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基于網絡藥理學和分子對接探討黃連溫膽湯治療幽門螺桿菌相關性胃炎的作用機制

2023-12-29 00:00:00劉文高云云尹志鵬呂剛王玉趙英會
山東科學 2023年2期

摘要: "運用網絡藥理學和分子對接方法探索黃連溫膽湯治療幽門螺桿菌相關性胃炎的分子機制。應用中藥系統藥理學數據庫與分析平臺對黃連溫膽湯藥物活性成分及藥物作用靶點基因進行篩選。通過Genecards 數據庫、DisGENET數據庫查找幽門螺桿菌相關性胃炎疾病相關靶點,利用維恩在線繪圖工具獲得疾病與藥物的共同靶點基因。利用Cytoscape 3.8.2軟件以及STRING數據庫分別構建藥物-化合物-靶點相互作用網絡及蛋白質-蛋白質相互作用網絡圖。運用DAVID數據庫進行基因本體功能和京都基因與基因組百科全書通路富集分析。選取度值排名前3的靶點蛋白和活性成分使用AutoDockTools 1.5.6軟件進行分子對接。共篩選得到槲皮素、川皮苷、柚皮素等127種黃連溫膽湯藥物活性成分,并獲得Akt1、JUN、TNF-α、STAT3等101個潛在靶點蛋白,涉及P53信號通路、NOD樣受體信號通路、TNF信號通路等90條信號通路。分子對接結果顯示關鍵靶點STAT3、TP53、Akt1與活性成分槲皮素、川皮苷、柚皮素的親和力較好,其中以Akt1與柚皮素的結合能力最強。通過分析黃連溫膽湯治療幽門螺桿菌相關性胃炎的作用靶點和相關信號通路,能夠為臨床應用和后續實驗研究提供理論基礎。

關鍵詞: 黃連溫膽湯;幽門螺桿菌相關性胃炎;網絡藥理學;分子對接

中圖分類號: R285 文獻標志碼:A文章編號:1002-4026(2023)02-0023-10

開放科學(資源服務)標志碼(OSID):

Network pharmacology and molecular docking analysis of the

mechanism of Huanglian Wendan Decoction in the treatment

of Helicobacter pylori associated gastritis

LIU Wenwen, GAO Yunyun, YIN Zhipeng, L Gang, WANG Yu, ZHAO Yinghui

(School of Basic Medical Science, Shandong First Medical University, Tai′an 271000, China)

Abstract∶ This study aimed to explore the mechanism of Huanglian Wendan Decoction in the treatment of Helicobacter pylori associated gastritis by network pharmacology and molecular docking methods. The active ingredients and drug target genes of Huanglian Wendan Decoction were screened using the traditional Chinese medicine system pharmacology database and analysis platform. The H. pylori associated gastritis disease-related targets were found by the GeneCards and DisGENET databases, and the common target genes of diseases and drugs were obtained via the Venny online mapping tool. Cytoscape 3.8.2 software and the STRING database were used to construct a drug-compound-target interaction network and a protein-protein interaction network diagram, respectively. Gene ontology function and Kyoto encyclopedia of genes and genomes pathway enrichment analysis were performed using the DAVID database. The target proteins and active ingredients with the top three selection scores were selected for molecular docking using Autodocktools 1.5.6 software. A total of 127 active ingredients of Huanglian Wendan Decoction were screened, such as quercetin, nobiletin, and naringenin. A total of 101 potential target proteins were obtained, such as Akt1, JUN, TNF-α, and STAT3, which involved 90 signal pathways, including the p53 signal pathway, NOD-like receptor signal pathway, and TNF signal pathway. Molecular docking results revealed that the key targets, STAT3, TP53, and Akt1, had high affinity for the active ingredients quercetin, nobiletin, and naringenin. In addition, Akt1 had the highest binding affinity for naringenin. Network pharmacology and molecular docking analysis predicted the action target and related signal pathway of Huanglian Wendan Decoction in the treatment of H. pylori associated gastritis, which will provide a theoretical basis for clinical application and subsequent experimental research.

