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文蛤CDK7基因克隆及其在不同品系生長發育中的表達分析

2021-04-15 20:56:36李秋潔陳愛華陳素華吳楊平張雨曹奕張志東田鎮
南方農業學報 2021年12期

李秋潔 陳愛華 陳素華 吳楊平 張雨 曹奕 張志東 田鎮

摘要:【目的】掌握文蛤(Meretrix meretrix)細胞周期蛋白依賴性激酶7(CDK7)基因(MmCDK7)的時空表達及在不同品系生長發育中的表達規律,從分子水平探究紅殼色文蛤新品系的生長優勢,為篩選文蛤生長相關基因及揭示其生長發育機制提供理論依據。【方法】利用RACE克隆MmCDK7基因cDNA序列,通過BLAST、ScanProsite、NetPhos 3.0 server及ExPASy等在線軟件進行生物信息學分析,使用實時熒光定量PCR檢測MmCDK7基因在文蛤不同組織和不同發育時期的表達情況,并比較同一養殖條件下紅殼色文蛤(簡稱紅文蛤)和黃殼色文蛤(簡稱黃文蛤)的殼長、殼長相對增長率及MmCDK7基因表達差異。【結果】MmCDK7基因cDNA序列全長1296 bp,其中,5'端非編碼區(5'-UTR)為83 bp,3'端非編碼區(3'-UTR)為196 bp,開放閱讀框(ORF)為1017 bp,共編碼338個氨基酸殘基。MmCDK7蛋白分子量約38.32 kD,理論等電點(pI)為8.78,包含絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶催化結構域(S_TKc)、酪氨酸激酶催化結構域(TyrKc)及與細胞周期蛋白結合有關的激酶結構域NRTALRE;而S_TKc結構域中有包含蛋白激酶ATP結合位點區域、絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶活化位點區域及T-loop環。MmCDK7氨基酸序列與蝦夷扇貝CDK7氨基酸序列高度同源,其相似性為75.00%;基于CDK7氨基酸序列相似性構建的系統發育進化樹顯示,文蛤與中國真蛸、長牡蠣、厚殼貽貝及蝦夷扇貝等軟體動物先聚為一支。MmCDK7基因在性腺、水管、外套膜和肝胰腺等組織中均有表達,以性腺中的相對表達量顯著高于其他組織(P<0.05,下同);MmCDK7基因在2種文蛤的8個發育時期均有表達,均以多細胞時期的相對表達量最高。在同一養殖條件下,除9月18日外,其他采樣時間點均表現為紅文蛤的殼長顯著大于黃文蛤,紅文蛤相對于黃文蛤的殼長增長率在2.79%~32.37%;除11月15日和11月30日外,其他采樣時間點均表現為紅文蛤的MmCDK7基因相對表達量顯著高于黃文蛤的相對表達量。【結論】MmCDK7基因屬于CDK家族成員,在細胞分裂旺盛的性腺及多細胞時期的相對表達量最高,且在生長速度較快紅文蛤中的相對表達量多數情況下顯著高于黃文蛤,故推測MmCDK7基因參與調控文蛤的早期生長發育過程。

關鍵詞: 文蛤;CDK7基因;基因克隆;時空表達;生長發育

中圖分類號: S968.317? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 文獻標志碼: A 文章編號:2095-1191(2021)12-3244-10

Cloning of CDK7 gene in Meretrix meretrix and its expression analysis on growth and development of different strains

LI Qiu-jie1,2, CHEN Ai-hua2*, CHEN Su-hua2, WU Yang-ping2, ZHANG Yu2,

CAO Yi2, ZHANG Zhi-dong2, TIAN Zhen1,2

(1Shanghai Ocean University/National Demonstration Center for Experimental Fisheries Science Education, Shanghai 201306, China; 2Jiangsu Institute of Marine Fisheries Research, Nantong, Jiangsu? 226007, China)

