結合蛋白質二級結構信息預測蛋白質空間結構中的二硫鍵

摘要：在蛋白質空間結構預測中，二硫鍵的確定可以大大減少蛋白質構象的搜索空間。為提高二硫鍵預測的準確率，對形成二硫鍵的半胱氨酸及其周圍的氨基酸殘基在蛋白質二級結構形成上的偏性進行了分析，并提出將蛋白質二級結構信息加入到BP神經網絡預測模型的輸入編碼信息中。研究對象為從Swiss—Prot數據庫中選’取的252條蛋白質序列，隨機均分四組，對預測準確率進行4－交叉驗證，各項準確率均比未加入蛋白質二級結構信息前有明顯提高。結果表明，結合蛋白質二級結構信息的編碼方式是可行且有效的。