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肝竇內皮細胞相關文獻的可視化分析

2020-04-03 13:33:50閆曉宇劉俞彤呂文良
中國醫藥導報 2020年6期

閆曉宇 劉俞彤 呂文良

[摘要] 目的 通過對相關文獻的可視化分析,探索近47年關于肝竇內皮細胞的主要研究方向及熱點。 方法 運用順查法檢索WOS中的SCI-E中1972年1月~2018年12月相關文獻,關鍵詞:“hapatic sinusoidal endothelial cell”OR“liver sinusoidal endothelial cell”OR“HSEC”OR“LSEC”,索引:SCI-EXPANDED。以純文本的格式導出檢索結果的全記錄與引用的參考文獻。應用CiteSpace5.4.R3對作者、機構、關鍵詞共現等進行可視化分析。 結果 共獲得3474篇相關文獻,2018年達到近47年的引文峰值。最高產的機構為悉尼大學,發文量最高的作者為Smedsrod B。被引頻次最高的期刊是HEPATOLOGY。熱點關鍵詞為肝竇內皮細胞、儲脂細胞、肝臟再生等,可形成9個聚類群。結論 應用CiteSpace分析肝竇內皮細胞相關文獻,展示出了目前合作的國家和機構,揭示了研究的熱點,為后續研究提供了參考,對肝竇內皮細胞的研究具有重要意義。

[關鍵詞] 肝竇內皮細胞;慢性肝病;文獻計量學;可視化分析;CiteSpace

[中圖分類號] R575? ? ? ? ? [文獻標識碼] A? ? ? ? ? [文章編號] 1673-7210(2020)02(c)-0168-06

[Abstract] Objective Through visual analysis of related literature, the main research directions and hot spots of sinusoidal endothelial cells in recent 47 years were explored. Methods The forward search method was used to search the relevant literature of SCI-E in WOS from January 1972 to December 2018, the key words were “hapatic sinusoidal endothelial cell” or “liver sinusoidal endothelial cell” or “HSEC” or “LSEC”, index: SCI-EXPANDED. The full records and references of search results were exported in plain text format. The co-occurrence of authors, organizations and keywords were analyzed by using CiteSpace 5.4.R3. Results A total of 3474 related literatures were obtained, reaching the peak of citations in nearly 47 years in 2018. The most productive institution was the University of Sydney, and the most prolific author was Smedsrod B. The most cited journal was HEPATOLOGY. The hot key words were sinusoidal endothelial cells, lipid storage cells, liver regeneration, etc., which could form 9 clusters. Conclusion CiteSpace is used to analyze the literature related to sinusoidal endothelial cells, showing the current cooperation countries and institutions, revealing the research hotspot, providing a reference for the follow-up research, which is of great significance for the research of sinusoidal endothelial cells.

[Key words] Sinusoid endothelial cells; Chronic liver disease; Bibliometrics; Visual analysis; CiteSpace

肝纖維化為多種急慢性肝臟疾病的恢復性瘢痕,大量細胞外基質在肝內過度淤積的病理過程。肝纖維化與炎性反應有關,是各種原因引起的急慢性肝病向肝硬化及肝癌發展的必經之路。每年約有103萬人死于慢性肝病,而中國患有慢性肝臟疾病的人數有3億左右。伴隨LSECs表型異常的肝竇毛細血管化的形成早于慢性肝病早期炎癥并促進肝纖維化形成與發展。LSECs表型微觀結構的改變對肝纖維化的防治具有重要意義和價值,因此眾多國家和機構通過對肝竇內皮細胞的研究,來探索肝纖維化可能的逆轉途徑。CiteSpace是一款信息可視化軟件,能夠通過對文獻進行計量分析及可視化圖譜的繪制,以發掘某個研究領域的探索熱點和前沿方向。本文采用軟件CiteSpace5.4.R3對近47年關于肝竇內皮細胞的文獻進行可視化分析,探究目前國內外相關的研究熱點及現狀,為肝臟疾病防治機制的進一步研究指引方向。

