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《中國醫藥科學》雜志以“報道醫藥研究進展、反映醫藥發展動態、推廣醫藥創新成果、普及醫藥適用技術、交流醫藥臨床經驗、探討醫藥工作熱點、服務醫藥科研人員、促進醫藥科學發展”為宗旨。設有專家論壇、論著、綜述、基礎醫學、生物醫學、藥物研究、中醫研究、中西醫結合醫學、臨床研究、婦幼健康、腫瘤醫學、五官醫學、神經疾病研究、臨床藥物應用、護理研究、檢驗醫學、麻醉與疼痛、放射與影像、微生物與感染、衛生統計與流行病、調查研究、預防醫學、公共衛生、科研管理、醫療管理、藥事管理、護理管理、醫藥教育、器械設備、藥業論壇等近40個欄目，涵蓋了醫藥科學門類的所有二級學科和部分三級學科。

《中國醫藥科學》雜志立足醫藥科研、教育和臨床研究前沿，面向海內外醫藥科研、教育、醫護和經營管理人員，客觀、全面地報道醫藥科研進展和業界發展動態，積極、快速地發布國內廣大醫藥衛生工作者的新思路、新理論、新觀點、新發現、新技術、新成果、新方法、新措施、新經驗等。報道內容不僅涵蓋醫學、藥學科研、教育和臨床各個學科，還涉及醫療器械、醫療和藥品管理與經營、醫藥政策與法規等。

《中國醫藥科學》雜志將進一步突出“出版周期短、報道時效強、涉及學科廣、審稿專家多、編輯業務精、審稿速度快、發稿周期短和服務意識高”為特色；堅持以科學的精神和實事求是的態度，關注醫學熱點、崇尚研究創新、鼓勵百家爭鳴、倡導誠實守信、注重學術質量；通過不斷提高編審速度和報道時效，以及優質、高效的服務態度和工作熱情，努力成為廣大醫藥科研人員和熱心于醫藥科學事業的人們進行科研創新與學術交流的堅實平臺和精神家園。