Abstract:【Objective】To master the spatiotemporal expression of cyclin dependent kinase 7 (CDK7) gene (MmCDK7) in Meretrix meretrix and the expression law in the growth and development process of different strains , so as to explore the growth advantages of new strains of red clam at the molecular level. It provided a theoretical basis for screening growth related genes of M. meretrix and revealing its growth and development mechanism. 【Method】The cDNA sequence of MmCDK7 gene was cloned by RACE. Bioinformatics analysis was carried out by BLAST,ScanProsite,NetPhos 3.0 server and ExPASy. The expression of MmCDK7 gene in different tissues and different developmental stages of M. meretrix was detected by real-time fluorescence quantitative PCR. The differences of shell length, relative growth rate of shell length and MmCDK7 gene expression between red clam and yellow clam were compared under the same culture conditions. 【Result】The total length of the cDNA sequence of MmCDK7 gene was 1296 bp, of which the 5 ' untranslated region (5'-UTR) was 83 bp, the 3 ' untranslated region (3'-UTR) was 196 bp, and the open reading frame (ORF) was 1017 bp, encoding 338 amino acid. The molecular weight of MmCDK7 protein was about 38.32 kD and the theoretical isoelectric point (pI) was 8.78. It included serine / threonine protein kinase catalytic domain (S_TKc), tyrosine kinase catalytic domain (TyrKc) and kinase domain NRTALRE related to cyclin binding. And S_ TKc domain contained protein kinase ATP binding site, serine / threonine protein kinase activation site and T-loop loop. The amino acid sequence of MmCDK7 was highly homologous with that of Mizuhopecten yessosensis, and its similarity was 75.00%. The phylogene-tic tree constructed based on the amino acid sequence similarity of CDK7showed that M. meretrix and molluscs such as Octopus sinensis, Crassostrea gigas,Mytilus coruscus and M. yessosensis first gathered into one branch. MmCDK7 gene was expressed in gonad, siphon, mantle and hepatopancreas, and the relative expression in gonad was significantly higher than that in other tissues (P<0.05, the same below). MmCDK7 gene was expressed in 8 developmental stages of two species, and the relative expression in multicellular stage was significantly higher than that in other stages. Under the same culture conditions, except September 18, the shell length of red clam was significantly longer than that of yellow clam, and the growth rate of red clam relative to yellow clam was 2.79%-32.37%. Except November 15 and November 30, the relative expression of MmCDK7 gene in red clam was significantly higher than that in yellow clam at other sampling time points. 【Conclusion】MmCDK7 gene belongs to CDK family. The relative expression of CDK7 gene in gonad and multicellular stage with vigorous cell division is the highest, and the relative expression of CDK7 gene in red clam with fast growth rate is significantly higher than that in yellow clam in most cases. Therefore, it is speculated that MmCDK7 gene is involved in regulating the early growth and development of M. meretrix.

Key words: Meretrix meretrix; CDK7 gene; gene cloning; spatiotemporal expression; growth and development

Foundation item: Jiangsu Fishery Science and Technology Major Project(D2018-1); Jiangsu Agricultural Independent Innovation Project [CX (20) 3194];Aquatic Varieties Preservation and Renewal Project of Jiangsu (2020-SJ-006-05); Basic Science Research Project of Nantong(JC2020118)

0 引言

【研究意義】文蛤(Meretrix meretrix)隸屬于軟體動物門(Mollusca)瓣鰓綱(Lamellibranchia)簾蛤目(Veneroida)簾蛤科(Veneridae),是我國傳統灘涂養殖的主要貝類之一。近年來,文蛤野生種質資源量逐年銳減,已出現近交衰退及種質下降等現象,導致文蛤苗種短缺且抗逆性差等問題頻出(宋文濤,2013)。細胞周期蛋白依賴性激酶7(Cyclin-dependent kinase,CDK7)是CDK家族中功能較特殊的成員(Malumbres,2014),主要參與生物體細胞的生長發育過程。因此,分析CDK7基因在文蛤生長過程中發揮的功能作用,對推進文蛤良種選育具有重要意義。【前人研究進展】CDK7屬于絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶家族,具有雙重功能:一方面,無活性的CDK7與相應周期蛋白Cyclin H結合,發生雙磷酸化后與MAT1結合,構成細胞周期蛋白依賴性激酶活化激酶,即CDK活化激酶(CAK),在哺乳動物體內參與CDK1、CDK2、CDK4及CDK6的激活磷酸化,進而調節細胞周期(Lolli and Johnson,2005;江艷,2010);另一方面,CDK7可作為轉錄因子TFⅡH的亞基組成成分,負責磷酸化RNA聚合酶Ⅱ大亞基的羧基末端結構域(CTD)及CDK9,在mRNA轉錄起始、延伸及共轉錄RNA成熟過程中發揮重要作用(Fisher,2005;Larochelle et al.,2012;張潔妤等,2013)。已有研究證實,CDK7基因在生物體細胞的生長發育過程中發揮重要作用,如線蟲(Caenorhabditis elegans)CDK7基因突變株不能激活mRNA轉錄,且通過RNAi可完全或接近完全抑制整個細胞周期進程(Matthew and Geraldine,2002);有選擇性破壞小鼠胚胎成纖維細胞中的CDK7基因,能有效阻礙細胞周期進程,造成早期胚胎死亡(Schachter and Fisher,2013)。此外,有研究表明CDK7基因可促進癌細胞增殖,通過抑制CDK7基因表達可造成mRNA的表達及轉錄因子活性降低,阻止多種腫瘤細胞的分裂與增殖,因此臨床醫學上將CDK7基因作為癌癥治療的一個潛在靶點(Wang et al.,2018;Sava et al.,2020)。在水生生物中,已有學者對斑馬魚(Danio rerio)(Liu et al.,2007)、斑節對蝦(Penaeus monodon)(Phinyo et al.,2014)及三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)(賈復龍等,2016)等物種的CDK7基因進行初步研究,但針對貝類的研究較少,僅Adzigbli等(2020)對馬氏珠母貝(Pinctada martensi)CDK7基因的免疫作用機制進行研究,并未涉及貝類的生長發育。【本研究切入點】江蘇省文蛤良種場經過多年的優良品種選育,已培育出紅殼色文蛤新品系,與自然群體黃殼色文蛤相比,紅殼色文蛤具有生長速度更快、成活率和抗逆性更高的優勢(王超等,2016;張雨等,2018),但有關CDK7基因在文蛤生長發育中的作用機制尚未明確。【擬解決的關鍵問題】利用RACE克隆文蛤CDK7基因(MmCDK7)全長,并通過實時熒光定量PCR檢測MmCDK7基因在2種文蛤群體不同組織和不同發育時期的表達情況,分析該基因表達規律與文蛤殼長變化的關系,以期從分子水平探究紅殼色文蛤新品系的生長優勢,為篩選文蛤生長相關基因及揭示其生長發育機制提供理論依據。

