廣義Gillespie算法在時滯生化反應系統中的應用

楊淑芬

摘 要：時滯解釋了許多隨機過程的非馬爾可夫性質，這些隨機過程在涉及生化反應或轉運的分子生物學的大量問題中起著關鍵作用。為了證明nMGA方法的通用性，并與其他已有的方法進行比較，我們將該方法應用于具有時滯的隨機反應系統。這些反應可以誘導基因表達的隨機振蕩。時滯可以模擬由靜默的多階段反應構成的緩慢過程，在神經傳遞中，時間延遲可能與樹突棘中粒子的陷阱有關，從而解釋了它們的異常擴散。

關鍵詞：Gillespie算法;時滯;非馬爾可夫;隨機模擬