Key words∶ Huanglian Wendan Decoction; Helicobacter pylori associated gastritis; network pharmacology; molecular docking

幽門螺桿菌Helicobacter pylori是感染胃黏膜最常見的病原體[1],流行病學研究表明,全球大約有一半人口感染幽門螺桿菌,在中國其感染率高達50%以上[2-4]。幽門螺桿菌相關性胃炎是一種由幽門螺桿菌感染后所引發的胃黏膜炎癥,可形成慢性炎癥,預后不良,被認為是消化性潰瘍和胃癌發生發展的潛在危險因素[5]。目前,臨床上通常將抗生素作為根除幽門螺桿菌感染的首選方法,主要包括標準的三聯療法和在其基礎上加入鉍劑的四聯療法[6-7]。近幾年,隨著抗生素廣泛使用,細菌的耐藥性不斷增加,尤其以克拉霉素為核心藥物的標準三聯療法耐藥情況最為嚴重[6]。2017年,WHO將耐克拉霉素的幽門螺桿菌列為對人類健康威脅最大的12種細菌之一[8]。因此,尋找能夠補充替代抗生素治療的其他方法,對于根治幽門螺桿菌感染至關重要。

已有研究表明,中藥在根除幽門螺桿菌和治療慢性胃炎方面具有較好的臨床效果[9]。黃連溫膽湯具有抗炎、調理脾胃失調、清熱燥濕等功效[10],研究發現,其藥物成分能夠抑制胃酸的分泌,并對幽門螺桿菌具有一定清除作用,對幽門螺桿菌相關性胃炎治療效果較為顯著[11]。但該藥物對幽門螺桿菌相關性胃炎治療的分子生物學機制還不清楚。因此,本研究采用網絡藥理學和分子對接的方法預測黃連溫膽湯治療幽門螺桿菌相關性胃炎的潛在靶點和相關信號通路等藥理機制,為后續實驗研究和在臨床上的應用提供參考。

1材料與方法

1.1黃連溫膽湯藥物活性成分及靶點的篩選

分別對黃連溫膽湯中的黃連、半夏、甘草、茯苓、枳實、生姜、陳皮等7種藥物運用中藥系統藥理學數據庫與分析平臺(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)(https://old.tcmsp-e.com/tcmsp.php)進行檢索,將篩選條件設置為口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%,類藥性(drug-likeness,DL)≥0.18,進一步獲得藥物的主要活性成分,之后運用TCMSP數據庫查詢上述藥物活性成分所對應的藥物作用蛋白靶點[12]。將獲得的所有蛋白靶點去重處理,利用Uniprot數據庫進行基因Symbol的轉換,最終獲得藥物活性成分的靶點基因。

1.2篩選疾病相關靶點和黃連溫膽湯治療幽門螺桿菌相關性胃炎的潛在靶點

在GeneCards數據庫(https://www.genecards.org/)和DisGENET數據庫(https://www.disgenet.org/)中輸入關鍵詞“Helicobacter pylori associated gastritis”、“Gastritis correlated to Helicobacter pylori”,查找幽門螺桿菌相關性胃炎疾病相關靶點,然后對疾病靶點進行合并去重處理[13-14]。運用Venny 2.1在線繪圖工具(https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html) 將幽門螺桿菌相關性胃炎疾病靶點基因和黃連溫膽湯藥物成分靶點基因進行整合,取交集后,最終獲得黃連溫膽湯治療幽門螺桿菌相關性胃炎的潛在靶點[15]。

1.3藥物-活性成分-潛在靶點網絡的構建

將藥物、活性成分、潛在靶點的數據進行處理整合后導入Cytoscape 3.8.2作圖軟件,構建藥物-活性成分-潛在靶點可視化網絡圖[16]。利用不同形狀的節點分別代表藥物、藥物活性成分、潛在靶點,邊用于表示三者之間的相互作用關系,運用Tool工具中的network analysis選項對節點進行分析,最終獲得各節點對應的度值(degree)。

