eRNA通過不同類型的增強子功能性地決定重新編程的轉錄過程
哺乳類基因組中含有數千個轉錄增強子,發揮著調節細胞特異性的基因表達功能。尚不清楚這些增強子如何作用于可選擇的結合位點,又如何與信號依賴的轉錄因子發生反應。
美國科學家發現細胞特異性的FoxA1在雄激素受體(androgen receptor,AR)介導下,通過作用于結構和功能各異的增強子,可同時發揮促進或限制某些關鍵性轉錄因子的作用。接著,FoxA1發生下調(FoxA1下調是一些進展期前列腺腫瘤出現的一種預后不良的征兆),通過不同層面的增強子與AR結合造成廣泛的開關效應,觸發顯著的激素反應性基因表達的重新編程。用全核連綴測序(global nuclear run-on sequencing,GRO-seq)分析技術可見增強子模板非編碼RNA(enhancer-templated non-coding RNA,eRNA)的生成,證明這些啟動子是功能性的,無需核小體重構就能誘導特定的增強子-啟動子環化和基因活化。GRO-seq的數據還提示與配體結合的AR能引起轉錄的啟動和延伸。
綜上所述,大量活化的增強子能動態地調節、引發交替的基因表達程序,這可能是生長發育、細胞分化和疾病進展中的序貫基因表達事件的基礎。
Nature, 2011, 474(7351):390-394(唐清亮)