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鱖不同亞型瘦素受體基因克隆與表達分析

2021-07-26 13:53:24魏君冉梁旭方徐晶蔡文靜

魏君冉,梁旭方,徐晶,蔡文靜

華中農業大學水產學院/華中農業大學鱖魚研究中心/農業農村部淡水生物繁育重點實驗室/湖北省名優魚育種與健康養殖工程技術研究中心,武漢 430070

瘦素(leptin)在1994年首次在小鼠(Musmusculus)中被發現,并描述為一種由肥胖基因(obese gene,ob)編碼的、由脂肪細胞分泌的多肽激素[1]。在哺乳動物中,leptin由脂肪組織合成并分泌進入血液,通過血腦屏障后到達下丘腦并與瘦素受體(leptin receptor,lepR)結合,導致食欲降低和脂質代謝增加[2]。繼leptin被發現后,Tartaglia等[3]隨即在小鼠中克隆出lepR基因。已有的研究表明,哺乳動物只有一個lepR基因的旁系同源物,lepRmRNA通過3′端的可變剪切形成6種不同的亞型,這6種不同的亞型可分為長型(lepRb)、短型(LepRa、LepRc、LepRd、LepRf)、分泌型(lepRe)3類[4]。自首次發現小鼠的lepR基因十多年后[3],Wong等[5]首次在海洋青鳉(Oryziasmelastigma)中發現魚類的lepr基因。不同于哺乳動物的是,在大多數魚類中只克隆出長型lepr,如日本青鳉(Oryziaslatipes)[6]、斑馬魚(Daniorerio)[7]和斜帶石斑魚(Epinepheluscoioides)[8]等。在少數魚類中通過cDNA末端快速擴增技術(rapid amplification of cDNA,RACE)克隆出多個由leprmRNA 3′端可變剪切產生的受體亞型,如虹鱒 (Oncorhynchusmykiss)[9],黑鯽(Carassiuscarassius)[10]和歐洲鱸 (Dicentrarchuslabrax)[11]。

魚類長型受體具備哺乳動物lepR高度保守的結構,短型受體亞型的胞內結構、氨基酸組成及序列長度均存在差異,分泌型受體通常缺乏胞內區和跨膜區。與哺乳動物一致,魚類的lepr只有長型受體亞型具備完全的重要功能域。在虹鱒[9]、大西洋鮭(Salmosalar)[12]及黑鯽[10]中的研究發現短型受體亞型可能與能量穩態有關。對于魚類可溶性leptin受體的研究發現其與leptin-a的結合能力高于leptin-b,隨著對多種魚類的lepr基因的鑒定和研究的深入,發現lepr及其leptin結合域(leptin binding domain,LBD)在魚類進化過程中相對保守[7-8,11,13]。

在哺乳動物及魚類中,leptin通過其專一性受體結合傳導抑食欲信號[14-15]。使用哺乳動物同源重組的leptin蛋白處理金魚可導致其攝食量下降[16],與在哺乳動物中觀察到的結果一致,但類似的處理并不能影響銀大馬哈魚(Oncorhynchuskisutch)[17]、鯰(Silurusasotus)[18]和綠海魴(Lepomiscyanellus)[19]的攝食行為。這些不同的結果可能是魚類和哺乳動物的leptin及lepr氨基酸序列差異較大引起的。因此,研究魚類leptin及lepr的結構和功能對于研究魚類攝食行為來說至關重要。鱖是我國特有的名貴淡水魚,其食性奇特,自開口起終身以活餌為食,但經長期馴化才可食人工飼料。本課題組在前期研究氨基酸、腦腸肽(PYY)對鱖攝食調控等[20-21]工作的基礎上,利用3′ RACE 技術,克隆鱖由mRNA的3′端可變剪切4個不同的lepr受體亞型,檢測長型受體亞型在鱖組織中的表達情況,以及注射鱖同源重組leptin蛋白對其在腦中表達的影響,以期為后續深入研究鱖不同亞型的lepr在攝食調控、生理代謝中的功能及leptin-a和leptin-b的基因功能提供理論依據。

1 材料與方法

1.1 試驗魚及飼養條件

試驗魚來自華中農業大學鱖魚研究中心,于農業農村部鱖魚育種創新基地的循環水養殖系統中暫養14 d,水溫為(25±1) ℃,pH為7.53~7.70,氨氮、亞硝酸氮、硝酸氮質量濃度均低于0.1 mg/L,每天09:00和17:00各飽食投喂鮮活麥鯪(Cirrhinusmrigala)1次。

