石云雷
此前最受關注的是新冠病毒刺突蛋白上的D614G突變,去年6月,該變體成為全球范圍內最主要的新冠病毒,能促進病毒進入人類細胞。但它并不位于受體結合域,因此不會影響疫苗的效果。但近期,一些新出現的新冠病毒突變毒株帶來了更大的威脅。
例如,在英國出現的有7個突變位于刺突蛋白上,其中關鍵的突變N501Y就存在于受體結合域,且在與病毒結合的序列中。它能增加新冠病毒與人細胞ACE2受體的親和力,加快病毒在人群中的傳播。除此之外,其刺突蛋白上的兩個氨基酸丟失,或可以幫助其逃避免疫反應;而P681H 突變可能還會增強它與細胞的融合能力。
但相比之下,在南非發現的501.V2突變株情況更加嚴重。它的刺突蛋白上存在9個突變,其中3個位于刺突蛋白的受體結合域,分別是N501Y、K417N和E484K。尤其值得注意的是,E484K也位于受體結合域的結合序列中。

3D打印的新冠病毒的刺突蛋白
前期檢測顯示,這一突變與病毒逃脫綜合性抗體的能力相關,可能會影響一些靶向刺突蛋白疫苗的效果。此外,501.V2突變株的刺突蛋白上還存在3個氨基酸的丟失,這可能會影響新冠病毒的抗原性,進而導致病毒出現“逃逸突變”,逃避單克隆抗體(單一的特異性抗體,能與刺突蛋白上特定的序列結合)的免疫反應。
根據WHO官網的數據,截至1月12日,B.1.1.7突變株已傳播到了50多個國家,它的傳播速度比此前傳播的其他新冠病毒株更快。另外截至目前,501.V2突變株已蔓延到29個國家。南非科學家和官員表示,501.V2突變株在年輕人中的流行度更高,相比于其他突變株,更容易造成嚴重的疾病,還可能造成“重大的再感染風險”。南非衛生部也表示,這種突變株可能正在推動南非的第二波新冠大流行,因為它比其他早期突變株的傳播速度更快。
近期,發表于預印本平臺bioRxiv的多項研究,測試了目前使用的新冠疫苗、單克隆抗體和治療性血清對B.1.1.7突變株和501.V2突變株的作用效果。研究顯示,當前的疫苗或許還對B.1.1.7突變株有效,但它們對501.V2突變株以及一些新的突變株的情況,或不容樂觀。
1月19日,輝瑞公司和BioNTech在預印本平臺bioRxiv上公布了BNT162b2疫苗對在英國發現的B.1.1.7突變株刺突蛋白的中和效果。他們利用水皰性口炎病毒(VSV)構建了假病毒模型,即在病毒表面表達B.1.1.7突變株完整的刺突蛋白,并以此驗證了BNT162b2接種個體的血清對它的中和效力。結果顯示,血清的中和活性沒有明顯降低,因此這一突變株或許不會影響BNT162b2疫苗產生的免疫保護。目前,這項研究還有待同行評議。
緊隨其后的是兩項評估501.V2突變株的研究(目前同樣在bioRxiv平臺上等待同行評議),來自美國和南非的研究人員分別測試了治療性血清、單克隆抗體對該突變株的抑制能力。

mRNA疫苗介導產生的多種抗體在新冠病毒受體結合域上的作用位點
其中,美國加州理工學院、洛克菲勒大學和NIH的科學家分析了mRNA-1273疫苗和BNT162b2疫苗介導的免疫反應對501.V2突變株的中和效果。他們分別給14位和6位志愿者接種了mRNA-1273和BNT162b2疫苗,并收集和分析了他們的血清。在第2劑疫苗注射的8周后,志愿者血清中出現了很高的抵抗新冠病毒刺突蛋白、受體結合區域的特異性IgM和 IgG抗體。
他們通過在HIV-1型病毒構建了假病毒模型,并評估了志愿者血清對10種突變的刺突蛋白的中和活性,其中包括N501Y(B1.1.7突變株)、K417N、E484K以及3個基因突變的組合(501Y.V2突變株)。結果顯示,與沒有突變的情況相比,血清對E484K、N501Y以及K417N:E484K:N501Y組合突變的刺突蛋白的中和活性出現了顯著降低,分別是3:1、2.5:1.3和3:1.1。
除此之外,他們還評估了記憶B細胞分泌的中和性抗體(共84種)對存在突變的病毒受體結合域突變的中和活性。有22種抗體(占比26%)對至少有一個突變的受體結合域的中和活性降低了5倍以上。

接種兩種疫苗后的血清,對3種突變的刺突蛋白的中和活性降低
而另一項由南非國家傳染病研究所(NICD)的科學家發表的研究,也得到了類似的結論。他們選擇了44份康復者的血清(其中22份血清的抗體濃度更高)進行了研究,分析了這些血清對病毒的受體結合域和501.V2突變株的中和活性。研究顯示,27%的血清對比具有單一突變的受體結合域的假病毒,喪失了中和活性。而對501.V2突變株的評估顯示,近一半的血清沒有中和活性,有一些血清的中和活性降低達86倍。
在單克隆抗體中和效應的實驗中,南非的研究人員評估了12種抗體(第1類)對假病毒上刺突蛋白K417N突變,以及8種抗體(第2類)、5種納米抗體對E484K突變的中和活性。與沒有突變相比,第1類抗體的濃度提高2.5倍時,仍無法中和假病毒上K417N突變的刺突蛋白。第2類抗體對E484K突變的受體結合域的中和活性也明顯降低。
這一結果顯示,501.V2突變株能逃避主要抗體的中和反應。此外,他們還評估了501.V2突變株的刺突蛋白(抗原結構)上3個氨基酸丟失造成的影響。實驗顯示,針對整個抗原結構的抗體的中和反應也會減弱。
美國的研究人員評估了17種最具治療潛力的單克隆抗體對假病毒上12種刺突蛋白突變(分別是A475V、E484K、Q493R、R346S、N439K、N440K、K417N、Y453F、S477R、N501Y、D614G、R683G突變)的中和活性。測試結果顯示,這些單克隆抗體對K417N、E484K、N501Y 突變的中和活性均降低了。其中,有9種和4種單克隆抗體分別對存在E484K突變和N501Y突變的受體結合域(RBD)的中和活性下降超10倍,還有5種對K417N突變新冠假病毒中和活性減弱。而這些正是南非501Y.V2突變株的刺突蛋白上關鍵的3個突變點。
針對上述的實驗結果,兩個研究團隊均表示,需要測試臨床使用的單克隆抗體對其他新冠突變株的中和活性,而其中有很多或已失去了對501.V2突變株的中和活性。此外,我們還需要定期去更新靶向新冠病毒刺突蛋白的mRNA疫苗,以避免其潛在的臨床療效喪失。
除此之外,大多數曾感染新冠病毒的康復患者對501Y.V2突變株的中和活性很小,或者無法檢測到對其的中和活性,因此很有可能出現新冠病毒感染復陽。南非的研究人員還提到,在巴西發現的一種新冠病毒突變株存在一些關鍵的突變,可能增加其對中和性抗體的抗性,而我們應該更多地關注著它和501Y.V2突變株。