陳靈芝,王蘭蘭,魏兵強
茄子種質資源數據庫的建立
陳靈芝,王蘭蘭,魏兵強
(甘肅省農業科學院蔬菜研究所,甘肅蘭州,730070)
采用動態web數據庫的策略,執行瀏覽器/服務器(B/S)的體系結構,建立了基于Internet的甘肅茄子種質資源數據庫平臺,應用數據庫查詢茄子種質及相關性狀,有利于茄子種質資源綜合評價和利用。
茄子;種質資源;數據庫平臺
茄子品種資源研究是培育優良茄子品種的基礎,新品種選育成功的關鍵因素之一就是選擇親本,親本的選配有賴于育種者的學識和經驗以及育種者對茄子品種資源的綜合評價。從大量的茄子品種資源中選擇綜合性狀好、具有某種特殊性狀的資源并非易事,如果利用計算機查詢數據,就能大大提高工作效率[1]。甘肅省農科院蔬菜研究所長期從事茄子新品種選育工作,在育種過程中,積累了一大批茄子種質資源及其相關的農藝、經濟性狀數據。為了便于科學地積累和管理數據,為茄子育種選配親本提供科學依據,本研究編制了可用于貯存、管理和綜合查詢各種數據的甘肅茄子種質資源數據庫。
茄子品種資源及各種性狀數據來自甘肅省農業科學院蔬菜研究所收集、保存的茄子品種資源,包括甘肅農家品種、各省市的茄子品種、育種中間材料和國外資源等。
2.1 數據庫總體設計方案
利用數據庫管理和應用軟件開發系統,將甘肅省農業科學院蔬菜研究所所收集的茄子資源歸類整理,建立由種質資源數據管理、種質資源數據檢索和種質資源互聯網信息發布等模塊構成的管理平臺,以方便育種過程中的資源評價、篩選,加強相關育種單位的信息交流。
2.2 數據的采集和規范
在數據采集時根據茄子資源利用的基本要求,結合國家制定的自然科技資源平臺茄子種質資源規范化標準,對種質資源進行描述,以茄子種質資源的收集、保存、鑒定、評價、研究利用為宗旨,實現茄子種質資源的充分共享和可持續利用。名詞術語與國家或國際標準保持一致,確保數據的規范性、嚴密性、科學性。
2.3 數據庫庫表結構的設計
首先依據植物學分類,結合收集的資源情況,將茄子資源劃分為三大類,分別是:長茄、圓茄、矮茄,如圖1。
每個類型的性狀描述共包括38個信息,分為4個部分。第1部分是基本信息,共9項,包括統一編號、品種名稱、譯名、原產地、類型、選育單位、選育方法、選育親本、種子來源地,從這部分可以了解種質資源的基本狀況;第2部分是性狀調查信息,共22項,包括果形(扁圓、圓球、高圓、卵圓、長卵、短筒、長筒、長條、線形)、果長、果寬、單果質量評價(大、中、小)、果頂(凹、平、凸)、果面光澤(無、有)、商品果色(白、白綠、綠、橘紅、淺紫、鮮紫、紫紅、黑紫)、老熟果色(黃、紅)、果實彎曲度(U形、鐮刀形、蛇形、微彎、直)、果萼顏色(綠、綠紫、紫)、果肉色(白、黃白、綠白、綠)、花色(白、綠白、淺紫、紫)、主莖色(綠、淺紫、紫、深紫)、莖茸毛(有、無)、葉色(黃綠、淺綠、綠、深綠)、葉形(卵圓、長卵圓)、株型(直立、半直立、開展)、株高、株幅、結果性(多、中、少)、熟性(早、中、晚)等。第3部分是抗性鑒定結果表,包括茄子黃萎病、綿疫病、菌核病、炭疽病、抗寒性、抗旱性等。第4部分是多媒體數據信息,包括照片等。
2.4 網絡平臺的實現
遠程數據訪問采取動態Web數據庫的策略,瀏覽器/服務器(B/S)體系結構,通過接口程序為用戶提供一種格式統一、直觀高效、易學易用、功能完備的人機交互的圖形界面,使終端用戶無需安裝客戶端界面程序,在任何一個地方只要通過一個普通的瀏覽器軟件即可實現對數據庫的訪問,進行數據傳輸、檢索與查詢[2]。
①種質資源數據庫平臺的環境設計 選用ASP2.0做為平臺的主導設計語言,Access2003做為數據庫的支撐平臺,網絡平臺采用windows2003Server操作系統,Internet Information Server5.1提供Web服務,動態網頁采用MacromediaDreamweaver MX創建ASP程序。
②種質資源平臺的數據庫結構 利用Access2003軟件,將茄子資源的多種性狀集成在一個數據庫中,內含多張數據表,這種數據庫結構與以前的數據庫結構相比,具有管理集中、維護方便、數據安全等特點。
查詢窗口由以上所列各信息組成,用戶可根據自己的需要選擇任一入口進行數據庫的訪問,還可提供多條件的組合查詢,為選擇特定性狀的茄子種質提供快速查詢手段,例如用戶想篩選:果長≥35 cm,單果質量≥60 g,果寬≥5 cm的品種,分別在對應的性狀窗口中輸入查詢條件,如圖2,確認后,系統就會給出查詢結果界面,如圖3。

