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低氧調(diào)控p53RFP基因啟動(dòng)子活性的初步研究

2023-02-15 05:50:50裴靜嫻王月剛
廣州醫(yī)藥 2023年1期

裴靜嫻 莫 沛 王月剛

1 廣州醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院心血管內(nèi)科(廣州 510260) 2 南方醫(yī)科大學(xué)南方醫(yī)院心血管內(nèi)科(廣州 510515)

低氧是心血管疾病發(fā)病過(guò)程中一個(gè)常見的病理生理因素,特別是在心肌梗死、心力衰竭發(fā)病過(guò)程中發(fā)揮重要的作用[1]。HIF-1α 作為調(diào)節(jié)細(xì)胞對(duì)低氧適應(yīng)性反應(yīng)的重要轉(zhuǎn)錄因子,通過(guò)與低氧反應(yīng)元件(hypoxia responsive element,HRE)核心DNA序列5′-RCGTG- 3′結(jié)合激活基因轉(zhuǎn)錄[2],從而調(diào)節(jié)多種下游靶基因的表達(dá),參與了紅細(xì)胞生成、鐵代謝、葡萄糖代謝、血管生成、細(xì)胞增殖與凋亡等多種生理病理過(guò)程[3- 4]。

p53RFP是調(diào)控細(xì)胞增殖和凋亡的一個(gè)重要基因[5],最初被鑒定為受p53調(diào)控的基因,其產(chǎn)物具有E3泛素連接酶活性,通過(guò)泛素化降解細(xì)胞周期調(diào)控因子p21WAF1/CIP1 參與細(xì)胞增殖和凋亡。生物信息學(xué)分析顯示p53RFP啟動(dòng)子區(qū)域存在多個(gè)低氧反應(yīng)元件,而p53RFP基因表達(dá)是否受低氧的調(diào)控尚未見相關(guān)報(bào)道。因此,本研究擬觀察低氧對(duì)p53RFP基因表達(dá)及p53RFP啟動(dòng)子活性的影響,并探索HIF-1α潛在的結(jié)合位點(diǎn)HRE在低氧調(diào)控p53RFP基因啟動(dòng)子活性中的作用。

1 材料與方法

1.1 試劑與細(xì)胞

HEK293細(xì)胞、E.coli DH5α 由本課題組保存,pGL3-p53RFP 載體由本課題組前期構(gòu)建;pRL-SV40、雙熒光素酶檢測(cè)試劑盒購(gòu)自Promega公司;定向突變?cè)噭┖匈?gòu)于Stratagene公司;Lipofectamine 2000、TRIzol、質(zhì)粒中提試劑盒均購(gòu)于Invitrogen公司;質(zhì)粒小提取試劑盒購(gòu)自Biomiga公司;逆轉(zhuǎn)錄試劑盒購(gòu)自Takara公司;熒光定量PCR試劑盒購(gòu)自 Roche公司;ECL發(fā)光試劑盒、 PVDF膜購(gòu)自Millipore公司;兔抗HIF-1α多克隆抗體購(gòu)自Abcom公司;小鼠抗p53RFP單克隆抗體購(gòu)自Abnova公司;小鼠抗β-actin 單克隆抗體、羊抗鼠辣根過(guò)氧化物酶標(biāo)記二抗、羊抗兔辣根過(guò)氧化物酶標(biāo)記二抗均購(gòu)自Santa Cruz公司。

1.2 方法

1.2.1 低氧對(duì)HEK293細(xì)胞p53RFP mRNA及蛋白表達(dá)的影響 將HEK293細(xì)胞消化為單細(xì)胞懸液、計(jì)數(shù),以4×105細(xì)胞總數(shù)接種于60 mm細(xì)胞培養(yǎng)皿,置于常規(guī)細(xì)胞培養(yǎng)箱(37 ℃,5% CO2,21% O2)培養(yǎng)24小時(shí),細(xì)胞換新鮮培養(yǎng)基。將細(xì)胞置入低氧培養(yǎng)箱(37 ℃,1% O2,5% CO2,94% N2)分別培養(yǎng)0、3、6、12小時(shí),TRIzol法提取細(xì)胞總RNA,細(xì)胞裂解液提取細(xì)胞總蛋白。