1 材料與方法

1. 1 試驗材料

供試紅殼色文蛤(簡稱紅文蛤)取自于江蘇省文蛤良種場選育的新品系,黃殼色文蛤(簡稱黃文蛤)為江蘇省如東海區的野生群體。紅文蛤是以江蘇南部沿海自然文蛤的5000粒紅殼色文蛤為育種基礎群體,以“紅殼色+生長”為目標性狀,通過閉鎖群體選育方式獲得的子代選育系,每代留種率大于0.01%。

1. 2 樣品采集

挑選4粒黃文蛤成貝,分別采集其肝胰腺、閉殼肌、外套膜、水管、鰓及性腺等組織進行RNA提取;2020年7月選取貝殼完整、健康且性腺成熟的紅文蛤和黃文蛤為親貝,在水溫27~29 ℃、鹽度29‰左右時進行催產。利用顯微鏡觀察跟蹤發育過程,分別選取紅文蛤和黃文蛤受精卵、多細胞、囊胚期、原腸胚、擔輪幼蟲、D形幼蟲、殼頂幼蟲和稚貝等8個胚胎發育時期的樣品用于總RNA提取。

將2020年7月繁育的紅文蛤和黃文蛤稚貝置于1.5 t的缸中進行養殖,每缸苗種密度相同,持續充氧,每天換水,投喂相同餌料。紅文蛤和黃文蛤各設3組平行。養殖試驗于2020年9月開始,9月每周取樣1次,10和11月每2周取樣1次。每次每組隨機取樣40粒,測量其殼長,并計算對應殼長相對增長率(R)。測量結束后,取文蛤全組織,經PBS(0.01 mol/L)洗滌,液氮速凍,-80 ℃保存備用。

R(%)=(Lt-Ly)/Ly×100

式中,Lt為紅文蛤殼長,Ly為黃文蛤殼長。

1. 3 MmCDK7基因cDNA序列克隆及測序

從構建的轉錄組文庫中檢索MmCDK7基因EST序列,設計并合成5'-RACE和3'-RACE特異性擴增引物(表1)。使用RNA提取純化試劑盒[天根生化科技(北京)有限公司]提取文蛤性腺總RNA,然后以RACE試劑盒(Clontech公司)反轉錄合成cDNA第一鏈。參照高曉艷(2015)的方法進行RACE擴增,擴增產物經1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測后割膠回收純化,純化產物連接至pMD18-T載體,37 ℃過夜培養后轉化大腸桿菌DH5α感受態細胞,篩選陽性克隆送至生工生物工程(上海)股份有限公司測序。

