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米曲霉乳糖酶基因在乳酸克魯維酵母中的表達(dá)

2019-03-25 03:21:22王敏席志文黃琳娜惠豐立
食品研究與開(kāi)發(fā) 2019年7期

王敏,席志文,黃琳娜,惠豐立

(南陽(yáng)師范學(xué)院生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,河南南陽(yáng)473061)

乳糖在牛奶中的含量極為豐富,乳糖酶能將其水解成被人體直接吸收的半乳糖和葡萄糖,為機(jī)體的生命活動(dòng)提供能量。研究表明,很多消費(fèi)者由于體內(nèi)缺乏乳糖酶,不能將食物中的乳糖分解[1-2],尤其是飲用牛奶之后會(huì)產(chǎn)生如腹痛、腹脹、水樣大便、嘔吐等不適癥狀。乳糖不耐受癥在嬰幼兒中也較為常見(jiàn),腹瀉嬰兒和新生兒中乳糖不耐受癥分別占46.95%~70.00%和5.17%~27.30%[3-4]。利用乳糖酶生產(chǎn)的低乳糖制品不僅其營(yíng)養(yǎng)成分有利于人體吸收,而且乳制品的風(fēng)味和品質(zhì)也能得到很大改良。因此乳糖酶在食品和醫(yī)藥領(lǐng)域都有很高的應(yīng)用價(jià)值。

乳糖酶的來(lái)源非常廣泛,動(dòng)物、植物、微生物均可產(chǎn)生乳糖酶,隨著發(fā)酵技術(shù)的不斷進(jìn)步,微生物表達(dá)乳糖酶具有較大的潛能。目前微生物法生產(chǎn)存在酶表達(dá)量低、胞內(nèi)分泌乳糖酶使得后續(xù)純化工藝復(fù)雜和酶回收率低等缺點(diǎn),導(dǎo)致其無(wú)法進(jìn)行大規(guī)模的生產(chǎn)和應(yīng)用[5-7]。自2005年米曲霉全基因組的破譯以來(lái),結(jié)合基因工程技術(shù)使得米曲霉在食品領(lǐng)域的應(yīng)用更加廣泛[8-9]。歐軍[10]研究表明,米曲霉原始菌株可胞外分泌乳糖酶,耐高溫,酶學(xué)性質(zhì)好,但酶活性較低,僅有2.34 U/mL。李淑娟[11]將黑曲霉Asperillus DL116乳糖酶基因電轉(zhuǎn)到畢赤酵母中,甲醇誘導(dǎo)發(fā)酵12 d后,乳糖酶活性達(dá)到271.15 U/mL。張偉等[12]將亮白曲霉乳糖酶基因電轉(zhuǎn)至畢赤酵母中,在5 L發(fā)酵罐中利用甲醇誘導(dǎo)表達(dá)乳糖酶,120 h后酶活性達(dá)到3 600 U/mL。侯重文等[13]將米曲霉乳糖酶基因在畢赤酵母中表達(dá),并對(duì)其培養(yǎng)基進(jìn)行優(yōu)化,搖瓶發(fā)酵72 h后酶活達(dá)到672 U/mL。但畢赤酵母在發(fā)酵過(guò)程中溶氧和甲醇需求量高,且甲醇有毒、易燃,存在非常大的安全隱患。采用基因工程等技術(shù)手段,構(gòu)建適宜的乳糖酶基因表達(dá)體系,是實(shí)現(xiàn)乳糖酶工藝化生產(chǎn)的關(guān)鍵[14]。目前酵母菌是工業(yè)上最常用的真核表達(dá)系統(tǒng),其產(chǎn)物多為胞外分泌,對(duì)后續(xù)的加工處理有很大的便利。因此,尋求更加有效的表達(dá)系統(tǒng),直接進(jìn)行胞外高效分泌表達(dá)乳糖酶,對(duì)減少后續(xù)純化工藝、降低生產(chǎn)成本具有重要意義,也為乳糖酶的工業(yè)化生產(chǎn)打下基礎(chǔ)[15-16]。

