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綿羊源地衣芽孢桿菌的分離和鑒定

2023-04-22 08:42:30祖麗胡瑪爾艾尼
湖北畜牧獸醫(yī) 2023年4期

祖麗胡瑪爾·艾尼

(塔里木大學(xué)動(dòng)物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,新疆阿拉爾 843300)

地衣芽孢桿菌是廣泛存在于自然環(huán)境中的需氧或兼性厭氧桿狀菌,大部分為非致病性菌,菌體桿狀兩端鈍圓或平截,產(chǎn)生芽孢,長(zhǎng)度可達(dá)10.0 μm。

地衣芽孢桿菌作為對(duì)宿主健康有益的天然治療劑,具有安全、無(wú)污染、不含殘留化合物等特點(diǎn)[1],可通過(guò)多種機(jī)制調(diào)節(jié)宿主免疫系統(tǒng),并產(chǎn)生短鏈脂肪酸提供能量,調(diào)節(jié)宿主腸道菌群平衡[2]。被廣泛應(yīng)用于醫(yī)療、制藥、農(nóng)業(yè)和工業(yè)及人類保健品等方面[3]。

地衣芽孢桿菌存在大量與碳水化合物代謝有關(guān)的基因,以及糖苷水解酶、多糖裂解酶和碳水化合物酯酶等[4],這些代謝途徑中的酶可以幫助部分動(dòng)物消化。本研究經(jīng)過(guò)細(xì)菌分離純化及形態(tài)學(xué)觀察、生化試驗(yàn)、藥敏試驗(yàn)、抑菌試驗(yàn)、16S rRNA 基因序列分析及小白鼠影響試驗(yàn),為綿羊的生長(zhǎng)環(huán)境及天然放牧飼養(yǎng)方式研究、提高養(yǎng)殖收入提供理論依據(jù),為綿羊飼料添加劑研究提供參考。

1 材料與方法

1.1 樣品來(lái)源

阿克蘇某規(guī)模化羊場(chǎng)的一只綿羊胸腔滲出液。

1.2 試驗(yàn)動(dòng)物

6 只健康昆明小鼠,體重16~22 g,購(gòu)自塔里木大學(xué)。

1.3 試劑與儀器

胰蛋白胨大豆肉湯,購(gòu)自北京索萊寶科技有限公司;瓊脂粉,購(gòu)自生工生物工程(上海)股份有限公司;瓊脂糖,購(gòu)自美國(guó)英杰生命技術(shù)有限公司;藥敏片,購(gòu)自杭州微生物試劑有限公司;細(xì)菌基因組DNA 提取試劑盒,購(gòu)自天根生化科技(北京)有限公司;T5 Zero Vector,購(gòu)自北京全式金生物技術(shù)有限公司;搖床,購(gòu)自天津歐諾儀器股份有限公司;恒溫培養(yǎng)箱,購(gòu)自上海博訊實(shí)業(yè)有限公司;2×EasyTaq PCR SuperMix(+dye)、DL-2000 Marker,購(gòu)自塔克藍(lán)生物科技有限公司;全能成像凝膠系統(tǒng),購(gòu)自諾派森生物科技(上海)有限公司。

1.4 方法

1.4.1 細(xì)菌分離純化及形態(tài)觀察 用接種環(huán)取胸腔滲出液劃線在胰蛋白胨瓊脂培養(yǎng)基上,置于37 ℃的恒溫培養(yǎng)箱培養(yǎng)14~24 h。挑取單個(gè)菌落接種到胰蛋白胨液體培養(yǎng)基上,置于37 ℃、200 r/min 搖菌12~16 h,純化培養(yǎng);采集綿羊血制備8%的鮮血培養(yǎng)基,將分離株接種到血平板上,置于37 ℃的恒溫培養(yǎng)箱培養(yǎng)22 h 后觀察溶血現(xiàn)象。

在無(wú)菌操作臺(tái)里,載玻片上滴1 滴蒸餾水,挑單個(gè)菌落涂布均勻,用酒精燈火焰固定后,結(jié)晶紫處理2 min、碘液處理3 min、酒精脫色30 s、復(fù)紅染色液復(fù)染30 s,觀察細(xì)菌形態(tài)。

1.4.2 生化試驗(yàn) 將菌液接種于生化管,37 ℃恒溫培養(yǎng)14~24 h 后觀察結(jié)果。

1.4.3 16S rRNA 鑒定 以提取的DNA 為模板,參照參考文獻(xiàn)[5]的細(xì)菌16S rRNA 基因擴(kuò)增引物,上游引物序列為27F 5' -AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3',下游引物序列為1 492R 3'-GGTTACCTTGTTACGACTT-5',目的條帶大小1 500 bp 左右,由上海桑尼公司合成,引物最終使用濃度為10 pmol/μL,稀釋后于-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