1. 4 生物信息學分析

利用NCBI中的ORF Finder(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/)進行MmCDK7基因開放閱讀框(ORF)尋找,并翻譯成氨基酸序列;使用BLAST(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)進行氨基酸序列同源比對分析;采用ScanProsite(https://prosite.expasy.org/scanprosite/)預測MmCDK7蛋白結構域;運用NetPhos 3.0 server(http://www.cbs.dtu.dk/servi-ces/NetPhos-3.0/)預測MmCDK7蛋白磷酸化位點;采用ExPASy(https://web.expasy.org/compute_pi/)預測MmCDK7蛋白分子量及其理論等電點(pI);利用DNAMAN進行多序列比對分析,并以MEGA 5.0中的鄰接法(Neighbor-joining method,NJ)構建系統發育進化樹。

1. 5 MmCDK7基因表達分析

使用RNA提取純化試劑盒分別提取文蛤成體不同組織及不同胚胎發育時期的總RNA,通過NanoDrop 2000微量紫外分光光度計和1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測其濃度和質量;利用FastKing cDNA第一鏈合成試劑盒將總RNA反轉錄合成cDNA,-20 ℃保存備用。根據MmCDK7基因序列設計實時熒光定量PCR擴增引物(MmCDK7-F/MmCDK7-R)(表1),以β-actin基因為內參基因,使用Applied Biosystems熒光定量PCR儀測定MmCDK7基因的表達情況。依據SuperReal熒光定量預混試劑盒[天根生化科技(北京)有限公司]說明,配制實時熒光定量PCR反應體系20.0 μL:2×SuperReal Premix Plus 10.0 μL,正、反向引物各0.6 μL, 50×ROX Reference Dye 2.0 μL,cDNA模板1.0 μL,ddH2O 5.8 μL。擴增程序:95 ℃預變性15 min;95 ℃ 10 s,58 ℃ 31 s,72 ℃ 31 s,進行40個循環,收集熒光信號。95 ℃ 15 s,60 ℃ 1 min;95 ℃ 30 s,60 ℃ 15 s,進行融解曲線分析。采用2–ΔΔCT法換算目的基因相對表達量,并以SPSS 20.0進行單因素方差分析(One-way ANOVA)。

2 結果與分析

2. 1 MmCDK7基因克隆及測序分析

通過RACE克隆得到MmCDK7基因cDNA序列全長1296 bp,其中,5'端非編碼區(5'-UTR)為83 bp,3'端非編碼區(3'-UTR)為196 bp,ORF為1017 bp,共編碼338個氨基酸殘基(圖1)。MmCDK7蛋白分子量約38.32 kD,pI為8.78,包含絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶催化結構域(S_TKc)(8~291 aa)、酪氨酸激酶催化結構域(TyrKc)(8~291 aa)及與細胞周期蛋白結合有關的激酶結構域NRTALRE。S_TKc結構域中包含蛋白激酶ATP結合位點區域(14~38 aa)、絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶活化位點區域(129~141 aa)及T-loop環(DFGLAKFFGSPNRIYTHQVVTRWYRCPE,151~178 aa)。此外,NetPhos 3.0預測結果顯示,MmCDK7蛋白存在12個磷酸化位點,包括6個絲氨酸磷酸化位點、4個蘇氨酸磷酸化位點及2個酪氨酸磷酸化位點。

從GenBank搜索參考物種的CDK7氨基酸序列(表2),利用DNAMAN進行多序列比對分析,結果(圖2)顯示,MmCDK7氨基酸序列與蝦夷扇貝(Mizuhopecten yessosensis)的CDK7氨基酸序列高度同源,其相似性為75.00%;與中國真蛸(Octopus sinensis)、厚殼貽貝(Mytilus coruscus)、斑馬魚、黑腹果蠅(Drosophila melanogaster)及木蟻(Camponotus floridanus)的CDK7氨基酸序列相似性分別為71.09%、72.27%、66.09%、61.19%和71.89%,且具有相同活化/結合位點的保守結構域,包括核苷酸結合位點(14~22 aa)、ATP結合位點(37 aa)及質子受體活化位點(133 aa)。基于CDK7氨基酸序列相似性構建的系統發育進化樹(圖3)顯示,文蛤首先與中國真蛸、長牡蠣(Crassostrea gigas)、厚殼貽貝及蝦夷扇貝等軟體動物聚為一支,然后與斑馬魚、大山雀(Parus major)及獼猴(Macaca mulatta)等脊索動物聚為一大支,而斑節對蝦、三疣梭子蟹等節肢動物聚為另一分支。

2. 2 MmCDK7基因在文蛤不同組織中的表達情況

通過實時熒光定量PCR檢測MmCDK7基因在文蛤成體不同組織中的表達情況,結果(圖4)表明,MmCDK7基因在性腺、水管、外套膜和肝胰腺等組織中均有表達,但各組織中的相對表達量存在差異,以性腺中的相對表達量最高,顯著高于其他組織(P<0.05,下同),其次是斧足、外套膜和鰓等組織。

