黃 鑫,夏百成,龍翔宇
(1 海南大學(xué) 農(nóng)學(xué)院, ???570228 ;2 中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院 橡膠研究所,海南儋州 571737)
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小麥脅迫相關(guān)基因TaSF3B2的克隆及表達(dá)特性分析
黃 鑫1,夏百成1,龍翔宇2*
(1 海南大學(xué) 農(nóng)學(xué)院, 海口 570228 ;2 中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院 橡膠研究所,海南儋州 571737)
為研究小麥剪接因子在逆境脅迫中的作用,通過分析小麥抗性相關(guān)EST數(shù)據(jù)庫,篩選并克隆獲得1條2 327 bp的核苷酸序列。該序列包含了一個(gè)1 854 bp的開放閱讀框,編碼一個(gè)由617個(gè)氨基酸殘基組成的蛋白,氨基酸同源比對(duì)發(fā)現(xiàn),該蛋白含有GUS1結(jié)構(gòu)域(Splicing Factor 3B, Subunit 2),屬于剪接因子3b亞基中的一員,將該蛋白命名為TaSF3B2。生物信息學(xué)分析顯示,TaSF3B2平均親水系數(shù)(GRAVY)為-0.895,不穩(wěn)定系數(shù)為43.92,且在細(xì)胞核中發(fā)揮作用的可能性最大。實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析表明,TaSF3B2基因在不同組織中存在差異表達(dá),不同發(fā)育時(shí)期其表達(dá)也存在差異;在幼苗葉片中,該基因表達(dá)受高鹽、低溫、條銹菌、干旱及ABA激素脅迫明顯下調(diào)表達(dá),而在幼苗根中變化不明顯。推測TaSF3B2基因參與了小麥正常條件下的生長發(fā)育,同時(shí)在小麥應(yīng)對(duì)逆境脅迫的過程中具有重要的作用。
小麥;TaSF3B2;基因克??;生物信息學(xué);基因表達(dá)
在真核生物中,前體RNA(pre-mRNA)需要經(jīng)過剪接加工,去除內(nèi)含子序列,并將外顯子序列連接才能成為成熟的有功能的mRNA分子。pre-mRNA的剪接有組成性剪接和選擇性剪接兩種方式,其剪接是在剪接體中進(jìn)行。剪接體是由多個(gè)小分子核內(nèi)核糖體蛋白(snRNP: U1、U2、U4/U6和U5)和50~100多種非snRNP剪接因子組成的大分子復(fù)合體[1]。在RNA剪接過程中,U2穩(wěn)定地結(jié)合到分支點(diǎn)序列形成復(fù)合體A是剪接過程中至關(guān)重要的一步,而剪接因子(splicing factor,SF)3是復(fù)合體A組裝所必需的成分[2]?!?br>