圖1 數據庫平臺主界面

圖2 數據查詢界面

圖3 數據查詢結果輸出界面
3.1 存在的問題
圖文并茂的數據資料可以大大豐富記錄內容,也可給人提供最直觀的視覺效果,育種者結合田間記載資料,可進一步對材料做出正確客觀的評價,但由于資料的采集、數據錄入是一項費時費力的工作,常受經費、人員等條件限制。另外,建設種質資源數據庫,是為了更好地利用種質資源,因此,一方面要加強現有種質資源的利用,以現有資源為材料,進行種質創新和新品種選育。另一方面,要不斷豐富種質資源庫和種質資源數據庫,從而更好地為新品種選育服務[3]。
3.2 數據庫平臺應用前景
傳統的數據信息只能以紙介方式管理,查詢檢索時只能逐頁、逐行查找[4],極不適應育種、生產者對種質信息的獲取和研究需求,種質資源數據庫平臺促進了茄子種質信息的共享,擴大了信息交流范圍,提高了茄子種質的利用效率,在充分發揮品種資源數據信息優勢的基礎上,可更好地為育種工作者和生產部門服務。
[1]唐榮華,高國慶.花生種質資源數據庫建立及應用研究[J].中國油料作物學報,2001(23):70-72.
[2]郭衛,王明霞.基于 Internet的蔬菜栽培專家系統的開發[J].河北農業大學學報,2003(26):283-284.
[3]易懋升,黎揚輝.紅掌種質資源數據庫的建立[J].廣東農業科學,2005(1):8-11.
[4]陳偉英,王曉娟.甘肅省農作物種質資源數據庫及查詢系統的建立[J].甘肅農業科技,2003(4):22-24.
Establishment of Database of Eggplant Germ Plasm Resource
CHEN Lingzhi,WANG Lanlan,WEI Bingqiang
(Institute of Vegetables,Gansu Academy of Agricultural Sciences,Lanzhou 730070)
Use the strategy of dynamic web-database and perform the architecture of Browser/server(B/S)to develop the database platform on eggplant germplasm based on internet technologies.It is favourable to utilize the database for management and comprehesive evaluation of eggplant germplasm.
Eggplant;Germ plasm resource;Database
10.3865/j.issn.1001-3547.2010.10.004
陳靈芝,女,副研究員,主要從事辣椒、茄子育種及栽培工作,電話:0931-7616788,E-mail:gschlzh38@sina.com
王蘭蘭,通信作者,研究員,碩導,主要從事辣椒育種及栽培工作
2010-01-06