用生物信息學方法處理基因芯片結果

摘要：基因芯片是一種能夠同時檢測大量基因在同一組織中表達情況的有力工具。利用前期工作篩選的2210個鼻咽癌差異表達基因和Biocarta信號通路資源庫，構建了一個基于信號通路的基因相互作用網絡。通過統計學分析，進一步篩選出一批對該基因相互作用網絡具有重大影響的基因(特別是RAN、CEL、RELA)。隨后，采用RT-PCR方法檢測候選基因在鼻咽癌活檢組織中的表達，發現RAN和CEL基因在高達80％的鼻咽癌組織中高表達。進一步將網絡分析結果和ArrayXPth軟件分析的結果比較，共計有40％(32／80)基因結果吻合，這驗證了網絡分析方法的有效性和可行性。最終探索建立了新的分析基因芯片的方法。

關鍵詞：鼻咽癌；微陣列；信號通路

中圖分類號：Q75

文獻標識碼：A

文章編號：1007-7847(2006)04-0295-09