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非小細胞肺癌中反義長鏈非編碼RNA RAB11B-AS1的表達及臨床意義

2020-12-08 08:18:58汪柳黃培芝熊將軍
安徽醫藥 2020年12期
關鍵詞:肺癌

汪柳,黃培芝,熊將軍

作者單位:湖南中醫藥高等??茖W校附屬第一醫院(湖南省直中醫醫院)檢驗科,湖南 株洲412000

肺癌是最為常見的惡性腫瘤,其發病率和死亡率均居全球腫瘤首位,嚴重危害人類的生命健康[1-2]。肺癌的發病機制尚未完全明確,可能與環境污染、吸煙、既往肺部慢性感染、電離輻射和遺傳等因素有關。非小細胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)約占肺癌的85%,進展期病人5年生存率僅為15%[3]。尋找治療NSCLC的新途徑,探尋有效的基因治療靶點是目前亟須解決的問題。全基因組分析顯示,人體內超過90%的基因被轉錄為非編碼RNA(non-coding RNA,ncRNA)。大量研究表明,長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在細胞增殖、分化和凋亡等多種生物學行為中發揮作用,并在多種腫瘤中異常表達,在腫瘤的發生發展中發揮抑癌或促癌作用[4-5]。lncRNA可通過表觀遺傳、轉錄及轉錄后多種途徑調控基因表達[6]。反義長鏈非編碼RNA RAB11B-AS1(long non-coding RAB11B antisense RNA,lncRNA RAB11B-AS1)是一種反義lncRNA,能通過不同機制調控基因的表達。研究發現,一些特定的lncRNA在NSCLC中表達異常,與NSCLC發生發展、轉移及預后有密切聯系[7]。然而lncRNA RAB11B-AS1在NSCLC中的作用鮮有報道,本研究將通過檢測NSCLC癌組織中lncRNA RAB11B-AS1的表達及與預后的關系,以期為NSCLC的治療和預后提供依據。

1 資料與方法

1.1一般資料選取2014年9月至2017年3月于湖南省直中醫醫院行手術治療的97例NSCLS病人,其中男/女:54例/43例,年齡(57.31±9.86)歲,范圍為34~79歲。Ⅰ~Ⅱ期/Ⅲ~Ⅳ期:47例/50例,淋巴結轉移有/無:60例/37例,遠處轉移有/無:28例/69例。試驗組為病人的癌組織,對照組則選取同一病人的癌旁組織(距腫瘤邊緣>2 cm)。

納入標準:①經病理確認為NSCLC;②入院前3個月未行放、化療;③臨床病理資料完整。排除標準:①肝、腎、心臟等功能不良者;②同時患有其他惡性腫瘤者;③拒絕參與研究者。

對所有病人隨訪2年,從術后第1天起,隨訪日期截至2019年4月1日,無失訪病例,統計隨訪期間的生存人數。97例NSCLC病人中共存活41例,死亡56例。本研究符合《世界醫學協會赫爾辛基宣言》相關要求,病人及其近親屬均知情且同意。

1.2主要儀器與試劑實時熒光定量PCR(Quantitative Real-time PCR,qPCR)儀(型號T100),購于伯樂生命醫學產品(上海)有限公司;Titan One Tube RT-PCR試劑盒(貨號11939823001),購于Sigma-Aldrich中國上??偛?;Prime Script?RT reagent Kit(Perfect Real Time)(貨號 RR037A)及TRIzol試劑(貨號JMS12279),均購于日本TaKaRa公司。

1.3研究方法

1.3.1 樣品采集 于術中收集新鮮的NSCLC癌組織及癌旁組織(距腫瘤邊緣大于2 cm),液氮中冷凍后,移至-80℃超低溫冰箱保存。

1.3.2 實時熒光定量逆轉錄PCR(RT-qPCR)測定lncRNA RAB11B-AS1的表達 ①提取總RNA:組織破碎后勻漿,按照Trizol RNA提取說明書操作,所得RNA溶于RNase Free水,保證RNA完整,并檢測RNA純度及濃度。②逆轉錄:將RNA逆轉錄為互補DNA(cDNA),按照Prime Script? RT reagent Kit試劑盒說明書操作,-20℃保存所得cDNA。③qPCR反應(20μL體系):2×SYBR Green PCR Master Mix(10μL),上下游引物(各1μL),cDNA模板(2μL),水(6μL),各樣本均設置3個重復。以GAPDH為內參,其正向引物序列為5’-GGAGCGAGATCCCTCCAAAAT-3’,反向引物序列為5’-GGCTGTTGTCTTACTTCTCATGG-3’;lncRNA RAB11B-AS1正向引物序列為5’-CCATGGACCCTTGCGAGAT-3’,反向引物序列為 5’-CAAAGTCCATGTAAACATGTTCCC-3’。④反應條件:于T100 qPCR儀上進行,95℃30 s、95 ℃ 10 s、60 ℃ 30 s,40個循環。采用2-ΔΔCt法計算lncRNA RAB11B-AS1相對表達量。

1.4統計學方法采用SPSS 24.0分析,計量資料以xˉ±s表示,采用配對樣本t檢驗;計數資料用例數表示,采用χ2檢驗;Kaplan-Meier曲線繪制NSCLC病人術后24個月的生存曲線;影響NSCLC預后的危險因素采用Cox多因素回歸分析,檢驗水準α=0.05。

2 結果

2.1 RT-qPCR法測定組織中lncRNA RAB11BAS1表達量試驗組lncRNA RAB11B-AS1的表達量為(2.61±0.74),對照組lncRNA RAB11B-AS1的表達量為(1.35±0.41),試驗組明顯高于對照組,差異有統計學意義(t=14.669,P<0.001)。

