這種豬育種芯片價(jià)格比行價(jià)便宜一半

這種豬育種芯片價(jià)格比行價(jià)便宜一半

由中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院劉劍鋒教授團(tuán)隊(duì)設(shè)計(jì)研制的新款豬55KSNP芯片已于4月底投入生產(chǎn)。該款芯片是在中外豬種全基因組重測(cè)序、多組織轉(zhuǎn)錄組和蛋白組圖譜構(gòu)建的基礎(chǔ)上，整合現(xiàn)有重要經(jīng)濟(jì)功能基因的公開(kāi)報(bào)道的候選位點(diǎn)，并加入72個(gè)我國(guó)部分地方豬種特有SNP，綜合優(yōu)化研制而成（命名為55KCAU-Porcine）。

我國(guó)作為養(yǎng)豬大國(guó)，持續(xù)、高效開(kāi)展生豬遺傳改良十分迫切。利用全基因組選擇、實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)群體遺傳關(guān)聯(lián)的評(píng)估、組織區(qū)域性乃至全國(guó)聯(lián)合遺傳評(píng)估，是加速我國(guó)豬育種效率、自主培育優(yōu)良品種的有效途徑。目前，國(guó)內(nèi)外市場(chǎng)上常用的豬育種芯片為60KSNP芯片，有6萬(wàn)個(gè)位點(diǎn)，但是位點(diǎn)在染色體的分布均勻性不高，約10K位點(diǎn)位置不詳。劉劍鋒介紹，該團(tuán)隊(duì)在多品種測(cè)序的基礎(chǔ)上，經(jīng)過(guò)大量位點(diǎn)信息的搜集，整合，經(jīng)過(guò)一年多的系統(tǒng)分析，最終設(shè)計(jì)確定5萬(wàn)多個(gè)位點(diǎn)用于新的芯片定制。新研發(fā)的芯片主要有三個(gè)優(yōu)點(diǎn)：一是具有經(jīng)濟(jì)性狀的功能相關(guān)性。芯片搜集并確定了10K與豬生長(zhǎng)性狀、繁殖性狀及健康性狀等相關(guān)的顯著位點(diǎn)，實(shí)用性更高；二是位點(diǎn)分布均勻，多態(tài)性好。芯片的位點(diǎn)在全基因組分布均勻，提高了捕捉基因組潛在功能變異的功效，而且在篩選位點(diǎn)時(shí)使用該團(tuán)隊(duì)的重測(cè)序數(shù)據(jù)，保證了所選位點(diǎn)有較高的多態(tài)性；三是具有特異性。不僅對(duì)比篩選我國(guó)代表性的地方豬種、國(guó)內(nèi)外高度選育商用豬種的特征位點(diǎn)，還特別加入了72個(gè)國(guó)內(nèi)部分地方特有的SNP位點(diǎn)。……