張 超,文 濤,張 媛,趙夢麗,劉 婷,袁 軍,沈其榮
基于文獻計量分析的鐮刀菌枯萎病研究進展解析*
張 超,文 濤,張 媛,趙夢麗,劉 婷,袁 軍?,沈其榮
(南京農業大學資源與環境科學學院/江蘇省固體有機廢棄物資源化高技術研究重點實驗室/國家有機類肥料工程技術研究中心/江蘇省有機固體廢棄物資源化協同創新中心,南京 210095)
鐮刀菌枯萎病是一種由尖孢鐮刀菌引起的、毀滅性極強的真菌作物病害,為探索鐮刀菌枯萎病的相關研究進展及熱點,對尖孢鐮刀菌枯萎病進行了引文分析。以“Fusarium wilt”(鐮刀菌枯萎病)進行主題搜索,在ISI Web of Science數據庫核心集搜索1985—2019年的相關文獻共4 873篇,采用CiteSpace可視化軟件進行引文分析,通過合作、共現、共被引等網絡分析,研究鐮刀菌枯萎病的研究熱點和前沿趨勢。根據發文量統計分析發現:美國、中國和印度在本領域發文量排名前三位,而中介中心性指標分析則表明荷蘭、美國和印度文獻重要性位列三甲,我國位居前10并表現出積極上升趨勢。引文分析的關鍵詞突發性檢測發現“induction(誘導)”、“genetic diversity(遺傳多樣性)”、“pathogenicity(致病性)”是近十年的重要熱點;文獻共被引聚類分析表明解淀粉芽孢桿菌、系統抗性、非致病性尖孢鐮刀菌等方面為本領域的研究前沿。隨著枯萎病研究層次的不斷深入,未來研究將會集中在微生物防控、抗病育種、根系-病原菌-有益菌互作機制等方向;此外,多組學技術的應用必將有利于解析鐮刀菌枯萎病發病機制,為鐮刀菌枯萎病基礎研究與防控應用提供理論和技術支持。
枯萎病;CiteSpace;尖孢鐮刀菌;可視化分析;網絡分析
枯萎病(Fusarium wilt)是世界上分布范圍較廣,毀滅性較強的作物病害之一。而鐮刀菌枯萎病作為枯萎病的重要代表,一直以來廣受世界各國研究者的關注[1]。當前,集約化農業迅速發展的同時,也給農業可持續生產和生態環境帶來諸多挑戰。由鐮刀菌枯萎病引起的土傳病害正威脅我國香蕉[2]、西瓜[3]、黃瓜[4]、百合[5]等多種重要經濟作物的生產。國外關于枯萎病的研究起步較早,且較為系統和深入,近年來,我國枯萎病相關的研究團隊逐漸增多[6-9]。但目前尚未有研究人員對該領域的發展歷程、研究現狀、前沿熱點等進行歸納總結。
CiteSpace(引文空間)是一款用來分析科學文獻中蘊含潛在知識的可視化分析軟件,通過CiteSpace可視化可以呈現出科學知識的合作網絡、共現網絡及共被引網絡[10]。通過合作網絡分析可以體現出枯萎病研究領域中作者、機構、國家之間的合作關系,發現本領域重要的研究機構和研究者。共現網絡分析通過對科學文獻的關鍵詞、學科領域詞頻的提取,來研究該領域發展動向和研究熱點。通過共被引網絡分析,揭示科學領域的發展方向、研究前沿學科基礎等信息,總結重要的研究成果[11]。
為了追蹤枯萎病相關研究的發展歷程,尋找相關的研究學者和機構,明確枯萎病領域的研究現狀及其發展趨勢。本文基于ISI Web of Science(WoS)數據庫核心合集,以“Fusarium wilt”為主題詞進行檢索,共得到4 873篇文獻和91 113條引文記錄。利用引文空間(CiteSpace)對上述鐮刀菌枯萎病的研究文獻進行了整合。在此基礎上對數據進行處理,發現了該領域重要的研究成果、研究學者和研究機構,總結本領域發展方向、歸納熱點、判斷趨勢。為初涉鐮刀菌枯萎病領域的研究者提供知識普及和領域把控,同時為鐮刀菌枯萎病的研究指引當前的研究熱點和未來的研究方向。
