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流式細(xì)胞儀檢測(cè)植物倍性的儀器參數(shù)設(shè)置體會(huì)

2020-07-31 03:12:14董馨憶柏春玲鄧菊慶李璠吳怡
農(nóng)村實(shí)用技術(shù) 2020年6期
關(guān)鍵詞:植物實(shí)驗(yàn)檢測(cè)

董馨憶,柏春玲,鄧菊慶,李璠,吳怡

(昆明醫(yī)科大學(xué)科研實(shí)驗(yàn)中心,云南 昆明 650000)

流式細(xì)胞儀是一種全自動(dòng)多色流式系統(tǒng),兼具分析和分選雙相功能,并具有完整的多參數(shù)系統(tǒng),能提供科研實(shí)驗(yàn)室和臨床所必需的客觀(guān)、可重復(fù)的實(shí)驗(yàn)結(jié)果[1]。流式細(xì)胞技術(shù)作為一門(mén)生物檢測(cè)技術(shù)已經(jīng)日臻完善,目前,該儀器已經(jīng)可以廣泛的應(yīng)用于植物倍性的檢測(cè)實(shí)驗(yàn)當(dāng)中。

在植物倍性的檢測(cè)中,大量處理好的、處于分裂間期的植物細(xì)胞樣品經(jīng)過(guò)流式細(xì)胞儀對(duì)其中的DNA含量進(jìn)行檢測(cè)之后,經(jīng)儀器自帶的計(jì)算機(jī)軟件系統(tǒng)自動(dòng)統(tǒng)計(jì)分析后形成的非常直觀(guān)的DNA含量的分布曲線(xiàn)圖,我們就能看到該植物細(xì)胞樣品的峰值圖譜,再與已知的二倍體、四倍體的峰值圖譜比較之后,就能判斷出該樣品是屬于二倍體還是四倍體。

使用流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)植物細(xì)胞DNA含量,用于判斷其倍性的方法雖然是簡(jiǎn)單有效,并且結(jié)果可靠,但是一定要特別注意檢測(cè)過(guò)程中,儀器參數(shù)的設(shè)置和調(diào)控。筆者長(zhǎng)期從事流式細(xì)胞儀的管理工作,通過(guò)長(zhǎng)期大量的實(shí)驗(yàn)后,總結(jié)出一些經(jīng)驗(yàn)教訓(xùn),謹(jǐn)以此文與大家分享交流。

1 儀器、材料與方法

1.1 實(shí)驗(yàn)儀器

本實(shí)驗(yàn)使用的是德國(guó)生產(chǎn)的Partec品牌流式細(xì)胞儀,其型號(hào)為 CyFlow? Space。德國(guó)Partec是全球三大流式細(xì)胞儀生產(chǎn)廠(chǎng)家之一,其產(chǎn)品遍布全球180多個(gè)國(guó)家和地區(qū),該公司生產(chǎn)的流式細(xì)胞儀具有卓越的性能和優(yōu)良的品質(zhì)。CyFlow? Space這個(gè)型號(hào)的流式細(xì)胞儀是該公司打造的新一代全能型流式細(xì)胞儀,有比較出眾的性能、也有靈活的配置空間以及方便快捷的操作。該儀器目前配備了3個(gè)激光光源,分別是488nm(激光器為Blue laser)、365nm(激光器為UV)、561nm(激光器為Yellow laser)、457nm(激光器為Dark Blue laser)、640nm(激光器為由軟件控制的Red laser),接收這些激光器的有FL-1至FL-13個(gè)光學(xué)通道,在具體的實(shí)驗(yàn)中,實(shí)驗(yàn)者只需要根據(jù)樣品所使用的熒光染料,找到的合適的激光器來(lái)和對(duì)應(yīng)的接收通道,就可以實(shí)現(xiàn)大部分實(shí)驗(yàn)的需求。

在本實(shí)驗(yàn)中,我們根據(jù)檢測(cè)植物倍性的染料,選用的激光器是365nm也稱(chēng)為UV(紫外)激光器,選用的對(duì)應(yīng)接收通道為FL-9。

1.2 試劑

試驗(yàn)中使用的DAPI熒光染料也同樣購(gòu)自德國(guó)partec。DAPI熒光染料全稱(chēng)為:4,6-聯(lián)脒-2-苯基吲哚。這是一種標(biāo)記可以用來(lái)做細(xì)胞DNA標(biāo)記的染料。該染料的標(biāo)記方式是以非嵌入方式與樣品DNA鏈上的A-T堿基對(duì)發(fā)生特異性的結(jié)合,當(dāng)DAPI染料與樣品的雙鏈DNA結(jié)合時(shí),DAPI的熒光強(qiáng)度可以增強(qiáng),最大能夠增強(qiáng)200倍[2]。

1.3 樣品的制備

試驗(yàn)中所用的植物為經(jīng)過(guò)前期處理好的馬鈴薯嫩葉,切碎后加入DPAI熒光染料,用過(guò)濾網(wǎng)(至少300目)過(guò)濾3遍。取濾液離心后棄上清,加入1mL超純水混勻,離心后棄上清,準(zhǔn)備染色。在每管樣品中加入1mLDAPI,充分混勻。上樣前再次過(guò)濾,300目。將制備好的細(xì)胞懸液充分混勻,轉(zhuǎn)至3.5mL專(zhuān)用流式管中,備用。

2 流式檢測(cè)植物倍性的上機(jī)檢測(cè)