1.4蛋白質-蛋白質相互作用網絡的構建

運用STRING數據庫(https://www.string-db.org/)對潛在靶點基因進行分析[17]。將物種設為“homo sapiens”,“high confidence”設置為0.9,獲得蛋白質-蛋白質相互作用(protein-protein interaction,PPI)關系后將TSV數據導出。將上述獲得的數據導入Cytoscape 3.8.2作圖軟件,通過設置degree值范圍,完成PPI網絡圖的繪制,其中節點的大小代表度值的高低,邊的粗細代表PPI關系的強弱程度。

1.5GO生物過程和KEGG通路富集分析

將黃連溫膽湯治療幽門螺桿菌相關性胃炎的潛在靶點基因輸入DAVID數據庫(https://david.ncifcrf.gov/)中[18]。設定物種為“Homo sapiens”,設定閾值Plt;0.01,分別進行基因本體( gene ontology, GO)分析和京都基因與基因組百科全書 ( Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)通路富集分析,得到數據后,將其導出,數據中-lg P值的大小代表著富集程度,值越大表示富集程度越大,最終選取富集程度排名前10的GO值和排名前20的KEGG值分別進行條形圖和氣泡圖的繪制。

1.6構建BP-CC-MF-KEGG-潛在靶點網絡

將藥物與疾病的交集靶點、GO分析中生物過程(biological process, BP)、細胞組分(cellular component, CC)、分子功能(molecular function, MF)富集度排名前10的數據和排名前20的KEGG信號通路數據導入Cytoscape 3.8.2軟件作圖工具,繪制BP-CC-MF-KEGG-潛在靶點網絡圖。

1.7分子對接

從PPI網絡圖和藥物-活性成分-靶點網絡圖中分別選取度值排名前3的靶點蛋白STAT3、TP53、Akt1與藥物活性成分槲皮素、川皮苷、柚皮素進行分子對接驗證。從PubChem數據庫(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/)中下載有效活性成分的結構式,利用Chem3D軟件制作相應的3D結構,并輸出為mol*2格式[19]。再從PDB 數據庫(http://www.rcsb.org/)下載核心蛋白結構域的pdb格式,得到STAT3、TP53、Akt1的PBD編號分別為6NJS、6VIP、3O96,接著利用 PyMOL 軟件對蛋白質進行去水、去磷酸根等操作。利用AutoDockTools 1.5.6軟件將藥物活性成分及核心蛋白基因文件pdb 格式轉換為pdbqt格式并尋找活性口袋,最后運行Vina腳本進行分子結合能計算以及分子對接結果展示,同時運行Discovery Studio 2019尋找對接位點并計算柔性結合的LibDockScore,將輸出的分子對接結果導入PyMOL軟件進行分子對接構象展示。若結合能為負值,說明配體與受體可自發結合,當Vina結合能≤-5.0 kJ/mol以及DS能找到對接位點,且LibDockScore≥100,說明兩者形成穩定對接,對配體-受體復合物進行分子對接結果3D、2D展示,以評價生物信息分析預測的可靠性。

2結果

2.1黃連溫膽湯藥物活性成分及靶點的篩選

運用TCMSP數據庫檢索黃連溫膽湯中的黃連、半夏、甘草、茯苓、枳實、生姜、陳皮等7種藥物活性成分,按照OB≥30%和DL≥0.18的檢索條件,共篩選得到166種藥物活性成分,將其中21種無對應藥物靶點蛋白的化合物和7種多藥物共有成分刪除、去重整合后,最終得到137種藥物活性化合物,多藥物共有活性成分見表1。利用TCMSP數據庫對137種藥物活性化合物對應的靶點蛋白進行查詢,獲得2 717個藥物作用的靶點蛋白,經過去重處理后,剩余260個。將260個藥物作用的靶點蛋白利用Uniprot數據庫進行規范化處理后,完成基因Symbol的轉換。