2. 3 MmCDK7基因在文蛤不同發育時期的表達情況

由圖5可看出,MmCDK7基因在紅文蛤和黃文蛤不同發育時期的表達情況呈現出相同的變化趨勢。2種文蛤在多細胞時期的MmCDK7基因相對表達量均達最高值,且顯著高于擔輪幼蟲、D形幼蟲、殼頂幼蟲及推貝等4個發育時期的相對表達量;發育至擔輪幼蟲時期,其相對表達量顯著下降,稚貝時期的相對表達量最低。

2. 4 MmCDK7基因在不同文蛤品種間的表達差異

在同一養殖條件下,紅文蛤和黃文蛤的殼長除了在9月18日的采樣中無顯著差異(P>0.05,下同)外,其他采樣時間點均表現為紅文蛤的殼長顯著大于黃文蛤,且在養殖后期(11月中下旬)這種差異達極顯著水平(P<0.01)(圖6)。在殼長相對增長率方面,紅文蛤相對于黃文蛤的殼長增長率在2.79%~32.37%,且部分養殖時期存在顯著差異(圖7)。同步檢測MmCDK7基因在文蛤生長過程中的表達變化規律,結果(圖8)發現除了在11月15日和11月30日的采樣中2種文蛤的MmCDK7基因相對表達量無顯著差異外,其他采樣時間點均表現為紅文蛤的MmCDK7基因相對表達量顯著高于黃文蛤的相對表達量。

3 討論

CDK屬于絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶家族,在真核生物細胞周期進程中發揮著重要的調控作用,其活性的獲得主要通過以下2種途徑實現:一方面,CDK的T-loop磷酸化有助于底物進入活性位點,使激酶構象發生變化,進而調節激酶活性(Wu et al.,2003);另一方面,與對應的周期蛋白調節亞基相結合,繼而表現出不同的激酶活性(Wood and Endicott,2018;Peissert et al.,2020)。CDK7是CDK家族中的特殊成員,其激活需T-loop的雙重磷酸化,以及與Cyclin H和MAT1組成復合體,參與細胞周期調控;也可作為轉錄因子TFⅡH的亞基,調節CTD激酶活性,發揮轉錄調控作用(Martinez et al.,1997;Ebmeier et al.,2017)。本研究通過克隆MmCDK7基因cDNA序列并進行測序分析,結果表明,MmCDK7基因具有CDK基因家族典型的結構特征,包括S_TKc結構域、TyrKc結構域、T-loop環、ATP結合位點及調節亞基Cyclin的結合部位NRTALRE等。通過與其他物種的CDK氨基酸序列進行多序列比對分析,發現MmCDK7氨基酸序列與蝦夷扇貝的CDK7氨基酸序列高度同源(相似性為75.00%),與斑馬魚和黑腹果蠅的相似性最低,說明CDK7基因在文蛤及其他物種間具有一定的保守性,均含有CDK家族的典型結構域。基于CDK7氨基酸序列相似性構建的系統發育進化樹顯示,文蛤與中國真蛸、長牡蠣、厚殼貽貝及蝦夷扇貝等軟體動物聚為一支,親緣關系較近。可見,克隆獲得的MmCDK7基因屬于CDK家族成員,可能具有類似于其他物種CDK7基因的功能。

細胞分裂活動的有序進行離不開CDK調控,其中,CDK7通過發揮CAK活性在細胞周期調控過程中發揮重要作用(Ganuza et al.,2012)。CDK7基因可特異性調控細胞分裂,本研究通過實時熒光定量PCR檢測MmCDK7基因在文蛤成體各組織中的表達情況,結果發現MmCDK7基因表達具有明顯的組織表達特異性,以在性腺中的相對表達量顯著高于在其他組織中的相對表達量,可能是由于性腺部位的細胞分裂較旺盛,因此MmCDK7基因在性腺部位高表達,與賈復龍等(2016)研究發現CDK7基因在三疣梭子蟹卵巢/精巢中表達量最高的結論一致。此外,MmCDK7基因在文蛤斧足和外套膜中的相對表達量僅次于性腺,可能是由于文蛤屬于埋棲型貝類,需依靠斧足的伸縮活動進行潛鉆穴居和運動,而外套膜與幼蟲貝殼生長關系密切(王如才,2008;王曉梅,2008),也說明MmCDK7基因在這2個組織的生長發育過程中發揮重要作用。