1.2 鱖leptin A和leptin B同源重組蛋白的表達、純化及腹腔注射

鱖leptin A和leptin B同源重組蛋白的表達和純化方法參照Yuan等[22]的方法進行。暫養結束后,隨機選取9尾健康、體表無傷、質量為(230±16) g的鱖,饑餓24 h后,使用MS-222麻醉后稱取質量。采用腹腔注射的方法,試驗組注射1 000 ng/g的溶解于DPBS的leptin A或leptin B同源重組蛋白,對照組注射等量的DPBS溶液,每組注射12尾試驗魚。

1.3 組織的獲取及RNA的提取

取樣前,手術刀、手術剪及1.5 mL離心管均于37 ℃下質量分數為0.1%的焦碳酸乙二酯(DEPC)浸泡12 h,隨后使用高壓滅菌鍋于120 ℃下處理30 min以去除DEPC,烘干后密封保存備用。鱖經MS-222麻醉后,解剖提取3尾試驗魚的垂體組織,所獲得的垂體組織置于1.5 mL離心管并立即凍存于液氮中,取樣結束后凍存于-80 ℃,用于后續lepr的3′- RACE克隆。取6尾試驗魚的端腦、中腦、小腦、垂體、下丘腦、延腦、肝臟、腸、腎、脂肪組織、鰓、脾和心組織置于1.5 mL離心管并立即凍存于液氮中,用于后續檢測lepr基因的組織表達。分別在注射鱖leptins同源重組蛋白2 h及4 h后取每組鱖的腦組織,置于1.5 mL離心管并立即凍存于液氮中。

將用于lepr的3′- RACE克隆的垂體組織混合,其余組織取適量放入干凈的1.5 mL離心管中,向裝有組織的離心管中加入1 mL TRIzol 試劑,并裝載入-20 ℃預冷的組織破碎儀夾板中,充分勻漿后按照有機溶劑抽提RNA法提取組織RNA。RNA經1.2%瓊脂糖凝膠電泳檢測完整性后用于后續試驗。

1.4 3′ RACE 引物設計及lepr cDNA全長克隆

從鱖基因組數據庫中調取lepr基因序列,根據TaKaRa公司的3′-Full RACE Core Set with PrimeScriptTMRTase試劑盒的說明和lepr基因的核心序列設計外引物Lepr- Outer,以及內引物Lepr-Inner,用于擴增lepr的cDNA全長序列。用于3′RACE克隆的引物如表1所示。

表1 本研究中所使用的克隆及定量引物 Table 1 Primers used for clone and qRT-PCR in this study

使用TaKaRa公司的3′-Full RACE Core Setver2.0以及DNA聚合酶(TaKaRa,日本)合成鱖lepr基因cDNA全長序列。根據試劑盒的使用說明操作,獲得PCR產物,經1.2%瓊脂糖凝膠電泳檢測無誤后用于連接、轉化。

1.5 lepr基因3′RACE克隆產物的連接、轉化及測序

PCR產物經1.5%的瓊脂糖凝膠電泳分離,切膠并使用Omega公司的EZNA Gel Extraction Kit試劑盒進行純化回收,并連接入T克隆載體(北京全式金公司,pEASY?-T1 Cloning Kit)。將克隆載體轉入DH5α感受態細胞(北京全式金公司),用不含有氨芐的LB培養液在37 ℃的搖床中培育1 h后,吸取200 μL菌液涂于含有氨芐的LB固體培養基平板上,37 ℃過夜培養。挑選陽性克隆送武漢生工生物工程有限公司測序。

1.6 不同亞型的lepr基因的生物信息學分析

使用NCBI網站的BLAST及ORF finder工具將測序結果與鱖基因組調取的lepr序列進行比對,并預測其氨基酸序列。分別使用在線軟件Signal P 4.1 Server (http://www.cbs.dtu.dk/services/Signal P/),TMpred Server (https://embnet.vital-it.ch/software/TMPRED_form.html)及SMART:Main page (http://smart.embl-heidelberg.de/)預測測序所得的lepr序列的信號肽、跨膜區和結構域。從GenBank數據庫(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/)獲取以下15個物種的lepr氨基酸序列:人(Homosapiens)、小鼠(Musmusculus)、大鼠(Rattusnorvegicus)、紅鰭東方鲀(Takifugurubripes)、爪蟾(Xenopustropicalis)、大黃魚(Larimichthyscrocea)、尖吻鱸(Latescalcarifer)、歐洲鱸、羅非魚(Dreochromisniloticus)、斜帶石斑魚(Epinepheluscoioides)、虹鱒、大西洋鮭、日本青鳉、斑馬魚、黑鯽,利用Bioedit軟件對上述氨基酸序列進行多重比對,并使用MEGA 6.0軟件構建上述物種lepr蛋白質的系統進化樹(bootstrap=1 000)。

