA Xiaohua4,LI Yingguo3*

(1.Chongqing Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau of China,Chongqing400020;2.State Key Laboratory of Chinese Herbal Medicine Species Identification and Quality Safety Testing,Chongqing 400020;3.Wanzhou Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau of China,Chongqing 404100;4.Chongqing FOGO Ecological Apiarian Co.,LTD,Chongqing404100,China)

In order to provide technical support for identification test of the Chinese gall honey,the TaqMan real-time PCR technique was used to develop a assay for detecting the Chinese gall honey.Primers and probe were designed from the ITS gene of Nutgall Tree and its specificity,sensitivity and repeatability were test in the paper.Results:The TaqMan real-time PCR assay for detecting the Chinese gall honey has good specificity,high detection sensitivity and reliable results.The detection limit was 0.2pg DNA/reaction.A good linear correlation was demonstrated in the standard curve for the real-time PCR assay,the correlation coefficient was 0.998.

nutgall tree;honey;detection;TaqMan real-time PCR

Q754

A

1001-3601(2016)08-0329-0015-04

2015-12-15;2016-06-13修回

重慶市科技計劃項目“秦巴山區(qū)特色蜂蜜(五倍子)基因真?zhèn)舞b別技術研究”(cstc2014yykfA80022);國家質(zhì)檢總局科技計劃項目“基于DNA條形碼的三種重要炭疽菌快速檢測技術研究”(2015IK336)

孫 濤(1985-),男,農(nóng)藝師,從事植物檢疫研究。E-mail:hisun1985@126.com

*通訊作者:李應國(1965-),男,研究員,從事動植物檢疫研究。E-mail:ciqlyg@163.com

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