基于樹莓派和物聯(lián)網(wǎng)的CO2培養(yǎng)箱監(jiān)測系統(tǒng)設(shè)計

湯福南，劉亞文，汪纓

南京醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院江蘇省人民醫(yī)院 臨床醫(yī)學(xué)工程處，江蘇 南京 210029

引言

試管嬰兒預(yù)約周期長、價格昂貴，在體外受精-胚胎移植技術(shù)（In Vitro Fertilization-Embryo Transfer，IVF-ET）獲得較為長足進(jìn)步的情況下，胚胎移植后的臨床妊娠率約為33%[1]，成功率有限。因此，試管嬰兒培養(yǎng)流程里的每個環(huán)節(jié)都至關(guān)重要。作為生殖醫(yī)學(xué)界的共識——“胚胎培養(yǎng)室是生殖中心的‘心臟’”，卵子和胚胎將在胚胎培養(yǎng)室度過形成生命最初的重要的幾天[2]。而胚胎實(shí)驗(yàn)室內(nèi)，CO2培養(yǎng)箱是用于進(jìn)行胚胎培養(yǎng)的關(guān)鍵醫(yī)療設(shè)備，其重要程度可想而知。

CO2培養(yǎng)箱的重要參數(shù)包括CO2濃度、O2濃度以及溫度等，當(dāng)以上參數(shù)出現(xiàn)與設(shè)定值有偏差時，如CO2濃度過低或者溫度過高，培養(yǎng)箱就會發(fā)出聲音報警[3]。為保證高質(zhì)量的胚胎培養(yǎng)，培養(yǎng)箱內(nèi)的實(shí)時狀態(tài)以及報警信息應(yīng)該更高效地傳遞到相關(guān)負(fù)責(zé)人。

傳統(tǒng)的CO2培養(yǎng)箱監(jiān)測方式依賴于設(shè)備自身的聲光報警，當(dāng)處于夜間或負(fù)責(zé)人員不在實(shí)驗(yàn)室現(xiàn)場則無法接收到報警信息和查看CO2培養(yǎng)箱內(nèi)部具體參數(shù)，從而使得胚胎培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)面臨失敗的風(fēng)險，容易造成患者重大損失。另外，在培養(yǎng)箱故障維修方面，根據(jù)趙安等[4]的研究，CO2培養(yǎng)箱的常見故障主要集中在氣體和溫度測控，這兩種故障在處理之后都需要進(jìn)行一段時間（如15 min）的觀察[5]，避免重復(fù)進(jìn)行胚胎細(xì)胞轉(zhuǎn)移操作而造成的胚胎污染風(fēng)險，現(xiàn)有的監(jiān)測系統(tǒng)無法進(jìn)行CO2培養(yǎng)箱內(nèi)部參數(shù)的歷史數(shù)據(jù)追溯，需要人為地進(jìn)行重復(fù)觀測，這種方式效率較低。

基于上述情況，本文利用樹莓派結(jié)合物聯(lián)網(wǎng)技術(shù)專門用于醫(yī)院生殖中心實(shí)驗(yàn)室CO2培養(yǎng)箱的遠(yuǎn)程監(jiān)測，有助于CO2培養(yǎng)箱的預(yù)防性維護(hù)[6-7]，降低實(shí)驗(yàn)室因設(shè)備故障、環(huán)境因素等造成的實(shí)驗(yàn)失敗的可能性，進(jìn)一步保障胚胎培養(yǎng)過程的安全穩(wěn)定。

1 系統(tǒng)總體設(shè)計

本文設(shè)計的CO2培養(yǎng)箱監(jiān)測系統(tǒng)主要由主控制器、USB轉(zhuǎn)串口模塊和物聯(lián)網(wǎng)云平臺組成。本文所設(shè)計的系統(tǒng)中，樹莓派作為主控制器[8]，通過串口發(fā)送請求指令[9]，接收返回結(jié)果之后對其進(jìn)行數(shù)據(jù)分割、變量賦值和數(shù)據(jù)上傳等操作，最終可以將CO2濃度、O2濃度[10]、溫度以及報警代碼等通過WiFi上傳到物聯(lián)網(wǎng)——OneNET云平臺[11]。OneNET云平臺接收數(shù)據(jù)，進(jìn)行實(shí)時數(shù)據(jù)顯示以及歷史數(shù)據(jù)波形繪制。系統(tǒng)總體框圖如1所示。