1.2.1.1 實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)mRNA表達(dá) 以RNA為模板逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA,應(yīng)用熒光定量PCR試劑盒,以β-actin基因?yàn)閮?nèi)對(duì)照,行 Real-time PCR,反應(yīng)條件:95 ℃ 10 min;95℃ 10 s,60 ℃ 30 s,共40個(gè)循環(huán)。引物序列如下:p53RFP 上游5′CATCTGGACCCCTACCGAACA 3′,下游5′ACACGAGCAGAATTTCAGGTG3′;β-actin 上游5′CAAATGCTTCTAGGCGGA CTATG 3′,下游5′TGCGCAAGTTAG GTTTTGTCA 3′。

1.2.1.2 Western blot 檢測(cè)蛋白表達(dá) 將蛋白加入SDS加樣緩沖液,100 ℃加熱5 min,取20 μg總蛋白上樣,行SDS-PAGE電泳,電轉(zhuǎn)移至PVDF膜,依次5%脫脂牛奶封閉2~3 h, 一抗(HIF-1α稀釋比例為1:700;p53RFP稀釋比例為1:500;β-actin稀釋比例為1:1000)孵育過(guò)夜,TBST 洗 膜10 min×3次,二抗(稀釋比例為1:10000)室溫孵育1 h,TBST 洗膜10 min×3次,ECL發(fā)光。

1.2.2 構(gòu)建突變型p53RFP啟動(dòng)子熒光素酶報(bào)告基因載體 p53RFP啟動(dòng)子區(qū)域-1118/-1115 、-636/-633存在2個(gè)低氧反應(yīng)元件特征序列,我們將可能的HRE核心序列5′-RCGTG- 3′分別突變成RTACA,構(gòu)建p53RFP啟動(dòng)子HRE單突變型(pGL3-p53RFPM)或雙突變型熒光素酶報(bào)告基因載體(pGL3-p53RFPM2)。以野生型p53RFP啟動(dòng)子1230bp截短片段的熒光素酶報(bào)告基因載體(pGL3-p53RFP)為模板,設(shè)計(jì)針對(duì) -1118/-1115 區(qū)域HRE 突變引物,引物序列如下:上游引物5′GGTGCCTGTTGGTACACACAGATCCTTTCC 3′;下游引物:5′GGAAAGGATCTGTGTGTACCAACAGG-CACC3′,按照定點(diǎn)突變?cè)噭┖胁僮髡f(shuō)明,PCR擴(kuò)增突變DNA。PCR結(jié)束后,向擴(kuò)增產(chǎn)物中加入2 μL Dpn I,37 ℃水浴5分鐘,切掉未突變的超螺旋雙鏈DNA。將Dpn I處理的DNA轉(zhuǎn)化超級(jí)感受態(tài)細(xì)胞,轉(zhuǎn)化產(chǎn)物涂Amp+LB培養(yǎng)板,37 ℃培養(yǎng)14~16 h。挑取單克隆,接種至LB液體培養(yǎng)基,小提質(zhì)粒,送華大基因公司測(cè)序。

以-1118/-1115 區(qū)域HRE 突變成功的p53RFP 啟動(dòng)子熒光素酶報(bào)告基因載體(pGL3-p53RFPM)為模板,設(shè)計(jì)針對(duì)- 636/- 633 HRE位點(diǎn)的突變引物,引物序列如下:上游引物5′CAGTTGTCTGCCATACAGGAAGGCAGGTC3′;下游引物5′GACCTG CCTTCCTGTATGGCAGACAACTG3′,構(gòu)建HRE雙突變型啟動(dòng)子報(bào)告基因(pGL3-p53RFPM2)。

1.2.3 雙熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)系統(tǒng)檢測(cè)低氧對(duì)p53RFP基因啟動(dòng)子活性的影響 按照Lipofectamine 2000操作說(shuō)明,將250 ng野生型及突變型p53RFP啟動(dòng)子熒光素酶報(bào)告載體分別轉(zhuǎn)染48孔細(xì)胞培養(yǎng)板的HEK293細(xì)胞,共轉(zhuǎn)染25 ng pRL-SV40作為內(nèi)參,以pGL3-Basic轉(zhuǎn)染組作為陰性對(duì)照。分別置于常規(guī)細(xì)胞培養(yǎng)箱及低氧培養(yǎng)箱培養(yǎng)。轉(zhuǎn)染24小時(shí)后收集細(xì)胞,應(yīng)用雙熒光素酶檢測(cè)試劑盒,經(jīng)化學(xué)法發(fā)光儀檢測(cè)螢火蟲及海蜃光子數(shù),以螢火蟲光子數(shù)與海蜃光子數(shù)的比值作為相對(duì)熒光素酶活性。

