侯大海,劉云國,張 亮,徐云峰,劉凌霄
(1.新疆大學生命科學與技術學院,新疆烏魯木齊 830046;2.廣東產品質量檢驗監督研究院,廣東廣州 510330;3.青州榮美爾生物科技有限公司,山東青州 262500;4.黃島出入境檢驗檢疫局,山東青島 266000)
食品微生物DNA能力驗證樣品的均勻性和穩定性研究
侯大海1,2,*劉云國1,3,張亮3,徐云峰4,劉凌霄3
(1.新疆大學生命科學與技術學院,新疆烏魯木齊830046;2.廣東產品質量檢驗監督研究院,廣東廣州510330;3.青州榮美爾生物科技有限公司,山東青州262500;4.黃島出入境檢驗檢疫局,山東青島266000)
食品微生物DNA能力驗證,是利用DNA檢測方法,通過實驗室間微生物檢測結果的比對來確定實驗室檢測能力的活動。以沙門氏菌(Salmonella)基因組DNA為測試目標,開展了實驗室間食品微生物DNA檢測能力驗證樣品的制備,研究了DNA檢測能力驗證中樣品的均勻性和穩定性,以期為食品微生物DNA能力驗證的運作提供指導。
食品微生物;DNA能力驗證;均勻性;穩定性
實驗室能力驗證,是通過實驗室間檢測結果的比對來確定實驗室能力的活動。通過持續地開展實驗室能力驗證活動,可以有效地提高實驗室的品質控制能力和檢測水平,并提高檢測結果的可靠性和權威性[1]。同時,為科研工作以及政府管理工作提供科學、客觀的信息。常規微生物能力驗證,通常指寄送含或不含目標測試菌盲樣時的驗證能力。由于可能存在致病微生物,常規微生物能力驗證方式在檢測樣品的運輸、儲存、檢測時,存在較大的生物安全隱患。實驗室能力驗證活動中采用滅活的微生物,通過提取DNA進行檢測的方法可消除這種危險。因而研究食源性致病微生物時,DNA檢測能力驗證的運作極其重要。能力驗證計劃中的樣品制備不同于一般檢測樣品的制備,除保證樣品具有代表性和可靠性外,還應考慮樣品的均一性和穩定性[2]。基于以上能力驗證規則的要求,本文研究了沙門氏菌(Salmonella)DNA樣品能力驗證中的均勻性和穩定性試驗。
1.1沙門氏菌的培養和制備
沙門氏菌菌株,來源于美國典型微生物菌種保藏中心(ATCC)。沙門氏菌標準菌株(ATCC 49416)經活化后,挑取單菌落接種到含有200 mL的TSBYE三角瓶中大量培養,以轉速10 000 r/min離心5 min收集沉淀,加入雙蒸水重新懸浮,水浴滅活后,分裝到Eppendorf管中凍干制樣[3]。
1.2均勻性試驗

若F<自由度為(v1,v2) 及給定顯著性水平α(通常α=0.05)的臨界值 Fα(v1,v2),則表明樣品內和樣品間無顯著性差異,因而樣品是均勻的。
1.3穩定性試驗
采用室溫條件下的儲存溫度(20℃),進行穩定性試驗。樣品制備完畢后間隔15 d,從沙門氏菌陽性樣品中各隨機抽取6份樣品,進行熒光定量PCR檢測。采用2個樣本均數顯著性檢驗-t檢驗進行統計分析。


自由度df=2(n-1)
若|t|<自由度為2(n-1)給定顯著性水平α(α= 0.05)的臨界值t0.05[2(n-1)],則表明2次檢測結果無顯著性差異,因而樣品是穩定的。
2.1均勻性試驗
(1)樣品A為沙門氏菌陽性樣品。隨機選取A樣品6個,進行熒光定量PCR檢測,結果與已知本底結果相吻合,說明均為陽性。CT值的平均值為14.75。
(2)樣品B為沙門氏菌陰性樣品。經隨機選取B樣品6個,進行熒光定量PCR檢測,結果與已知本底結果相吻合,說明結果均為陰性。
沙門氏菌陽性樣品的均勻性試驗結果(熒光定量PCR CT值)見表1,沙門氏菌樣品均勻性試驗方差分析結果見表2。

表1 沙門氏菌陽性樣品的均勻性試驗結果(熒光定量PCR CT值)

