張靜,張 潔,莫 穎,張 蕾,孫明慧
(新疆醫科大學第五附屬醫院腎病科,烏魯木齊 830000)
糖尿病腎臟病(diabetic kidney disease,DKD)是糖尿病患者最嚴重、最普遍的并發癥之一,可導致患者死亡,也是終末期腎病(ESRD)的主要促成因素[1]。DKD有多種形態改變,包括系膜細胞肥大和增殖、腎小管細胞上皮—間充質轉化(epithelialmesenchymal transition,EMT)、足細胞凋亡等[2],其中腎小管細胞EMT是引起腎功能損害最常見的原因[3]。DKD的易感因素包括遺傳、代謝機制紊亂、高血糖、胰島素抵抗、血流動力學改變、炎癥反應、氧化應激等[4]。有研究表明,糖尿病患者存在“遺留效應”,表觀遺傳因素在該效應中起到重要作用[5-6]。
腺嘌呤第6位氮原子上發生的甲基化修飾(m6A)是真核生物mRNA中最常見的甲基化修飾[7]。類甲基化轉移酶3(methyltransferase-like 3,METTL3)是構成m6A甲基轉移酶復合體的核心組分,負責催化RNA發生m6A修飾[8]。在2型糖尿病中,葡萄糖調節METTL3介導的m6A修飾,然而,METTL3在糖尿病相關疾病調控中的作用存在爭議[9],METTL3與DKD發病機制之間的關系仍不清楚。METTL3還可以介導m6A修飾調控miRNA表達[10]。有研究表明,多種miRNA在DKD發病機制中發揮重要作用[11]。其中miR-126參與糖尿病的發生和發展,在DKD中的表達下調,但具體作用機制尚不清楚[12-13]。本研究旨在探討METTL3對高糖(HG)誘導的大鼠腎小管上皮細胞(NRK-52E)和大鼠腎小球系膜細胞(HBZY-1)增殖的影響及其作用機制,并闡明METTL3與miR-126的相互作用,為探索DKD新的治療靶點提供實驗依據。
1.1 細胞與培養 大鼠NRK-52E細胞和大鼠HBZY-1細胞均購自武漢Procell公司。將NRK-52E細胞和HBZY-1細胞轉移到含有10%胎牛血清(FBS)和1%青—鏈霉素DMEM培養基的離心管中,1 000 r/min離心10 min,收集細胞,用含10%FBS的完全培養基懸浮細胞;將細胞接種到培養皿中,輕輕吹打混勻,置于37℃、5%CO2飽和濕度細胞培養箱中培養,間隔2 d更換1次培養液。細胞融合度達到約80%時,胰酶消化,傳代,取第3代細胞用于實驗。
1.2主要試劑FBS、青—鏈霉素、酚紅(Gibco,美國);MTT試劑盒(BioFroxx,德國);TIANScript RT Kit、SuperReal PreMix Plus(SYBR Green)(天根,中國);BCA蛋白濃度測定試劑盒(Solarbio,中國);smad2抗體、METTL3抗體(Proteintech,中國);GAPDH、Goat anti-Rabbit IgG(Bioswamp,中國);轉化生長因子(TGF)-β1酶聯免疫吸附試驗(ELISA)試劑盒(Cusabio,中國);RNA-Binding Protein Immunoprecipitation Kit(Millipore,美國)。
1.3細胞分組和轉染 取對數生長期、生長狀態良好的NRK-52E和HBZY-1細胞,按3×105個/孔接種于96孔板,分為對照組、高糖(HG)組、HG+siRNA陰性對照(siRNA-NC)組和HG+METTL3 siRNA組。采用LipofectamineTM 2000分別轉染siRNA-NC和si-METTL3,細胞于37℃、CO2培養箱中培養,6 h后吸出轉染液換入正常培養,繼續培養24 h。對照組用含有5.5 mmol/L葡萄糖的培養基培養24 h,其他各組用含有35 mmol/L葡萄糖的培養基培養24 h。METTL3的siRNA序列由擎科生物生物科技有限公司合成,序列如下:METTL3 siRNA1:5’-GUCUAUAGUCCUGAAUUATT-3’;METTL3 siRNA2:5’-GUUGAUUGAGGUAAAGCGATT-3’;METTL3 siRNA3:5’-GGAAUUGGGCAGAGAAU GUTT-3’。
1.4 MTT法檢測細胞增殖活性 取對數生長期、生長狀態良好的HBZY-1和NRK-52E細胞,以4×103個/孔接種于96孔板,培養24 h后,每孔加入10μL MTT溶液,繼續培養4 h,棄去培養基,加入150μL DMSO震蕩10 min,酶標儀測定568 nm波長處各孔的吸光值(OD)。