1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

2 結(jié) 果

2.1 低氧對(duì)HEK293細(xì)胞p53RFP及HIF-1α基因表達(dá)的影響

實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)低氧對(duì)HEK293細(xì)胞p53RFP mRNA表達(dá)的影響,結(jié)果顯示:低氧處理不同時(shí)間點(diǎn)p53RFP mRNA 表達(dá)水平均顯著增加(F=96.493,P<0.001),與低氧0 h組相比,低氧培養(yǎng)3 h、6 h、12 h的p53RFP mRNA表達(dá)水平均顯著升高,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P分別為0.01,<0.001,<0.001),見圖1A。

Western blot 檢測(cè)低氧對(duì)HEK293細(xì)胞p53RFP及HIF-1α蛋白表達(dá)的影響,結(jié)果顯示:與常氧組相比,低氧組不同時(shí)間點(diǎn)p53RFP及HIF-1α蛋白表達(dá)水平均明顯上調(diào),且呈時(shí)間依賴性遞增趨勢(shì),見圖1B。

圖1 低氧對(duì)p53RFP 基因表達(dá)表達(dá)的影響條帶旁邊標(biāo)注蛋白大小注:A,熒光定量PCR檢測(cè)低氧處理不同時(shí)間p53RFP mRNA表達(dá)水平的變化,與0小時(shí)相比, **P<0.01, ***P<0.001;B,Western blot 檢測(cè)低氧處理不同時(shí)間p53RFP及HIF-1α蛋白表達(dá)水平的變化

2.2 突變型p53RFP基因啟動(dòng)子熒光素酶報(bào)告基因載體構(gòu)建

基因測(cè)序結(jié)果經(jīng)NCBI 基因序列對(duì)比,結(jié)果顯示pGL3-p53RFPM 單突變載體啟動(dòng)子區(qū)域-1118/-1115 HRE核心序列5′-RCGTG- 3′突變成RTACA,pGL3-p53RFPM雙突變載體啟動(dòng)子區(qū)域-1118/-1115 、-636/-633 HRE核心序列5′-RCGTG- 3′均突變成RTACA,證明HRE單突變型(pGL3-p53RFPM)及雙突變型(pGL3-p53RFPM2)熒光素酶報(bào)告基因載體構(gòu)建成功。載體示意圖見圖2,測(cè)序結(jié)果見圖3。

圖2 p53RFP基因啟動(dòng)子熒光素酶報(bào)告載體示意圖

2.3 低氧對(duì)p53RFP基因啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄活性的影響

雙熒光素酶檢測(cè)結(jié)果顯示:與常氧組野生型p53RFP啟動(dòng)子活性相比,低氧組野生型p53RFP基因啟動(dòng)子活性顯著增加(t=-19.504,P<0.001),盡管低氧仍能增加pGL3-p53RFPM及pGL3-p53RFPM2 啟動(dòng)子活性,但低氧條件下,HRE單突變或雙突變均較野生型p53RFP啟動(dòng)子活性顯著下降(F=160.891,P<0.001)。

圖3 突變型p53RFP基因啟動(dòng)子熒光素酶報(bào)告基因載體測(cè)序結(jié)果 注:A:pGL3-p53RFPM 測(cè)序結(jié)果,-1118/-1115 HRE(CGTG)突變?yōu)門ACA(下劃線處); B、C: pGL3-p53RFPM2測(cè)序結(jié)果,-1118/-1115 及- 636/- 633HRE(CGTG)均突變?yōu)門ACA(下劃線處)

圖4 低氧對(duì)野生型及突變型p53RFP啟動(dòng)子活性的影響注:與常氧組pGL3-p53RFP啟動(dòng)子活性比較, ***P<0.001;與低氧組pGL3-p53RFP啟動(dòng)子活性比較, ###P <0.001