為保證研究結果的客觀性及科學性,文獻分析數據均來自ISI Web of Science數據庫中的核心合集,通過主題詞“Fusarium wilt”進行檢索,時間跨度為所有年限(1985年—2019年),共獲到相關文獻4 972篇(檢索日期截至2019年4月1日)。檢索得到的文獻以“全記錄與引用的參考文獻”及“純文本”的格式下載,將下載好的文獻重命名為CiteSpace能夠識別的download-fw.txt格式,將文件作為數據分析的基礎。
CiteSpace軟件工具可用來幫助用戶快速而方便地把握某一科學領域中的前沿方向和熱點問題,找出研究中的知識基礎和關鍵文獻,識別該領域中的主要研究人員和主要研究機構。CiteSpace具有使用操作簡單、可繪制多種圖譜、可視化效果好、提供信息量大、易于圖譜解讀等優勢。
在WoS數據庫中檢索并進行初步分析,統計鐮刀菌枯萎病各年限的發文量,可得到鐮刀菌枯萎病的發文趨勢。打開CitesSpace點擊new(新建)新建項目,將保存download(下載)文件的data(數據)文件夾加載到datadirectory(數據字典)加載項中,同時將新建的project(項目)文件夾加載到projecthome(項目之家)中,用來保存分析后的數據,其他設置默認后保存項目。將Timeslicing(時間切片)設置為1985年—2019年,時間前切片為1(年),在Notetypes(節點類型)分別單次選中Author(作者)、Institution(機構)、Country(國家),top設置為20,點擊go(運行)后,得到作者、機構、國家的合作網絡;將notetypes(節點類型)分別選中Keyword(關鍵詞)、Category(學科),其他設置不變,點擊go,彈出關鍵詞、領域共現網絡,關鍵詞可視化窗口中,點擊突發性檢測,可得到關鍵詞突發性檢測表;將notetypes(節點類型)選中Citedreference(被引文獻),Pruning(裁剪功能)選中Pathfinder(尋徑網格),其他設置不變,點擊go,可以初步得到鐮刀菌枯萎病文獻合作者的共被引網絡。通過其他設置對圖譜進行美化設置,以便于更好地解讀圖譜。
中介中心性(Betweenness centrality)是測度節點在網絡中重要性的一個指標,CiteSpace中使用此指標來發現和衡量文獻的重要性,并用紫色外圈對該類文獻(或作者、國家、機構等,且帶有紫色外圈的節點中介中心性不小于0.1)進行重點標注[12]。具有高中介中心性的文獻通常是連接兩個不同領域的關鍵樞紐,在CiteSpace中也稱其為轉折點。這種節點的重要度計算的方法是Freeman[13]于1977年提出的中介中心性的計算公式,如下:

式中,、和分別為三個不同節點,BC為節點的中介中心性(Betweenness centrality),st為節點到節點的最短路徑數目,nst為從節點到節點的st條最短路徑中經過節點的最短路徑數目。就信息傳輸角度而言,中介中心性越高,節點的重要性越大,去除這些點之后對網絡傳輸影響也越大,因此,本文采用中介中心性來衡量和發現枯萎病領域中重要的文獻、作者和機構等。
突發性檢測(Burst detection)表示節點在短時間內躍遷的現象,強調突發性。在文獻關鍵詞突發性檢測中紅色圈層為突出節點,表示該關鍵詞在某時間段內被引頻次突現增長并在此時間段內引起了高度重視。
在共被引網絡中,Sigma值是結合中介中心性和突發性來衡量節點重要性的一個指標,Sigma值越高說明網絡中節點在結構性和突現性綜合表現上最優。
Modularity(Q值)是網絡模塊化的評價指標,一個網絡的Q值越大,則表示網絡的聚類越好,Q>0.3時就意味著網絡結構顯著[14]。
