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基于無人機圖像以及不同機器學習和深度學習模型的小麥倒伏率檢測

2021-01-17 23:20:30PauloFLORES張昭
智慧農業(中英文) 2021年2期

Paulo FLORES 張昭

摘要:冬小麥澇漬脅迫頻發不僅嚴重影響區域糧食安全和生態安全,還威脅社會經濟穩定和可持續發展。為識別冬小麥澇漬脅迫及判別其脅迫程度,本研究設置冬小麥澇漬脅迫梯度盆栽試驗,采用ASD地物光譜儀和Gaiasky-mini2推掃式成像光譜儀分別測定葉片及冠層高光譜數據,結合植被指數、歸一化均值距離和光譜微分差信息熵等方法,監測冬小麥是否遭受澇漬脅迫并判別其澇漬脅迫程度。試驗結果顯示,簡單比值色素指數SRPI是識別澇漬脅迫冬小麥的最優植被指數。紅光吸收谷(RW:640~680nm)是識別冬小麥澇漬脅迫程度的最優波段,在RW波段內,抽穗、開花和灌漿期的光譜微分差信息熵可判別冬小麥澇漬脅迫程度,脅迫程度越大,光譜微分差信息熵越大。本研究為澇漬脅迫監測提供了一種新方法,在澇漬脅迫精確防控中具有較好的應用前景。

關鍵詞:高光譜遙感;澇漬脅迫;植被指數;光譜微分差信息熵;冬小麥

中圖分類號:S127;TP79文獻標志碼:A文章編號:202105-SA001

引用格式:楊菲菲,劉升平,諸葉平,李世娟.基于高光譜遙感的冬小麥澇漬脅迫識別及程度判別分析[J].智慧農業(中英文),2021, 3(2): 35-44.

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1引言

農業生產對氣候條件具有較強的依賴性。澇漬災害作為主要自然災害之一,正成為制約作物生長的明顯因素。澇漬災害是一種慢性災害現象,監測困難。傳統的監測方法主要包括檢測土壤水分和作物體內水分狀況等,存在勞動強度大、觀測不及時等缺陷。高光譜遙感信息豐富、無破壞性,可為監測澇漬脅迫提供一種無損、實時、可信的方法。基于高光譜遙感對澇漬脅迫進行早期監測,盡早提供有關植被狀況信息,對制定精確的生產投入管理方案至關重要[1]。

目前基于高光譜遙感監測作物環境脅迫程度的研究主要集中于監測重金屬脅迫和病害脅迫程度。其中,劉美玲等[2]基于光譜高頻組份的分維數診斷水稻鉛污染脅迫水平,表明結合小波變換、分形分析和模糊數學可有效實現光譜弱信息提取、度量及建模,以監測重金屬脅迫程度;Zhang等[3]研究發現冠層空氣溫差分布的平均值和標準差是較好的水稻重金屬脅迫水平判別指標;Li等[4]利用多源遙感數據的互補特性,融合高光譜遙感和雷達遙感監測稻田重金屬脅迫程度;楊興川等[5]研究發現,在單葉尺度下,基于785nm波段的二次曲線模型反演煙煤病嚴重程度的效果較為理想;Stefan等[6]通過高光譜成像,結合單純形體積最大化和支持向量機的組合自動量化大麥白粉病癥狀,實現在每個測量日對所有栽培品種疾病嚴重程度的準確評估;Gui等[7]提出卷積神經網絡和支持向量機相結合的方法檢測大豆早期花葉病毒病,模型識別準確率較高。部分研究集中于判別凍害脅迫、粉塵脅迫、干旱脅迫及鹽脅迫程度。其中,王慧芳等[8]利用主成分分析方法構建冬小麥凍害嚴重度反演模型,模型效果達到極顯著;Liang等[9]設計粉塵脅迫歸一化指數,結合隨機森林分類算法預測小麥葉片的粉塵脅迫程度,精度較高;Zhang和Zhou[10]基于干旱脅迫梯度試驗,研究發現綠色葉綠素指數,紅邊葉綠素指數和紅邊歸一化指數對冠層水分含量和平均葉片等效水厚度的變化最為明顯;Miguel等[11]分別基于主成分分析和計算紅邊區域二階導數近似值的指數建立鹽度效應監測模型,研究不同鹽度水平對萵苣的影響,兩種模型均可有效監測鹽脅迫程度,但基于指數的模型更簡單易用。