近年來(lái),乳酸克魯維酵母(Kluyveromyces lactis)表達(dá)體系統(tǒng)受到人們的青睞,獲得了包括美國(guó)食品和藥物管理局(Food and Drug Administration,F(xiàn)DA)在內(nèi)的眾多機(jī)構(gòu)的安全認(rèn)證,證明其表達(dá)的乳糖酶和凝乳酶具有極高的安全性[17]。乳酸克魯維酵母工程菌有著超強(qiáng)的胞外分泌表達(dá)能力,其工業(yè)發(fā)酵規(guī)模已超過(guò)100m3,和其他酵母表達(dá)系統(tǒng)相比,乳酸克魯維酵母表達(dá)載體pKLAC1帶有非抗生素篩選標(biāo)記基因乙酰胺酶基因(amdS)[18-19],篩選和發(fā)酵的過(guò)程中均不需要添加抗生素或誘導(dǎo)劑,是表達(dá)乳糖酶的理想載體。此外,乳酸克魯維酵母的營(yíng)養(yǎng)適應(yīng)性較強(qiáng),為后期發(fā)酵工藝優(yōu)化提供了便利的條件。該研究將米曲霉乳糖酶基因轉(zhuǎn)化到乳酸克魯維酵母表達(dá)系統(tǒng)中,得到直接胞外分泌表達(dá)的乳糖酶基因工程菌株,為乳糖酶的工業(yè)化生產(chǎn)奠定基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 菌株與載體

乳酸克魯維酵母GG799:由南陽(yáng)師范學(xué)院能源微生物多樣性實(shí)驗(yàn)室保存;表達(dá)載體pKLAC1:NEW England Biolabs公司。

1.1.2 試劑

質(zhì)粒小量提取試劑盒:康寧生命科學(xué)有限公司;DNA產(chǎn)物純化試劑盒:Thermo Scientific公司;SacⅡ酶(20 000 U/mL)酵母基本碳源(yeast carbon base,YCB)培養(yǎng)基、乙酰胺溶液(100×):NEB;酵母基因組DNA抽提試劑盒:生工生物工程有限公司。

鄰硝基苯β-D-半乳吡喃糖苷(o-nitrophenyl-β-D-galactopyranoside,ONPG)、鄰-硝基苯酚(o-nitro phenol,ONP)、碳酸鈉顆粒、冰醋酸、氫氧化鈉顆粒、95%乙醇、蒸餾水、二硫蘇糖醇(dl-dithiothreitol,DTT)、醋酸鋰、正丁醇、乙醇、丙酮、苯胺、二苯胺、磷酸、無(wú)水葡萄糖、乳糖、半乳糖等常用藥品與試劑均是國(guó)產(chǎn)分析純或國(guó)外進(jìn)口分析純。

1.1.3 培養(yǎng)基

LB 培養(yǎng)基(luria-bertani culture,LB):蛋白胨 1%、酵母粉0.5%、氯化鈉1%;YEPD培養(yǎng)基(yeast extract peptone dextrose medium,YEPD):酵母粉 1%、蛋白胨2%、葡萄糖2%。

發(fā)酵培養(yǎng)基:乳糖4%、玉米漿5%、酵母粉6%、硫酸鎂0.1%、硫酸錳0.03%。

1.1.4 主要儀器與設(shè)備

Gel DOC XR型凝膠成像系統(tǒng):BioRad公司;Electroporator 2510型電轉(zhuǎn)儀:Eppendorf公司;DYY-12型電泳儀:北京六一儀器廠(chǎng);TC-512型PCR擴(kuò)增儀:Techne公司;TU-1900型紫外可見(jiàn)分光光度計(jì):北京普析通用儀器公司;超微量分光光度計(jì):Thermo公司;R124CN型分析天平:奧豪斯儀器有限公司。

1.2 試驗(yàn)設(shè)計(jì)

1.2.1 目的基因的合成

根據(jù)米曲霉乳糖酶基因序列和乳酸克魯維酵母GG799密碼子的偏愛(ài)性,設(shè)計(jì)了編碼乳糖酶蛋白的lacA DNA序列,由南京金斯瑞生物科技有限公司合成并構(gòu)建于載體pKLAC1中。

