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無創(chuàng)DNA檢測臨床應(yīng)用的研究進展

2017-08-15 00:55:35王宏吉曾曉玲趙淑云
關(guān)鍵詞:檢測

王宏吉,曾曉玲,趙淑云

(1.貴州醫(yī)科大學2015級研究生,貴州 貴陽 550001;2.貴州醫(yī)科大學附屬醫(yī)院婦產(chǎn)科,貴州 貴陽 550001)

出生缺陷是指胎兒出生前已經(jīng)存在的結(jié)構(gòu)或功能異常,是導致早期流產(chǎn)、死胎和先天殘疾的主要原因,不僅影響嬰幼兒生活質(zhì)量及健康,且對家庭和社會帶來沉重的負擔,因此重視產(chǎn)前診斷對降低新生兒缺陷發(fā)生率尤為重要。

1 無創(chuàng)DNA檢測發(fā)展進程

常規(guī)的產(chǎn)前診斷技術(shù)需要通過侵入性穿刺,存在0.5%~3%左右的流產(chǎn)風險,如絨毛穿刺(1%~3%流產(chǎn)率)、羊膜腔穿刺(0.5%~1%流產(chǎn)率 )及臍靜脈穿刺(0.5%~1%流產(chǎn)率)等。

無創(chuàng)DNA檢測(Non-invasive Prenatal Testing,NIPT)是通過提取母體外周血血漿中胎兒游離DNA進行檢測,分析胎兒是否患遺傳性疾病的一種檢測方法。1997年[1]Lo等用常規(guī)聚合酶鏈反應(yīng)(PCR),在男胎孕婦血漿檢測到Y(jié)染色體特異性DNA序列,證實孕婦血漿中存在胎兒DNA可能,相比侵入性產(chǎn)前診斷,其更便捷、無流產(chǎn)風險。檢測方法包括熒光染色體原位雜交、熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)、二代測序法等。近年發(fā)現(xiàn)表觀遺傳領(lǐng)域中基于胎兒-母體DNA不同的甲基化區(qū)域可提取胎兒DNA,通過尋找常見染色體差異甲基化片段,以父系遺傳的多態(tài)位點代替SRY基因,打破男性胎兒的限制,能檢驗胎兒性別鑒定、血型鑒定,定性分析胎兒DNA的存在,提高異常染色體檢出率,對自發(fā)流產(chǎn)、早產(chǎn)等都有一定的預(yù)測意義[2],但臨床運營成本較大,仍需大量臨床實踐考證。

1.1 染色體非整倍體疾病

胎兒染色體非整倍體疾病可致嚴重的新生兒出生缺陷和兒童期死亡,這類疾病常見的染色體異常主要是21一三體、18一三體、13一三體。Gil等[3]在PubMed、EMBASE和Cochrane圖書館運用meta分析了從2011年1月和2015年1月4日之間關(guān)于無創(chuàng)DNA檢測的文章,通過計算無創(chuàng)DNA檢測21/18/13-三體、性染色體三倍體陽性檢出率,發(fā)現(xiàn)在單胎妊娠中三體總陽性檢出率和假陽性率分別為99.2%和0.09%。21-三體陽性檢出率及假陽性率為96.3%和0.13%,18-三體為91.0%和0.13%,13-三體為90.3%和0.23%,性染色體三倍體為93.0%和 0.14%。雙胎妊娠對于21-三體陽性檢出率和假陽性率分別為93.7%和0.23%。綜上無創(chuàng)DNA檢測對21-三體檢出率高于其他染色體非整倍體檢出率,單胎21-三體檢出率稍高于雙胎,且假陽性率低于雙胎假陽性率。

關(guān)于無創(chuàng)DNA檢測出現(xiàn)假陰性、假陽性[4],其可能原因是異常細胞可能分布在胎盤滋養(yǎng)層、胚外中胚層并不一定來自于胎兒,如果胎盤細胞正常胎兒細胞異常,則可能導致結(jié)果假陰性,反之可致假陽性。

1.2 微缺失微重復(fù)綜合征(MD)

染色體微缺失微重復(fù)綜合征是由于染色體微小片段缺失或重復(fù),使正常基因發(fā)生改變而導致的染色體病,該類疾病目前已發(fā)現(xiàn)近300種,發(fā)病率在1/200000~1/4000不等[5]。

近年來國內(nèi)Hu等[6]通過對1190例選擇無創(chuàng)DNA微缺失微重復(fù)綜合征檢測的孕婦進行跟蹤發(fā)現(xiàn),NIPT可以篩查較大片段的缺失和重復(fù),但對較小的缺失或重復(fù)檢出能力欠佳,猜測原因可能是母體背景干擾結(jié)果,建議檢測陽性的病例接受有創(chuàng)性產(chǎn)前診斷取樣進行驗證。