對作物澇漬脅迫的研究方向主要包括檢測單一澇漬脅迫的發生,建立澇漬脅迫下生理生化參數反演模型[12]及區分不同環境脅迫,而對判別澇漬脅迫程度的研究較少。其中,熊勤學等[13]建議用670~2400nm波段光譜的均值差異反映小麥受漬情況;Xia等[14]結合二次判別分析、K- 最近鄰和支持向量機等方法,發現利用高光譜成像技術檢測油菜澇漬脅迫可行;Zhao等[15]基于高光譜圖像和卷積神經網絡檢測棉花澇漬脅迫;高小梅等[16]結合相關分析和神經網絡方法,建立基于高光譜和數字圖像特征指標的受漬冬小麥葉綠素儀(Soil and Plant Analyzer Develotrnent,SPAD)值估算模型;Emengini等[17]研究發現高光譜和熱紅外遙感結合可能區分石油污染、澇漬及油漬脅迫。植被原始光譜在采集中易受噪聲、土壤背景信息等因素影響,澇漬脅迫對作物光譜的影響微弱而難于探測,光譜微分可減弱背景信息對原始光譜信號的影響,通過計算不同曲線光譜微分的差值,可進一步減少光譜噪聲的影響[18]。因此,可以結合植被指數和歸一化均值距離識別冬小麥澇漬脅迫,并結合光譜微分差信息嫡對其澇漬脅迫程度進行判別。

本研究以長江中下游地區的江蘇省揚州市為研究區,基于盆栽試驗,于拔節期對冬小麥進行不同梯度的澇漬脅迫處理,采用冬小麥葉片光譜、冠層高光譜成像數據,結合植被指數、歸一化均值距離和光譜微分差信息嫡等方法,理清澇漬脅迫下冬小麥葉片及冠層光譜特征,識別冬小麥澇漬脅迫并對其脅迫程度進行判別。

2材料與方法

2.1試驗設計

研究對象為冬小麥(品種:揚幅麥4號(YF4)、濟麥31號(JM31)、濟麥38號(JM38))。試驗于2018—2019年在揚州大學盆栽試驗場遮雨棚內進行。2018年11月10日播種,播種密度為每盆8穴,每穴2粒,待生長到三葉一心時定苗至每盆8株,共189盆。2019年5 月28日收獲。盆底內徑20cm,口內徑28cm,高29cm,空盆重0.54kg。每盆裝風干輕壤土10kg與5.28g復合肥,復合肥N-P-K比例為15%-15%-15%,播種后覆土1kg,拔節期追施復合肥3.52 g。

于冬小麥拔節期(2019年3月15日)開始采用稱重法控水,進行澇漬脅迫梯度試驗,控制拔節期澇漬脅迫水平(對照CK,漬水ML,淹水SL),脅迫時間(5 d,10 d,15 d)及小麥品種(YF4、JM31、JM38)三個因子。其中,CK處理控制土壤相對含水量為70%~80%,ML處理控制土壤相對含水量為85%~90%,SL處理保留土壤表層水層1.5cm左右;YF4為正常品種,JM31為對水分高度敏感品種,JM38為對水分高度不敏感品種。于2019年3月30日結束所有澇漬處理,此后等量控制澆水,直至成熟收獲。試驗共21組處理,每個處理設9次重復,共189次試驗。

2.2數據采集

試驗數據的獲取頻率為從小麥拔節期第一次漬水日開始,選擇晴朗無風天氣,試驗當天在10:00—14:00測量盆栽冬小麥的葉片及冠層光譜數據,每7d測量一次,陰雨天延后,直至小麥成熟。