發文數量及其年份可以反映所研究專題隨時間發展的軌跡,如發展的起步階段、發展階段、穩步階段等動態信息。基于ISI Web of Science數據庫核心合集,以“Fusarium wilt”為主題詞進行檢索,相關文獻共4 873篇,對發文數量進行統計如圖1所示,研究人員對鐮刀菌枯萎病的研究在1985年之前就有所探索,但發文量較少。直至21世紀初,鐮刀菌枯萎病相關研究的發文量增長加快。尤其是21世紀以來,本領域整體發展較為迅速,2018年更是發文量最高的一年,發文數量突破350篇,2019年截至4月1日已發表73篇,預期2019年鐮刀菌枯萎病總發文量也可達300篇以上。表明了該領域正處于快速發展階段,越來越多的科研工作者關注并推動這一領域的研究。

圖1 ISI Web of Science數據庫核心合集中以“Fusarium wilt”主題檢索的文獻年發文量統計
科學合作是指研究學者為生產新的科學知識而一起進行工作。合作圖譜是將這一工作關系進行可視化。CiteSpace提供了三個層次的科學合作網絡分析,分別為:作者合作網絡、機構合作網絡和國家地區的合作網絡,可識別出鐮刀菌枯萎病研究領域的學者、機構及國家間的合作關系。既為評價其學術影響力提供參考,又有利于發現值得關注的學者和機構。
圖2為國家地區的合作網絡圖譜,圖中35個節點,表示自1985年以來共有35個國家地區對鐮刀菌枯萎病進行了不同程度的研究。其中荷蘭(0.27)和美國(0.16)中介中心性較高,表明美國和荷蘭在國家合作網絡中占有重要地位。美國(903篇)、中國(701篇)、印度(614篇)發文量排在前列。荷蘭雖然發文量排在第七位,但其中介中心性排在第一位(0.27),進一步分析發現荷蘭對鐮刀菌枯萎病的研究起始較晚,文獻數量較少,但文獻質量較高,被引次數較多,與其他國家交流合作頻繁。中國在20世紀末才開始探索鐮刀菌枯萎病領域,起步較晚,網絡中介中心性較低,但在短短20年之間發展迅速,發文量達到701篇,僅次于美國,正處于快速發展階段。這與近年來我國集約化農業慢慢凸現出來的連作障礙等問題有關,也表明了國家和相關研究者關注并支持這方面的研究。

注:圓形節點大小與文獻數量成正比,節點外圈代表中介中心性,厚度與中介中心性為正相關;年輪灰度代表文獻發表年限,厚度與文獻數量成正相關,灰度越深發表時間越早;節點間連線代表兩者共現或共被引關系,線條粗細反映關系的強弱,灰度對應二者首次引用年份。下同。Note:Size of the round node is in direct proportion to the number of papers published,the outer circle of the node represents the intermediary centrality,and thickness of the circle is positively related to the intermediary centrality;Gray level of the ring represents year of the publication,and thickness of the ring is positively related to the number of papers in the literature;Lines between the nodes represent the co-occurrence or co-citation relationship between the two,thickness of the line reflects strength of the relationship,and gray level of the line corresponds to the first year when the two were cited. The same below.