1.2.2 重組質(zhì)粒的提取及SacⅡ酶切

將含有重組質(zhì)粒的大腸桿菌過(guò)夜培養(yǎng),用小劑量質(zhì)粒提取試劑盒提取質(zhì)粒,通過(guò)濃度為1%(10 g/L)的瓊脂糖凝膠電泳對(duì)提取質(zhì)粒進(jìn)行檢測(cè)。將成功提取的重組質(zhì)粒pKLAC1-lacA用SacⅡ酶酶切2 h,用普通DNA純化試劑盒來(lái)進(jìn)行回收,通過(guò)濃度為1%(10 g/L)的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)DNA片段的大小。

1.2.3 電轉(zhuǎn)化乳酸克魯維酵母GG799[19-20]

利用醋酸鋰∶DTT=1∶9(體積比)制備乳酸克魯維酵母GG799感受態(tài)細(xì)胞,通過(guò)電脈沖法(電壓為2500V)將線(xiàn)性化的質(zhì)粒DNA片段轉(zhuǎn)化到乳酸克魯維酵母GG799感受態(tài)細(xì)胞中。電擊后的酵母細(xì)胞立即加入1 mL預(yù)冷的1 mol/L山梨醇溶液中,并收集電轉(zhuǎn)后的酵母溶液。在30℃水浴鍋中處理2 h,離心收集菌體,重懸于1 mL無(wú)菌水中,均勻涂布在含有5 mmol/L乙酰胺的YCB平板上,30℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)3 d~5 d。

1.2.4 標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)的制作[21-22]

ONP標(biāo)準(zhǔn)溶液的配制:稱(chēng)取139.0 mg ONP,先用10 mL濃度為95%乙醇溶解,然后轉(zhuǎn)移至1000 mL容量瓶,蒸餾水定容搖勻。分別準(zhǔn)確移取ONP標(biāo)準(zhǔn)制備液 2、4、6、8、10、12、14 mL 至 100 mL 容量瓶中,分別加入25 mL濃度為10%碳酸鈉溶液,再用濃度為0.1 mol/L、pH值為5.2醋酸緩沖液定容,搖勻[22-23]。420 nm處測(cè)定每個(gè)稀釋液的吸光值,用蒸餾水作空白對(duì)照。以420 nm處吸光值為橫坐標(biāo),鄰硝基苯酚的濃度為縱坐標(biāo),繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn),結(jié)果如圖1所示。

圖1 乳糖酶酶活標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)Fig.1 Standard curve of lactase activity

酶活力單位的定義:一個(gè)酶活單位(U)為在反應(yīng)溫度60℃,pH值為5.2的條件下,每分鐘將ONPG分解為1 μmolONP所需的酶量。

1.2.5 高表達(dá)菌株的篩選

挑取YCB平板上長(zhǎng)勢(shì)良好的單菌落接種到48孔板中,微孔板恒溫振蕩器在28℃、600 r/min發(fā)酵96 h。離心獲取發(fā)酵上清液,將上清液用0.1 mol/L、pH值為5.2醋酸鈉緩沖液適量稀釋?zhuān)琌NPG(0.037g/L)2 mL提前預(yù)熱10 min,加入稀釋的發(fā)酵上清液500 μL,60℃保溫15 min,加入2.5 mL10%碳酸鈉溶液終止反應(yīng)并顯色,最加入20 mL蒸餾水稀釋?zhuān)梅止夤舛扔?jì)檢測(cè)420 nm吸光值,篩選出獲得高表達(dá)量的重組菌株。

1.2.6 重組酵母菌株的PCR鑒定

酵母基因組DNA抽提試劑盒提取重組酵母菌株細(xì)胞的全基因組,用全細(xì)胞聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(poly merase chain reaction,PCR)方法驗(yàn)證目的基因與宿主細(xì)胞染色體整合的情況。以重組酵母菌株基因組DNA作為PCR反應(yīng)的模板,單拷貝整合子的鑒定用引物為:Prochy-inter 1(5`-TACCGACGTATATCAAGCCCA-3`)和Prochy-inter2(5`-ATCATCCTTGTCAGCGAAAGC-3`),多拷貝整合子的鑒定用引物為:Prochy-inter 2(5`-ATCATCCTTGTCAGCGAAAGC-3`)和 Prochy-inter 3(5`-CAGTGATTACATGCATATTGT-3`)。PCR條件為:95℃ 5 min;95 ℃ 30 s,50 ℃ 30 s,72 ℃ 2 min,30 個(gè)循環(huán);72 ℃ 10 min。