(1)葉片光譜數據。采用美國ASD公司(Analytical. Spectral. Devices)生產的便攜式地物光譜儀(Field Spec3)測量冬小麥葉片光譜反射率,光譜采樣間隔為1.4nm (采樣范圍350~1000nm)和2nm(采樣范圍1000~2500nm),重采樣間隔1nm。利用自帶光源型手持葉片光譜探測器夾取葉片中間部位測量光譜,各處理測定5盆,每盆測定4次,取均值作為該處理的冬小麥葉片光譜反射率,測量前使用標準白板進行定標校正,測量過程中每隔30min進行一次標準白板校正。

(2)冠層光譜數據。采用四川雙利合普公司生產的Gaiasky-mini2推掃式成像光譜儀(光譜范圍400~1000nm,采樣間隔4nm)測量冬小麥冠層光譜反射率。采用三腳架支起Gaiasky- mini2成像光譜儀,鏡頭垂直向下,距小麥冠層1m拍攝,各處理測定5盆,取均值作為該處理的冬小麥冠層光譜反射率,測量前使用標準白板進行定標校正。盆栽冬小麥冠層高光譜數據采集現場圖見圖lo

2.3數據處理與分析方法

2.3.1植被指數

植被指數可綜合相關光譜信號,在增強植被信息的同時減弱土壤等非植被信息的影響,有效反映植被與土壤等背景之間的差異性,各個植被指數在一定條件下能用來定量說明植被的生長狀況。結合已有研究[13,19],本研究選擇可能反映作物水分狀況的植被指數如表1所示。

2.3.2歸一化均值距離

Fisher準則是特征選擇的有效方法之一,其主要思想是鑒別性能較強的特征表現為類內距離盡可能小,類間距離盡可能大,即類別間相對距離可度量類別可分性[26],傳統常用距離包括歐氏距離、馬氏距離和漢明距離等[27]。本研究引入歸一化均值距離定量評估不同植被指數識別澇漬脅迫冬小麥能力的優劣,距離越大,說明植被指數識別能力越強[28]。綜合分析最優植被指數值的相對大小和變化趨勢可以判斷冬小麥是否遭受澇漬脅迫。歸一化均值距離原理為:

(7)

其中,μ和μ分別為對照、澇漬脅迫下植被指數均值;σ和σ分別為對照、澇漬脅迫下植被指數的標準差。

2.3.3光譜微分差信息熵

信息論之父Shannon[29]借鑒熱力學熵的概念,提出“信息熵”解決信息的量化度量問題。信息熵可定義為離散隨機事件發生的概率,可理解為消除不確定性所需信息量的度量,即未知事件可能含有的信息量,需要引入消除不確定性的信息量越多,則信息熵越高,反之則越低;也可作為一個系統復雜程度的度量,系統越復雜,出現不同情況的種類越多,則信息熵越高,反之則越低。本研究引入信息熵的思想衡量與評價冬小麥受澇漬脅迫影響的程度以及光譜由此產生的弱畸變,依據信息熵定義,構建光譜微分差信息熵,脅迫程度越大,光譜差異越大,其所對應的光譜微分差信息熵值就越大[30],計算公式如下[18]:

(8)

(9)

其中,i對應6種澇漬脅迫下光譜;j為某一波段范圍內波段數;SD為澇漬脅迫下小麥一階微分光譜值;為正常小麥一階微分光譜值。

3結果與分析

葉片光譜數據采用手持葉片光譜探測器夾取冬小麥葉片中間部位量測得到,未受背景信息的影響,而冠層高光譜影像數據不僅包含冬小麥冠層高光譜數據,還包括土壤等背景信息。因此,本研究在對冠層高光譜影像數據進行輻射定標、幾何校正等預處理后,基于隨機森林算法對冠層高光譜影像數據進行批處理,其中每幅影像均被分為冬小麥、盆、草和土壤四部分,通過計算混淆矩陣,可以得到總體分類精度和kappa系數分別為95.86%和0.9438,精度較高。提取分類后冬小麥的冠層光譜數據,進行后續處理。