CDK7在生物體正常生長發育過程中也發揮著至關重要的作用。在斑馬魚的早期胚胎發育過程中,CDK7基因在胚胎動物極的各細胞中均普遍存在,且其過表達可補救因Cyclin H失活造成的細胞凋亡或胚胎畸形(儲琳等,2006;劉清云,2006);通過基因敲除技術分析CDK7基因在小鼠體內的生理作用,結果發現CDK7基因缺失能導致體外細胞分裂停止及體內早期胚胎死亡(Ganuza et al.,2012);在適宜溫度條件下,熱帶爪蟾發育速度始終快于非洲爪蟾,與CDK7基因表達量高于非洲爪蟾密切相關(Tanaka et al.,2017)。此外,有研究證實抑制CDK7基因表達能阻止多種腫瘤細胞的分裂與增殖(Wang et al.,2016;Sava et al.,2020),因此可將CDK7基因作為癌癥治療的潛在靶點。本研究對MmCDK7基因在紅文蛤和黃文蛤不同發育時期的表達情況進行分析,結果發現MmCDK7基因在2種文蛤的多個發育階段均有表達,以多細胞時期的相對表達量最高,可能是由于這一時期的細胞分裂活動較旺盛,細胞數目增加,需更多的MmCDK7基因來調控細胞有絲分裂。D形幼蟲時期是文蛤幼蟲消化道形成,開始攝取外源食物,形成斧足和平衡囊等組織器官的關鍵時期(李太武等,2006;王如才,2008),因此也需要大量MmCDK7基因以滿足機體生長所需;之后MmCDK7基因表達下調,至稚貝時期達最低值,究其原因可能是此時文蛤幼蟲生長發育趨于穩定,對MmCDK7基因表達需求量相對較低。

目前,針對CDK7基因功能已有相關研究報道。在斑馬魚(劉清云,2006)、斑節對蝦(Phinyo et al.,2014)和馬氏珠母貝(Adzigbli et al.,2020)等物種中,發現CDK7基因參與其卵巢/精巢發育、免疫調節及胚胎發育過程,但未見CDK7基因與機體生長發育間的關聯性研究。本研究在同一養殖條件下的生長試驗中發現,除了個別時間點外,紅文蛤殼長顯著大于黃文蛤,同時結合紅文蛤較黃文蛤的殼長相對增長率,可確定紅文蛤的生長速度快于黃文蛤,且其生長優勢在此次養殖后期更明顯。與此同時,紅文蛤MmCDK7基因的相對表達量在多數情況下顯著高于黃文蛤的相對表達量,與2種文蛤的殼長對比結果相吻合,故推測紅文蛤較黃文蛤生長快速可能與其MmCDK7基因表達量水平較高存在一定聯系。

4 結論

MmCDK7基因屬于CDK家族成員,在細胞分裂旺盛的性腺及多細胞時期的相對表達量最高,且在生長速度較快紅文蛤中的相對表達量多數情況下顯著高于黃文蛤,故推測MmCDK7基因參與調控文蛤的早期生長發育過程。

參考文獻:

儲琳,劉清云,錢旻,嚴緣昌,李逸平. 2006. 斑馬魚cdk7和cyclin H基因的原核表達及多克隆抗體的制備與鑒定[J]. 細胞生物學雜志,28(6):849-854. [Chu L,Liu Q Y,Qian M,Yan Y C,Li Y P. 2006. Prokaryotic expression and polyclonal antibodies preparation of cdk7 and cyclin H in zebrafish[J]. Chinese Journal of Cell Biology,28(6):849-854.] doi:10.3969/j.issn.1674-7666.2006.06.015.

高曉艷. 2015. 文蛤4個生長相關基因克隆、時空表達及與生長的相關性分析[D]. 寧波:浙江萬里學院. [Gao X Y. 2015. Cloning,spatiotemporal expression and association analysis of 4 genes with growth traits in hard clam Meretrix meretrix[D]. Ningbo:Zhejiang Wanli University.]

賈復龍,孟憲亮,劉萍,李健,高保全. 2016. 三疣梭子蟹細胞Cdk7基因克隆及其在卵巢發育中的表達[J]. 中國水產科學,23(5):1032-1040. [Jia F L,Meng X L,Liu P,Li J,Gao B Q. 2016. Cloning and expression analysis of Cdk7,a gene involved in ovarian development,from swimming crab (Portunus trituberculatus)[J]. Journal of Fishery Sciences of China,23(5):1032-1040.] doi:10.3724/ SP.J.1118.2016.15401.

江艷. 2010. BmCycH基因及其在家蠶中表達特性的研究[D]. 杭州:浙江理工大學. [Jiang Y. 2010. Study on expression characteristics of BmCycH gene in silkworm,Bombyx mori[D]. Hangzhou:Zhejiang Sci-Tech University.] doi:10.7666/d.y1747463.

