內蒙古自治區農牧業科學院農畜產品加工研究所

內蒙古自治區農牧業科學院農畜產品加工研究所先后與內蒙古科爾沁右翼中旗特牧牧業開發有限公司（掛牌動物福利示范基地）、內蒙古牧名食品有限責任公司（掛牌地方特色乳制品加工研發合作基地）、內蒙古大啟食品有限公司（掛牌高原紅蔥加工研發基地）、內蒙古食全食美股份有限公司（掛牌科研成果轉化合作基地）、內蒙古朝日農業科技有限公司（掛牌科研合作單位）、內蒙古蘇太食品有限責任公司、科右前旗恒佳果業有限公司、正鑲白旗蒙盛肉類有限責任公司、開魯縣魯豐實業投資有限公司、內蒙古額爾敦羊業股份有限公司、內蒙古薩霖乳業有限公司、赤峰市巴林左旗孟和奶食品有限公司、內蒙古準露山野食品有限公司等建立了長期合作關系。

此外，先后與中國農業科學院農產品加工研究所、吉林農科院農產品加工研究所、遼寧農科院食品與加工研究所、黑龍江農科院食品加工研究所、中國農業科學院果樹研究所、廣東農科院蠶業與農產品加工研究所、云南農科院農產品加工研究所、江蘇農科院農產品加工研究所和廣西農科院農產品加工研究所等科研院所和中國農業大學、西北農林科技大學、南京農業大學食品科學技術學院等高等院校建立了業務聯系。

在國際合作交流方面，該所與蒙古國農業大學畜牧業與生物科學學院、蒙古國達爾罕農業科學院、蒙古國KAYSER Fleischerei有限責任公司、美國密西西比州立大學、匈牙利圣伊斯特萬大學花卉栽培與樹木學院等建立了長期友好的合作關系。