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四聯鱟抗菌肽Tachyplesin Ⅱ畢赤酵母重組質粒構建及其表達

2024-03-18 05:13:02羅家英蔡依婕上官雪茹黃藝虹李雅婷李婉褀譚強來
科技創新與應用 2024年7期

曾 臻,羅家英,蔡依婕,上官雪茹,黃藝虹,李雅婷,李婉褀,譚強來

(廈門醫學院,福建 廈門 361023)

自20 世紀人們發現青霉素以來,抗生素便被廣泛應用于醫療衛生、養殖生產等行業。然而抗生素濫用的弊端日益顯現,抗生素耐藥性嚴重對公共衛生造成嚴重影響,同時造成環境污染等問題,威脅人們的健康。相較于傳統抗生素,抗菌肽是一類在生物體廣泛存在的小分子生物活性肽,由先天性免疫防御系統在抵御外來病原微生物侵染時產生,多在12~50 個氨基酸之間[1]。由于抗菌肽種類多、抗菌譜廣、不易產生耐藥性,對細菌、真菌、病毒、寄生蟲乃至癌細胞均可有效抑制或殺傷,應用前景廣闊[2]。

鱟抗菌肽是鱟在抵御外源病原體侵襲過程中的天然防御系統之一[3]。目前已發現5 種,其中3 種來源于中國鱟,分別為Tachyplesin I、Tachyplesin II、Tachyplesin Ⅲ,由17 個氨基酸組成;另外2 種來源于美洲鱟,分別為Polyphemusins I、Polyphemusins II,由18 個氨基酸組成[4]。其中,Tachyplesin II 表現出優良的抑菌活性。Xu 等[5]曾選取36 株真菌和細菌用于Tachyplesin II 的抑菌活性測定,結果表明26 株真菌和細菌的生長被有效抑制。然而,天然抗菌肽提取量低,通過基因工程可實現大量制備以應用于實際生產。相較于大腸桿菌,畢赤酵母具有更好的表達后加工修飾能力,有助于保持重組蛋白的生物學活性[6]。因此,本研究擬通過串聯表達以期實現高產,為高效制備鱟抗菌肽Tachyplesin Ⅱ奠定基礎。

1 材料與方法

1.1 試劑

畢赤酵母X-33 和表達載體pPICZαA(本實驗室保存);限制性內切酶、T4 DNA 連接酶、Taq DNA 聚合酶(生工生物工程(上海)股份有限公司);Zeocin 博來霉素(美國英杰生命技術有限公司);BMGY/BMMY培養基(上海瑞楚生物科技有限公司);彩虹180 廣譜蛋白Marker、Tris-Tricine-SDS-PAGE 凝膠制備試劑盒、YPD 培養基、無氨基酵母氮源(YNB)、生物素和山梨醇(北京索萊寶科技有限公司);其他常規化學試劑均為國產分析純。

1.2 儀器

聚丙烯酰胺凝膠電泳儀、PCR 擴增儀、凝膠成像分析儀(美國伯樂);電轉化儀(德國艾本德股份公司);超凈工作臺(蘇凈安泰空氣技術有限公司);恒溫培養箱、恒溫振蕩器(上海蘇坤實業有限公司)。

1.3 實驗方法

1.3.1 四聯鱟抗菌肽Tachyplesin Ⅱ(4TpⅡ)序列的設計

查詢抗菌活性及多肽結構數據庫(Database of Anti microbial Activity and Structure of Peptides,DBAAS P),獲得鱟抗菌肽Tachyplesin Ⅱ的氨基酸序列;選用含α-factor 的畢赤酵母蛋白分泌表達載體pPICZαA,以利于高水平的分泌表達。選用X-33 畢赤酵母表達菌,以適于含Zeocin 抗性的pPICZαA 重組質粒的表達。參考Li等[7]的方法,根據胰彈性蛋白酶(-Ala↓或-Gly↓)和羧肽酶A(裂解C 末端氨基酸)的特異性裂解位點,設計四聯鱟抗菌肽Tachyplesin Ⅱ(4TpⅡ)序列;根據畢赤酵母密碼子的偏好性進行密碼子優化;根據4TpⅡ和pPICZαA的堿基序列特點,設計相應酶切位點。

1.3.2 生物信息學分析

參考譚強來等[8]的方法,利用ExPASy 數據庫工具包分析4TpⅡ的基本理化性質。

1.3.3 構建重組質粒pPICZαA-4TpⅡ

4TpⅡ序列交由生工生物工程(上海)股份有限公司進行全基因合成。然后,用EcoRⅠ和NotⅠ對4TpⅡ和pPICZαA 雙酶切,然后T4 DNA 連接酶連接,轉入大腸桿菌感受態細胞,用Zeocin 抗性LB 平板篩選,并通過酶切和測序驗證重組質粒pPICZαA-4TpⅡ是否成功構建,構建策略如圖1 所示。

圖1 重組質粒pPICZαA-4TpⅡ構建示意圖

1.3.4 電轉化畢赤酵母X-33 及篩選陽性轉化子

參考譚強來等[9]的方法,用SacI 酶切線性化pPIC ZαA-4TpⅡ,電轉化畢赤酵母X-33,條件為:0.2 cm 電轉杯(預冷)、1 500 V、25 μF 和400 Ω。電擊后立即加入1 mol/L 山梨醇(預冷),涂布Zeocin 抗性YPD 平板,30 ℃培養至單菌落長出,以pPICZαA 空載體同上處理作為陰性對照。

