首個園藝類作物全基因變異數據庫發布

近日，《園藝研究》在線發表了中國農業科學院柑橘研究所構建完成的柑橘全基因組變異數據庫CitGVD，這是第一個園藝類作物全基因變異數據庫。

該數據庫中，變異數據包括單核苷酸多態性和插入缺失。CitGVD V1.0包含了來自內部測序項目和公共資源的346個種質的1 493 258 964個高質量基因組變異位點和84個表型數據。

CitGVD集成了基因組變異位點注釋、相關基因注釋以及有關種質的詳細信息，并集成了多種內置工具來進行數據訪問和深入分析。這些功能使CitGVD成為柑橘相關研究的綜合Web門戶和生物信息學平臺，也為構建其他農作物的全基因組變異數據平臺提供了范例。