2020-2021年我國規(guī)模化豬場豬圓環(huán)病毒2型和3型的分子流行病學(xué)調(diào)查分析

陳翔鴻,曹 琪,諶 磊,鄧文芳,袁 意,孔丹妮,宋文博,2*,湯細(xì)彪*

(武漢科前生物股份有限公司,湖北武漢 430070;華中農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院,湖北武漢 430070)

豬圓環(huán)病毒(Porcine circovirus,PCV)為圓環(huán)病毒科圓環(huán)病毒屬,PCV主要有豬圓環(huán)病毒1型(Porcine circovirus,PCV1)、豬圓環(huán)病毒2型(PCV2)、豬圓環(huán)病毒3型(PCV3)和豬圓環(huán)病毒4型(Porcine circovirus,PCV4)[1-2]。PCV1是一種細(xì)胞培養(yǎng)污染物,與疾病沒有關(guān)聯(lián)。PCV2是豬圓環(huán)病毒病(Porcine circovirus disease,PCVD)的主要病原[3]。PCV3可能與豬皮炎腎病綜合征、母豬繁殖障礙 、心肌炎及多系統(tǒng)炎癥有關(guān)[4]。PCV4在我國湖南省幾頭患有嚴(yán)重呼吸道及腸道癥狀的豬中發(fā)現(xiàn),并命名為PCV4[2]。PCV2包含2個(gè)主要的開放閱讀框ORF1和ORF2,分別編碼復(fù)制酶(Rep)和衣殼(Cap)蛋白,Cap蛋白是該病毒可誘導(dǎo)機(jī)體產(chǎn)生針對PCV2的中和抗體的一種重要的免疫原性蛋白[5]。與ORF1基因相比,ORF2基因表現(xiàn)出更多的遺傳變異,通?？勺鳛橄到y(tǒng)發(fā)育和流行病學(xué)標(biāo)記?；赑CV2的ORF2中不同核苷酸位點(diǎn)比例將PCV2分為8個(gè)基因型,即PCV2a、b、c、d、e、f、g、h[6]。PCV3的基因組結(jié)構(gòu)與PCV1和PCV2類似,ORF2 是變異最大的區(qū)域,編碼唯一的結(jié)構(gòu)蛋白(Cap蛋白),與病毒的感染和免疫有較強(qiáng)的相關(guān)性。PCV3 Cap蛋白的氨基酸數(shù)為214個(gè),比PCV2少19～29個(gè),與PCV1和 PCV2的基因組核苷酸同源性僅為37%左右[7]?；贑ap蛋白氨基酸序列上第24位和第27位特異性氨基酸位點(diǎn)的差異,將PCV3分為PCV3a、PCV3b、PCV3c共3個(gè)基因型[8]。2012-2018年我國東南地區(qū)PCV2陽性率為41.9%(272/649),PCV2d檢出率為67.6%(184/272),其次為PCV2b、PCV2a、PCV2c和PCV2e[9]。2015-2018年豫南地區(qū)PCV2陽性率為27.39%(43/157),PCV2d占76.92%(10/13)[10]。2017-2018年華中地區(qū)PCV2感染率為68.53%(1091/1592),PCV2d占86.84%(33/38)[11]。2018-2020年我國不同省份PCV2的陽性率為53%(3619/6872),PCV2d占79%(49/62個(gè)樣本)[12]。巴西在1967年從病料中檢出了PCV3病毒,提示 PCV3多年來一直存在于豬群中[13]。2016年對安徽、重慶、福建、河南等 11 個(gè)省市的臨床樣品進(jìn)行 PCV3檢測,結(jié)果豬場陽性率為 68.6%(24/35),個(gè)體陽性率為 34.7%(77/222)[14]。……