李太武,蘇秀榕,季延濱,劉保忠. 2006. 不同發育階段文蛤同工酶基因的表達研究[J]. 海洋學報(中文版),28(5):162-166. [Li T W,Su X R,Ji Y B,Liu B Z. 2006. Stu-dies on the expressions of isozyme during ontogeny of Meretrix meretrix[J]. Acta Oceanologica Sinica,28(5):162-166.] doi:10.3321/j.issn:0253-4193.2006.05.022.

劉清云. 2006. 斑馬魚中囊胚發育相關基因的克隆及功能研究[D]. 上海:中國科學院研究生院. [Liu Q Y. 2006. Cloning and function of genes related to blastocyst deve-lopment in zebrafish[D]. Shanghai:Graduate School of Chinese Academy of Sciences.]

宋文濤. 2013. 文蛤的養殖和研究現狀[J]. 山東工業技術,(11):246. [Song W T. 2013. Cultivation and research status of the clam Meretrix meretrix[J]. Shandong Industrial Technology,(11):246.] doi:10.16640/j.cnki.37-1222/ t.2013.11.107.

王超,陳愛華,曹奕,吳楊平,張雨,姚國興,蔡永祥. 2016. 6個不同海域文蛤地理群體的親緣關系分析[J]. 海洋漁業,38(3):262-272. [Wang C,Chen A H,Cao Y,Wu Y P,Zhang Y,Yao G X,Cai Y X. 2016. Genetic relationship analysis of six Meretrix meretrix populations from diffe-rent sea areas[J]. Marine Fisheries,38(3):262-272.] doi:10.13233/j.cnki.mar.fish.2016.03.005.

王如才. 2008. 海水貝類養殖學[M]. 青島:中國海洋大學出版社. [Wang R C. 2008. Science of marine shellfish culture[M]. Qingdao:China Ocean University Press.]

王曉梅. 2008. 文蛤(Meretrix meretrix)幼蟲生長發育相關基因的克隆和功能分析[D]. 青島:中國科學院研究生院. [Wang X M. 2008. Molecular cloning and functional analysis of genes involved in larval development in clam Meretrix meretrix[D]. Qingdao:Graduate School of Chinese Academy of Sciences.]

張潔妤,張靜怡,黃孝天. 2013. TFⅡH參與調控RNA聚合酶Ⅱ介導的mRNA轉錄的研究進展[J]. 南昌大學學報(醫學版),53(7):72-75. [Zhang J Y,Zhang J Y,Huang X T. 2013. Advances in studies of TFⅡH in the regulation of RNA polymeraseⅡmediated mRNA transcription[J]. Journal of Nanchang University (Medical Sciences),53(7):72-75.] doi:10.3969/j.issn.1000-2294.2013.07.025.

張雨,陳愛華,吳楊平,曹奕,姚國興. 2018. 紅殼色文蛤選育子代養殖效果分析[J]. 江蘇農業科學,46(6):145-147. [Zhang Y,Chen A H,Wu Y P,Cao Y,Yao G X. 2018. Analysis of breeding offspring culture effect of red-shelled Meretrix meretrix[J]. Jiangsu Agricultural Sciences,46(6):145-147.] doi:10.15889/j.issn.1002-1302.2018.06. 037.

Adzigbli L,Zhao Z H,Wang Z M,Yang C Y,Hao R J,Deng Y W. 2020. Characterization of cyclin dependent kinase-7 and its differential response to grafting challenge in the black shell colored selected line of pearl oyster Pinctada fucata martensii[J]. Fish and Shellfish Immunology,101:277-283. doi:10.1016/j.fsi.2020.04.008.

Ebmeier C C,Erickson B,Allen B L,Allen M A,Kim H,Nova F,Jacobsen J R,Liang K,Shilatifard A,Dowell R D,Old W M,Bentley D L,Taatjes D J. 2017. Human TFIIH kinase CDK7 regulates transcription-associated chromatin modifications[J]. Cell Reports,20(5):1173-1186. doi:10.1016/j.celrep.2017.07.021.

Fisher R P. 2005. Secrets of a double agent:CDK7 in cell-cycle control and transcription[J]. Journal of Cell Science,118(22):5171-5180.

Ganuza M,Sáiz-Ladera C,Ca?amero M,Gómez G,Schneider R,Blasco M A,Pisano D,Paramio J M,Santamaría D,Barbacid M. 2012. Genetic inactivation of Cdk7 leads to cell cycle arrest and induces premature aging due to adult stem cell exhaustion[J]. The EMBO Journal,31(11):2498-2510. doi:10.1038/emboj.2012.94.

