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利用自制電泳裝置模擬電泳實驗*

2017-05-12 08:22:25郭琪琦朱立偉趙盼盼
生物學通報 2017年5期
關鍵詞:實驗

郭琪琦 沈 藝 朱立偉 趙盼盼

(1廣東省深圳市第二實驗學校 廣東深圳 518021 2廣東省深圳市坪山新區(qū)同心外國語學校 廣東深圳 518118 3廣東省深圳科學高中 廣東深圳 518129 4廣東省深圳市橫崗高級中學 廣東深圳 518115)

電泳技術作為生化實驗的重要技術,被廣泛應用于分離分析蛋白質(zhì)、核酸等生物大分子。但由于電泳裝置和相關試劑的價格較高,且高中階段使用頻率不高,學校一般不開展電泳實驗。在國外相關資料[1]的啟發(fā)下,本實驗通過自制電泳裝置和模擬電泳,解決學生無法親自動手進行電泳實驗的問題。

1 自制電泳裝置

常規(guī)的電泳裝置一般由直流電源和電泳槽組成,電泳槽又包括緩沖液槽、電泳介質(zhì)支架(例如“凝膠托盤”)、點樣孔模具(俗稱“梳子”) 、電極等。自制電泳裝置時,直流電源可由串聯(lián)電池替代,電泳槽則需利用生活中常見的材料自行制作再組裝。

1.1 制作材料 實驗室提供器材:9 V電池若干、鱷魚夾導線、電極(或錫箔)。

自備材料:記號筆、剪刀、防水膠帶、塑料盒2個、用于做“梳子”的自選材料。

1.2 制作過程

1.2.1 電源的組裝 電泳時需要一個穩(wěn)定的直流電源,根據(jù)凝膠的大小,電源的電壓可能需要達到30~150 V以上。根據(jù)需要準備相應數(shù)量(一般為奇數(shù))的電池,將電池的正、負極接頭相互連接串聯(lián)起來,再連接上導線,電源即組裝完成。

1.2.2 緩沖液槽和凝膠托盤的制作 準備 2個大小不同的長方形塑料盒,小塑料盒應能放入大塑料盒中,且留有一定的空隙。大塑料盒用以充當緩沖液槽,小塑料盒用于制作凝膠托盤。凝膠托盤的制作過程如圖1所示。

圖1 凝膠托盤制作過程

1.2.3 梳子的制作 “梳子”是點樣孔模具的俗稱,制作凝膠時,將其插入凝膠托盤中,當凝膠固化時就能形成點樣孔。

梳子長度應比凝膠托盤寬度至少長2 cm,梳齒之間的間隔在1 cm左右,每個梳齒的直徑大約為3~4 mm(若梳齒是正方形或矩形時為等效面積),長度要接近凝膠托盤的深度。可以使用生活中常見的材料制作“梳子”,例如硬紙板和鋁箔、一次性筷子和釘子等;也可以直接用日常使用的寬齒梳替代“梳子”。選擇自制材料時,應注意材料表面盡可能平滑,以免在拔出梳子時弄破凝膠,破壞點樣孔。

1.2.4 組裝電泳裝置 電泳時,電泳槽要與電源相連,因此電泳槽要安裝電極。可使用現(xiàn)成的電極,例如碳棒、銅片等;若無現(xiàn)成電極,也可在緩沖液槽(即大塑料盒)的兩端包裹鋁箔作為電極。將凝膠托盤放入緩沖液槽時,要注意其兩端與相應電極之間應保持至少幾毫米的距離,不可直接接觸。電泳時將電源導線連接到相應電極上即可。

2 模擬電泳實驗

2.1 實驗原理 由于影響電泳的因素很多,在分離DNA或蛋白質(zhì)時,需對樣品進行不同處理,配制不同的凝膠和緩沖液,采用不同的染色技術。實驗不僅過程復雜,且需要的試劑較多,價格不菲。

模擬實驗用大分子染料模擬DNA或蛋白質(zhì)分子。大分子染料在真實的電泳實驗中主要充當指示劑,例如常用的指示劑溴酚藍,在0.6%、1.0%、1.4%和2.0%瓊脂糖凝膠電泳中,其遷移率分別與1 Kb、0.6 Kb、0.2 Kb和0.15 Kb的雙鏈線性DNA片段大致相同,因此可根據(jù)電泳中形成的指示帶預測電泳的速度和位置。在模擬實驗中,以分子量不同的染料及染料混合液為樣品進行電泳,最終可觀察到處于不同位置的條帶,從而模擬DNA或蛋白質(zhì)分子的分離。

綜合染料的分子量、酸堿性、水溶性及價格因素,本實驗選擇堿性染料甲基紫、亞甲基藍作為樣品,使用普通瓊脂和自制緩沖溶液,在自制電泳裝置中進行分離。

2.2 實驗器材與試劑

實驗器材:500 mL燒杯(或飲料瓶)、250 mL燒杯(或玻璃杯)、100 mL量筒、藥匙(或茶匙)、玻璃棒、滴管、點樣板(或薄膜)、牙簽、尺子、微波爐、自制電泳裝置。

