砂梨擴展蛋白基因ｃＤＮＡ克隆及全序列分析
2008-01-01 00:00:00宋長年喬玉山等
果樹學報 2008年2期
摘要：設計植物EXP擴展蛋白簡并引物，以砂梨果實cDNA為模板，克隆得到EXP基因cDNA片段，該片段長465 bp。根據該片段序列，分別設計2條5’和3’末端擴增的特異引物，利用RACE技術，獲得了該片段的5’端和3’端序列。用DNAMAN5.22軟件對3個序列進行拼接和分析，獲得了該基因的cDNA全長，命名為Pyp-EXP。該cDNA全長為1395 bp，5’端起始密碼子ATG始于72 bp，3’端終止子TAG止于830 bp，Ploy+(A)從1 363～1 395 bp。該基因已在GenBank基因數據庫注冊，注冊號為EF602031。Pyp-EXP核苷酸序列有一個759 bp完整的開放閱讀框，編碼區與西洋梨、蘋果、湖北海棠、桃的同源性分別為96％，96％，94％和86％；該cDNA推導編碼252個氨基酸，含有1個組氨酸(His－Phe－Asp，HFD)功能域，與西洋梨、蘋果、湖北海棠、桃中相應序列同源性分別為98％，97％，95％和93％。該基因的克隆為研究擴展蛋白的時空表達及其在果實發育和成熟過程中的作用奠定了基礎。
關鍵詞：砂梨；擴展蛋白；分子克隆；序列分析
中圖分類號：S665.1 文獻標識碼：A
文章編號：1009—9980(2008102—166一06
