雷 玲,王紅霞,高 儀,張志華*
(1河北省贊皇縣林業旅游局 051230;2河北農業大學山區研究所;3河北農業大學園藝學院)
?
河北核桃ISSR反應體系的建立
雷玲1,王紅霞2,高儀3,張志華2*
(1河北省贊皇縣林業旅游局051230;2河北農業大學山區研究所;3河北農業大學園藝學院)
摘要:以3個河北核桃樣品為材料,對ISSR反應體系中的主要影響因子DNA模板濃度、引物濃度、?DNA聚合酶用量、退火溫度進行優化篩選。最后確定河北核桃 ISSR-PCR反應體系為 20L體系中含 10×PCR Buffer (Mg2+Plus)2L,dNTPs(各2.5 mM)1.6L,?DNA聚合酶1.0 U,引物25M,模板DNA 50 ng。反應的基本程序為:94℃預變性5 min(1個循環),然后94℃變性30 s,52℃退火60 s,72℃鏈延伸60 s(32個循環),72℃延伸10 min(1個循環),4℃保持。不同引物間適宜的退火溫度不同。通過對影響 ISSR反應體系的主要因子進行優化篩選,建立了適合河北核桃 ISSR分析的反應體系,為進一步開展河北核桃指紋圖譜、遺傳多樣性及品種鑒定等的研究奠定基礎。
關鍵詞:河北核桃;ISSR;反應體系
河北核桃(Juglans hopeiensis Hu)又稱麻核桃[1],自然群體中類型較多,堅果的大小、形狀、紋理的起伏及變化等存在較大差異,并且其引種資源也比較混亂,國內通過鑒定的河北核桃新品種唯見張志華等[2]選育的“藝核1號”,因此,建立河北核桃ISSR反應體系為品種鑒定和育種改良打下基礎是非常必要的。ISSR (inter-simple sequence repeat)是由Zietkiewicz等于1994年創建的一種新型的分子標記[3-5],這種SSR指紋是用SSR為引物來擴增重復序列之間的區域,因此又稱為Inter-SSR,簡稱ISSR[3]。
因ISSR分子標記技術特點其應用越來越廣泛,柑橘、蘋果和枇杷等物種的反應體系及其品種的指紋圖譜相繼建立[6-10]。在核桃屬ISSR體系建立方面也有些報道,如陳少瑜等[11]以漾濞核桃為研究對象,建立了適合漾濞核桃ISSR-PCR分析的反應體系。……