通過機構合作分析可發現對鐮刀菌研究比較先進的研究機構,并與之交流學習。圖3為機構合作網絡分析圖譜,由477個節點和754條連線組成,表示477個研究機構之間的合作聯系,節點的連線代表機構之間的合作關系。本文統計了各機構的發文數量、中介中心性、首發年份等信息。從圖中的連線可以看出,歐美國家研究機構之間的連線更加密集,合作更加頻繁。其中南京農業大學在網絡中的節點最大,在鐮刀菌枯萎病領域發文量最多,但大多是機構間內部合作。中介中心性排名前十的機構中美國農業研究所、美國農業部、科爾多瓦大學位列前三位,研究起步較早,中介中心性和發文數量均較高,表明了這三個機構在本領域占有重要地位。我國僅有中國科學院和南京農業大學兩家機構入圍排名前十的機構,他們雖然研究起步稍晚,中介中心性也較低,但積極探索,已同多個機構產生合作關系。尤其是南京農業大學,發文量排名國內第一,中介中心性也排在所有中國機構中的前列,在鐮刀菌枯萎病方面的研究正在快速發展。

圖3 鐮刀菌枯萎病研究的機構合作特征
通過分析作者合作網絡能夠得到關注鐮刀菌枯萎病的研究人員信息,發掘出鐮刀菌枯萎病研究領域中優秀的研究人員,以及研究領域中作者之間的相互合作。圖4中共有1 289個節點代表著枯萎病領域中的1 289位研究人員發表過本領域文章,圖中節點大多獨立分散,其中可以清晰發現圖中最大的節點是Shen Q R教授。說明署名包含Shen Q R教授的文獻數量最多,為130篇(表1),位居所有鐮刀菌枯萎病研究人員發文量的第一位,遠高于第二名的Garibaldi A(58篇)。進一步分析發現以Shen Q R教授為中心,聯系的其他作者大部分屬于同一個單位,團隊內部合作較多,表明了在本領域Shen Q R教授領導了一個成規模的團隊。從中介中心性來看,排名前三的作者分別是Viljoen A、Aitken E A B、Czislowski E,其中Viljoen A發文26篇,首發年份為2007年,中介中心性0.11,其次是Aitken E A B,發文9篇,2012年首發,中介中心性0.09(表1)。Czislowski E、Yang L、Thatcher L F等人,雖然發文量較少,起步較晚,但中介中心性較高,說明這幾位作者在該領域中合作交流較多,并且與其他作者合作發文的數量較多。值得注意的是高產作者的合作大多存在于內部合作,跨機構合作的現象相對較少。從世界范圍的研究者來看,許多研究人員以小范圍獨立研究為主,團隊合作較少,表明大部分枯萎病研究人員分布廣泛且獨立性較強。
我國與其他國家機構作者合作較少,這可能是導致我國科研人員中介中心性較低的重要原因。中介中心性前十名中僅有兩位中國的科研人員,且均來自南京農業大學,表明了南京農業大學枯萎病研究領域中處于國內領先地位。整體而言,我國在該領域的研究未來尚有較大的進步空間,我國研究人員應加強與國外優秀科研人員交流學習,以提高我國該領域研究在全世界的地位。

圖4 鐮刀菌枯萎病研究作者合作網絡

表1 鐮刀菌枯萎病作者合作分析中介中心性統計
對學科領域的共現分析,可構建學科間的關聯網絡,揭示鐮刀菌枯萎病研究中學科間的相互聯系。圖5為領域共現分析網絡,圖中共有56個節點,表明在鐮刀菌枯萎病研究中有56個學科相互交叉滲透,222條代表學科領域間相互聯系的連線,表明鐮刀菌枯萎病學科領域分布廣泛、復雜。該領域研究論文主要涉及植物科學、農學和農業經濟學領域,除此之外還在園藝、應用微生物、醫學微生物、土壤肥料學等領域有較多的發文量。其中生物化學與分子生物學、環境科學與生態學的中介中心性較高。分別為0.42、0.28和0.25,表明鐮刀菌枯萎病在這些學科中有重要的研究價值,交叉也最為廣泛。

圖5 鐮刀菌枯萎病學科領域共現網絡
關鍵詞是文獻主題的精確表達,關鍵詞共現分析有利于識別研究主題演變過程。關鍵詞共現分析和關鍵詞突發性檢測有利于發現該研究發展動向和研究熱點,將CiteSpace節點選擇為“keyword”,閾值選擇50,得到關鍵詞共現知識圖譜(圖6)。根據圖形大小可以看出頻次最高的五個關鍵詞分別是“鐮刀菌枯萎病”(Fusarium wilt)、“生物防治”(biological control)、“枯萎”(wilt)、“抗性”(resistance)、和“尖孢鐮刀菌”()。中介中心性最高的十個關鍵詞中“生物防控”(biological control)、“鐮刀菌枯萎病”(Fusarium wilt)、“枯萎”(wilt)最高。其中,“枯萎病”和“鐮刀菌枯萎病”這兩個關鍵詞為本研究的篩選用詞,因此,本研究關注這兩個詞之外的其他關鍵詞。發現在對枯萎病研究的過程中,病理的發生和病害的防治是枯萎病研究課題的關鍵內容。結果中所有關鍵詞首發年份均在20世紀90年代初期,表明科研人員很早就開始了對于鐮刀菌枯萎病的發病機理和防控研究。

圖6 鐮刀菌枯萎病關鍵詞共現網絡