1 資料與方法

1.1 檢索方法

1.1.1 文獻來源及檢索策略

文獻來源:WOSCC數據庫;檢索策略:主題“hapatic sinusoidal endothelial cell”OR“liver sinusoidal endothelial cell”OR “HSEC”OR“LSEC”。時間跨度:1900年1月~2018年12月。索引:SCI-EXPANDED。以純文本的格式導出檢索結果的全記錄與引用的參考文獻。所有檢索結果及導出在1 d內完成。新建兩個文件夾,分別以“project”和“data”為名。將導出的結果以“download_***.txt”的格式命名后存入“data”文件夾中。

1.1.2 分析方法

運用CiteSpace5.4.R3進行可視化分析。因1900年以來首篇文獻于1972年發表,故時間分區選擇:1972年1月~2018年12月,時間切片:2年。根據不同的目的設置不同的節點類型。選擇標準:選擇TOPN,設置為20或50,即從每個時間切片中選擇最常被引用或最常出現的前20或50個條目。剪切方式采用Pathfinder法。

2 結果

2.1 檢索結果

檢索獲得1972年1月~2018年12月關于肝竇內皮細胞的文獻3474篇,其中主要包括論著類文獻2665篇、綜述類文獻420篇、會議摘要322篇、會議論文152篇、編輯素材類文獻36篇等。被引頻次總計122 693,h-index 147,每項平均引用次數35.32。

2.2 可視化分析

2.2.1 發文年度分析

分析近47年發表的肝竇內皮細胞相關文獻,平均年發文量73篇,自1995年起每年發文量總體呈現上升趨勢,年發文量均在101篇以上(圖1),說明對肝竇內皮細胞的研究呈現逐年興盛的趨勢,2017年及2018年發文量達到高峰,均為173篇,為肝竇內皮細胞研究熱點階段。關于肝竇內皮細胞的研究逐漸增多,說明了廣大研究人員及機構對此熱點的認可。分析年度引文數,被引頻次總計數122 693次,每年的引文數目呈現逐年增長的趨勢,2018年度達到近47年的引文峰值(圖2:2019年還未統計完全,故不做分析),反映出該領域近年來正處于研究熱點階段。

2.2.2 作者合作和作者共被引

作者合作與作者共被引的可視化圖譜可以提供研究肝竇內皮細胞領域中較有影響力的研究團隊和具有潛在合作可能的作者信息,可以幫助研究人員和不同研究小組之間建立合作關系。用CiteSpace分析后得到N = 914,E = 1842(N表示網絡節點數量,E表示連線數量)的作者合作關系圖譜(圖3)。作者合作圖譜顯示發文量前3的作者分別為Smedsrod B[1]、Le Couteur DG[2]、Adams DH[3],但是作者合作的中心性均不高,說明作者合作關系可以進一步加強。作者共被引圖譜中N = 135、E = 184(圖4),按中心性排序(表1),Wisse E[4]、Knook DL[5]、Irving MG[6]、Friedman SL[7]、Smedsrod B[1]中心性較高,在肝竇內皮細胞相關研究中具有一定的影響力。

2.2.3 國家和機構分布

用CiteSpace生成國家和機構可視化圖譜(圖5),中心性前5的機構(表2):北卡羅萊納大學、美因茨約翰內斯古滕貝格大學、柏林自由大學、巴斯克地區大學、大阪大學。發文量排名前5的機構(表3):悉尼大學、哈佛大學、伯明翰大學、匹茲堡大學、北卡羅萊納大學。中心性排名前5的國家(表4):德國、西班牙、美國、日本、法國;發文量前5的國家(表5):美國、日本、德國、中國、英國。綜合分析:在該領域占主要地位的國家是美國、日本、德國,這些國家文獻產量較多,且圖譜的連線情況體現出這三個國家的機構之間的合作較為密切。綜合發文量及中心性分析可知,北卡羅萊納大學是該領域的權威機構,主要研究方向:卡羅來納沖洗液對大鼠肝臟缺血后再灌注損傷的保護作用[8]。

