田靖
南部戰區 疾病預防控制中心,云南 昆明 650031
由嚴重急性呼吸系統綜合征冠狀病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)引起的2019冠狀病毒病(Coronavirus disease 2019,COVID-19)是人類進入21世紀以來面臨的影響最大的公共衛生性事件。SARSCoV-2感染波及全球,截至2020年5月19日[1],全球累計報道確診病例4 696 849人,已致216個國家和地區315 131人喪生,對人類的生命造成嚴重威脅。
SARS-CoV-2屬于冠狀病毒β屬Sabecovirus亞屬[2],由日冕狀包膜和單鏈RNA基因組組成。SARS-CoV-2基因組包含29 891個核苷酸,編碼9860個氨基酸殘基,G+C含量為38%,與人SARSCoV的相似性為82%。通過對結構基因進行進化樹分析,發現SARS-CoV-2與SARS-CoV同屬β屬冠狀病毒的B系(lineage B),與其他SARS類病毒親緣關系較近。
SARS-CoV-2基因組從5'端到3'端依次編碼復制酶和結構蛋白。復制酶通過蛋白水解作用水解為16種非結構蛋白(nonstructural proteins,NSPs),參與病毒基因組的復制和亞基因組mRNA的合成。
結構蛋白具有種屬特異性,在不同的冠狀病毒中表達組成不同[3]。一般來說,冠狀病毒的結構蛋白主要由刺突(spike,S)蛋白、膜(membrane,M)蛋白、核衣殼(nucleocapsid,N)蛋白和小包膜(envelope,E)蛋白組成。S蛋白介導細胞與膜的融合,與病毒入侵的毒力有關,是誘導機體產生細胞免疫和體液免疫的主要抗原成分;M蛋白是一種糖蛋白,參與包膜的形成;N蛋白是一種磷酸化蛋白,促進病毒的出芽生殖;E蛋白與M蛋白共同構成病毒的骨架,與病毒顆粒的組裝相關。
SARS-CoV-2的結構蛋白除了上述4種外,還識別到幾個可能具有功能的假想蛋白,包括ORF3a(b)、ORF6、ORF7a/b、ORF8和 ORF9b,但是缺乏A系(lineage A)β屬冠狀病毒中普遍存在的血清凝集素酯酶。
不同冠狀病毒可以通過與細胞表面的不同受體結合而感染細胞[4],例如HCoV-22944主要作用于氨肽酶 N(aminopeptidase N,ANPEP)受體[5];……