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基于三維地震數(shù)據(jù)的并行希爾伯特黃變換算法研究

2012-05-04 08:09:04阮寧君于文茂余厚全羅明璋
計算機(jī)工程與設(shè)計 2012年6期
關(guān)鍵詞:模態(tài)

阮寧君,陳 俊,于文茂,余厚全,2,羅明璋,2,謝 凱,2

(1.長江大學(xué) 電子信息學(xué)院油氣信息處理與識別研究所,湖北 荊州434023;2.油氣資源與勘探技術(shù)教育部重點實驗室,湖北 荊州434023)

0 引 言

在過去50年里,國內(nèi)油氣田被大規(guī)模的開發(fā),現(xiàn)在未被發(fā)現(xiàn)的油氣藏大都儲量較小、埋藏深、孔滲條件復(fù)雜且難于發(fā)現(xiàn),那么為了更清楚的 “看見”那些存儲復(fù)雜儲量小的油氣藏,就必須對采集到的信號做出更準(zhǔn)確更精細(xì)的處理,以獲得更詳盡地層的信息。此前,在地震信號的時頻分析[1-2]領(lǐng)域里最常用的信號處理方法是傅立葉分析[3]和小波分析[4-5]。由于地震信號屬于非線性和非平穩(wěn)信號[6],這就暴露了傅立葉分析和小波分析的許多自身難以克服的缺陷。希爾伯特[7-10]黃變換是基于信號局部特征的,并且是自適應(yīng)的,它獨特的處理方法不但使得它能識別出信號的不同震蕩模式,而且大大的提高了地震信號的分辨率。因此,黃變換在地震信號的分析和處理中具有非常重要的意義。

隨著處理內(nèi)容和算法復(fù)雜度的不斷增加,這為計算的速度帶來了巨大挑戰(zhàn)。并行處理技術(shù)日益引起石油地球物理界的廣泛關(guān)注,如何快速高效地并行處理大規(guī)模地震數(shù)據(jù)這一問題已成為亟待解決的重大課題之一。當(dāng)前值得關(guān)注的是GPU[11-13]計算能力的飛速發(fā)展及其應(yīng)用的擴(kuò)展,特別是基于GPU并行處理技術(shù)的形成與發(fā)展,為地震數(shù)據(jù)的并行處理提供了平臺。任何有C語言基礎(chǔ)的用戶都很容易地開發(fā) CUDA(compute unified device architecture)[14-15]的應(yīng)用程序。基于GPU的并行地震數(shù)據(jù)處理不僅大大的提高了性價比,而且為海量地震數(shù)據(jù)的處理提供了可能。

1 研究背景

1.1 HHT算法原理

HHT算法是由經(jīng)驗?zāi)B(tài)分解和希爾伯特變換兩步組成:

(1)經(jīng)驗?zāi)B(tài)分解(EMD)

希爾伯特變換(hilbert huang transform,HHT)核心是對信號進(jìn)行 經(jīng)驗?zāi)B(tài)分解 ,獲得有限數(shù)目的固有模態(tài)函數(shù)(IMF)。為保證IMF是單分量函數(shù) ,它必須滿足下列條件:① 極值點的數(shù)目和零交叉點的數(shù)目相同或者至多相差一個;②所有瞬時平均包絡(luò)序列M(t)的平方和與原序列Y(t)的平方和的比值小于0.1。

(2)希爾伯特頻譜分析(HSA)

對于任意一個時間序列X(t),都能得到它的Hilbert變換結(jié)果Y(t),即

于是可得

瞬時振幅

瞬時相位

瞬時頻率

1.2 CUDA的體系結(jié)構(gòu)

統(tǒng)一計算設(shè)備架構(gòu)(compute unified device architecture,CUDA)是NVIDIA公司提出的一種新的處理和管理GPU計算的硬件和軟件架構(gòu),其是以C編程為基礎(chǔ),可以直接用C語言進(jìn)行應(yīng)用程序的開發(fā)。在CUDA的架構(gòu)下可以分為host端和device端,如圖1所示,device端是在GPU上執(zhí)行的部份,Host端則是在CPU上執(zhí)行的部份。在Device上執(zhí)行的程序稱為"kernel"。一般host端的程序會將數(shù)據(jù)準(zhǔn)備好后,復(fù)制到顯存中,再由GPU執(zhí)行device端程序完成對數(shù)據(jù)的處理,處理完后再由host端程序?qū)⒔Y(jié)果從顯存中取回到內(nèi)存中。