2.2癌組織中lncRNA RAB11B-AS1表達與NSCLC病人臨床病理特征的關系以lncRNA RAB11B-AS1表達的平均數值(2.61)將試驗組分為高、低表達組。lncRNA RAB11B-AS1表達與病人年齡、性別、吸煙史及腫瘤直徑無關(P>0.05),與病理類型、分化程度、淋巴結轉移、遠處轉移和疾病分期有關(P<0.05)。見表1。

2.3癌組織中lncRNA RAB11B-AS1表達與NSCLC病人預后的關系繪制97例NSCLC病人術后1~24個月的生存曲線,其中生存41例,總生存率為42.27%(41/97)。lncRNA RAB11B-AS1高表達組術后 2年總生存率為 28.30%(15/53),95%CI:13.401~17.542;低表達組術后2年總生存率為59.09%(26/44),95%CI:17.595~21.451,兩組比較log-rank值為9.272,P=0.002。見圖1。

圖1 非小細胞肺癌97例癌組織反義長鏈非編碼RNA RAB11B-AS1表達24個月生存曲線

2.4影響NSCLC病人預后的危險因素分析單因素分析顯示,病理類型、分化程度、疾病分期、淋巴結轉移、lncRNA RAB11B-AS1表達及遠處轉移是影響NSCLC病人預后的危險因素。多因素分析顯示,lncRNA RAB11B-AS1表達、遠處轉移和疾病分期(HR=2.69、2.70、2.93,95%CI:1.83~3.96、1.58~4.62、1.67~5.13,均P<0.05)均是影響NSCLC病人預后的獨立危險因素。見表2。

3 討論

NSCLC多數病人確診時處于NSCLC晚期[8]。晚期NSCLC病人常伴隨淋巴結轉移和遠處轉移,療效不佳[9]。隨著科技的進步和分子生物技術的發展,NSCLC分子靶向治療取得一定進展,但發病機制尚未明確,目前仍缺乏有效的診斷及預后判斷指標[10]。

lncRNA不具有編碼蛋白功能,但可以參與細胞的多種生物學行為,在人體內發揮重要作用。lncRNA主要通過以下途徑參與細胞調控:①影響目的基因啟動子轉錄;②影響RNA聚合酶Ⅱ活性;③與目的基因轉錄本形成互補雙鏈;④與目的蛋白結合影響其活性;⑤改變目的蛋白在細胞中的定位[11]。越來越多研究表明,lncRNA在肺癌的發生發展中起重要作用[12-13]。Meng等[14]發現,lncRNA RMRP在肺腺癌細胞系A546、SPC-A1、H1299和H23中均呈高表達,且其異常表達可促進肺腺癌癌細胞增殖和侵襲。She等[15]研究表明,長鏈非編碼RNA SNHG7可增強Fas凋亡抑制分子2(FAIM2)蛋白的表達,從而促進肺癌細胞的增殖、遷移和侵襲,并抑制細胞凋亡。

表2 非小細胞肺癌病人97例的預后影響因素分析

根據位置及轉錄方向,可將lncRNA分為5類:雙向、正義、反義、基因間和內含子lncRNA[16]。反義lncRNA含有m7GPPPN結構,可躲避5’-3’核酸外切酶,比其他lncRNA更穩定,并且反義lncRNA亞細胞定位相對自由,其發揮作用的機制更加廣泛[17]。反義lncRNA正在受到人們的廣泛關注。Wu等[18]研究發現,長鏈非編碼RNA GAS5-AS1在NSCLC癌組織中表達下調,且與疾病分期和淋巴結轉移有關,lncRNA GAS5-AS1過表達能夠抑制NSCLC細胞的上皮-間質轉化,發揮抑癌作用。lncRNA RAB11BAS1是RAS癌基因家族成員,定位于19q13.2處,長1 022 bp,有3個外顯子。馮麗萍等[19]研究表明,胃癌組織中lncRNA RAB11B-AS1表達上調,且與病人預后密切相關。Chen等[20]發現,lncRNA RAB11BAS1在骨肉瘤中組織中表達下調,能夠抑制骨肉瘤細胞的增殖、遷移和侵襲。目前,對于lncRNA RAB11B-AS1在腫瘤疾病中的作用研究較少,在NSCLC中的表達情況及作用未見報道。

本研究檢查NSCLC病人癌組織中lncRNA RAB11B-AS1的表達水平,結果顯示lncRNA RAB11B-AS1表達在癌組織中明顯高于癌旁組織,NSCLC病人癌組織中腺癌、低分化、淋巴結轉移、遠處轉移、Ⅲ~Ⅳ期病人lncRNA RAB11B-AS1表達水平明顯高于鱗癌及其他、中高分化、無淋巴轉移、無遠處轉移、Ⅰ~Ⅱ期病人,提示lncRNA RAB11B-AS1表達可能影響NSCLC的發生及病程進展;Kaplan-Meier曲線顯示,lncRNA RAB11B-AS1高表達組的生存率(28.30%)低于低表達組(59.09%),提示lncRNA RAB11B-AS1高表達影響NSCLC病人術后生存率;Cox回歸分析顯示,lncRNA RAB11B-AS1表達、處轉移和疾病分期均是影響NSCLC預后的獨立危險因素,提示下調lncRNA RAB11B-AS1可能對提高NSCLC病人的術后生存率有一定幫助。

綜上所述,lncRNA RAB11B-AS1在NSCLC病人癌組織中上調,其表達與病人臨床病例特征有關,且與NSCLC病人的預后密切相關,可為NSCLC的治療提供參考。

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