突發性檢測(Burst detection)表示所考察的關鍵詞在短時間內躍遷的現象,強調突發性。通過對關鍵詞突發性的檢測,可得知特定時間內的研究熱點。按照突發性強度統計出圖,發現“induction(誘導)”的突發性最高,突發強度為31.44(表2),說明在鐮刀菌枯萎病研究中,“誘導”是其研究中的最大熱點,其突發性從起始的1997年持續至21世紀。進入21世紀后,“熒光假單胞)”、“cotton(棉花)”、“race(種、屬)”、“vegetative compatibility(營養親和性)”、“induced resistance(誘導抗性)”、“(哈茨木霉)”等關鍵詞研究熱度逐漸增多。為了更好地把握當前鐮刀菌枯萎病的研究熱點,本研究進一步統計了近十年的關鍵詞突發性檢測(表2),其中“induction(誘導)”依然是近十年鐮刀菌枯萎病研究的重要熱點,突發強度為11.61。其次分別是“chickpea(鷹嘴豆)”、“genetic diversity(遺傳多樣性)”、“DNA(基因)”、“systemic resistance(系統抗性)”等關鍵詞熱點。隨著近年來高通量測序技術的不斷完善,測序深度與精度的逐步提升,研究熱點轉變至分子層面的研究,因此遺傳多樣性、基因、系統抗性等熱點逐漸增多。鷹嘴豆是鐮刀菌枯萎病實驗中的最為常見的實驗材料,此處不做過多分析。值得注意的是“pathogenicity(致病性)”,它是近年來(2016年—2019年)最大的研究熱點,這也充分體現了枯萎病研究領域更加多元、更加深入的研究特點。

表2 關鍵詞突發性檢測
在文獻計量學中,共被引是指兩篇文獻共同出現在第三篇施引文獻的參考文獻目錄中,則這兩篇文獻形成共被引關系。科學文獻的相互引證反映了科學發展的客觀規律,是揭示其數量特征和內在規律的一種信息計量研究方法。圖7反映的文獻共被引圖譜由274個節點和387條連線形成了42個群組聚類,包含11個較大的群組,Q=0.844 2,其中最大節點為Ma L J教授的文獻,共被引次數最多(111次)。圖中11個聚類群組標簽為鐮刀菌枯萎病的11個研究前沿,表明鐮刀菌枯萎病研究涉獵廣泛。其中前三的聚類群組為#0解淀粉芽孢桿菌、#1系統抗性、#2非致病性尖孢鐮刀菌,文章數量分別為32、30、24,S值為0.945、0.895、0.933,說明聚類的結果具有高可信度,這三個聚類群組標簽為鐮刀菌枯萎病領域的最前沿研究,即:提高植物系統抗性;使用以芽孢桿菌為代表的有益菌防控鐮刀菌;通過非致病鐮刀菌防控致病鐮刀菌數量。通過總結出三個聚類中Sigma最高的三篇文獻,對每個聚類中的重要文件進行挑選,其中#0解淀粉芽孢桿菌中Sigma最高的文獻是2008年南京農業大學的Zhang等[15]所發表的文獻“Control of Fusarium wilt disease of cucumber plants with the application of a bioorganic fertilizer”,該文章采用芽孢桿菌SQR-5和SQR-11的生物有機肥控制尖孢鐮刀菌和黃瓜枯萎病有顯著效果。深入剖析后發現#0解淀粉芽孢桿菌群組中有19篇文獻來自南京農業大學的沈其榮團隊,由此可見沈其榮教授所領導的有機肥與土壤微生物研究團隊是該領域中解淀粉芽孢桿菌研究方向的中堅力量。#1系統抗性中烏特勒支大學的van Loon等[16]在1998年發表的“Systemic resistance induced by rhizosphere bacteria”Sigma最高,主要闡述了根瘤菌介導的系統抗藥性在田間條件下是有效的,提供了一種生防機制。#2非致病性尖孢鐮刀菌中Sigma最高的文獻是“Mechanisms involved in biological control of Fusarium wilt of cucumber with strains of nonpathogenic”由巴林大學的Mandeel[17]于1991年發表,主要內容為非致病性尖孢鐮刀菌的增加有利于降低黃瓜枯萎病的發病率。

圖7 鐮刀菌枯萎病文獻共被引圖譜
對前三聚類群組進行總結分析,其主要內容見表3。Sigma值越高說明網絡中該文章的結構性和突現性綜合表現上最優,進一步深入剖析近十年Sigma值最高的十篇被引文獻(表4),其中Sigma值最高的為Di PA的“:Exploring the molecular arsenal of a vascular wilt fungus”,這十篇文獻為近十年鐮刀菌枯萎病研究的重要基礎。值得注意的是2013年發表的“Effects of novel bioorganic fertilizer produced byW19 on antagonism of Fusarium wilt of banana”,利用解淀粉芽孢桿菌制作有機肥來預防枯萎病,2012年發表的“The Top 10 fungal pathogens in molecular plant pathology”,從分子層面來分析鐮刀菌枯萎病,以及“Application of bio- organic fertilizer can control Fusarium wilt of cucumber plants by regulating microbial community of rhizosphere soil”通過有機肥調控微生物群落防控枯萎病。雖發表年限較短,但Sigma值較高。通過三篇文獻可以側面看出系統抗性、病原菌的基因分子研究及微生物互作等是近年來的主要研究方向。
我國是農業大國,在農業現代化發展的過程中,作物連作及長期不合理施肥等不良現象導致土壤微生物區系破壞,造成鐮刀菌枯萎病爆發頻繁,影響經濟作物生長發育。因此,減輕病害發生對我國現代化農業發展十分緊迫。南京農業大學有機肥與土壤微生物團隊,利用芽孢桿菌和木霉等土壤有益微生物對香蕉、黃瓜、西瓜、番茄等作物的枯萎病進行生物防控,做過大量應用研究[27-28]。國內研究更偏重實際運用,對作物抗性和產量等研究較多。隨著近年來研究層次的不斷深入,鐮刀菌枯萎病的研究熱點轉變至基因分子層面。包括尖孢鐮刀菌的致病機理、根際微生物互作、根系分泌物對病原菌的影響以及植物多種基因的表達對病原菌的影響等方向。同時,本文根據對鐮刀枯萎病研究熱點和研究前沿的深度剖析,認為未來研究將會繼續集中在抗病基因與抗病育種、生態防控、微生物方面的研究以及枯萎病在全球尺度下的遺傳多樣性與致病多樣性。今后在土壤微生物尤其是根際微生物生態方面的研究會得到長足的發展,通過多組學研究深入剖析植物-病原菌互作機制,為我國鐮刀菌枯萎病、土壤連作障礙等問題提供理論與技術支持。

