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一些柿屬樣本遺傳多樣性的SSAP標記分析

2020-01-02 02:20:08吳美華樂美旺付江凡
江西農業學報 2019年12期

曾 明,吳美華,謝 楓,樂美旺,付江凡

(1.江西省農業科學院 園藝研究所,江西 南昌 330200;2.江西省農業科學院 農業經濟與信息研究所,江西 南昌 330200)

柿屬植物(Diospyrosspp.)包含近500個種[1],我國有近70個種和變種[2]。柿(DiospyroskakiL.)作為柿屬最具代表性的栽培樹種,在我國已有2000多年的栽培歷史,各地選育出了繁多的品種。據文獻記載,我國經過整理統計的原產柿品種資源有1058個[3]。在地理上,依秦嶺-淮河一線可簡單劃分為北方柿和南方柿兩大地理種群,但對南北柿遺傳相關性以及在品種起源進化中地位的研究相對較少。

分子標記因其多態性豐富、穩定性好,成為植物種質資源鑒定和遺傳多樣性研究最常用的方法[4-6]。目前,在柿屬植物中已報道的DNA分子標記涉及5大類13種[7],其中基于反轉錄轉座子的分子標記因靈敏度高、基因覆蓋度廣和多態性豐富等特點,尤其適用于種質遺傳多樣性研究和資源品種鑒定[8]。

特異序列擴增多態性(sequence-specific amplification polymorphism, SSAP)標記是一種檢測逆轉座子和與其臨近的酶切位點之間DNA片段擴增多態性的逆轉座子分子標記,它由AFLP改進而來,具有更高的多態性[9-11],它已被廣泛應用于植物種質鑒定、遺傳多樣性評價、系統進化研究、遺傳連鎖分析和遺傳圖譜構建等許多領域[12-14]。杜曉云等利用開發的SSAP引物,驗證了其在柿芽變類型鑒定上具有不錯的分辨效果[15]。

本實驗利用SSAP分子標記對53份柿屬樣本進行了遺傳分析;通過UPGMA聚類,分析了供試樣本的遺傳多樣性,并在此基礎上探討了南方柿和北方柿兩大地理種群的關系,以期為柿品種的起源和進化研究提供科學依據。……

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