曹宇生, 梁浩源, 李林濤, 蔣開海, 黃天賦, 李廣生, 黃許森
作者單位:1.右江民族醫學院臨床醫學院,百色 533000;2.右江民族醫學院附屬醫院胃腸外科,百色 533000
結直腸癌(colorectal cancer,CRC)是發病率第三、死亡率第二的惡性腫瘤[1]。預計到2040年,全球CRC新增病例超過300萬,每年可造成約160萬例患者死亡[2]。CRC的早期診斷和治療都極為困難,患者預后差,且患病年齡有年輕化的趨勢,給社會帶來很大的負擔。CRC的發生與年齡、生活習慣、遺傳因素、環境因素等密切相關[3-5]。林奇綜合征、家族性腺瘤性息肉病會增加CRC的發生風險。有研究顯示,一級親屬中有CRC病史者,罹患CRC的風險可升高約20%[6]。CRC患者預后不佳,盡管近年治療方法有所發展和改進,但患者的5年總生存率仍不理想[7-8]。miR-3189是一種嵌入GDF15基因內含子的新型靈長類動物特異性微小RNA(micro RNA,miRNA)[9]。由miR-3189編碼的前體序列在莖環內包含2個成熟的miRNA序列,即miR-3189-3p和miR-3189-5p,長度分別為21個核苷酸和25個核苷酸[10]。有研究顯示,miR-3189-3p在腫瘤的發生發展中起到重要作用[11-12],但其在CRC中的報道較少。本文旨在探討miR-3189-3p對CRC相關生物活動的作用,為CRC的診療方法研發提供參考。
1.1生物信息學分析 應用CancerMIRNome數據庫(http://bioinfo.jialab-ucr.org/CancerMIRNome/),點擊“query”,在“search a miRNA”模塊中輸入“miRNA-3189-3p”,在“TCGA pan-cancer”和“TCGA project”模塊分析miRNA-3189-3p在癌組織與正常組織中表達水平的差異,以及miRNA-3189-3p表達水平對CRC患者生存預后的影響。應用ENCORI數據庫(https://starbase.sysu.edu.cn/),點擊“pan-cancer”,在“miRNA differential expression”及“miRNA survival analysis”模塊中進一步驗證miRNA-3189-3p在CRC組織與正常組織中表達水平的差異,以及miRNA-3189-3p表達水平對CRC患者生存預后的影響。
1.2主要實驗材料 DMEM高糖培養基(武漢普諾賽生命科技有限公司);標準級胎……