3.1光譜特征分析

植被反射光譜與葉片內部結構、色素含量、含水率等密切相關。冬小麥受到澇漬脅迫后,生理特性會發生敏感變化,從而引起葉片及冠層光譜反射率的改變。

澇漬脅迫是土壤水分長期影響植被生長發育所導致的一種慢性災害現象,且具有滯后性,因此很難在遭受澇漬脅迫的拔節期就識別出澇漬脅迫冬小麥。為盡早識別冬小麥澇漬脅迫,分析遭受脅迫后第一個生育期冬小麥光譜反射率的變化,即對抽穗期對照及澇漬脅迫(包括所有漬水及淹水處理)后冬小麥葉片及冠層光譜反射率分別取平均,得到光譜特征對比結果(圖2),其中冬小麥葉片光譜數據對照及澇漬脅迫樣本數分別為60和360,冠層光譜數據對照及澇漬脅迫樣本數分別為15和90。

由圖2可知,冬小麥在澇漬脅迫后,與對照冬小麥葉片的光譜曲線在紅光吸收谷(RW:640~680nm),紅邊(RE:670~737 nm),近紅外(NIR:750~900 nm),1428~1456 nm波段和1650~1800 nm波段出現較明顯變化。冬小麥在澇漬脅迫下,受葉片中色素含量的影響,綠峰(550 nm)附近吸收減弱,綠峰有抬升的趨勢;澇漬脅迫導致葉片光合作用能力下降,NDVI指數降低,即在RW波段偏高,NIR波段降低;受葉綠素和氮素等影響[31,32],RE波段范圍內,光譜有藍移或向短波方向移動的現象。澇漬脅迫會延緩冬小麥根系生長,降低根系導水率,引起葉片水分虧缺,導致葉片水勢降低,1428~1456 nm波段可體現葉片水勢;1650~1800 nm位于大氣吸收波段,難以獲得高質量的野外數據,本節不再贅述。冠層光譜曲線變化趨勢和葉片光譜基本相同,但差異更為明顯,這可能由于澇漬脅迫不僅對冬小麥葉片生理特性造成影響,還影響了作物冠層的形狀結構等。

3.2澇漬脅迫識別分析

為有效綜合各有關光譜信號,增強植被信息,減少非植被信息,選取NDVI、SIPI、NDWI、GNDVI、PRI和SRPI六個植被指數對拔節期及之后全生育期的冬小麥葉片光譜進行處理分析,以識別澇漬脅迫下的冬小麥。由圖3可知,在整個生育期,正常與澇漬脅迫冬小麥的NDVI和SIPI沒有恒定規律,因此上述2個指數無法準確識別出澇漬脅迫下的冬小麥;GNDVI和NDWI在拔節期后的生育期可識別澇漬脅迫后的冬小麥,但上述2個指數在脅迫前就具有差異性,在識別澇漬脅迫冬小麥時具有系統性誤差,從而導致其無法在脅迫初期準確區分正常及澇漬脅迫的冬小麥;PRI和SRPI可以在整個生育期內識別出澇漬脅迫下的冬小麥。綜上,PRI和SRPI更適合用來識別澇漬脅迫的冬小麥。

為選取可識別澇漬脅迫的最優指數,基于公式(7)計算對照與澇漬樣本植被指數之間的歸一化均值距離,并進行對比分析,來判斷其識別能力的優劣,結果見表2。

由表2可見,在澇漬脅迫前(2019年3月15日),正常與澇漬脅迫冬小麥SRPI之間的歸一化均值距離是0.11,PRI的是0.28,其值較小,說明正常與漬害脅迫冬小麥的可分性較弱,這也與圖3所示一致。之后,除成熟期5月5日外,正常與脅迫冬小麥SRPI之間的距離均大于PRI,這可能由于成熟期冬小麥葉片開始衰老,萎蔫變黃,其他影響因素較多所致。因此,SRPI區分正常及澇漬脅迫冬小麥的能力比PRI強,且具有較強的敏感性及穩定性。

