以湖泊水的物理性質進行劃分,可把湖泊分成咸水湖和淡水湖。有的咸水湖是由海跡湖演變而來。海跡湖是指湖泊原本為海洋的一部分,因為地殼運動、板塊運動或泥沙淤積等作用最終與海洋分離而形成的湖泊,又稱海成湖。海跡湖本來就是海洋的一部分,所以湖泊內的水是咸水,比如世界上最大的咸水湖里海就是海跡湖。
多數咸水湖中的鹽分往往是由河流攜帶而來的礦物質,河流注入湖泊也就帶來了鹽分。如果有河流流出湖泊就會帶走鹽分,保持湖水是淡水。如果湖泊只有匯入的河流而沒有流出的河流,那么鹽分會在湖泊集聚,最終形成咸水湖。咸水湖多分布在干旱和半干旱氣候區,湖泊水分的蒸發量往往超過湖泊水分的補給量,湖水不斷濃縮,含鹽量就會不斷地增加。
咸水湖雖然不能直接飲用,但咸水中含有大量鹽分,可作為化工原料。