表3 鐮刀菌枯萎病研究聚類分析主要內容

表4 近十年鐮刀菌枯萎病研究文獻Sigma值
通過CitesSpace對鐮刀菌枯萎病研究文獻進行合作網絡、共現網絡及共被引網絡分析,探索該領域的重要基礎、研究熱點、研究前沿。結果表明,美國和荷蘭在該領域的研究占有重要地位,擁有學科內大量優秀的研究機構,其中包括美國農業研究所、烏特勒支大學、科爾多瓦大學等優秀研究機構。許多優秀的學者對鐮刀菌領域的研究探索中發表了重要的文獻,其中Larkin R P教授、Mandeel Q教授、Vanpeer R教授研究了非致病性鐮刀菌對番茄和黃瓜枯萎病防控以及假單胞菌對康乃馨枯萎病的防控;van Loon L C教授研究了根際微生物和生物防控;Ma L J教授則主要從基因組學方面研究了鐮刀菌的致病染色體等,以上學者在鐮刀菌枯萎病領域發表了多篇重要文獻。鐮刀菌枯萎病涉及多個交叉學科,其中工程學、生物化學與分子生物學、環境科學與生態學交叉頻繁。我國鐮刀菌枯萎病研究起步較晚,但發展迅速,未來仍需緊跟國際研究熱點和前沿,加強合作交流,注重學科交叉,為攻克土傳枯萎病和農業可持續發展貢獻力量。
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Bibliometric-based Analysis of Advances in Researches on Fusarium Wilt Disease
ZHANG Chao, WEN Tao, ZHANG Yuan, ZHAO Mengli, LIU Ting, YUAN Jun?, SHEN Qirong
(College of Resources and Environmental Sciences / Jiangsu Provincial Key Lab of Solid Organic Waste Utilization / National Engineering Research Center for Organic-Based Fertilizers/ Jiangsu Collaborative Innovation Center of Solid Organic Wastes, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, China)
Fusarium wilt, caused by, is a kind of fungal disease highly destructive to crops. A review was prepared of advances and hot spots in the research on through citation analysis.In order to ensure that the review is objective and scientific, literature analysis was performed based on the data collected and retrieved by “Fusarium wilt” as the subject word from the core collection of the database of ISI Web of Science of the period of 1985~2019. A total of 4972 relevant papers were obtained finally by April 1, 2019. All the retrieved documents were downloaded in the format of “full record and quoted references” and “plain text”, and renamed to download-fw.txt format, for easy recognition by CiteSpace for further analysis. Then, the CiteSpace visualization software was used for citation analysis by cooperation, co-occurrence, co-citation, research hotspot and frontier trend.Statistical analysis of volume of the publications shows that the United States, China and India ranked the top three in this field. Analysis of betweenness central indicators shows that the Netherlands, the United States and India were the top three in