3.3脅迫程度判別分析

不同程度澇漬脅迫下冬小麥葉片光譜差異較小,難以對澇漬脅迫程度進行預測和區分。因此本節采用不同脅迫程度冠層光譜數據,基于前人研究[31-33].和以上結果,選取以下波段范圍進行分析:紅光吸收谷(RW:640~680 nm)、紅邊(RE:670~737 nm)和近紅外區(NIR:750~900 nm),結合光譜微分差信息熵方法,對澇漬脅迫下的冬小麥進行脅迫程度判別分析。

結合3.1和3.2的分析,可知冬小麥于拔節期遭受澇漬脅迫后,抽穗、開花及灌漿期是識別澇漬冬小麥的最佳生育期,拔節期差異不明顯可能是由于澇漬脅迫對植被的影響具有滯后性,成熟期冬小麥葉片開始衰老,萎蔫變黃,其他影響因素較多。因此對這3個生育期冬小麥的冠層光譜數據進行微分處理,獲取對照和不同澇漬脅迫程度下冬小麥一階微分光譜數據,計算RW、RE和NIR波段范圍內澇漬脅迫與對照組冬小麥光譜微分之差(圖4),并基于公式(8)和公式(9)計算RW、RE和NIR波段范圍內的光譜微分差信息熵,結果如表3所示。

土壤相對含水量相同時,澇漬脅迫程度隨處理天數的增加而增大;處理天數相同時,脅迫程度隨土壤相對含水量的增加而增大。即脅迫程度:ML5d<ML10d<ML15d,SL5d<SL10d<SL15d;ML5d<SL5d,ML10d<SL10d,ML15d<SL15d。在對冬小麥冠層光譜進行微分后,背景信息對原始光譜信號的影響被減弱,通過計算不同澇漬處理下的光譜微分差,可進一步減少光譜噪聲的影響,增強不同澇漬脅迫程度間的光譜差異。由圖4可知,紅光吸收谷(RW:640~680 nm),紅邊(RE:670~737 nm)和近紅外(NIR:750~900nm)波段冬小麥光譜微分差已有較明顯差異。引入信息熵來衡量這種差異性,由表3可得,在RW波段范圍內,澇漬脅迫程度越大,其對應的光譜微分差信息熵越大,從ML5d的0.677增大至USL15d的1.023,基本呈現CK<ML5d<ML10d<SL5d<ML15d<SL10d<SL15d的規律;而在RE和NIR波段范圍內,光譜微分差信息熵變化沒有任何規律。因此紅光吸收谷(RW:640~680 nm)波段光譜微分差信息熵可作為識別冬小麥受澇漬脅迫的指標,這一波段范圍內光譜微分差信息熵越大,表示冬小麥澇漬脅迫程度越大。

4討論

本研究通過設置冬小麥澇漬脅迫梯度盆栽試驗,期望找到識別澇漬脅迫及判別脅迫程度的相應指標和方法。分析冬小麥光譜變化特征,結合植被指數、歸一化均值距離和光譜微分差信息熵,識別澇漬脅迫并判別脅迫程度。

分析冬小麥的光譜變化特征,澇漬脅迫冬小麥的光譜響應特征在RW、RE、NIR和1650~1800nm波段發生較明顯變化。可能由于這幾個波段對影響光譜響應特征的生理參數敏感,如色素、營養素、干物質含量、葉片內部結構、葉水勢等。采用表1所示六個植被指數,對冬小麥拔節期及之后全生育期的冬小麥葉片光譜進行處理分析,得出SRPI是識別澇漬脅迫冬小麥的最優植被指數,該植被指數的優異表現可能來自于其對葉黃素循環色素的環氧化狀態和光合效率極敏感[34,35]。在RW波段內,抽穗、開花和灌漿期的光譜微分差信息熵可判別冬小麥澇漬脅迫程度,脅迫程度越大,光譜微分差信息熵越大。前人研究表明,RW波段對色素含量更為敏感[36,37],而光譜微分差信息熵可減少光譜噪聲及背景的影響。