流式細(xì)胞儀打開(kāi)UV激發(fā)光,調(diào)整好對(duì)應(yīng)的接收通道FL-9,進(jìn)樣速度調(diào)整至1,將染色好的樣品按照參照、樣品的順序逐一進(jìn)行檢測(cè)。

3 結(jié)果與討論

3.1 坐標(biāo)圖的選擇

在流式細(xì)胞儀結(jié)果圖中,我們可以自由的選擇橫坐標(biāo)和縱坐標(biāo),但是一般情況下我們都要選擇的首先就是FSC與SSC的雙參數(shù)圖,該圖一般是用于目標(biāo)細(xì)胞群的選擇。FSC與SSC均為流式細(xì)胞儀的散射光信號(hào),前者被稱(chēng)為前向角散射,后者被稱(chēng)為側(cè)向角散射,這兩種散射光不依賴(lài)任何細(xì)胞樣品的制備技術(shù)(例如染色的處理等等),因此被稱(chēng)為細(xì)胞的物理參數(shù)或稱(chēng)固有參數(shù)[3]。前向角散射與被測(cè)細(xì)胞的大小有關(guān),側(cè)向角散射對(duì)細(xì)胞膜、質(zhì)膜的折射率更為敏感,可提供有關(guān)細(xì)胞內(nèi)精細(xì)結(jié)構(gòu)和顆粒性質(zhì)的信息。所以一般情況下,我們都會(huì)優(yōu)先選擇FSC/SSC雙參數(shù)的坐標(biāo)圖來(lái)首先選取目標(biāo)細(xì)胞[4][5]。

僅有一個(gè)FSC和SSC的坐標(biāo)圖是不夠的,我們還要根據(jù)實(shí)驗(yàn)所選用的染料來(lái)進(jìn)行選用其他坐標(biāo)圖。根據(jù)本實(shí)驗(yàn)中DAPI染料的接收通道,選用橫坐標(biāo)為FL-9的單參數(shù)直方圖。這是一個(gè)通過(guò)儀器的UV激光器激發(fā)了DAPI熒光染料,該染料發(fā)射出的光被儀器所接收到之后體現(xiàn)實(shí)驗(yàn)結(jié)果的直方圖,該直方圖就是為了看到我們所需要的DNA含量。

3.2 對(duì)照的重要性

為了實(shí)驗(yàn)的科學(xué)性和精密性,一般情況下我們都需要在實(shí)驗(yàn)的過(guò)程中設(shè)置對(duì)照組,對(duì)照的目的是檢驗(yàn)對(duì)比試驗(yàn)的效果,沒(méi)有對(duì)照組,實(shí)驗(yàn)組的實(shí)驗(yàn)結(jié)果就將無(wú)法確定或者是無(wú)法判斷,所以在使用流式細(xì)胞儀對(duì)植物細(xì)胞的DNA含量進(jìn)行檢測(cè)之前,首先要確定好每種樣品植物的已知二倍體作為整個(gè)實(shí)驗(yàn)的對(duì)照。因?yàn)槲覀儗?duì)樣品進(jìn)行檢測(cè)得到的結(jié)果只是一個(gè)峰型圖,我們必須以對(duì)照,也就是已知的二倍體為參照,給樣本DNA的含量提供一個(gè)位置的對(duì)比,才能判斷出該樣品的倍性。

如上圖(圖1)所示:這是一個(gè)流式典型的單參數(shù)直方圖,橫坐標(biāo)是植物細(xì)胞DNA含量,通道為FL-9,使用的是UV LED燈。這個(gè)圖為一個(gè)典型的二倍體圖,在圖中我們可以看到在橫坐標(biāo)的100和200的位置分別出現(xiàn)了兩個(gè)峰,其中橫坐標(biāo)100位置的這個(gè)峰高而且比較尖,其DNA含量我們?cè)O(shè)為N,而橫坐標(biāo)200位置的這個(gè)峰稍短,其DNA含量相對(duì)對(duì)100這個(gè)位置的來(lái)說(shuō)就應(yīng)該是2N,所以說(shuō)該樣品為二倍體。

3.3 參數(shù)調(diào)節(jié)的巧妙

在檢測(cè)過(guò)程中,值得注意的是要做好FL-9通道的電壓值的調(diào)節(jié)。在對(duì)照的檢查過(guò)程中,經(jīng)過(guò)幾次刷新后,結(jié)果的峰型圖已經(jīng)趨于穩(wěn)定,這個(gè)時(shí)候就要將已知二倍體的對(duì)照樣品的第一個(gè)高尖熒光峰調(diào)至橫坐標(biāo)的熒光道數(shù)為100處,調(diào)好之后不斷刷新、觀(guān)察,使100這個(gè)位置可以正好處于該峰型的中間,然后保持電壓不變,收集足夠多的信號(hào)。為什么一定要將第一個(gè)峰調(diào)至橫坐標(biāo)100的位置呢?這是為了更好地判斷其他峰的位置。只有第一個(gè)峰在橫坐標(biāo)100的位置,才能比較直觀(guān)的得知橫坐標(biāo)200位置的峰其DNA含量是其的2倍,也能比較直觀(guān)的得知橫坐標(biāo)400位置的峰其DNA含量是其的4倍。如果不將第一個(gè)峰調(diào)整至橫坐標(biāo)100的位置,那么我們?cè)谄渌宓呐袛嗌厦婢透鼮椴蝗菀祝赡苄枰屑?xì)的、費(fèi)時(shí)間的去數(shù)橫坐標(biāo)的刻度,這些都不太直觀(guān),耗時(shí)且還會(huì)發(fā)生判斷錯(cuò)誤的情況。

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