2.2篩選疾病相關靶點和黃連溫膽湯治療幽門螺桿菌相關性胃炎的潛在靶點

利用幽門螺桿菌相關性胃炎的英文名稱為關鍵詞在Genecards數據庫和DisGENET數據庫經過查找篩選,共得到800個疾病靶點,與上述獲得的260個藥物作用靶點進行維恩分析,最終得到101個交集靶點,作為黃連溫膽湯治療幽門螺桿菌相關性胃炎的直接作用靶點(OSID科學數據與內容附圖1)。

2.3藥物-活性成分-潛在靶點網絡的構建

為了進一步探索黃連溫膽湯治療幽門螺桿菌相關性胃炎的作用機制,將137種藥物活性成分對應靶點去重后,與101個交集靶點分別進行比對篩選,刪除10種無對應交集靶點的藥物活性成分,最終將剩余的127種藥物活性成分,7個藥物節點(黃連、半夏、甘草、茯苓、枳實、生姜、陳皮),101個交集靶點的數據導入Cytoscape 3.8.2軟件,完成藥物-活性成分-潛在靶點網絡模型的構建,見OSID科學數據與內容附圖2,圖中正方形節點代表藥物活性成分、六邊形節點代表藥物、菱形節點代表交集靶點。利用network analysis選項對網絡中的節點進行分析,最終得到各節點的度值。在藥物活性化合物中,度值越高表示藥物活性成分對應的交集靶點越多,交集靶點的度值越高,說明作用于該靶點對應藥物活性成分越多。

經分析可知,平均每種藥物的活性成分對應8個交集靶點,127種藥物活性成分中有49種活性成分作用的靶點數大于均值,表明這49種藥物成分為有效活性成分;平均每個交集靶點對應11種藥物活性成分,101個交集靶點中有15個靶點對應的藥物活性成分高于平均值,說明這15個靶點為黃連溫膽湯治療幽門螺桿菌相關性胃炎的關鍵靶點。表2列舉了度值最高的前8種(度值gt;15)藥物活性成分,表3列舉了度值高于均值的前15個交集靶點。

2.4PPI網絡的構建

運用STRING數據庫和Cytoscape 3.8.2作圖軟件進行PPI網絡構建,見OSID科學數據與內容附圖3,該網絡由92個節點和453條邊組成,圓形節點的直徑代表著度值,直徑越大度值越大。邊的粗細代表PPI關系的強弱程度,邊由粗到細,作用關系由強到弱,顏色由藍色向橙色過渡。其中度值≥20的節點有10個,節點顏色用黃色表示;度值介于10~20之間有27個節點,節點顏色用紅色表示;剩余55個節點度值 lt;10,節點顏色用紫色表示。度值較大的10個節點蛋白分別為STAT3、TP53、Akt1、TNF、JUN、MAPK3、MAPK1、IL-6、MAPK14、MAPK8。

2.5GO功能和KEGG通路富集分析

將101個潛在靶基因利用DAVID數據庫分別進行GO功能富集分析和KEGG信號通路富集分析,在Plt;0.01條件下,共得到349條GO富集類目和90條信號通路,其中BP 285條類目、CC 25條類目、MF 39條類目。按照P值的大小和靶點數進行排序,篩選出排名前10的GO條目用于條形圖的構建(OSID科學數據與內容附圖4),篩選出排名前20的KEGG條目用于氣泡圖的繪制(OSID科學數據與內容附圖5)。