2 基于GPU的希爾伯特黃變換算法

2.1 GHHT的基本步驟

GHHT(GPU based Hilbert-Huang transform)并行算法流程圖如圖2所示,申請保存原始數(shù)據(jù)和中間變量的設(shè)備內(nèi)存。

圖1 CUDA執(zhí)行模型

圖2 GHHT算法流程

(1)將原始數(shù)據(jù)和中間變量的值拷貝到設(shè)備內(nèi)存中;

(2)執(zhí)行極大值與極小值的判斷、三次樣條插值、平均包絡(luò);

(3)IMF分量終止條件的判斷;

(4)判斷條件是否滿足,是否退出循環(huán);

(5)將分解后的數(shù)據(jù)進(jìn)行希爾伯特頻譜分析,包括瞬時振幅譜、瞬時相位譜、瞬時頻率譜;

(6)將結(jié)果從設(shè)備內(nèi)存中拷貝的主機(jī)內(nèi)存中。

在本次試驗中,每一道數(shù)據(jù)有一個線程負(fù)責(zé)處理,但是雖說是并行計算,并沒有滿足硬件設(shè)備的一些要求,且沒有發(fā)揮最大的運算能力,硬件資源沒有充分的利用,所以加速比并不理想,GPU速度和CPU速度相當(dāng)。

2.2 GHHT的加速方案

(1)存儲器優(yōu)化:①在利用CUDA并行加速時。既要充分的利用硬件資源(如共享內(nèi)存、常量存儲器、寄存器、紋理緩存),也要合理的訪問達(dá)到最高效率。其存儲器的存儲模型如圖4所示,其中包括多種不同類型的存儲器。每個thread都有自己的一定大小的register和local memory的空間。同一個block中的每個thread則有共享的一份share memory。此外,所有的thread(包括不同block的thread)都共享一份 global memory、constant memory、和texture memory。不同的grid則有各自的global memory、constant memory 和 texture memory。② 同 一 block 中 的thread可以通過共享內(nèi)存進(jìn)行通訊。不同的block可以通過全局存儲器進(jìn)行通訊。在不同的條件下合理搭配發(fā)揮存儲器的最大效率。例如共享內(nèi)存訪問速度快,但是必須對齊訪問和防止bank沖突,才能達(dá)到最佳效率,適用于多次重復(fù)訪問的數(shù)據(jù)。常量存儲器擁有的一定大小的緩存的只讀存儲器,適用于多次隨機(jī)訪問的常量。寄存器訪問速度快,適用于存放中間變量,但數(shù)量相當(dāng)有限。每個線程用自己的可讀寫的寄存器于本地內(nèi)存。在同一塊中的線程可以通過讀寫共享內(nèi)存通訊,所有的線程可以讀寫全局的內(nèi)存(常量內(nèi)存、紋理緩存、顯存)通信。能合理的組織數(shù)據(jù)的存儲至關(guān)重要。③本文將不變的常數(shù)如地震數(shù)據(jù)采樣點的個數(shù)、道數(shù)、切片數(shù)放入常量存儲器中,將存取頻率最大的地震數(shù)據(jù)放入共享存儲器中。為了充分的利用寄存器,本文將一些中間變量放入寄存器中如在三次樣條時會產(chǎn)生許多中間變量。

(2)線程模式優(yōu)化

在CUDA架構(gòu)下,GPU執(zhí)行時的最小單位是thread(線程)。Grid、block和thread的關(guān)系如圖3所示,多個thread可以組成一個block(塊)。而多個block組成一個grid。每一個block包含有限的thread數(shù)目。讓每個block處理一道數(shù)據(jù),這樣就可以充分的利用共享內(nèi)存如圖4所示。把讀取頻繁的數(shù)據(jù)和一些中間變量放入共享內(nèi)存中,這樣就可以減少一些中間變量的存取時間。IMF判斷條件主要的計算量在于求過零點的個數(shù)和平均包絡(luò)與原始數(shù)據(jù)能量的比值。由每個block處理一道數(shù)據(jù),線程之間的協(xié)調(diào)和通信至關(guān)重要。我們借助共享內(nèi)存將每個線程 “產(chǎn)生”的數(shù)據(jù)求和,在求和時采用樹狀加法如圖5所示,可以避免bank沖突達(dá)到最大效率。

