軍曹魚(yú)響應(yīng)低氧脅迫轉(zhuǎn)錄組SNP位點(diǎn)鑒定及其功能注釋分析

楊二軍，楊林桐，王維政，黃建盛,2,3*，張健東,2,3，王忠良,2,3，陳剛,2,3*

( 1. 廣東海洋大學(xué) 水產(chǎn)學(xué)院，廣東 湛江 524088；2. 南方海洋科學(xué)與工程廣東省實(shí)驗(yàn)室（湛江），廣東 湛江 524025；3. 廣東省水產(chǎn)經(jīng)濟(jì)動(dòng)物病原生物學(xué)及流行病學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，廣東 湛江 524088)

1 引言

溶解氧（Dissolved Oxygen, DO）對(duì)水生動(dòng)物的發(fā)育和健康至關(guān)重要[1]，同時(shí)也是水生動(dòng)物生存不可缺少的環(huán)境因子之一。溶解氧不足時(shí)，機(jī)體的生長(zhǎng)發(fā)育、呼吸、新陳代謝、繁殖及免疫功能等生化反應(yīng)和生理功能會(huì)受到影響，嚴(yán)重時(shí)會(huì)發(fā)生死亡[2]。隨著全球氣候變暖和水體富營(yíng)養(yǎng)化引發(fā)的一系列生態(tài)問(wèn)題，水體低氧化現(xiàn)象越來(lái)越嚴(yán)重。調(diào)查發(fā)現(xiàn)，我國(guó)近岸海域出現(xiàn)的低氧層（DO濃度約為3 mg/L）水域范圍越來(lái)越大，對(duì)生活在其中的海洋生物造成了極大的威脅，低氧現(xiàn)象已成為一個(gè)被高度重視和廣泛關(guān)注的問(wèn)題[3-4]。

軍曹魚(yú)(Rachycentron canadum)，隸屬于鱸形目(Periformes)，軍曹魚(yú)科(Rachycentridae)，軍曹魚(yú)屬(Rachycentron)，又名海鱺、海龍魚(yú)等，是熱帶和亞熱帶海域的廣鹽性、肉食性洄游魚(yú)類(lèi)。因其具有生長(zhǎng)快、抗病能力強(qiáng)、營(yíng)養(yǎng)豐富、肉質(zhì)鮮美等特點(diǎn)，使其成為我國(guó)南方沿海地區(qū)深水網(wǎng)箱養(yǎng)殖的重要品種之一[5]。近年來(lái)，隨著高密度集約化養(yǎng)殖模式的推廣，軍曹魚(yú)近海浮動(dòng)式網(wǎng)箱養(yǎng)殖和深海網(wǎng)箱養(yǎng)殖發(fā)展迅速，然而受養(yǎng)殖密度大、管理不善、養(yǎng)殖生態(tài)環(huán)境惡化、天氣、溫度等因素的影響，軍曹魚(yú)在養(yǎng)殖過(guò)程中容易出現(xiàn)缺氧、抗病能力下降等情況，導(dǎo)致病害日趨頻繁，嚴(yán)重制約了軍曹魚(yú)的健康養(yǎng)殖發(fā)展[6-7]。針對(duì)軍曹魚(yú)養(yǎng)殖過(guò)程中出現(xiàn)的缺氧問(wèn)題，本實(shí)驗(yàn)室前期開(kāi)展了低氧脅迫對(duì)軍曹魚(yú)幼魚(yú)生長(zhǎng)和血清生化指標(biāo)、氧化應(yīng)激、能量代謝以及腸道菌群影響的研究，結(jié)果表明，低氧脅迫對(duì)軍曹魚(yú)幼魚(yú)的生理狀況有顯著影響[7-12]。……