PCR 擴(kuò)增體系25 μL:2×EasyTaq PCR SuperMix(+dye)12.5 μL,ddH2O 9.5 μL,上下引物各0.5 μL,DNA 模板2 μL。PCR 擴(kuò)增程序,94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸90 s,35 個(gè)循環(huán);72 ℃終延伸10 min。取5 μL PCR 產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),觀察結(jié)果。PCR 產(chǎn)物送上海賽恒生物科技有限公司測(cè)序。

1.4.4 檢測(cè)陽(yáng)性克隆 切膠后按照說(shuō)明書進(jìn)行膠回收,目的基因與T5 Zero Vector 連接轉(zhuǎn)化后,將產(chǎn)物在LB 液體培養(yǎng)基置200 r/min,37 ℃搖5 h 后,將菌液涂布到含Amp 的LB 瓊脂培養(yǎng)基上過(guò)夜培養(yǎng),挑取單個(gè)菌落加入5 μL 無(wú)菌水混合均勻作為模板DNA,上下引物用M13F、M13R 擴(kuò)增PCR。

PCR 擴(kuò)增體系25 μL:2×EasyTaq PCR SuperMix(+dye)12.5 μL,ddH2O 9.5 μL,上下引物各0.5 μL,DNA 模板2 μL。PCR 擴(kuò)增程序,94 ℃預(yù)變性10 min;94 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸90 s,30 個(gè)循環(huán);72 ℃終延伸10 min。取5 μL PCR 產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),觀察結(jié)果。PCR 產(chǎn)物送上海賽恒生物科技有限公司測(cè)序。

1.4.5 抑菌試驗(yàn)

1)對(duì)金黃色葡萄球菌的抑制。吸100 μL 新鮮的金黃色葡萄球菌菌液涂布至胰蛋白胨瓊脂培養(yǎng)基上,用牛津杯打孔后將地衣芽孢桿菌接種至孔里,在37 ℃的恒溫培養(yǎng)箱培養(yǎng)14~22 h 后觀察結(jié)果。

2)對(duì)大腸桿菌的抑制。吸100 μL 新鮮的大腸桿菌菌液涂布至胰蛋白胨瓊脂培養(yǎng)基上,用牛津杯打孔后將地衣芽孢桿菌接種至孔里,在37 ℃恒溫培養(yǎng)箱培養(yǎng)14~22 h 后觀察結(jié)果。

3)對(duì)沙門氏菌的抑制。吸100 μL 新鮮的沙門氏菌菌液涂布至胰蛋白胨瓊脂培養(yǎng)基上,用牛津杯打孔后將地衣芽孢桿菌接種至孔里,在37 ℃恒溫培養(yǎng)箱培養(yǎng)14~22 h 后觀察結(jié)果。

抑菌試驗(yàn)結(jié)果判定標(biāo)準(zhǔn)如下,抑菌圈直徑均≥15 mm 為高度敏感,抑菌效果良好[6]。

1.4.6 藥敏試驗(yàn) 取100 μL 的菌液涂布到瓊脂培養(yǎng)基上,將藥敏片貼到菌液均勻的位置,在37 ℃的恒溫培養(yǎng)箱培養(yǎng)14~22 h。測(cè)量藥敏圈直徑(Diameter of inhibition zone,DIZ)。

藥敏性結(jié)果判定標(biāo)準(zhǔn)如下,DIZ=0 mm 為不敏感;0 mm<DIZ≤17 mm 為中敏感;DIZ>17 mm 為敏感[7]。

1.4.7 對(duì)小白鼠的影響試驗(yàn) 小白鼠稱體重后,分別給試驗(yàn)組小白鼠注射菌液,對(duì)照組小白鼠注射等量的生理鹽水,其他管理措施不變,21 d 后觀察有無(wú)不良反應(yīng)、精神狀態(tài)、腹瀉、中毒等癥狀,結(jié)束后剖解觀察內(nèi)臟有無(wú)病理變化[8]。

2 結(jié)果與分析

2.1 細(xì)菌分離純化及形態(tài)觀察

在胰蛋白胨瓊脂培養(yǎng)基培養(yǎng)12~16 h結(jié)果見(jiàn)圖1。由圖1 可知,菌落為圓形白色,外觀扁平,不透明,邊緣不整齊,表面粗糙皺褶。在含8%綿羊鮮血培養(yǎng)基培養(yǎng)22 h 結(jié)果見(jiàn)圖2。由圖2 可知,將菌液接種到鮮血平板上培養(yǎng)后,能觀察到草綠色的α 溶血。革蘭氏染色鏡檢結(jié)果見(jiàn)圖3。由圖3 可知,分離株為革蘭氏陽(yáng)性短桿菌。

圖2 8%綿羊鮮血培養(yǎng)基的生長(zhǎng)結(jié)果

圖3 革蘭氏染色鏡檢結(jié)果(10×100)