1.5流式細胞儀檢測細胞周期 用不含EDTA的0.25%胰酶消化處理細胞,終止消化后收集細胞,1 500 r/min離心5 min,棄上清,PBS洗滌2次;1 500 r/min離心5 min,棄上清,PBS重懸細胞,緩慢加入700μL預冷的80%乙醇;4℃條件下固定4 h,1 500 r/min離心5min,預冷PBS洗滌2次;加入100μL RNase,37℃水浴30 min;加入400μL PI,4℃避光染色30 min;用流式細胞儀在激發波長488 nm波長處檢測紅色熒光。
1.6 RT-qPCR法檢測METTL3和miR-126表達
通過DNAMAN軟件設計METTL3、β-actin、miR-126、U6熒光實時定量PCR引物,并由擎科公司合成。METTL3引物上游:5’-TAAGCCCAGCACAACGTCTA-3’,下游:5’-CAACTCCTGGGCAGCA AATT-3’;miR-126引物上游:5’-TGCGCTCGTACCGTGAGTAATA-3’,下 游:5’-CCAGTGCAGG GTCCGAGGTATT-3’;U6引物上游:5’-CGCTTCGGCAGCACATATAC-3’,下 游:5’-AAATATGGAACGCTTCACGA-3’;β-actin引物上游:5’-CACGATGGAGGGGCCGGACTCATC-3’,下 游:5’-TAAAGACCTCTATGCCAACACAGT-3’。提取細胞總RNA,逆轉錄為cDNA。PCR反應體系:上、下引物10 μmol/L各0.4μL,2×SYBR Select Master Mix 10μL,RNase-free水4.8μL,cDNA模板4μL,50×ROX Reference Dye 20.4μL,配制成20μL體系混合均勻。PCR反應條件:在ABI(QuantStudio 6)儀器上保持95℃預變性10 min;95℃變性15 s,60℃退火60 s,延展95℃,15 s,40個循環。采用2-ΔΔCT方法計算METTL3和miR-126相對表達量。
1.7 Western blotting法檢測METTL3和smad2蛋白表達 提取細胞總蛋白,BCA法測定蛋白濃度;聚丙烯酰胺凝膠電泳,轉膜,5%脫脂奶粉封閉2 h,加入一抗smad(1∶3 000)、METTL3(1∶3 000)、GAPDH(1∶1 000)稀釋液4℃下孵育過夜;洗膜,加入HRP標記二抗(1∶10 000)室溫孵育2 h,ECL顯色,在暗室中壓片、曝光、顯影,用Band Scan分析條帶灰度值。
1.8細胞上清液中TGF-β1含量檢測 收集各組細胞培養上清液,采用酶聯免疫吸附試驗(ELISA)法檢測細胞上清液中TGF-β1含量,檢測過程嚴格按照試劑盒說明書進行操作。
1.9 RNA免疫共沉淀技術(RIP)采用RIP實驗探討miR-126和METTL3之間的結合情況。RIP分析使用Magna-RIP RNA結合蛋白免疫沉淀試劑盒(Magna RIP Kit,Millipore)。測定抗體的總RNA(輸入對照)和同型對照(IgG)。RT-qPCR法檢測共沉淀RNA。提取細胞中總RNA,并使用Ribo-Zero磁性試劑盒(Illumina)去除核糖體RNA。用RNA裂解試劑(Ambion)對核糖核酸進行裂解。使用之前在RIP免疫沉淀緩沖液中與磁性Dynabeads結合的抗m6A抗體(Synaptic Systems,202003)進行RNA免疫沉淀,并與片段RNA孵育。經蛋白酶K(10 mg/mL)處理后,用苯酚/氯仿/異戊醇提取RNA,用miR-126引物進行RT-qPCR驗證。
1.10統計學方法 所有數據采用SPSS 25.0軟件進行處理,計量資料以均數±標準差()表示,多組間比較采用方差分析,組間兩兩比較采用LDS-t檢驗,以P<0.05為差異有統計學意義。
2.1 METTL3 siRNA轉染效果及其對HG誘導的NRK-52E和HBZY-1細胞增殖的影響METTL3 siRNA1組、METTL3 siRNA2組、METTL3 siRNA3組METTL3 mRNA表達均下調,且siRNA1效果最佳,見圖1。因此選擇siRNA1作為后續轉染片段。NRK-52E和HBZY-1細胞中,HG+METTL3 siRNA組增殖活性均較HG組提高,且METTL3 siRNA對NRK-52E細胞的促增殖作用較明顯,見表1。因此選擇NRK-52E細胞進行后續實驗。

