唐俊瑜, 楊潤煥, 王曉春, 曾彩虹, 夏桂林, 藍 睿, 楊貴樹, 王麗屏*
(1.云南農業大學,云南 昆明 650201; 2.云南省永勝縣動物疫病預防控制中心, 云南 永勝 674200)
仔豬腹瀉是仔豬生長發育過程中的一種常見疾病,常由于秋冬和初春季節氣溫驟變,導致仔豬抵抗力下降,誘發病原體感染,該病發病率和死亡率均較高。如2010—2011年中國南方10個省的豬因腹瀉而死亡的數量超過100萬頭,給養豬業造成了巨大的經濟損失[1]。近年來,隨養豬業的迅速發展,仔豬發病率逐漸升高,哺乳仔豬腹瀉發病率達54.83%,死亡率為16.27%[2-3]。引起仔豬病毒性腹瀉的3種常見病原是豬傳染性胃腸炎病毒(transmissible gastroenteritis virus,TGEV)、豬流行性腹瀉病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)和豬輪狀病毒(porcine rotavirus,PRoV)[4]。
生豬健康養殖對畜牧業的良性發展有著極其重要的作用,2018年進入秋冬季節,永勝縣多個生豬養殖場和散養戶多次出現仔豬腹瀉病例,且一直得不到有效控制,嚴重影響仔豬的生長發育。因此,非常迫切需要查明引起腹瀉的各種可能因素,從而為其有效防治提供理論依據。因此,筆者通過PCR和RT-PCR方法檢測有腹瀉癥狀豬的糞便,從病毒性病原的角度對哺乳仔豬腹瀉綜合征的病因進行篩查,為了解當地豬場發生該病的病因和臨床治療提供參考。
1.1.1哺乳仔豬腹瀉樣品用肛門拭子采自云南省麗江市永勝縣3個規模化養殖場和部分散養戶。其中,養殖場A 32份,養殖場B 24份,養殖場C 10份及散養戶22份,一共88份。樣品置于-80℃冰箱保存備用。
1.1.2主要試劑RNA提取試劑RNAiso Plus Total RNA(TAKARA);反轉錄試劑RI Enzyme Mix、2×ES Reaction Mix(全式金)、2×Trans Taq HiFi PCR Super Mix(全式金)、異丙醇、75%乙醇、氯仿、瓊脂粉、TBE緩沖液、雙蒸水等。
1.1.3主要儀器高速冷凍離心機、PCR儀器、電泳儀、凝膠成像系統、恒溫水浴鍋、高壓蒸汽滅菌鍋、超凈工作臺等。

表1 擴增PEDV、TGEV和PRoV的特異性引物信息
1.2.1引物合成用于擴增PEDV、TGEV、PRoV的特異性引物由昆明碩擎生物科技有限公司合成,具體信息見表1。
1.2.2樣品處理將采集的肛門拭子浸于生理鹽水(0.9%)中,用力搖晃,使糞便溶于生理鹽水,4℃浸毒過夜,將液體轉移到新的無RNAase離心管,4℃、3 000 r/min離心10 min,去除糞便殘渣,將上清液吸到新的無RNAase離心管中,4℃、10 000 r/min離心10 min后將上清液吸出,用于提取核酸。
1.2.3RNA提取在2 mL離心管中加入處理好的糞便樣品上清液300 μL、RNAiso Plus(TRIZOL)800 μL,上下反復顛倒使RNAiso Plus(TRIZOL)與樣品混勻,4℃靜置10 min,再加入氯仿溶液160 μL,上下反復顛倒15 s使兩相徹底混勻,使RNA在水飽和酚的酸性條件下存在有機相中,4℃靜置10 min,12 000 r/min離心15 min;吸上層無色溶液約500 μL于新的1.5 mL無RNAase的離心管中,加入等量異丙醇,4℃靜置10 min,12 000 r/min離心10 min,使RNA沉淀于離心管底部;倒去上清液,向離心管內加75%乙醇1 mL清洗,7 500 r/min離心5 min;倒去上清液,輕甩,用吸水紙吸干離心管壁的液體,每管加入DEPC水20 mL溶解RNA,瞬時離心,取RNA 5 μL加樣到1%瓊脂糖凝膠(含0.2%EB)孔中,150 V 電泳15 min,在凝膠成像系統上觀察提取RNA的完整性,并通過核酸定量儀測定其濃度和純度。
1.2.4RNA反轉錄反轉錄體系10 μL:2×ES Reaction Mix(含10×RT Buffer,dNTPs)5 μL,EasyscriptTM RT/RI Emzyme Mix(反轉錄酶,含Rnase Inhibitor) 0.5 μL,下游引物 1 μL,模板RNA 3.5 μL。反轉錄程序:42℃、30 min;85℃、5 min。
1.2.5PEDV、TGEV、PRoV的檢測分別以反轉錄好的cDNA為模板,用PEDV、TGEV、PRoV的特異性引物進行擴增。PCR反應體系25 μL:2×TransHiFiII 12.5 μL,ddH2O 10.5 μL,上游引物 0.5 μL,下游引物 0.5 μL,cDNA 1.0 μL。PEDV、TGEV擴增程序:94℃、5 min;94℃、30 s,53℃、30 s,72℃、30 s,循環35次;72℃、5 min;4℃保存。PRoV擴增程序:94℃、5 min;94℃、30 s,58℃、30 s,72℃、30 s,循環34次;72℃、5 min;4℃保存。取PCR擴增產物10 μL配制成體系后加樣到1.5%瓊脂糖凝膠(含0.2%EB)孔中,120 V電泳30 min,在凝膠成像系統上觀察結果,并拍照。
利用特異性引物及對應的PCR檢測方法檢測88份糞便樣品,并通過瓊脂糖凝膠電泳對PCR產物進行鑒定。從圖1看出,PEDV的擴增片段為199 bp,與預期目的片段大小相符,表明部分糞便樣品中PEDV檢測呈陽性。TGEV的擴增片段為439 bp,與預期目的片段大小相符,表明部分糞便樣品中TGEV檢測呈陽性。PRoV的擴增片段為362 bp,與預期目的片段大小相符,表明部分糞便樣品中PRoV檢測呈陽性。