美國婦產(chǎn)科學會和母胎醫(yī)學會不支持無創(chuàng)DNA檢測常規(guī)用于MD篩查[7],由于其缺乏對每一種微缺失微重復(fù)綜合征對于其臨床驗證、敏感性和特異性的準確信息,所以難以對其臨床預(yù)測價值進行準確估計。國際產(chǎn)前診斷協(xié)會建議[8],無創(chuàng)DNA檢測應(yīng)局限于臨床意義重大的疾病或明確定義的嚴重病癥,對一些臨床意義不明確的MD,對結(jié)果判讀和臨床處理時面臨較大的風險。但Lorraine Dugoff等[9]認為對于MD篩查,無創(chuàng)DNA檢測可作為一種額外的輔助篩查。對于孕早、中期B超發(fā)現(xiàn)胎兒異常的患者,首先應(yīng)建議早期絨毛活檢或羊膜穿刺術(shù),使用染色體微陣列分析,但對于不考慮侵入性產(chǎn)前診斷的孕婦,無創(chuàng)DNA檢測也是一種選擇,但應(yīng)該讓患者知曉該檢測提供的是篩查而不是診斷,必要時分娩后進一步診斷。

1.3 單基因病檢測

單基因遺傳病是由單一位點的等位基因異常導致的疾病。目前人類孟德爾遺傳網(wǎng)(Online Mendelian Inheritance In Man,OMIM) 列出了3173種已知分子基礎(chǔ)的疾病。當孕婦有單基因病家族史、B超提示異常胎兒改變時,羊膜穿刺術(shù)或早期絨毛膜活檢(CVS)可以用于診斷,但Ana等[10]認為CVS更有利于胎兒DNA提取,但同時胎兒的流產(chǎn)風險增加,部分有心理負擔的孕婦更愿意選擇無創(chuàng)DNA檢測。

現(xiàn)無創(chuàng)DNA檢測可檢測的單基因疾病有:肌強制性營養(yǎng)不良、亨廷頓氏舞蹈癥、軟骨發(fā)育不全、早期原發(fā)性肌張力障礙、X性連鎖遺傳、血友病、囊腫性纖維化、α地中海貧血、β地中海貧血、丙酸血癥、先天性腎上腺皮質(zhì)增生癥、血紅蛋白Lepore病、莫克—格伯綜合征、顱縫早閉癥[11]。對于常染色體顯性遺傳病的診斷基于胎兒DNA中來自父親等位基因所致的基因改變,部分單基因疾病由于女胎缺乏特異性基因序列識別,故女胎在單基因病診斷中存在局限性。

此外,無創(chuàng)DNA技術(shù)也漸漸擴展到腫瘤領(lǐng)域。最早在1977年Leon 等[12]采用放射免疫法測定不同類型癌癥患者和健康人血清游離DNA水平,發(fā)現(xiàn)測試血漿中游離DNA可評估癌癥預(yù)后及放化療方案選擇。2016年Bedin[13]順利提取結(jié)腸癌患者血漿游離DNA通過定量甲基化特異性PCR檢測SFRP1抑制基因啟動子區(qū),對癌癥晚期手術(shù)預(yù)后及隨訪復(fù)查有重要意義。

2 未來展望

隨著分子生物學發(fā)展,無創(chuàng)DNA檢測通過檢測胎兒游離核酸,即cffDNA等潛力生物預(yù)測標記物,可以有效地預(yù)測部分遺傳疾病實現(xiàn)優(yōu)生優(yōu)育,具備較高準確性、敏感性,雖不能作為診斷手段,但對“珍貴兒、前置胎盤、心理負擔過重”等孕婦仍然是一種選擇。作為近年來炙手可熱的研究項目,不僅在產(chǎn)前診斷領(lǐng)域擁有發(fā)展?jié)摿Γ谄渌麑W科領(lǐng)域也擁有一定臨床價值,在不久的將來仍有巨大發(fā)展空間。

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[3]M.M.Gil,M.S.Quezada,R. Revello,R.Akolekar,K.H.Nicolaides,Analysis of cell-free DNA in maternal blood inscreening for fetal aneuploidies:updated metaanalysis,Ultrasound in Obstertrics & GynecologyMarch[J].2015:241-362.

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[6]胡芷洋,郭 輝.無創(chuàng)產(chǎn)前檢測篩查胎兒微缺失微重復(fù)綜合征陽性病例的臨床分析[J].中國產(chǎn)前診斷雜志(電子版),2016,8(1):14-18.

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[10]Ana Bustamante-Aragonés,Non-invasive prenatal diagnosis of singlegene disorders from maternal blood,Gene, 2012(8):144-149.

[11]韓璐好,陳曉丹,蔣瑋瑩.無創(chuàng)產(chǎn)前檢測的發(fā)展過程[J].中國優(yōu)生與遺傳雜志,2016,24 (7):4-5.

[12]Leon S A,Shapiro B,Sklaroff D M,Yaros M J. Free DNA in the serum of cancer patients and the effect of therapy[J].Cancer Res, 1977,37:646-650.[13]Bedin C,Enzo MV, Del Bianco P.Diagnostic and prognostic role of cellfree DNA testing for colorectal cancer patients.Int J Cancer. 2016 Dec 10.

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