importance of literature, while China was among the top 10s with a positive upward trend. Further analysis by institution shows that the United States Department of Agriculture, the University of Cordoba, the French National Agricultural Research Institute, the University of Utrecht, etc. were outstanding ones in this field; Domestic research institutions, represented by the Nanjing Agricultural University, actively carried out relevant researches and contributed a huge number of publications addressing the issue “Fusarium wilt is widely distributed and complex crop disease” in the fields of plant science, agronomy and agricultural economics.Further citation analysis shows that “induction”, “genetic diversity” and “pathogenicity” are important hot spots in the recent ten years, and literature co-citation clustering analysis shows that “”, “systemic resistance”, and “non-pathogenic” were the research frontiers in this field. With the research on Fusarium wilt going on in-depth, it is speculated that the future research will go on keeping focus on microbial control and prevention, breeding of disease resistant crop varieties, and interaction of root - pathogen - beneficial microbes and its mechanism, and moreover, the adoption of the multiple omics technology will sure help understand the pathogenesis of Fusarium wilt and provide a theoretical basis and technical support for fundamental studies on and prevention of Fusarium wilt.
Fusarium wilt; CiteSpace;; Visual analysis; Network
S436.421.1+3
A
10.11766/trxb201909090479
張超,文濤,張媛,趙夢麗,劉婷,袁軍,沈其榮. 基于文獻計量分析的鐮刀菌枯萎病研究進展解析[J]. 土壤學報,2020,57(5):1280–1291.
ZHANG Chao,WEN Tao,ZHANG Yuan,ZHAO Mengli,LIU Ting,YUAN Jun,SHEN Qirong. Bibliometric-based Analysis of Advances in Researches on Fusarium Wilt Disease [J]. Acta Pedologica Sinica,2020,57(5):1280–1291.
* 國家重點研發計劃項目(2017YFD0200805)、國家自然科學基金項目(31902107)和農業部公益性行業(農業)科研專項(201503110)共同資助Supported by the National Key Research and Development Program of China(No. 2017YFD0200805),the National Natural Science Foundation of China(No. 31902107)and the Public Welfare Industry(Agriculture)Scientific Research Special Project of the Ministry of Agriculture of China(No. 201503110)
,E-mail:junyuan@njau.edu.cn
張 超(1994—),碩士研究生,主要研究土壤微生物。E-mail:1173463678@qq.com
2019–09–09;
2020–04–15;
優先數字出版日期(www.cnki.net):2020–06–01
(責任編輯:陳榮府)