1.7 qRT-PCR

通過qRT-PCR技術檢測DNA的表達水平。20 μL反應體系:ChamQ SYBR qPCR Master Mix(諾唯贊,南京)10 μL,F/R引物0.4 μL,模板cDNA 1 μL,雙蒸水8.2 μL。qRT-PCR反應條件:95 ℃預變性5 min; 95 ℃變性15 s,引物特異性退火溫度下30 s,72 ℃延伸45 s,共40個循環。溶解曲線以0.5 ℃/s的速度從95 ℃降低至65 ℃,每6 s采集1次信號。

2 結果與分析

2.1 lepr cDNA 3′RACE克隆

使用3′ RACE技術克隆獲得leprcDNA,發現4個不同大小的DNA片段。經測序發現這4個DNA片段均為leprmRNA經3′可變剪切產生的不同亞型,長度分別為3 474、1 512、945和915 bp。

2.2 lepr基因與氨基酸序列分析

將使用3′RACE技術克隆得到的4條序列與從鱖基因組中獲取的lepr序列進行比對分析,發現1個長型受體亞型lepr-L,3個由mRNA 3′端可變剪切產生的短型受體亞型:lepr-S1、lepr-S2、lepr-S3(圖1)。lepr-L的CDS長度為3 474 bp,編碼1 157個氨基酸;短型受體亞型lepr-S1、lepr-S2和lepr-S3的CDS長度分別為1 512、945和915 bp,分別編碼503、314和304個氨基酸。序列分析發現,鱖lepr-L蛋白具有1個信號肽結構、1個跨膜區、1個免疫球蛋白(Ig) C2-like結構域、1個LBD結構域,2個FNIII結構域和2個重復的色氨酸/絲氨酸基序(WSXWS),含有JAK和STAT功能域等全部胞內結構。除lepr-S1蛋白具備不完整的LBD結構域外,其余2個短型受體亞型均不具備LBD結構域,同時,所有短型受體亞型均丟失跨膜區和所有胞內結構域(圖2)。如表2所示,鱖lepr-L的氨基酸序列與魚類同源性高(42%~86%),與哺乳動物同源性低(26%~28%)。

下劃線部分氨基酸序列為lepr保守結構。The amino acid sequence of lepr gene conserved domains are underlined.

表2 鱖與其他脊椎動物LBD結構域氨基酸序列同源性比較 Table 2 Amino acid homology comparisonof LBD domain between Chinese perch and other vertebrates

黑色方塊表示 “WSXWS”基序;箭頭位置指示終止密碼子; TM:跨膜區。The black bar means “WSXWS” motif; arrows indicates the location of stop codon; TM:Transmembrane domain.

2.3 lepr氨基酸序列多重比對和進化樹分析

鱖lepr-L亞型的LBD序列與其他物種氨基酸序列多重比對發現,鱖與石斑魚、羅非魚和歐洲鱸同源性最高(75%~87%),其次是虹鱒和大西洋鮭(48%),與斑馬魚、黑鯽、小鼠和人同源性最低(31%~42%)(圖3)。

黑色底紋表示氨基酸序列一致 Black shading indicates that the amino acid sequence is consistent.

比對16個不同物種的lepr氨基酸序列并構建系統進化樹。如圖4所示,lepr進化樹整體分為2支,哺乳動物和兩棲動物的lepr聚為一支,魚類的lepr聚為另一支。鱖與鱸形目魚類的lepr的親緣關系最近,其次為鮭鱒類,與鯉科魚類的親緣關系最遠。

圖4 脊椎動物lepr氨基酸系統進化樹

2.4 lepr在鱖各組織中的表達情況

圖5所示為lepr-L在鱖各組織器官中的表達情況。在鱖中,lepr-L在鰓中表達量最高,其次是腎、垂體、腸、脾、脂肪組織、心、肝、中腦、下丘腦和小腦,在小腦和端腦中表達量最低。

T:端腦 Telencephalon; M:中腦 Midbrain; C:小腦 Cerebellum; P:垂體 Pituitary; Ht:下丘腦 Hypothalamus; MO:延腦 Medulla oblongata; L:肝臟 Liver; I:腸 Intestines; K:腎臟 Kidney; A:脂肪組織 Adipose; G:鰓 Gill; S:脾臟 Spleen; H:心臟 Heart.