結果顯示黃連溫膽湯治療幽門螺桿菌相關性胃炎的潛在作用靶點可以參與藥物反應、脂多糖反應、酒精反應、雌二醇反應和有機環化合物的細胞反應,參與凋亡過程的負調控、缺乏配體的外源凋亡信號通路,參與基因表達的正調控、RNA聚合酶II啟動子的轉錄正調控等生物過程;主要定位在細胞外隙、胞質、胞外區、線粒體、蛋白質復合體、膜筏、線粒體外膜、核原生質、膜小凹、細胞外基質等;同時還可參與酶結合、同源蛋白結合、蛋白結合、轉錄因子結合、蛋白激酶結合、蛋白磷酸酶結合、支架蛋白結合、細胞因子活性、異源蛋白二聚體活性、同源蛋白二聚體活性等分子功能。黃連溫膽湯治療幽門螺桿菌相關性胃炎富集主要涉及6條癌癥相關通路,7條感染相關通路,以及其他富集度較高的P53信號通路、TNF信號通路、Nod樣受體信號通路、T細胞受體信號通路、Toll樣受體信號通路等。

2.6構建BP-CC-MF-KEGG-潛在靶點網絡

將上述得到的潛在靶點、GO功能分析中BP、CC、MF排名前10的數據、KEGG通路富集分析中排名前20的數據導入Cytoscape 3.8.2中,完成BP-CC-MF-KEGG-潛在靶點網絡圖的繪制,見OSID科學數據與內容附圖6,圖中紅色節點代表潛在靶點、藍色節點代表KEGG分析、黃色節點代表BP分析、綠色節點代表CC分析、紫色節點代表MF分析,可以看到黃連溫膽湯作用的靶點主要分布在細胞外間隙和胞質等多細胞組分中,通過酶或蛋白等多種結合方式參與藥物、脂多糖、外源刺激等反應以及凋亡過程的負調控、缺乏配體的外源凋亡信號通路等生物過程,并通過調控P53信號通路、TNF信號通路等多條信號通路實現對幽門螺桿菌相關性胃炎的治療。

2.7分子對接

從PPI網絡圖和藥物-活性成分-靶點網絡圖中,分別選擇度值排名前3的靶點蛋白STAT3、TP53、Akt1與藥物活性成分槲皮素、川皮苷、柚皮素進行結合能力預測,結合能為負值說明受體與配體具有親和力。分子對接結果見表4,活性成分槲皮素、川皮苷、柚皮素與靶點蛋白STAT3、TP53、Akt1形成的對接模型的結合能均小于-5 kJ/mol,說明親和力較好。另外,應用Discovery Studio 2019軟件對活性成分槲皮素、川皮苷、柚皮素及靶點蛋白STAT3、TP53、Akt1進行對接,計算LibDockScore見表4,其中靶點蛋白STAT3、TP53與活性成分柚皮素,以及靶點蛋白Akt1與活性成分槲皮素、柚皮素形成的對接模型LibDockScore均大于100,其余對接體形成的對接模型LibDockScore<100。綜合分析發現,靶點蛋白Akt1與柚皮素結合能力最強,能形成最穩定的對接模型。由于不同靶點蛋白與不同活性分子在不同氨基酸位點形成不同的氫鍵及疏水鍵聯系,因此彼此形成不一樣的對接體。最后,把Vina輸出的化合物結果導入Pymol中,利用Discovery Studio 2019軟件,與蛋白配體進行3維及2維分子對接展示,見圖1和OSID科學數據與內容附圖7。

3討論

本文運用網絡藥理學分析黃連溫膽湯治療幽門螺桿菌相關性胃炎的機制,通過構建藥物-活性成分-潛在靶點網絡模型,篩選出127種活性成分。其中度值大于15的8種藥物活性成分,已有部分活性成分經實驗證明具有抑制幽門螺桿菌增殖、治療幽門螺桿菌相關性疾病的作用[20]。在這8種活性成分中以槲皮素作用的靶點數最多,槲皮素是黃酮醇類黃酮亞類的主要代表,在抗氧化、抗炎、抗纖維化、抑制幽門螺桿菌增殖等方面發揮重要作用,經研究發現槲皮素能夠通過抑制p38 MAPK和BAX表達,調控胃黏膜上皮細胞增殖和凋亡之間的平衡,對幽門螺桿菌誘導的胃炎起到保護作用[21-22]。黃岑素是黃岑最主要活性成分,能夠抑制幽門螺桿菌在胃黏膜中的定植,減少對胃黏膜的損傷,同時可以降低核轉錄因子(NF-κB)的表達水平,抑制炎性因子的產生,增強對胃黏膜的保護作用[23]。上述兩種活性成分已被證實能夠通過抑制幽門螺桿菌增殖發揮對胃黏膜的保護作用,而其余幾種作用靶點較多的活性成分對幽門螺桿菌的抑制作用還有待進一步研究。