2.2.4 關鍵詞可視化分析

2.2.4.1 關鍵詞共現分析? 用CitesSpace構建關鍵詞共現圖譜(圖6:N = 83,E = 87),可反映在WOS中與肝竇內皮細胞相關的研究熱點。按中心性排序排名前5的關鍵詞(表6):枯氏細胞、離體、內毒素、巨噬細胞、釋放。按出現頻次排序排名前5的關鍵詞(表7):肝竇內皮細胞、鼠肝、肝臟、內皮細胞、枯氏細胞。

2.2.4.2 關鍵詞聚類分析? 用CiteSpace對關鍵詞進行聚類(圖7),采用對數似然率算法,通過提取文獻的關鍵詞進行聚類命名,最終形成了9個聚類,其中MeanSilhouette值是用來衡量網絡同質性的指標,越接近于1,反映網絡的同質性越高。Modularity表示網絡的模塊度,值越大表示網絡的聚類結果越好,本次聚類MeanSilhouette值S=0.9455,Modularity值Q=0.7799,聚類結果較好。按每個聚類的MeanSilhouette值由高到低排序,可以反映該聚類的主要研究內容及方向,具體分析見表8所示。

2.2.5 期刊及文獻共被引

運用CiteSpace對期刊共被引分析得到圖8可視化圖譜,表9~10為中心性排名前5的期刊及共被引頻次排名前5的期刊。綜合分析,Hepatology、Gastroenterology等期刊可以反映近47年來與肝竇內皮細胞相關的研究進展。運用CiteSpace進行文獻共被引分析得到可視化圖譜見圖9,共被引頻次最多的文獻(表11)為Xie G于2012年在Gastroenterology上發表的關于肝竇內皮細胞分化在大鼠肝纖維化進程和消退中的作用機制的文章,闡述了LSEC的分化狀態在HSC的活化和纖維化過程中起著至關重要的作用,解釋了維持肝竇內皮細胞的分化需要血管內皮生長因子、恢復肝竇內皮細胞分化的影響機制[9]。中心性排名最高的文獻(表12)為Knolle PA[10]于2000年在Immunol Rev上發表的關于肝臟免疫反應的局部控制的文獻。其認為在肝臟中,抗原從血液中清除主要是由竇狀內皮細胞進行的,闡明了肝竇內皮細胞在肝臟的生理過程中可能進行的局部調節,奠定了肝血竇通路研究的基礎。

[9]? Xie G,Wang X,Wang L,et al. Role of differentiation of liver sinusoidal endothelial cells in progression and regression of hepatic fibrosis in rats [J]. Gastroenterology,2012,142(4):918-927.

[10]? Knolle PA,Gerken G. Local control of the immune response in the liver [J]. Immunol Rev,2000,4(174):21-34.

[11]? Fraser R,Cogger VC,Dobbs B,et al. The Liver Sieve and Atherosclerosis [J]. Pathology,2012,44(3):181-186.

[12]? Rogers GW,Dobbs BR,Fraser R. Decreased hepatic uptake of cholesterol and retinol in the dimethylnitrosamine rat model of cirrhosis [J]. Liver,1992,12(5):326-329.

[13]? Fraser R,Dobbs BR,Rogers GW. Lipoproteins and the liver sieve:the role of the fenestrated sinusoidal endothelium in lipoproteinmetabolism,atherosclerosis,and cirrhosis [J]. Hepatology,1995,21(3):863-874.

[14]? Kanazawa H,Obara H,Yoshikawa R,et al. Impact of machine perfusion on sinusoid microcirculation of liver graft donated after cardiac death [J]. J Surg Res,2019, 19(245):410-419.

[15]? Yang XQ,Ye J,Li X,et al. Pyrrolizidine alkaloids-induced hepatic sinusoidal obstruction syndrome: Pathogenesis,clinical manifestations,diagnosis,treatment,and outcomes [J]. World J Gastroenterol,2019,25(28):3753-3763.

[16]? Gracia-Sancho J,Manicardi N,Ortega-Ribera M,et al. Emricasan ameliorates portal hypertension and liver fibrosis in cirrhotic rats through a hepatocyte-mediated paracrine mechanism [J]. Hepatol Commun,2019,3(7):987-1000.

(收稿日期:2019-09-03? 本文編輯:李亞聰)

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