3 討 論

低氧是機(jī)體最常見的病理生理過(guò)程,大多數(shù)情況下,短暫的缺氧和HIF-1α低氧信號(hào)通路的激活是有益的。然而,在某些慢性損傷、慢性缺氧及病理修復(fù)的情況下,低氧途徑的激活可能導(dǎo)致組織纖維化及器官功能損傷[6]。大量研究表明低氧通過(guò)介導(dǎo)HIF-1α的穩(wěn)定表達(dá)在急性心肌缺血中減輕梗死面積、保護(hù)心功能。但也有證據(jù)表明在慢性缺血中HIF-1α的長(zhǎng)期激活可促進(jìn)心肌重構(gòu)和心功能惡化。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)顯示HIF-1α的持續(xù)激活可能參與了缺血性心肌病的發(fā)病過(guò)程,同樣在慢性缺血性心肌病患者的尸檢組織中也檢測(cè)到了心肌HIF-1α蛋白的高表達(dá)[10]。同樣,低氧也是心臟肥厚的病理特征,有研究表明HIF-1α參與了壓力超負(fù)荷誘導(dǎo)的心肌肥厚[11]。此外,Lei等構(gòu)建了心肌細(xì)胞特異性 VHL基因缺失小鼠,結(jié)果顯示VHL基因缺失小鼠嚴(yán)重心衰的發(fā)生與HIF-1α的持續(xù)表達(dá)直接相關(guān)[12]。因此, HIF-1α在急性心肌缺血中既發(fā)揮了心臟保護(hù)作用,也可能參與了心梗后續(xù)心衰的發(fā)生發(fā)展過(guò)程。然而,HIF-1α通過(guò)激活哪些信號(hào)通路參與了缺血性心肌病的發(fā)病過(guò)程目前尚不明確。

p53RFP是受p53家族成員調(diào)控的一個(gè)基因,具有E3泛素連接酶活性。研究表明p53RFP 通過(guò)泛素化降解Bax、p21、p63,在調(diào)控細(xì)胞凋亡、細(xì)胞周期中發(fā)揮重要作用。我們的研究顯示低氧可促進(jìn)p53RFP mRNA及蛋白表達(dá)增加,其mRNA表達(dá)上調(diào)更加顯著,提示低氧對(duì)p53RFP基因表達(dá)的調(diào)控可能主要發(fā)生在轉(zhuǎn)錄水平。同時(shí),低氧條件下,HIF-1α與p53RFP蛋白表達(dá)趨勢(shì)均呈時(shí)間依賴性。生物信息學(xué)分析顯示p53RFP基因啟動(dòng)子區(qū)域存在多個(gè)低氧反應(yīng)元件。因此,我們推測(cè)低氧可能通過(guò)HIF-1α介導(dǎo)了p53RFP基因轉(zhuǎn)錄激活。

為此,本研究在野生型p53RFP雙熒光素酶報(bào)告載體的基礎(chǔ)上[15],構(gòu)建了低氧反應(yīng)元件突變型的p53RFP雙熒光素酶報(bào)告載體。我們通過(guò)雙熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)了低氧對(duì)野生型及突變型p53RFP啟動(dòng)子活性的影響,結(jié)果顯示低氧可顯著增加野生型p53RFP基因啟動(dòng)子活性,HRE單突變或雙突變后,p53RFP啟動(dòng)子活性顯著下降。以上研究結(jié)果表明低氧可能通過(guò)啟動(dòng)子區(qū)域的低氧反應(yīng)元件調(diào)控p53RFP基因表達(dá),p53RFP啟動(dòng)子區(qū)域位點(diǎn)的-1118/-1115、- 636/- 633 位點(diǎn)的低氧反應(yīng)元件可能是HIF-1α潛在的結(jié)合位點(diǎn),提示p53RFP可能是HIF-1α直接調(diào)控的一個(gè)靶基因。因此,我們推測(cè)p53RFP作為調(diào)控細(xì)胞增殖和凋亡的一個(gè)重要基因,可能參與了低氧誘導(dǎo)的細(xì)胞損傷過(guò)程。

綜上所述,本研究首次表明低氧可能通過(guò)HIF-1α介導(dǎo)了對(duì)p53RFP基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控。野生型及突變型p53RFP雙熒光素酶報(bào)告基因載體的成功構(gòu)建,為下一步深入研究低氧調(diào)控p53RFP的分子機(jī)制及生物學(xué)效應(yīng)奠定了基礎(chǔ)。

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