1.2.7 重組酵母菌株的搖瓶表達(dá)

挑取重組酵母菌株的單菌落接種于裝有5 mL YEPD液體培養(yǎng)基的試管中,在28℃、200 r/min條件下培養(yǎng)18 h獲得種子液。將種子液全部接種于裝有45 mL/250 mLYEPD液體培養(yǎng)基的搖瓶中,相同條件下培養(yǎng)120 h。每隔12 h取樣,5 000 r/min、離心10 min,菌體適當(dāng)稀釋用于測(cè)定重組菌株的生物量(OD600),發(fā)酵上清液用于測(cè)定乳糖酶活力。

1.2.8 十二烷基硫酸鈉—聚丙烯酰胺凝膠電泳(sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gelelectrophoresis,SDSPAGE)分析表達(dá)產(chǎn)物

配制SDS-PAGE溶液:5%的濃縮膠和12%的分離膠,在發(fā)酵時(shí)間分別為 12、24、36、48、60、72 h 進(jìn)行取樣,將發(fā)酵液上清與上樣緩沖液按3∶1體積比混合,沸水浴中加熱10 min,離心去除雜質(zhì),用考馬斯亮藍(lán)染液染色2 h,過(guò)夜脫色。

1.2.9 薄層層析法(thin layer chromatography,TLC)檢測(cè)重組菌株分泌乳糖酶水解乳糖的產(chǎn)物

展開(kāi)劑∶水∶乙醇∶正丁醇體積比為 2∶3∶5;顯色劑:配置苯胺—二苯胺顯色液溶液(A液:0.1二苯胺溶于2.5 mL丙酮溶液中;B液:100 μL苯胺溶液溶于2.4 mL丙酮溶液中;然后將A、B液混合,并加入500 μL磷酸,加入磷酸后會(huì)產(chǎn)生白色沉淀,搖勻至白色沉淀消失,4℃保存,用于顯色備用[23-24]。配置1%葡萄糖,1%乳糖,1%半乳糖,及1%葡萄糖和半乳糖的混合物。將發(fā)酵120h發(fā)酵液上清與1%乳糖按體積比為1∶1混合,40℃水浴4 h,沸水終止發(fā)應(yīng),室溫25℃條件下冷卻,備用。

在距硅膠板底部1.5 cm處用鉛筆劃一細(xì)橫線(xiàn),等距離間隔畫(huà)出5個(gè)標(biāo)記,放入105℃烘箱中活化30 min,將活化后硅膠板放在足夠干燥的桌面上快速點(diǎn)樣,樣品劑量為3 μL,再將硅膠板烘干。取出硅膠板放入層析缸中,密封隔絕空氣。展開(kāi)劑自下而上在硅膠板上展開(kāi),當(dāng)展開(kāi)層的前沿移至硅膠板前沿0.5 cm處,停止展層,取出層析板用電吹風(fēng)機(jī)吹干,均勻的噴灑上顯色劑,放在烘箱中85℃烘干,時(shí)刻觀(guān)察顏色變化,直至條帶顯色明顯。

1.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析

采用Excel 2010軟件對(duì)試驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,所有試驗(yàn)數(shù)據(jù)均為3次或3次以上重復(fù)試驗(yàn)的平均值;并利用Excel 2010軟件繪制作圖。

圖2 lacA天然序列及其優(yōu)化后DNA序列比較Fig.2 Comparison of original and optimized sequences for lacA