1.3.5 重組蛋白4TpⅡ的誘導表達篩選

選取若干個陽性轉化子于YPD 中活化,然后轉接于BMGY,30 ℃、250 r/min 培養至菌液OD600≈3,離心收集菌體后用含1%甲醇的BMMY 重懸,誘導表達5 d,每隔24 h 補加甲醇至終濃度1%,第5 天離心5 min 收集上清,SDS-PAGE 分析。用含pPICZαA 空載體的酵母轉化子同上處理作為陰性對照。

2 結果與分析

2.1 四聯鱟抗菌肽Tachyplesin Ⅱ(4TpⅡ)的設計

獲取鱟抗菌肽Tachyplesin Ⅱ的氨基酸序列(RWC FRVCYRGICYRKCR),設計四聯鱟抗菌肽TachyplesinⅡ(4TpⅡ)序列(MARWCFRVCYRGICYRKCRARWCF RVCYRGICYRKCRARWCFRVCYRGICYRKCRARWCF RVCYRGICYRKCRAHHHHHH),中間嵌入胰彈性蛋白酶(-Ala↓或-Gly↓)和羧肽酶A(裂解C 末端氨基酸)的特異性裂解位點。5′端含EcoRⅠ酶切位點和起始密碼子ATG(Met,pPICZαA 插入基因所必需),3′端含6×His 標簽、終止密碼子TAA 和NotⅠ酶切位點。

2.2 4TpⅡ的畢赤酵母密碼子偏好性優化

4TpⅡ經畢赤酵母密碼子偏好性優化如圖2 所示。經優化后的4TpⅡ密碼子相對頻率雷達圖的曲線匹配較好,最優密碼子頻率增加,GC 含量適宜(39.1%),無重復序列。

圖2 4TpⅡ的畢赤酵母密碼子偏好性優化

2.3 4TpⅡ的生物信息學分析

4TpⅡ的基本理化參數見表1,預期氨基酸數量為74 個,分子量為9 507.61 Da,等電點為10.23,僅帶正電荷,殘基總數為24 個,較為穩定,酵母體內半衰期大于20 h,推測適于畢赤酵母表達。4TpⅡ的氨基酸親疏水性分析如圖3 所示,最大值為0.6(第5 位氨基酸),最小值為-2.48(第73 位氨基酸)。

表1 4TpⅡ的基本理化參數分析

2.4 重組質粒pPICZαA-4TpⅡ的驗證

對重組質粒pPICZαA-4TpⅡ進行酶切鑒定,結果如圖4 所示,表明重組質粒pPICZαA-4TpⅡ構建成功,并經測序驗證無堿基和氨基酸突變。

圖4 重組質粒pPICZαA-4TpⅡ的鑒定

2.5 重組蛋白4TpⅡ的誘導表達篩選

選取陽性轉化子進行重組蛋白4TpⅡ的誘導表達篩選,結果如圖5 所示,1 號轉化子的泳道清晰,在17~20 kDa 處有一個明顯的條帶,而陰性對照的泳道則無此條帶,表明重組蛋白4TpⅡ表達成功。但電泳測定的分子量比生物信息學預測的結果偏高,與張亞莉等[10]得出的結果相似,推測可能原因,一是4TpⅡ分子量小且帶正電荷殘基總數多,SDS-PAGE 電泳時遷移變慢;二是生物信息學預測時無法考慮蛋白質翻譯后修飾等,導致分子量預測偏小。

圖5 重組蛋白4TpⅡ的誘導表達篩選

3 結論與討論

抗菌肽不僅具有較廣泛的微生物殺滅作用,還常存在重要的免疫及非免疫功能,是替代抗生素解決其耐藥性的有效方案之一[11]。鱟抗菌肽分子量小、結構簡單、不易產生耐藥性,在食品醫藥等領域扮演重要角色。有研究表明,Tachyplesin Ⅰ可拮抗枯草桿菌和隱球菌,還能有效抑制肝癌細胞的生長[12-13]。Tachyplesin II 的細胞毒性較低、抗菌譜廣,被廣泛應用于醫藥、食品、畜牧水產業[14]。

直接提取或化學合成抗菌肽成本高、產量低,無法滿足實際需要,利用基因工程菌高效制備勢在必行,而畢赤酵母操作簡單、營養要求低,是高密度發酵和大規模生產的優先選擇[15]。王蓮哲等[16]利用表達載體pPIC9K和畢赤酵母GS115,成功表達樹蛙抗菌肽Cathelicidin。Li 等[7]則利用pGAPZαB 和畢赤酵母GS115,通過串聯表達的方式高效制備了Tachyplesin I。

本研究基于畢赤酵母密碼子偏好性和生物信息學分析,成功設計4TpⅡ序列,構建重組質粒pPICZαA-4TpⅡ;篩選到1 株重組畢赤酵母X-33/pPICZαA-4TpⅡ,經30 ℃、250 r/min、1%甲醇誘導5 d 后,分泌表達出重組蛋白,為高效制備鱟抗菌肽Tachyplesin Ⅱ奠定基礎。后續將優化表達和純化條件,為基因工程菌生產抗菌肽提供了可資參考的技術途徑。

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