3 實驗結(jié)果與分析

利用GPU實現(xiàn)了對經(jīng)驗?zāi)B(tài)分解的加速,為了驗證本文算法的有效性,實驗環(huán)境配置如下:

本次實驗采用的設(shè)備GPU是GT240顯卡,有12個多核處理器、96個核心、512M內(nèi)存、15384個寄存器、65536b常量內(nèi)存,時鐘頻率為1.51GHz。該顯卡著色器的理論計算能力為36GFLOP/s。對照實驗采用的CPU為AMD Athlon II X2 245雙核 ,主頻2.89GHz。

3.1 GPU與CPU結(jié)果對比

在表1中,根據(jù)不同地震數(shù)據(jù)處理的時間對比,我們可以看出GPU的并行處理優(yōu)勢。與傳統(tǒng)CPU的串行處理相比,GPU并行處理的速度有了4倍左右的提升,性價比也大大提高。

表1 GPU與CPU的結(jié)果對比表

3.2 GPU資源分析

如圖6所示我們用軟件分析應(yīng)用程序測試GPU的資源占有率。在目前的GPU架構(gòu)中,所有的線程被組織成多個的warp塊,一個warp里面有32個threads,每16個線程為一個half-warp。而流多處理器是以half-warp為單位執(zhí)行的,因此每個流多處理器所分配的warp塊的數(shù)量直接影響著GPU資源的利用率。而每個流多處理器所分配的warp塊的數(shù)量又與每個塊(block)中的線程的大小密切相關(guān)。

圖6中橫坐標(biāo)表示每個block中分配線程的數(shù)目,縱坐標(biāo)表示每個流多處理器中Warp的數(shù)目。在本次試驗中每個block分配256個線程,如圖6中三角符號的橫坐標(biāo)所示,其縱坐標(biāo)表示W(wǎng)arp的數(shù)目為32個。可知資源的配置已達(dá)到最佳配置狀態(tài),說明GPU資源已經(jīng)得到了充分的利用。

圖6 每個流多處理器當(dāng)前活動的Warp塊數(shù)目

3.3 地震數(shù)據(jù)處理前后的結(jié)果對比

從微觀上看,處理前的波形與處理后的波形最明顯的差別在于穿越零點的個數(shù),處理后的波形穿越零點的個數(shù)明顯增多,也就是縱向分辨率提高了,如圖7所示。

圖7 處理前后的波形

如圖8所示,左邊是處理前的數(shù)據(jù),右邊是處理后的數(shù)據(jù)。處理前切片的斷層很模糊不容易被發(fā)現(xiàn),處理后切片斷層很清晰易被發(fā)現(xiàn),由此可見處理后地震數(shù)據(jù)的分辨率明顯提高。

圖8 處理前后的切片

4 結(jié)束語

本文在研究地震數(shù)據(jù)的并行處理時,采用了基于GPU的希爾伯特黃變換算法,實驗結(jié)果表明經(jīng)過希爾伯特黃變換處理后的地震數(shù)據(jù)與處理前相比分辨率明顯提高,采用的GPU并行處理的速度與CPU串行處理的速度相比,有了大幅度的提升,大大的提高了性價比。我們在熟悉了解了一維希爾伯特黃變換的基礎(chǔ)上,今后會朝二維乃至三維方面發(fā)展。從二維到三維思想大致類似,這是黃變換的前瞻性理論,若能很好的處理,必將極大的推動黃變換的發(fā)展,二維乃至三維的經(jīng)驗?zāi)B(tài)分解的并行算法,有利于進(jìn)一步的發(fā)揮GPU的優(yōu)勢,從而進(jìn)一步的加速數(shù)據(jù)的處理。

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