甘藍(lán)型油菜PEBP基因家族的鑒定與表達(dá)分析

薦紅舉 楊 博 李陽陽 楊 鴻 劉列釗 徐新福 李加納

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甘藍(lán)型油菜基因家族的鑒定與表達(dá)分析

薦紅舉**楊 博**李陽陽 楊 鴻 劉列釗 徐新福 李加納*

西南大學(xué)農(nóng)學(xué)與生物科技學(xué)院 / 油菜工程研究中心 / 西南大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院, 重慶 400716

植物磷脂酰乙醇胺結(jié)合蛋白(phosphatidylethanolamine-binding protein, PEBP)基因?qū)τ诳刂崎_花時(shí)間具有重要作用。油菜作為世界上最重要的油料作物之一, 與模式植物擬南芥具有相似的開花習(xí)性。但有關(guān)油菜開花基因的功能研究相對較少。本研究利用擬南芥PEBP基因家族蛋白序列在油菜基因組內(nèi)進(jìn)行BlastP分析, 獲得油菜PEBP家族成員, 并對其進(jìn)行基因結(jié)構(gòu)分析、motif預(yù)測、復(fù)制事件、進(jìn)化樹構(gòu)建、選擇壓力分析和組織表達(dá)分析。結(jié)果表明, 共有26個(gè)油菜基因成員得到鑒定, 大部分成員含有4個(gè)外顯子和3個(gè)內(nèi)含子, motif-1和motif -2是PEBP成員的特征基序, 超過76.9%的成員屬于片段復(fù)制擴(kuò)增事件。進(jìn)化樹分析顯示, PEBP分為3個(gè)亞家族, 基于轉(zhuǎn)錄組測序的組織表達(dá)數(shù)據(jù)表明油菜26個(gè)成員具有非常明顯的組織表達(dá)特性。以上研究結(jié)果, 極大豐富了我們對甘藍(lán)型油菜開花基因及調(diào)控模式的認(rèn)識, 為進(jìn)一步的分子育種提供了理論基礎(chǔ)。

油菜; 開花基因; PEBP; 進(jìn)化; 表達(dá)

開花是植物通過有性生殖傳遞后代的關(guān)鍵前提, 開花時(shí)間是影響作物產(chǎn)量和品質(zhì)最重要的農(nóng)藝性狀之一。相比于其他性狀, 開花時(shí)間對外界環(huán)境更加敏感。因此, 控制開花時(shí)間對于提高不同地域的作物產(chǎn)量具有重要意義。截至目前, 有關(guān)開花候選基因的解析主要集中在擬南芥等模式植物中?！?br>