朱秀蘭 馬文麗 陰常欣 鄭文嶺
摘要:淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移是影響宮頸癌預(yù)后因素的首要因素,但分子機理尚不清楚,探討宮頸癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的分子機制,篩選可能用于臨床診斷和治療的新的分子靶標(biāo)尤其重要,BRB-Array Tools軟件對基因表達綜合數(shù)據(jù)庫(Gene Expression Ominibus,GEO)中有/無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移早期宮頸癌的基因芯片表達譜數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計學(xué)分析,找出二者的差異基因,利用GenCLip軟件進行文獻挖掘研究這些差異表達基因的功能關(guān)系,篩選出71個差異表達基因。其中35個在有淋巴轉(zhuǎn)移的宮頸癌中表達上調(diào),36個下調(diào),文獻挖掘發(fā)現(xiàn)FZD10、PDZKIIIPI、SERPINB9、COMP、MAGEA1等幾個新的宮頸癌淋巴轉(zhuǎn)移相關(guān)基因,結(jié)果表明生物信息學(xué)方法能有效地分析基因芯片數(shù)據(jù)并獲取生物內(nèi)在信息,為宮頸癌淋巴轉(zhuǎn)移發(fā)生機制及治療靶位開辟新思路。
關(guān)鍵詞:宮頸癌;淋巴轉(zhuǎn)移;基因芯片;差異表達
中圖分類號:R737文獻標(biāo)識碼:A文章編號1007-7847(2009)04-0337-06