利用TCMSP數據庫查詢137種藥物活性成分對應的靶點蛋白,獲得黃連溫膽湯相關靶點260個,同時運用GeneCards數據庫和DisGENET數據庫獲取800個幽門螺桿菌相關性胃炎相關靶點,將得到的藥物相關靶點與疾病相關靶點取交集,最終得到101個交集靶點作為黃連溫膽湯治療幽門螺桿菌相關性胃炎的關鍵靶點。利用STRING數據庫和Cytoscape 3.8.2繪圖軟件對101個交集靶點進行PPI網絡的構建,其中Akt1、P53、TNF-a、IL-6、STAT3等蛋白與其他靶點聯系密切,是調控整個網絡的樞紐,在黃連溫膽湯治療幽門螺桿菌相關性胃炎過程中起到關鍵作用。

Akt又稱蛋白激酶B,參與多條信號通路,其中PI3K/Akt信號通路對于維持細胞的完整性,細胞生長、生存、死亡和代謝至關重要,該通路的激活參與多種癌癥的發生[24-25]。經研究發現,幽門螺桿菌感染會增加活性氧水平,導致PI3K/Akt通路持續激活,進而促進p-Akt (Ser473)和下游蛋白p-GSK-3β (Ser9)的激活,有助于細胞增殖和胃癌發生[26]。通過分析,黃連溫膽湯可能通過Akt1參與的信號通路發揮治療幽門螺桿菌相關性胃炎的作用以及降低下一步轉化為胃癌的風險。

[STBX]P53[STBZ]基因是一種重要的抑癌基因,具有修復受損DNA,并維持受損DNA基因組穩定性的功能,被稱為“基因的守護者”。幽門螺桿菌感染可通過調節各種細胞應激反應,包括活性氧和活性氮的產生以及抑癌基因的異常激活,來調控宿主P53信號通路[27]。慢性幽門螺桿菌感染可通過誘導[STBX]P53[STBZ]突變、蛋白酶體降解、轉錄后修飾,來降低P53的表達水平,導致細胞過度增殖和凋亡受損,從而增加胃癌發生的風險[28]。黃連溫膽湯可影響P53的表達,進而抑制幽門螺桿菌相關性胃炎轉化為胃癌的風險。

抗凋亡蛋白BCL-2和促凋亡蛋白BAX屬于[STBX]BCL-2[STBZ]基因家族成員,共同參與線粒體凋亡通路。BAX位于P53信號通路的下游,可以與BCL-2構成異源二聚體形式,同P53一起參與細胞凋亡過程[22]。幽門螺桿菌感染可上調BAX基因,引起BCL-2與BAX蛋白表達比例降低,誘導慢性胃炎患者胃黏膜上皮細胞發生凋亡[29]。研究證實,黃連溫膽湯可以通過下調BAX,提高BCL-2蛋白表達,抑制胃黏膜細胞凋亡,對慢性胃炎的胃黏膜損傷具有一定修復作用[30],這與本文分析一致。