圖1PEDV、TGEV 和ProV的RT-PCR擴增圖譜
從表2看出,在檢測的88份樣品中有8份為PEDV陽性,陽性率為9.09%;4份樣品為TGEV陽性,陽性率為4.54%;24份樣品為PRoV陽性,陽性率為27.27%。其中,養殖場A的PEDV陽性3份,陽性率為9.38%;TGEV陽性2份,陽性率為6.25%;PRoV陽性6份,陽性率為18.75%。養殖場B無PEDV陽性;TGEV陽性1份,陽性率為4.17%;PRoV陽性10份,陽性率為41.67%。養殖場C的PEDV陽性1份,陽性率為10.00%;TGEV陽性2份,陽性率為20.00%;PRoV陽性1份,陽性率為10.00%。散養戶無PEDV陽性;TGEV陽性3份,陽性率為13.63%;PRoV陽性7份,陽性率為31.82%。

表2PEDV、TGEV和ProV 3種病原陽性率檢出結果
從表3看出,在88份糞便樣品中檢測出36份樣品呈陽性,其中,有3份樣品同時檢測出TGEV和PRoV病毒,混合感染率為8.33%;有1份樣品同時檢測出PEDV與PRoV病毒,混合感染率為2.78%;36份樣品中未發現3種病毒同時混合感染。養殖場A存在1份TGEV與PRoV混合感染,混合感染率為9.09%;1份PEDV與PRoV混合感染,混合感染率為9.09%,2份混合感染率為18.18%。養殖場B有1份TGEV與PRoV混合感染,混合感染率為9.09%。養殖場C無混合感染。散養戶有1份TGEV與PRoV混合感染,混合感染率為10.00%。

表3陽性病例中的混合感染病例
2010年以來,豬腹瀉疾病給全球養豬業造成了巨大的經濟損失,根據流行病學調查發現,PEDV是引起腹瀉的主要致病病原之一[5]。2011年,陳建飛等[6]對我國11個省市28個規?;i場的139份病料進行檢測發現,TGEV檢出率達38.1%,PEDV陽性率為54.7%,二者混合感染率為25.9%。2012年,劉孝珍等[7]對全國12個省(直轄市)共55個發生嚴重腹瀉的豬場病料檢測發現,PEDV陽性率達33.33%,同時與TGEV、PRoV的混合感染率為27.85%,有69.09%的豬場存在PEDV感染。薛瑞雪等[8]于2013年10月至2014年10月對山東省226份豬腹瀉樣品進行檢測發現,PEDV陽性率為34.69%,TGEV為2.21%,PRoV為28.51%。曹恭貌等[9]于2014年9月至2015年3月對四川省130份豬腹瀉樣品進行檢測發現,PEDV陽性率為41.54%,TGEV為11.54%,PRoV為7.69%。龍飛翔等[10]采用多重RT-PCR對2015—2016年廣西190份豬腹瀉樣品進行檢測發現,PEDV陽性率為22.11%,TGEV為30.53%,PRoV為17.89%。永勝縣豬腹瀉病原PEDV陽性率為4.54%,TGEV陽性率為9.09%,PRoV陽性率為27.27%。表明,PEDV、TGEV與PRoV是引起我國豬腹瀉的3種主要病原,且出現混合感染的情況。
仔豬感染PRoV是影響仔豬成活率的主要因素之一,其單獨發生或與其他病原混合感染均可致病。近年來,導致仔豬病毒性腹瀉的流行性病毒陽性率在26.5%~75.6%[11]。在永勝縣36份陽性樣品中存在TGEV與PRoV、PEDV與PRoV的混合感染,其中,有3份樣品存在TGEV與PRoV病毒,混合感染率為8.33%;1份樣品存在PEDV與PRoV病毒,混合感染率為2.78%;未發現PEDV、TGEV與PRoV病毒同時感染的情況。病毒混合感染加劇了豬群的危害,增加其他病原的感染機會,嚴重影響豬群的正常發育,同時增加了防控難度。檢測結果表明,永勝縣腹瀉仔豬存在多種病毒性疾病的情況,可能還有細菌性疾病的存在,盡管病毒檢測陽性率相對較低,在當前豬病防控的嚴峻形勢下,有必要加強對豬群的疫病檢測和疫苗免疫。