圖1 RT-qPCR法驗證3條METTL3 siRNA轉染效果
表1 METTL3 siRNA對HG誘導的NRK-52E和HBZY-1細胞增殖的影響 ,n=3

表1 METTL3 siRNA對HG誘導的NRK-52E和HBZY-1細胞增殖的影響 ,n=3
與對照組比較,*P<0.05;與HG組比較,#P<0.05。
2.2 METTL3 siRNA對HG誘導的NRK-52E細胞周期的影響HG+METTL3 siRNA組G1期細胞所占百分比較HG組降低,而S期細胞所占百分比較HG組升高,HG+siRNA-NC組與HG組比較,差異無統計學意義(P>0.05),見圖2、表2。

圖2 各組細胞周期比較
表2 METTL3 siRNA對HG誘導的NRK-52E細胞周期的影響 ,n=3

表2 METTL3 siRNA對HG誘導的NRK-52E細胞周期的影響 ,n=3
與對照組比較,*P<0.05;與HG組比較,#P<0.05。
2.3 METTL3 siRNA可抑制HG處理的NRK-52E細胞TGF-β1、smad2及miR-126表達 與對照組比較,HG組METTL3、smad2蛋白表達及TGF-β1水平升高;與HG組比較,HG+METTL3 siRNA組MET-TL3、smad2蛋白表達及TGF-β1水平降低;HG組與HG+siRNA-NC組比較,差異無統計學意義(P>0.05),見圖3、表3。
表3 METTL3 siRNA對NRK-52E細胞TGF-β1、METTL3、smad2及miR-126表達的影響 ,n=3

表3 METTL3 siRNA對NRK-52E細胞TGF-β1、METTL3、smad2及miR-126表達的影響 ,n=3
與對照組比較,*P<0.05;與HG組比較,#P<0.05。

圖3 Western blotting蛋白電泳圖
2.4 METTL3與miR-126的相互作用RIP結果顯示:METTL3 siRNA可降低HG處理的NRK-52E細胞miR-126的成熟能力,見圖4。表明METTL3可通過結合miR-126發揮作用。

圖4 RIP實驗驗證METTL3與miR126的相互作用
m6A修飾包括甲基化轉移酶(METTL3、METTL14等)、去甲基化轉移酶(FTO)和識別蛋白(YTH家族)[14]。本研究發現,HG誘導的NRK-52E細胞中METTL3表達量較對照組顯著升高,而METTL3 siRNA轉染的細胞METTL3表達水平下降。提示HG刺激可提高甲基轉移酶的表達,同時說明RNA甲基化可能調控DKD發病機制。本研究中,HG誘導的細胞增殖活性顯著降低,通過siRNA抑制METTL3表達后,細胞增殖活性明顯升高。細胞周期中G1期為DNA合成前期,S期為DNA合成期,G2為DNA合成后期。本研究結果顯示,METTL3 siRNA使得G1期細胞減少,S期和G2期細胞增加,表明沉默METTL3可促進HG誘導的NRK-52E細胞DNA復制,加快細胞周期進程,促進細胞分裂,這與細胞增殖率升高的結果相一致。
在DKD的病理生理過程中,腎纖維化是一個終點事件,主要特征為ECM蛋白的過度表達[15]。腎小管上皮細胞是DKD纖維化的主要來源,可以通過TGF-β1來調控[16]。而TGF-β1是DKD纖維化的重要生長因子之一,能引起細胞凋亡、肥大、表型轉換、ECM積累等[17]。TGF-β1介導的信號通路主要為TGF1/smad信號通路,該通路的激活誘導腎小球硬化和腎小管間質纖維化。本研究表明,TGF-β1、smad2在HG組中的表達量顯著升高,而這種表達變化可以被METTL3 siRNA抑制。提示METTL3 siRNA可能通過阻斷TGF1/smad2信號通路抑制HG誘導的NRK-52E細胞纖維化。
miRNA可被METTL3以m6A修飾依賴的方式調控,METTL3可影響miRNA的成熟,METTL3表達升高會增加miRNA含量,從而激活相關信號通路,促進疾病的發生和發展[18]。本研究發現,在HG環境下細胞miR-126的表達量升高,METTL3 siRNA明顯降低miR-126的表達量。為了進一步揭示METTL3與miR-126之間的相關性,本研究采用RIP實驗,針對目標蛋白的抗體將相互作用的miR-126和METTL3蛋白復合物沉淀下來,經過分離純化對結合在復合物上的miR-126進行分析,結果表明METTL3可以特異性靶向miR-126并影響其表達。
綜上所述,METTL3在HG誘導的腎小管上皮細胞中的表達上調,抑制細胞增殖,其可能的作用機制為METTL3甲基化修飾miR-126,激活TGF-β1/smad2信號通路。本研究為DKD的機制研究提供了新的方向。