圖1 系統(tǒng)總體框圖

系統(tǒng)采用讀取培養(yǎng)箱設(shè)備串口的方式獲取數(shù)據(jù)，其意義在于無需額外使用傳感器來獲取培養(yǎng)箱內(nèi)數(shù)據(jù)，這種方式獲取的各種參數(shù)最為準(zhǔn)確；另一方面，通過USB轉(zhuǎn)串口模塊方便系統(tǒng)進(jìn)行擴(kuò)展，有利于同時多個CO2培養(yǎng)箱的數(shù)據(jù)監(jiān)測。

2 系統(tǒng)硬件設(shè)計

2.1 主控制器模塊

本系統(tǒng)設(shè)計采用樹莓派3B作為主控制器，樹莓派3B是一款基于ARM架構(gòu)的微型電腦主板，電源輸入為5 V/2 A，其外形只有信用卡片大小，尺寸為86 mm×56 mm×17 mm。樹莓派3B搭載1.2 GHz的64位四核處理器，內(nèi)存1 GB，采用Micro SD卡作為硬盤[12]，操作系統(tǒng)映像文件版本為“2019-04-08-raspbian-stretch”。

本系統(tǒng)設(shè)計采用樹莓派3B作為主控制器的原因主要有：① 樹莓派3B板載BCM43438無線芯片集成了IEEE 802.11n無線網(wǎng)卡，可直接通過無線網(wǎng)連接OneNET云平臺進(jìn)行數(shù)據(jù)傳輸；② 樹莓派3B自帶4個USB 2.0接口，可通過USB轉(zhuǎn)串口線直接與培養(yǎng)箱設(shè)備進(jìn)行數(shù)據(jù)對接，方便快捷而且容易擴(kuò)展，見圖2。

圖2 樹莓派3B

2.2 USB轉(zhuǎn)RS232串口模塊

本系統(tǒng)選用Z-TEK公司生產(chǎn)的USB轉(zhuǎn)RS232串口線，型號為ZE658，可實(shí)現(xiàn)樹莓派對CO2培養(yǎng)箱的數(shù)據(jù)采集監(jiān)測。內(nèi)部集成PL2303芯片，支持RS232協(xié)議，支持Win10、MacOS、Linux等多種操作系統(tǒng)，波特率300-1 Mbps，數(shù)據(jù)位7/8，停止位1/2。

通常情況下，如果選用單片機(jī)作為主控制器，TXD、RXD使用的是TTL電平，需要轉(zhuǎn)換成TTL電平才能進(jìn)行通信，而且單片機(jī)自帶USB數(shù)量有限，擴(kuò)展能力相對較低[13]，因此使用樹莓派結(jié)合USB轉(zhuǎn)串口模塊連接CO2培養(yǎng)箱的方式優(yōu)勢十分明顯。本文設(shè)計的監(jiān)測系統(tǒng)以日本ASTEC APM-30D型號CO2培養(yǎng)箱為例，實(shí)物如圖3所示，其背部自帶串口數(shù)據(jù)接口。

圖3 CO2培養(yǎng)箱實(shí)物圖

3 系統(tǒng)軟件設(shè)計

系統(tǒng)軟件設(shè)計由樹莓派軟件設(shè)計以及物聯(lián)網(wǎng)云平臺端軟件設(shè)計兩部分組成。其中樹莓派使用Python語言開發(fā)[14]，控制串口向CO2培養(yǎng)箱發(fā)送數(shù)據(jù)請求指令，接收返回數(shù)據(jù)之后進(jìn)行數(shù)據(jù)解析，最后將溫度、CO2濃度、O2濃度、報警代碼等關(guān)鍵數(shù)據(jù)上傳至OneNET云平臺，樹莓派端軟件流程如圖4所示。使用Python語言開發(fā)是因?yàn)榭梢允褂帽姸喙δ軓?qiáng)大的開源函數(shù)庫，更為重要的是其程序可直接在樹莓派的操作系統(tǒng)上執(zhí)行。