Larochelle S,Amat R,Glover-Cutter K,Sansó M,Zhang C,Allen J J,Shokat K M,Bentley D L,Fisher R P. 2012. Cyclin-dependent kinase control of the initiation-to-elongation switch of RNA polymerase II[J]. Nature Structural and Molecular Biology,19(11):1108-1115. doi:10.1038/nsmb.2399.

Liu Q Y,Wu Z L,Lv W J,Yan Y C,Li Y P. 2007. Developmental expression of Cyclin H and Cdk7 in zebrafish:The essential role of Cyclin H during early embryo deve-lopment[J]. Cell Research,17(2):163-173. doi:10.1038/sj.cr.7310144.

Lolli G,Johnson L N. 2005. CAK-Cyclin-dependent activa-ting kinase:A key kinase in cell cycle control and a target for drugs?[J]. Cell Cycle,4(4):565-570. doi:10.4161/cc.4.4.1607.

Malumbres M. 2014. Cyclin-dependent kinases[J]. Genome Biology,15:122. doi:10.1186/gb4184.

Martinez A M,Afshar M,Martin F,Cavadore J C,Labbé J C,Dorée M. 1997. Dual phosphorylation of the T-loop in Cdk7:Its role in controlling cyclin H binding and CAK activity[J]. The EMBO Journal,16(2):343-354. doi:10.1093/emboj/16.2.343.

Matthew R W,Geraldine S. 2002. cdk-7 is required for mRNA transcription and cell cycle progression in Caenorhabditis elegans embryos[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,99(8):5527-5532. doi:10.1073/pnas.082618399.

Peissert S,Schlosser A,Kendel R,Kuper J,Kisker C. 2020. Structural basis for CDK7 activation by MAT1 and Cyclin H[J]. Proceedings of the National Academy of Scien-ces of the United States of America,117(43):26739-26748. doi:10.1073/pnas.2010885117.

Phinyo M,Nounurai P,Hiransuchalert R,Padermsak J,Si-rawut K. 2014. Characterization and expression analysis of Cyclin-dependent kinase 7 gene and protein in ovaries of the giant tiger shrimp Penaeus monodon[J]. Aquaculture,432:286-294. doi:10.1016/j.aquaculture.2014.05. 022.

Sava G P,Fan H L,Coombes R C,Buluwela L,Ali S. 2020. CDK7 inhibitors as anticancer drugs[J]. Cancer Metastasis Reviews,39(3):805-823. doi:10.1007/s10555-020-09885-8.

Schachter M M,Fisher R P. 2013. The CDK-activating kinase Cdk7[J]. Cell Cycle,12(20):3239-3240. doi:10.4161/cc.26355.

Tanaka T,Ochi H,Takahashi S,Ueno N,Taira M. 2017. Genes coding for cyclin-dependent kinase inhibitors are fragile in Xenopus[J]. Developmental Biology,426(2):291-300. doi:10.1016/j.ydbio.2016.06.019.

Wang C,Jin H J,Gao D M,Wang L Q,Evers B,Xue Z,Jin G Z,Lieftink C,Beijersbergen R L,Qin W X,Bernards R. 2018. A CRISPR screen identifies CDK7 as a therapeutic target in hepatocellular carcinoma[J]. Cell Research,28(6):690-692. doi:10.1038/s41422-018-0020-z.

Wang Q H,Li M H,Zhang X L,Huang H,Huang J F,Ke J,Ding H F,Xiao J Z,Shan X H,Liu Q Q,Bao B J,Yang L. 2016. Upregulation of CDK7 in gastric cancer cell promotes tumor cell proliferation and predicts poor pro-gnosis[J]. Experimental & Molecular Pathology,100(3):514-521. doi:10.1016/j.yexmp.2016.05.001.

Wood D J,Endicott J A. 2018. Structural insights into the functional diversity of the CDK-cyclin family[J]. Royal Society Open Biology,8(9):108112. doi:10.1098/rsob. 180112.

Wu S Y,McNae I,Kontopidis G,McClue S J,McInnes C,Stewart K J,Wang S D,Zheleva D,Marriage H,Lane D P,Taylor P,Fischer P M,Walkinshaw M D. 2003. Discovery of a novel family of CDK inhibitors with the program LIDAEUS:Structural basis for ligand-induced disordering of the activation loop[J]. Structure,11(4):399-410. doi:10.1016/S0969-2126(03)00060-1.

(責任編輯 陳德元)

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