(2021.1.4 iPlants)
大豆馴化起源于中國,隨后廣泛傳播于世界各地,為人類提供了主要的植物油料和蛋白資源,是重要的糧食經濟作物。對大豆馴化和改良過程的了解有助于促進基因組學輔助的育種工作。2021年1月4日,Nature Communicatons雜志在線發表了來自韓國生物科學與生物技術研究所Soon-Chun Jeong課題組題為“The patterns of deleterious mutations during the domestication of soybean”的研究論文。該研究組提供了781種大豆品種的1060萬個單核苷酸多態性和140萬個插入缺失的全基因組變異圖譜,并表明大豆馴化過程中有害突變一直在減少。
大豆馴化起源于中國,隨后廣泛傳播于世界各地,為人類提供了主要的植物油料和蛋白資源,是重要的糧食經濟作物。對大豆馴化和改良過程的了解有助于促進基因組學輔助的育種工作。2021年1月4日,Nature Communicatons雜志在線發表了來自韓國生物科學與生物技術研究所Soon-Chun Jeong課題組題為“The patterns of deleterious mutations during the domestication of soybean”的研究論文。該研究組提供了781種大豆品種的1060萬個單核苷酸多態性和140萬個插入缺失的全基因組變異圖譜,并表明大豆馴化過程中有害突變一直在減少。
該研究分析了781種大豆品種(包括418種馴化大豆,345種野生大豆和18個天然雜種大豆)的高覆蓋率(> 13X)WGS數據,獲得了1060萬個單核苷酸多態性和140萬個插入缺失的全基因組變異圖。進一步分析表明,與野生大豆相比,馴化大豆的總體有害突變減少了7.1%,從地方品種到改良種質則進一步減少了1.4%。用這種資源進行基因型估算提高了大豆多樣性研究小組對種子蛋白和油性狀的全基因組關聯研究的作圖分辨率。因此結果表明,馴化和野生品種的自交繁殖方式都有助于減少馴化相對于野生大豆品種的突變負擔。故該研究有助于更好的設計雜交和自交結合,以有效地從育種程序中消除有害的等位基因,從而從野生大豆中選擇具有農學意義的重要未開發基因。