圖4 軟件流程圖

OneNET云平臺端接收到主控制器發(fā)送的數(shù)據(jù)，根據(jù)不同數(shù)據(jù)流接收對應(yīng)數(shù)據(jù)設(shè)置觸發(fā)器[15]，判斷相關(guān)數(shù)值是否在正常范圍，當(dāng)達(dá)到觸發(fā)條件時，OneNET云平臺將自動發(fā)送報警提示信息到預(yù)先設(shè)置的電子郵箱中，實(shí)現(xiàn)郵件報警功能。

3.1 樹莓派端程序設(shè)計

3.1.1 查看串口相關(guān)信息

（1）首先通過運(yùn)行指令 dmesg | grep ttyS* 查看樹莓派串口相關(guān)信息[16]，見圖5，當(dāng)前有三個CO2培養(yǎng)箱設(shè)備通過USB轉(zhuǎn)串口線連接到樹莓派，分別對應(yīng)串口號ttyUSB0、ttyUSB1、ttyUSB2。本文以ttyUSB0為例，介紹其中一臺CO2培養(yǎng)箱監(jiān)測設(shè)計。

圖5 樹莓派查詢串口設(shè)備圖

（2）通過以下指令安裝圖形化串口調(diào)試工具cutecom：sudo apt-get install cutecom

安裝成功之后，通過指令sudo cutecom打開串口調(diào)試工具，選擇ttyUSB0，設(shè)置波特率，發(fā)送數(shù)據(jù)請求指令并等待返回數(shù)據(jù)，即可確認(rèn)樹莓派與CO2培養(yǎng)箱可以正常通訊。

（3）為了實(shí)現(xiàn)串口通訊和數(shù)據(jù)上傳到物聯(lián)網(wǎng)等功能，Python程序中需要通過import語句先導(dǎo)入serial模塊、urllib.request、requests、json等相關(guān)模塊；

打開串口，設(shè)置波特率語句：

serial = serial.Serial(‘/dev/ttyUSB0’,19200,timeout =3600)

串口配置完成之后，通過向培養(yǎng)箱發(fā)送特定指令就可以得到回傳數(shù)據(jù)。以ASTEC APM-30D型號的培養(yǎng)箱為例，發(fā)送ASCII字符串“reqd”，即可得到返回數(shù)據(jù)，發(fā)送指令以及等待返回數(shù)據(jù)的代碼如下：

send_data = ‘reqd’

send_data = send_data + ‘ ’

serial.write(send_data.encode(“utf-8”))

data=serial.read(1)

sleep(0.1)

data = (data + serial.read(serial.inWaiting())).decode()

3.1.2 數(shù)據(jù)處理及上傳程序

CO2培養(yǎng)箱串口收到“reqd”指令后，會返回三行數(shù)據(jù)，舉例如下：

“reqd

0,370,38,208,-56,0

＞ ”

其中“reqd”和“＞”分別代表回傳數(shù)據(jù)的開始和結(jié)尾，屬于固定不變的部分；“370”代表當(dāng)前培養(yǎng)箱內(nèi)部溫度為37.0 ℃；”38”代表當(dāng)前培養(yǎng)箱內(nèi)部CO2濃度為3.8%；”208”代表當(dāng)前培養(yǎng)箱內(nèi)部O2濃度為20.8%；最后一位數(shù)值的“0”代表當(dāng)前報警代碼為0，即無報警。在Python程序中分別使用find()和r find()函數(shù)通過查找逗號“，”即可定位到關(guān)鍵參數(shù)在返回數(shù)據(jù)中的具體位置，然后再使用split()函數(shù)把Temp、CO2、O2以及AlarmCode等變量自動分離出來，從而實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)的自動讀取和相應(yīng)變量的賦值操作。報警代碼表如表1所示。

表1 報警代碼

3.2 OneNET云平臺設(shè)置

OneNET云平臺是中國移動通信集團(tuán)在物聯(lián)網(wǎng)應(yīng)用和真實(shí)設(shè)備之間搭建的一個應(yīng)用平臺。該平臺不僅適配多種網(wǎng)絡(luò)環(huán)境和常見傳輸協(xié)議，提供各類設(shè)備快速接入方案和管理服務(wù)，而且在應(yīng)用層提供豐富的API和數(shù)據(jù)分發(fā)能力，從而縮短物聯(lián)網(wǎng)系統(tǒng)的形成周期，方便開發(fā)者進(jìn)行數(shù)據(jù)傳輸和管理。