幽門螺桿菌分泌的Tipa毒素與細胞表面受體結合后,通過激活NF-κB信號通路誘導炎性因子TNF-a的分泌,加速胃炎的進展,并誘導細胞內信號的轉變[31]。同時TNF-a的異常表達與幽門螺桿菌誘導胃黏膜病變的嚴重程度有關,是促進淺表性胃炎向胃癌方向轉變的關鍵因素[32]。Chen等[33]發現Tipa可以通過激活IL-6/STAT3通路促進上皮細胞間充質轉化,從而加速胃癌細胞的侵襲。信號傳導和轉錄激活因子3 (STAT3)作為轉錄因子,能夠在感染、生長因子等各種條件刺激下,介導下游信號的傳遞,參與炎癥及相關腫瘤的發展[34]。Piao等[35]研究發現,幽門螺桿菌的感染能夠誘導活性氧產生,并通過刺激IL-6炎性因子的上調,促進STAT3磷酸化激活,介導下游信號轉錄,加速胃炎和胃癌的發生發展。絲裂原活化蛋白激酶(MAPK)是多種細胞信號通路的關鍵調控因子[36],在眾多信號通路中,MAPK通路在細胞增殖、分化、凋亡、血管生成和腫瘤轉移中發揮重要的作用[37]。細胞外信號調節激酶(ERK)、c-Jun氨基末端激酶(JNK)、p38 MAPK和ERK5信號轉導途徑是4種MAPK級聯通路[30]。其中JNK/p38 MAPK通路主要與細胞的應激和凋亡有關,而ERK/MAPK信號通路主要與細胞增殖和分化密切相關[38]。幽門螺桿菌感染胃黏膜細胞后,可以觸發ERK1/2、JNK、p38 MAPK多條MAPK信號通路的激活,誘導IL-8、TNF-a、IL-1β和IL-17等炎性因子的分泌,造成嚴重的胃黏膜炎癥性損傷[39-40]。有研究發現,黃連溫膽湯可通過降低炎性因子TNF-a和IL-8的分泌,減輕幽門螺桿菌誘導的胃黏膜炎癥性損傷,從而改善臨床癥狀[41]。黃連溫膽湯調控上述信號分子,在信號通路中起作用的具體機制亟待研究。

本研究將101個潛在靶點進行KEGG通路富集分析,在Plt;0.01的條件下篩選出的90條相關通路中,癌癥通路如P53信號通路、TNF信號通路等在KEGG中富集程度較高,除此之外還包括Toll樣受體信號通路、Nod樣受體信號通路、T細胞受體信號通路等。Toll樣受體I型跨膜受體,可在病原體的誘導刺激下啟動免疫應答反應,而MyD88是信號傳導的關鍵節點[42]。有研究發現,當幽門螺桿菌感染細胞后,其自身的配體可與胃上皮細胞上TLR2、TLR4結合啟動一系列級聯反應,進而刺激MyD88和NF-κB下游信號通路的激活,造成機體免疫功能紊亂,加深胃炎和胃潰瘍的嚴重程度[43-44]。而NOD樣受體(NOD-like receptors, NLR)不僅能夠識別病原相關分子,還能識別損傷相關分子,NLR受體與配體結合后被激活并參與炎性小體的形成,誘導Caspase-1前體蛋白募集,并自剪切成Caspase-1活體形式,促進炎性細胞因子的產生,從而導致炎癥反應的發生[45-46]。所以黃連溫膽湯可能通過作用于以上通路發揮對幽門螺桿菌誘發的相關性胃病的治療作用。

本文采用網絡藥理學和分子對接技術探究黃連溫膽湯治療幽門螺桿菌相關性胃炎的作用靶點和分子機制,通過構建藥物-疾病靶點網絡,分析其藥理作用,證實黃連溫膽湯通過槲皮素、川皮苷、柚皮素等藥物活性成分,經過抗炎、抗氧化、免疫調節等多種途徑作用于STAT3、TP53、Akt1等關鍵靶點蛋白,發揮治療幽門螺桿菌相關性胃炎的作用。本研究僅是理論上的預測,能夠為后續的實驗驗證提供理論基礎,并為臨床藥物的推廣提供科學依據。

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