實驗試劑:NaHCO3(小蘇打)、蒸餾水(或自來水)、瓊脂粉、甲基紫、亞甲基藍、甘油。

2.3 實驗過程 模擬實驗過程與真實電泳過程相似,借此過程可幫助學生理解電泳原理,初步了解電泳實驗操作。自制裝置的實驗過程見圖2。具體過程如表1所示。

圖2 自制電泳裝置

表1 模擬實驗過程

2.4 實驗結(jié)果 經(jīng)過30 min的電泳,實驗結(jié)果如圖3所示。

圖3 實驗結(jié)果

結(jié)果表明,大分子染料確實在自制的電泳裝置中發(fā)生了遷移,可以從色帶的遷移位置比較染料分子量的大小,混合染料也能夠較好地分離。大分子染料確實能模擬DNA或蛋白質(zhì)分子,而自制的電泳裝置也確實能進行電泳實驗。

3 本實驗在中學課程開發(fā)中的應用

3.1 填補國內(nèi)教材空白 國內(nèi)高中生物學教材對電泳技術及其應用有一定的介紹,例如選修1《生物技術實踐》中課題“血紅蛋白的提取和分離”,詳細介紹了電泳技術相關原理,并將利用電泳技術鑒定血紅蛋白作為選做實驗,寫明“有條件的學校,可以參考生物化學實驗的有關書籍,嘗試SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳的操作”。學生一方面對教材中的電泳結(jié)果圖感到好奇,另一方面卻沒有機會通過實驗操作直觀地了解電泳過程,對理解電泳技術的原理也存在一定困難。本實驗能為學生提供親自動手進行電泳實驗的機會,填補了現(xiàn)行高中教材中關于電泳實驗的空白。

3.2 整合為STEAM課程 本實驗內(nèi)容特別適合整合為基于項目學習的STEAM課程模式。教學中可圍繞自制電泳裝置和模擬實驗的項目組織課程,讓學生進行設計、動手操作,綜合應用生物、化學、物理等學科知識(S),與 STEAM學科的技術(T)、工程(E)、藝術(A)、數(shù)學(M)這些跨學科對接融合。在這種模式下要求學生參與、合作、創(chuàng)新、分享,像工程師一樣做產(chǎn)品,像科學家一樣做研究,因此能更好地培養(yǎng)創(chuàng)新精神與實踐能力。

3.3 運用靈活多樣的教學形式 本自制實驗裝置雖為面向高中學生的動手操作,但由于其材料的易獲得性、過程的易操作性,成人、手工愛好者、對生物學實驗有興趣者均可以利用現(xiàn)有的家庭條件嘗試該操作;教師也可以參考本實驗,設計針對高中學生的實驗室教學,甚至一系列相關的社團活動。

4 教學建議

結(jié)合國內(nèi)高中教學的實際情況,在應用這一實驗進行實際教學時,應注意如下幾點:

4.1 結(jié)合本地情況尋找替代材料 本實驗用生活常見物品代替相關電泳設備,成本低廉,取材方便,操作簡單,能夠滿足課程標準對于電泳技術的要求,既適合在家庭環(huán)境中操作,也適合在我國特別是中西部貧困地區(qū)中學推廣,是一項具有實際意義的實驗技術,有利于學生實驗能力的培養(yǎng)和科學素養(yǎng)的提高。模擬電泳實驗使用甲基紫、亞甲藍等染料,較真正電泳實驗中使用的染料安全簡便,但考慮價格和獲取途徑等實際因素,可以嘗試用其他更常見的染料代替。

4.2 操作中的注意事項 雖然是模擬電泳實驗,但在實驗操作中仍然要遵循電泳實驗的相關操作要求,例如凝膠要均勻冷卻,防止倒膠過程中產(chǎn)生氣泡,染料在樣品緩沖液中溶解完全,控制加樣量和電泳時間等。

4.3 模擬實驗與真實實驗關系的處理 在高中階段,電泳技術對于學生來說并不容易理解,而實際進行電泳實驗又難以操作,因而模擬電泳實驗能夠幫助學生更好地理解電泳技術的原理,掌握電泳實驗的操作流程,提高學習興趣。但模擬實驗并不等價于真實實驗,教學過程中一定要強調(diào)二者的區(qū)別。在實驗中,需要重點說明染料模擬電泳與DNA、蛋白質(zhì)電泳的不同,同時結(jié)合化學、物理等其他學科知識,對于實驗過程中的不同點進行介紹或演示,激發(fā)學生的學習興趣,以便更好地幫助學生理解電泳技術。

主要參考文獻

[1]Robert Bruce Thompson, BarbaraFritchman Thompson.DIY science:illustrated guide to home biology experiments:all lab,no lecture.Maker Media,2012.

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