3.2.1 設(shè)備接入

在正式使用OneNET云平臺物聯(lián)網(wǎng)服務(wù)之前，需要進(jìn)行賬戶注冊登陸等操作；然后在其基礎(chǔ)服務(wù)中選擇多協(xié)議接入，進(jìn)行創(chuàng)建產(chǎn)品、創(chuàng)建設(shè)備、生成數(shù)據(jù)流等操作[17]；最后通過生成相應(yīng)的應(yīng)用，單個應(yīng)用下可以創(chuàng)建多個數(shù)據(jù)流，分別對應(yīng)CO2培養(yǎng)箱的CO2濃度、O2濃度、溫度以及報警代碼等參數(shù)。

3.2.2 傳輸協(xié)議

OneNET平臺支持包括HTTP、Modbus、EDP、TCP透傳、MQTT[18-19]等協(xié)議場景下的設(shè)備快速上云，本文設(shè)計的系統(tǒng)采用HTTP協(xié)議。本系統(tǒng)首先在OneNET平臺上創(chuàng)建產(chǎn)品時設(shè)備接入?yún)f(xié)議選擇HTTP協(xié)議，記錄下云平臺分配的產(chǎn)品ID、設(shè)備ID以及安全鑒權(quán)密鑰APIKey。樹莓派端通過在Python程序中利用APIurl和APIKey即可將獲取到的CO2培養(yǎng)箱CO2濃度等數(shù)據(jù)上傳到云平臺。

3.2.3 應(yīng)用編輯

通過OneNET應(yīng)用編輯器，開發(fā)者可以在云平臺端實(shí)現(xiàn)設(shè)備數(shù)據(jù)流的可視化：在應(yīng)用編輯頁面，可以通過組件庫進(jìn)行可視化元素的添加與刪除，可視化元素包括基礎(chǔ)元素與控制元素。本文設(shè)計的系統(tǒng)主要使用了基礎(chǔ)元素中的文本、折線圖以及儀表盤等控件，即可對CO2濃度、O2濃度、溫度以及報警代碼等數(shù)據(jù)流進(jìn)行圖形化展示，展示內(nèi)容包括當(dāng)前數(shù)據(jù)、歷史數(shù)據(jù)波形和數(shù)據(jù)最近更新時間，實(shí)際運(yùn)行效果如圖6所示。

圖6 物聯(lián)網(wǎng)云平臺數(shù)據(jù)顯示

4 效果對比

使用本文設(shè)計的監(jiān)測系統(tǒng)之前，胚胎實(shí)驗(yàn)室的負(fù)責(zé)人員想要了解CO2培養(yǎng)箱是否處于正常運(yùn)行狀態(tài)通常只能通過以下兩種方式：① 親自到現(xiàn)場逐一查看CO2培養(yǎng)箱的面板，檢查是否存在Led燈閃爍報警和蜂鳴器報警；② 電話敦促實(shí)驗(yàn)室工作人員執(zhí)行以上操作。

針對傳統(tǒng)方法的不足，本文基于樹莓派和物聯(lián)網(wǎng)技術(shù)設(shè)計了CO2培養(yǎng)箱監(jiān)測系統(tǒng)，本系統(tǒng)具有以下優(yōu)點(diǎn)：① 可以讓相關(guān)負(fù)責(zé)人員隨時隨地從OneNET云平臺端登錄進(jìn)行遠(yuǎn)程查閱當(dāng)前數(shù)據(jù)信息，并且在云平臺端設(shè)置數(shù)據(jù)刷新頻率最快為3次/s，極大提高了當(dāng)前數(shù)據(jù)監(jiān)測的實(shí)時性；② 在進(jìn)行歷史數(shù)據(jù)追溯時，每次查詢請求可以返回6000個數(shù)據(jù)點(diǎn)[20]，相當(dāng)于最近5 h的數(shù)據(jù)長度；在此基礎(chǔ)之上，可以向前查閱30 d以內(nèi)的歷史數(shù)據(jù)，這樣的追溯長度已經(jīng)可以完全涵蓋胚胎體外培養(yǎng)整個周期；③ 報警信息傳達(dá)的及時性。OneNET云平臺的觸發(fā)器功能，可以設(shè)置報警范圍以及數(shù)據(jù)異常實(shí)時觸發(fā)[21]，即使在胚胎實(shí)驗(yàn)室無人值守時仍然能夠第一時間發(fā)現(xiàn)培養(yǎng)箱異常并報警。

