最完整海洋微生物基因數(shù)據(jù)庫(kù)出爐

近日，記者從“千種海洋生物基因測(cè)序項(xiàng)目”暨全球海洋微生物基因庫(kù)建設(shè)及應(yīng)用成果聯(lián)合發(fā)布會(huì)上獲悉，華大生命科學(xué)研究院聯(lián)合山東大學(xué)、英國(guó)東安格利亞大學(xué)等機(jī)構(gòu)，構(gòu)建了迄今為止最完整的海洋微生物基因數(shù)據(jù)庫(kù)，并從中發(fā)現(xiàn)大量具有應(yīng)用潛力的基因資源。該研究為開(kāi)發(fā)抗菌肽、新型基因編輯工具、PET塑料降解酶等提供了新思路。相關(guān)成果在線發(fā)表于國(guó)際學(xué)術(shù)期刊《自然》上。

研究團(tuán)隊(duì)介紹，他們通過(guò)對(duì)已公開(kāi)的海洋微生物宏基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行分析和深度挖掘，構(gòu)建了海洋微生物基因數(shù)據(jù)庫(kù)GOMC。這一數(shù)據(jù)庫(kù)擁有超過(guò)4.31萬(wàn)個(gè)海洋微生物基因組和24.58億個(gè)基因序列，是已報(bào)道海洋基因組數(shù)據(jù)庫(kù)Tara Ocean的3倍。其中，2萬(wàn)多個(gè)微生物是潛在新發(fā)現(xiàn)物種，近1萬(wàn)個(gè)微生物為在深海等獨(dú)特生境中首次發(fā)現(xiàn)。目前，該數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)已存儲(chǔ)于國(guó)家基因庫(kù)生命大數(shù)據(jù)平臺(tái)。

論文通訊作者、青島華大基因研究院院長(zhǎng)范廣益介紹，研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)GOMC進(jìn)行深度挖掘，發(fā)現(xiàn)了多項(xiàng)具有應(yīng)用潛力的基因資源。其中，研究團(tuán)隊(duì)鑒定了36個(gè)新型CRISPR-Cas9基因編輯系統(tǒng)，并挖掘出一個(gè)具有潛在應(yīng)用價(jià)值的新型Cas9編輯系統(tǒng)，為科研人員使用基因編輯工具提供了更多選擇。

據(jù)了解，作為青島自貿(mào)片區(qū)“千種海洋生物基因測(cè)序項(xiàng)目”第1年度的重要成果，該項(xiàng)研究將助力海洋微生物的演化、生態(tài)學(xué)研究和遺傳資源的開(kāi)發(fā)與利用。

（來(lái)源：科技日?qǐng)?bào)）