2 結(jié)果與討論

2.1 目的基因的合成

根據(jù)乳酸克魯維酵母GG799密碼子的偏愛(ài)性,改造米曲霉lacA基因序列的678個(gè)基因位點(diǎn),設(shè)計(jì)全長(zhǎng)2 982 bp的lacA成熟蛋白編碼序列,如圖2所示。與原始序列相比較,堿基GC含量由原來(lái)的51.4%下降至39.2%。改造后的lacA基因能更穩(wěn)定的在乳酸克魯維酵母中高效表達(dá)。去除優(yōu)化序列中的引物序列,改造后的乳糖酶基因一共編碼988個(gè)氨基酸,表達(dá)出的蛋白分子量理論值約為110 kDa。

2.2 重組表達(dá)載體pKLAC1-lacA及SacⅡ酶切鑒定

提取已獲得轉(zhuǎn)化子的大腸桿菌中的質(zhì)粒,試驗(yàn)結(jié)果如圖3所示,圖中泳道“1”出現(xiàn)兩條目的條帶,說(shuō)明成功提取重組質(zhì)粒。對(duì)所提取的質(zhì)粒用SacⅡ酶切,用普通DNA純化試劑盒純化后,產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),試驗(yàn)結(jié)果如圖4所示,在泳道“1”和“2”中分別出現(xiàn)相同的兩條特異條帶,片段大小接近10 kb和3 kb,說(shuō)明目的基因成功構(gòu)建在質(zhì)粒pKLAC1中。

圖3 重組表達(dá)載體pKLAC1-lacA的提取鑒定Fig.3 Extraction and identification of recombinant expression vector pKLAC1-lacA

圖4 重組表達(dá)質(zhì)粒pKLAC1-lacA的SacⅡ酶切鑒定Fig.4 Identification of the recombinant plasmid pKLAC1-lacA by SacⅡdigestion

2.3 多拷貝整合重組菌株的鑒定

用SacⅡ?qū)χ亟M質(zhì)粒pKLAC1-lacA進(jìn)行線(xiàn)性化處理,以電轉(zhuǎn)化方法將線(xiàn)性化質(zhì)粒轉(zhuǎn)入乳酸克魯維酵母GG799,利用含5 mmol/L乙酰胺的YCB培養(yǎng)基富集篩選整合有表達(dá)框的陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子。利用多個(gè)表達(dá)框插入鑒定整合引物進(jìn)行全細(xì)胞PCR鑒定,分別擴(kuò)增出了兩條特異性條帶,大小分別約1.9 kb和2.3 kb(圖5),該試驗(yàn)結(jié)果進(jìn)一步證實(shí)lacA基因片段已成功整合到乳酸克魯維酵母GG799的基因組中,而且菌株lacA-1為多拷貝整合表達(dá)框的重組菌株。

圖5 重組工程菌株lacA-1多拷貝整合表達(dá)框的PCR鑒定Fig.5 Identification of multi-copy transformants by PCR

2.4 重組菌株生物量及產(chǎn)酶活性

重組菌株lacA-1進(jìn)行搖瓶發(fā)酵,每隔12 h取樣,測(cè)定生物量和乳糖酶活性。重組菌株lacA-1用發(fā)酵培養(yǎng)基培養(yǎng)發(fā)酵,96 h后進(jìn)入穩(wěn)定生長(zhǎng)期,菌液OD600維持在80左右。產(chǎn)酶曲線(xiàn)滯后于生長(zhǎng)曲線(xiàn),在72 h后產(chǎn)酶量開(kāi)始呈現(xiàn)明顯上升,120 h進(jìn)入穩(wěn)定期,乳糖酶酶活為120.65 U/mL,如圖6所示。

圖6 重組菌株lacA-1生長(zhǎng)曲線(xiàn)及產(chǎn)酶活力曲線(xiàn)Fig.6 Growth and activity curve of recombinant strain lacA-1