因此，相比之下本系統(tǒng)在遠(yuǎn)程監(jiān)測的實(shí)時性、歷史數(shù)據(jù)追溯時間長度、報警信息及時性等方面要明顯優(yōu)于傳統(tǒng)方法，見表2。

表2 效果對比

5 小結(jié)

CO2培養(yǎng)箱的監(jiān)測對胚胎質(zhì)量具有重要意義，等級越高、質(zhì)量越好的胚胎移植后其妊娠率越高[22]。本文設(shè)計的系統(tǒng)是基于樹莓派和物聯(lián)網(wǎng)平臺的遠(yuǎn)程監(jiān)測系統(tǒng)，其創(chuàng)新性在于：① 使用物聯(lián)網(wǎng)技術(shù)將生殖中心實(shí)驗(yàn)室的CO2培養(yǎng)箱設(shè)備接入物聯(lián)網(wǎng)云端，可通過網(wǎng)絡(luò)遠(yuǎn)程隨時查看各種關(guān)鍵參數(shù)信息和遠(yuǎn)程接收報警信息；而以往的研究主要是將培養(yǎng)箱報警接口進(jìn)行改造設(shè)計，使得報警信息延長到相關(guān)負(fù)責(zé)人手中，不能做到真正意義上的遠(yuǎn)程監(jiān)測；② 在硬件設(shè)計方面，使用樹莓派微型電腦作為主控制器，其強(qiáng)大的處理能力和USB接口擴(kuò)展能力能夠?qū)崿F(xiàn)一對多的CO2培養(yǎng)箱檢測系統(tǒng)；而以往的研究思路是每一臺CO2培養(yǎng)箱配備一個單片機(jī)對其分別進(jìn)行讀取控制，然后再進(jìn)行數(shù)據(jù)的處理，比較分散不方便管理。

樹莓派可以通過WiFi直接連入物聯(lián)網(wǎng)平臺，獲取CO2培養(yǎng)箱的各項(xiàng)關(guān)鍵參數(shù)以及報警代碼之后即可上傳，相關(guān)負(fù)責(zé)人可以在物聯(lián)網(wǎng)平臺查看當(dāng)前及歷史數(shù)據(jù)，實(shí)現(xiàn)真正的CO2培養(yǎng)箱遠(yuǎn)程監(jiān)測；不僅如此，對于擁有多臺CO2培養(yǎng)箱的生殖中心實(shí)驗(yàn)室來說，能夠以本系統(tǒng)為樣本，通過工業(yè)級的USB HUB對樹莓派USB口進(jìn)行擴(kuò)展，在物聯(lián)網(wǎng)平臺實(shí)現(xiàn)多臺CO2培養(yǎng)箱的關(guān)鍵參數(shù)以及報警信息的同時監(jiān)測，相對于傳統(tǒng)的聲光報警方式能夠很大程度上減少人力物力的投入。

我院生殖中心實(shí)驗(yàn)室有45臺CO2培養(yǎng)箱，本系統(tǒng)在我院生殖中心實(shí)驗(yàn)室已初步調(diào)試成功并計劃投入使用。對于醫(yī)院的臨床工程師來說，醫(yī)療設(shè)備的內(nèi)部傳感器一般都經(jīng)過定期校準(zhǔn)或計量，其重要參數(shù)監(jiān)測改進(jìn)設(shè)計應(yīng)盡可能利用設(shè)備本身傳感器的信息，既能夠高效準(zhǔn)確地獲取數(shù)據(jù)，又可以降低系統(tǒng)設(shè)計成本。