由于各品種冬小麥對澇漬脅迫的響應特征基本一致,且本研究主要目的為找出冬小麥澇漬脅迫識別指數與脅迫程度判別指標,因此未對小麥品種間的差異性進行討論。

5結論

本研究設置澇漬脅迫梯度盆栽試驗,通過分析冬小麥光譜變化特征,得出SRPI是識別澇漬脅迫的最優植被指數,在紅光吸收谷波段范圍內,可以采用光譜微分差信息熵作為識別冬小麥澇漬脅迫程度的指標。

本研究結果可對澇漬脅迫精確防控提供理論意義和實踐應用價值,可為其他環境脅迫監測研究提供參考。本研究尚存不足之處,如盆栽試驗與田間實際環境存在差別、缺少獨立的試驗驗證等,后續研究可以增加盆栽及田間試驗,結合交叉驗證等,進一步驗證本研究方法識別澇漬脅迫及判別脅迫程度的可行性。

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Identification and Level Discrimination of Waterlogging Stress in Winter Wheat Using Hyperspectral. Remote Sensing

YANG Feifei, LIU Shengping, ZHU Yeping, LI Shijuan*

(Agricultural. Information Institute. Chinese Academy of Agricultural. Sciences/Key Laboratory of Agri-information Service Technology. Ministry of Agriculture and Rural. Affairs. Beijing 100081, China)

Abstract: The frequent occurrence of waterlogging stress in winter wheat not only seriously affects regional. food security and ecological. security, but also threatens social. and economic stability and sustainable development. In order to identify the waterlogging stress level of winter wheat, a waterlogging stress gradient pot experiment was set up in this research. Three factors were controlled: waterlogging stress level (control, slight waterlogging, severe waterlogging), stress duration (5 days, 10 days, 15 days) and wheat variety (YF4, JM31, JM38). Leaf and canopy hyperspectral. data were measured by using ASD Field Spec3 and Gaiasky-mini2 imaging spectrometer, respectively. The data were collected from the first waterlogging day of winter wheat. The sunny and windless weather was selected and measured every 7 days until the wheat was mature. Combined with vegetation index, normalized mean distance and spectral. derivative difference entropy, if winter wheat was under waterlogging stress was monitored and stress level was identified. The results showed that: 1) the spectral. response characteristics of winter wheat under waterlogging stress changed significantly in RW, RE, NIR and 1650—1800 nm region, which may be due to the sensitivity of these regions to physiological. parameters affecting the spectral. response characteristics, such as pigment, nutrient, leaf internal. structure, etc; 2) the simple ratio pigment index SRPI was the optimal. vegetation index for identifying the waterlogging stress of winter wheat. The excellent performance of this vegetation index may come from its extreme sensitivity to the epoxidation state and photosynthetic efficiency of the xanthophyll cycle pigment; 3) the red light absorption valley (RW: 640—680 nm) region was the optimal. region for identifying waterlogging stress level. In RW region, waterlogging stress level of winter wheat could be determined by the spectral. derivative difference entropy at heading, flowering and filling stages. The greater the level of waterlogging stress, the greater the spectral. derivative difference entropy. This may be due to the fact that the RW region was more sensitive to pigment content, and the spectral. derivative difference entropy could reduce the effects of spectral. noise and background. This study could provide a new method for monitoring waterlogging stress, and would have a good application prospect in the precise prevention and control of waterlogging stress. There are still shortcomings in this study, such as the difference between the pot experiment and the actual. field environment, the lack of independent experimental. verification, etc. Next research could add pot and field experiments, combine with cross-validation, to further verify the feasibility of this research method.

Key words: hyperspectral. remote sensing; waterlogging stress; vegetation index; spectral. derivative difference entropy; winter wheat

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作者簡介:楊菲菲(1995—),女,博士研究生,研究方向為農業信息技術。E-mail:yangfeifei61@163.com。

*通訊作者:李世娟(1975—),女,博士,研究員,研究方向為農業信息技術。電話:010-82109916。E-mail:lishijuan@caas.cn。

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