2.5 重組菌株表達(dá)產(chǎn)物的SDS-PAGE電泳分析

將乳酸克魯維酵母GG799和經(jīng)轉(zhuǎn)化后篩選的重組菌株lacA-1在發(fā)酵培養(yǎng)基中每隔12 h取樣,取樣6次,離心、取上清,并對(duì)樣品進(jìn)行預(yù)處理,上樣15 μL,進(jìn)行SDS-PAGE電泳檢測(cè),結(jié)果如圖7所示。與空載乳酸克魯維酵母GG799相比,重組菌株lacA-1樣品在分子量約在120 kDa~130 kDa處出現(xiàn)特異性條帶,隨著發(fā)酵時(shí)間的增加也呈現(xiàn)逐漸增加的趨勢(shì),而空載乳酸克魯維酵母在此處沒(méi)有特異性條帶出現(xiàn)。該乳糖酶蛋白分子量略高于計(jì)算所得的米曲霉乳糖酶蛋白理論值。這應(yīng)該是由于該基因片段存在多個(gè)糖基化位點(diǎn),在分泌表達(dá)時(shí)發(fā)生了糖基化[25-26],導(dǎo)致該蛋白表觀(guān)分子量略高于其理論值。

圖7 不同時(shí)間重組工程菌株lacA-1發(fā)酵上清液SDS-PAGE分析Fig.7 SDS-PAGE analysis of recombinant K.lactis strain lacA-1 in different times

2.6 乳糖水解產(chǎn)物的TCL分析

以葡萄糖、半乳糖、及兩者的混合物作為對(duì)照,處理后的乳糖水解產(chǎn)物分別點(diǎn)樣,顯色,檢測(cè)發(fā)酵液的水解產(chǎn)物。由圖8可知,標(biāo)記為(1)的泳道可看出乳糖溶液被發(fā)酵液水解為葡糖糖和半乳糖,說(shuō)明該重組菌株lacA-1胞外分泌了乳糖酶,并具有生物活性。

圖8 重組工程菌株lacA-1發(fā)酵液水解乳糖產(chǎn)物的TCL分析Fig.8 TCL detection of hydrolysis lactose of recombinant strain lacA-1

3 結(jié)論

本研究中利用乳酸克魯維酵母GG799為表達(dá)系統(tǒng),將目的基因片段lacA在大腸桿菌中克隆至載體pKLAC1中,獲得乳糖酶基因工程菌。該載體pKLAC1中的真菌乙酰胺酶基因(amdS)可高效篩選整合有表達(dá)框的酵母菌,不需要添加任何抗生素。與畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)相比,畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)在發(fā)酵過(guò)程中需要大量甲醇誘導(dǎo),甲醇為有毒有機(jī)物,需要后期除雜,增加了生產(chǎn)流程[27]。該工程菌不僅安全性高,而且能夠胞外分泌乳糖酶,在發(fā)酵過(guò)程中不需要添加任何誘導(dǎo)物,工業(yè)化生產(chǎn)中將發(fā)酵液進(jìn)行超濾即可獲得純酶液,減少了后期處理工藝,能有效降低生產(chǎn)成本,提高酶的回收率。

米曲霉乳糖酶基因具有相對(duì)耐熱、耐酸、穩(wěn)定性高等優(yōu)點(diǎn),本研究首次將優(yōu)化的米曲霉的乳糖酶基因片段lacA電轉(zhuǎn)到乳酸克魯維酵母GG799中,獲得了高效胞外分泌表達(dá)乳糖酶的重組菌株lacA-1。利用薄層層析法檢測(cè)該菌株分泌的乳糖酶具有生物活性。由SDS-PAGE電泳分析表達(dá)重組菌株lacA-1產(chǎn)物可知,該菌株所分泌的乳糖酶蛋白分子量略高于理論值,其原因在于該基因存在糖基化位點(diǎn),在表達(dá)過(guò)程中發(fā)生了一定程度的糖基化,從而使其表觀(guān)分子量大于理論值。由發(fā)酵液的SDS-PAGE電泳圖像可知,該蛋白分泌表達(dá)量較高,通過(guò)后期培養(yǎng)基優(yōu)化及發(fā)酵工藝優(yōu)化有望實(shí)現(xiàn)乳糖酶的高效表達(dá)。綜上所述,本研究通過(guò)基因工程手段成功構(gòu)建一株可胞外分泌、安全性高的乳糖酶工程菌株,實(shí)現(xiàn)了米曲霉乳糖酶基因在乳酸克魯維酵母表達(dá)體系中的胞外分泌表達(dá),為乳糖酶在食品、醫(yī)藥等工業(yè)化上的應(yīng)用奠定了基礎(chǔ)。

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