表2 沙門氏菌樣品均勻性試驗方差分析結果
F臨界值F0.05(5,6)=4.387,計算的F值為0.106 4,該值<F臨界值,無顯著性差異,這表明樣品中沙門氏菌含量均勻。
沙門氏菌均勻性試驗熒光定量PCR擴增曲線見圖1。

圖1 沙門氏菌均勻性試驗熒光定量PCR擴增曲線
2.2穩定性試驗
沙門氏菌陽性樣品穩定性試驗結果(熒光定量PCR CT值)見表3。

表3 沙門氏菌陽性樣品穩定性試驗結果(熒光定量PCR CT值)
由表3可知,沙門氏菌陽性樣品第1次檢測的平均值結果為14.73,室溫條件下放置15 d后第2次檢測的平均值結果為14.93。
沙門氏菌陽性樣品穩定性試驗結果見表4。

表4 沙門氏菌陽性樣品穩定性試驗結果
t臨界值t0.05(10)=2.228,計算所得|t|值<t臨界值,無顯著性差異,這表明沙門氏菌樣品的穩定性良好。
沙門氏菌穩定性試驗熒光定量PCR擴增曲線見圖2。

圖2 沙門氏菌穩定性試驗熒光定量PCR擴增曲線
本次沙門氏菌DNA能力驗證要求利用基于DNA技術的分子生物學手段進行檢測,試驗結果表明DNA樣品符合均勻性和穩定性的要求。實驗室間食源致病微生物DNA檢測能力驗證提供的沙門氏菌檢測樣品已經滅活,目的是消除能力驗證活動中食源致病微生物在運輸、儲存、檢測過程中的生物安全隱患。本次能力驗證活動的樣品在制備、保存、運輸、安全性等技術指標上均能達到實驗要求。本研究以CNAS-RL02∶2011能力驗證規則、CNASPD21∶2011能力驗證工作程序、CNAS-CL03∶2010能力驗證計劃提供者認可準則、ISO/IEC導則43-1∶1997利用實驗室間比對的能力驗證-能力驗證計劃的建立和運作、CNAS-CL04∶2010標準物質/標準樣品生產者能力認可準則等規則為基礎,結合食源致病微生物檢測實驗室的特點,通過對樣品均勻性、穩定性等關鍵技術的研究,旨在建立一個與國際規范接軌、操作性強的食品微生物能力驗證關鍵技術規范。
[1]中國實驗室國家認可委員會.ISO/IEC 17025∶2005檢測和校準實驗室能力的通用要求 [S].北京:中國標準出版社,2005.
[2]中國合格評定國家認可委員會.CNAS-GL02∶2014能力驗證結果的統計處理和能力評價指南 [S].北京:中國標準出版社,2014.
[3]中華人民共和國衛生部.GB 4789.4—2010食品安全國家標準食品微生物學檢驗沙門氏菌檢驗 [S].北京:中國標準出版社,2010.◇
Study on Uniformity and Stability of Food Micro-organism DNA Proficiency Testing
HOU Dahai1,2,*LIU Yunguo1,3,ZHANG Liang3,XU Yunfeng4,LIU Lingxiao3
(1.College of Life Science and Technology,Xinjiang University,Urumqi,Xinjiang 830046,China;2.Guangdong Testing Institute of Product Quality Supervision,Guangzhou,Guangdong 510330,China 3.Qingzhou Ronmer Biology Technology Co.,Ltd.,Qingzhou,Shandong 262500,China;4.Huangdao Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau,Qingdao,Shandong 266000,China)
Food micro-organism DNA proficiency testing is to determine the testing capacity by inter-laboratory testing results using DNA testing method.This study organized DNA proficiency testing of food micro-organism using genomic DNA of Salmonella as the test objective.The uniformity and stability of food micro-organism DNA samples are studied in order to provide guidance for the operation of DNA proficiency testing.
food micro-organism;DNA proficiency testing;uniformity;stability
R378
A
10.16693/j.cnki.1671-9646(X).2016.06.033
1671-9646(2016)06b-0022-03
2016-05-08
新疆大學自治區天山學者科研啟動金資金項目(45030);新疆自治區高層次人才引進工程專項經費項目(45049)。
侯大海(1976— ),男,碩士,質量工程師,研究方向為食品加工。
*
劉云國(1977— ),男,博士,教授級高級工程師,碩士生導師,研究方向為食品生物技術。