2.2 生化試驗(yàn)結(jié)果

將分離株接種于生化管培養(yǎng)22 h,結(jié)果見(jiàn)表1。由表1 可知,分離株對(duì)淀粉水解、觸酶、VP、脲酶、甘露醇、硝酸鹽還原陽(yáng)性;對(duì)葡萄糖酸鹽、檸檬酸鹽、苯丙氨酸、木糖、棉子糖陰性。

表1 生化試驗(yàn)結(jié)果

2.3 16S rRNA 基因鑒定結(jié)果

選擇16S rRNA 通用引物擴(kuò)增,PCR 產(chǎn)物1%的瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果見(jiàn)圖4。由圖4 可知,PCR 擴(kuò)增成功,目的條帶大小1 500 bp 左右,符合預(yù)期大小。

圖4 16S rRNA 擴(kuò)增結(jié)果

2.4 檢測(cè)陽(yáng)性克隆結(jié)果

從含Amp 的瓊脂培養(yǎng)基挑單個(gè)菌落進(jìn)行擴(kuò)增,結(jié)果見(jiàn)圖5。由圖5 可知,目的片段大小為1 500 bp左右,與預(yù)期大小符合。

圖5 檢測(cè)陽(yáng)性克隆結(jié)果

2.5 抑菌試驗(yàn)結(jié)果

取分離株100 μL 至對(duì)應(yīng)的孔里,抑菌試驗(yàn)結(jié)果見(jiàn)表2。由表2 可知,分離株對(duì)金黃色葡萄球菌高度敏感,對(duì)沙門氏菌中度敏感,對(duì)大腸桿菌低度敏感。

表2 抑菌試驗(yàn)結(jié)果

2.6 藥敏試驗(yàn)結(jié)果

將藥敏片貼到培養(yǎng)板上菌液均勻的位置,在37 ℃的恒溫培養(yǎng)箱培養(yǎng)22 h,結(jié)果見(jiàn)表3。由表3 可知,分離株對(duì)阿奇霉素、克林霉素耐藥,對(duì)四環(huán)素、環(huán)丙沙星、卡那霉素、呋喃唑啉、慶大霉素、頭孢氨芐、萬(wàn)古霉素、頭孢呋辛、頭孢哌酮、頭孢拉定敏感。

表3 藥敏試驗(yàn)結(jié)果

2.7 對(duì)小白鼠的影響

小白鼠沒(méi)出現(xiàn)不良反應(yīng),精神狀態(tài)正常,無(wú)中毒癥狀和腹瀉,解剖后內(nèi)臟沒(méi)有病理變化,分析發(fā)現(xiàn)該菌對(duì)小白鼠胸腺和脾臟的發(fā)育有促進(jìn)作用,對(duì)小白鼠的體質(zhì)有明顯的提高作用。

3 討論

本研究通過(guò)細(xì)菌分離純化及形態(tài)學(xué)觀察、生化鑒定試驗(yàn)、細(xì)菌16S rRNA 基因序列分析等方法,確認(rèn)從綿羊胸腔液分離到的菌株為地衣芽孢桿菌。

地衣芽孢桿菌是芽孢桿菌中應(yīng)用比較廣泛的菌株,國(guó)內(nèi)外對(duì)地衣芽孢桿菌應(yīng)用的報(bào)道較多[9-11],地衣芽孢桿菌作為一種無(wú)毒、無(wú)殘留、無(wú)抗藥性的益生菌在飼料生產(chǎn)中成為首選的飼料添加劑[12],在醫(yī)學(xué)上成為增加空腸絨毛高度、改善腸道吸收功能的保護(hù)劑[13],也可以抑制沙門氏菌[14]。在畜牧養(yǎng)殖方面,具有提高水產(chǎn)類的免疫力[15]、提高雞對(duì)沙門氏菌的抵抗力[16]等作用。進(jìn)一步挖掘新的芽孢桿菌資源,在世界范圍內(nèi)篩選自然環(huán)境中的芽孢桿菌,建立地方特色芽孢桿菌資源庫(kù),利用地方特色菌服務(wù)當(dāng)?shù)兀?7]。地衣芽孢桿菌具有菌體繁殖速度快,易培養(yǎng),抗逆性強(qiáng),耐酸堿、耐高溫、耐膽堿,能分泌蛋白酶以及多種氨基酸等特點(diǎn),在養(yǎng)殖業(yè)有較高的應(yīng)用價(jià)值。

隨著抗生素的廣泛應(yīng)用,藥物殘留和抗生素耐藥性呈上升趨勢(shì),抑菌試驗(yàn)表明,如出現(xiàn)沙門氏菌、金黃色葡萄球菌、大腸桿菌感染可以將地衣芽孢桿菌當(dāng)做抑制細(xì)菌的替代品。參考文獻(xiàn)[13]、[15]、[18]表明地衣芽孢桿菌對(duì)部分動(dòng)物具有促進(jìn)胃腸道功能、提高免疫力、提高肉雞的飼料利用率等作用。

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