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兩步多重RT-PCR快速檢測蘋果潛隱性病毒

2012-04-29 00:00:00陳紅霞邵建柱孫建設曹曉鳳喬雪華
果樹學報 2012年4期

摘要: 【目的】為建立檢測3種蘋果潛隱性病毒更為快速準確的方法,【方法】以攜帶蘋果莖溝病毒(ASGV)、蘋果褪綠葉斑病毒(ACLSV)和蘋果莖痘病毒(ASPV)的成齡蘋果樹韌皮部為試材,根據基因庫中蘋果莖痘病毒(Apple stem pitting virus,ASPV)的外殼蛋白基因序列,設計合成了2對特異性引物,分別與合成的蘋果莖溝病毒(ASGV)引物和蘋果褪綠葉斑病毒(ACLSV)的引物組合配伍,篩選出最佳的引物對組合。對cDNA的合成所用引物和總RNA模板進行遴選和量化,對PCR過程中cDNA的用量、引物對的終濃度、退火溫度等主要影響因素進行優化。【結果】結果表明,反轉錄引物為Oligo(dT)18、總RNA 0.1~3.0 μL時,可以得到較好的cDNA;ASPV-FR與ASGV-Pch、ACLSV-Pch 引物組合優于ASPV-Pch,并且篩選出4組最佳的終濃度處理組合;cDNA用量為2.0~4.0 μL、退火溫度為50.0~52.9 ℃、循環數為35時,擴增效果較好。采用優化的多重RT-PCR體系對采自陜西和山東兩省的樣品進行檢測,并用3種病毒的單重RT-PCR體系進行驗證。【結論】結果呈現高度一致性,充分印證了該多重RT-PCR體系的準確性,適用于大量樣品的快速檢測。

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