2.5 腹腔注射鱖leptin A和leptin B同源重組蛋白對腦lepr-L表達的影響

圖6所示為腹腔注射鱖同源重組leptin A和leptin B 2 h和4 h后,腦組織中lepr-L的表達情況。注射leptin A 2 h和4 h對鱖腦組織中lepr-L的表達均無顯著影響(P>0.05);注射leptin B 2 h鱖腦組織中lepr-L的表達水平顯著上調(P<0.05),注射leptin B 4 h后未觀察到鱖腦組織中lepr-LmRNA豐度的顯著變化(P>0.05)。

含有不同字母的組別之間存在顯著性差異(P <0.05),數據以平均值±標準誤表示(n=6)。Values within the same row with superscripted letters represent significant difference (P<0.05),data are expressed as mean±S.E (n=6).

3 討 論

本研究采用3′ RACE克隆的方法,獲得了由mRNA 3′端可變剪切產生鱖的4種lepr亞型,包括1個長受體亞型和3個短受體亞型。氨基酸多重比對和進化樹分析發現,鱖lepr及其LBD區域均較為保守,與同屬鱸形目的歐洲鱸和石斑魚的同源性最高,親緣關系最近,其次是鯉科魚類,與兩棲動物和哺乳動物的同源性較低,親緣關系最遠。這與在其他鱸形目魚類中得到的結果相一致[8,11,24]。

本研究中使用3′ RACE克隆得到鱖的4種亞型的lepr,與哺乳動物和其他魚類一致的是,長型受體亞型lepr-L具有完整的功能結構域,包括:信號肽、LBD、FNIII,重復的WSXWS、Ig-C2-like、跨膜區、細胞膜內的JAK-STAT結構域。鱖lepr-S1含有LBD,完全缺失了跨膜結構域和胞內域,推測其可能是可溶性leptin受體。在哺乳動物和魚類中,可溶性受體與循環瘦素結合,避免瘦素被降解,進而調節瘦素的濃度和活動[9,23,25]。鱖短受體亞型lepr-S1結構與哺乳動物和虹鱒的可溶性受體相似,我們推測鱖短受體亞型lepr-S1應當具備分泌型受體的功能,可能具備調節血漿leptin濃度的功能。而鱖短型受體亞型lepr-S2和lepr-S3僅含有一個WSXWS,未見其他重要結構域,在其他魚類中均未見報道類似的短型受體亞型,其生理功能還需進一步探究。

在魚類中,lepr在各組織中的表達分布情況與物種相關,例如在金魚[26]、歐洲鰻鱺[27]和大西洋鮭[12]的端腦、下丘體和性腺中lepr表達量最高,在羅非魚的垂體中lepr表達最多,其次是肌肉和頭腎[26],日本青鳉的lepr則在肌肉中表達量最高,其次是皮膚和鰓[6]。在我們的研究中,鱖lepr-L在鰓中表達最高,其次是腎臟和垂體。此類lepr組織表達分布的差異可能說明leptin在不同的物種中發揮的作用不盡相同。

在哺乳動物中,leptin作為一種飽食因子,通過與專一性受體lepr結合發揮其抑制食欲的生理功能[14-15]。草魚[28]、鱖[22]、羅非魚[29]等魚類腹腔注射同源重組的leptin蛋白后均表現出食欲降低,因此,leptin在魚類中也被認為具有抑制食欲的作用。同時,敲除lepr基因的日本青鳉也表現出食欲增強[30],也驗證了上述觀點。然而,lepr敲除的斑馬魚卻未表現出食欲的增加[31]。在我們的研究中發現,腹腔注射鱖leptin B同源重組蛋白2 h后,鱖食欲顯著降低[22],腦中lepr的表達量隨之升高,在注射4 h后,鱖食欲恢復的同時[22],腦中lepr的表達量也隨之降低;而注射鱖leptin A同源重組蛋2 h及4 h后,既未觀察到食欲明顯降低[22],也未觀察到腦組織中lepr表達的變化。由此,我們推測,魚類不同的leptins在不同的組織中對lepr表達的影響不一致,從而行使不同的生理功能。

本研究首次克隆出由mRNA 3′端可變剪切產生的鱖lepr的4個受體亞型。經序列分析發現,僅長型受體lepr-L具有完整的功能結構域,且各功能結構域的氨基酸序列高度保守。短型受體亞型lepr-S1完全缺失跨膜區域和胞內結構域,推測其為可溶性受體亞型,發現了2個在其他魚類中未見報道的、僅具備1個WSXWS結構的lepr短型受體亞型。鱖lepr基因在鰓、腎和垂體中表達量較高;注射鱖leptin B而非leptin A的同源重組蛋白會引起腦lepr表達量上升。這些結果說明鱖leptins能引起組織中lepr的表達的不同變化而發揮獨特的生理功能。

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