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基于生物信息學的椎間盤退變miRNA-mRNA 調控關系的分析

2022-08-09 06:33:40杜文佳晏麗李延宏
甘肅醫藥 2022年6期
關鍵詞:數據庫信號分析

杜文佳 晏麗 李延宏

1.蘭州大學第二醫院/甘肅省骨關節病重點實驗室,甘肅 蘭州730030;2.蘭州現代職業技術學院,甘肅 蘭州730000

下腰痛(low back pain,LBP)是世界范圍內重要的醫學問題,給社會和患者造成了巨大的經濟負擔[1]。據相關研究表明,超過80%的成年人在生命中的某個階段會遭受LBP[2]。其中,約10%的腰痛患者會發展為慢性殘疾[3]。LBP 的病因是多方面的,包括遺傳原因,生活方式和老化[4-7]。盡管LBP 的病因很復雜,但椎間盤退變(intervertebral disc deqeneration,IDD)被認為是主要原因[8]。正常椎間盤(IVD)是由髓核(NP)、纖維環(AF)和軟骨終板(CEP)組成的無血管纖維軟骨墊[9]。NP 組織通過產生細胞外基質(ECM)在維持IVD 完整性方面發揮重要作用。越來越多的研究表明,異常的NP 細胞功能在IDD 的發病機制中起關鍵作用[10,11]。現有證據表明,IDD 的發生與多種因素相關,包括身體損傷、遺傳易感性、微環境變化和炎癥[12,13]。目前對于IDD 的治療主要側重于藥物治療和手術,暫時緩解疼痛癥狀。然而,這些治療并沒有完全解決IDD[14]。因此,應從分子層面開展針對IDD 的分子靶向治療,從根本上預防IDD或恢復IVD 功能[15]。既往研究表明,許多編碼基因在IDD 中存在差異表達,其中一些已被證明在IDD中起重要作用[16]。

作為基因表達的關鍵調節因子,miRNA 是一種內源性基因編碼的小型非編碼RNA,通過與靶mRNA 分子的3′-非翻譯區(3′-UTR)結合來調節基因轉錄后的表達[17]。通常,初級miRNA 在細胞核中產生,并通過Dicer 酶在細胞質中進一步加工為成熟的miRNA。在摻入RNA 誘導的沉默復合物(RISC)后,它們可以靶向抑制多個mRNA 的翻譯,從而調節大約30%的人類蛋白質編碼基因和多個細胞內過程,包括細胞增殖、凋亡和細胞因子釋放[18]。……

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