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一株水貂阿留申病毒的分離鑒定及VP2基因序列分析1)

2012-07-02 00:03:54張段玲錢毓斌張彥龍
東北林業大學學報 2012年9期
關鍵詞:檢測

桑 宇 張段玲 錢毓斌 張彥龍

(東北林業大學,哈爾濱,150040)

水貂阿留申病(Aleutian Ddisease,AD)是由阿留申病毒(Aleutian disease parvovirus,ADV)引起的水貂慢性傳染性疾病,主要侵害水貂的免疫系統,以漿細胞彌漫性增生和持續性病毒血癥為特征[1-2]。AD在有水貂飼養的國家普遍存在,臨床上主要表現為水貂產仔量降低、死胎、流產、腎小球腎炎、動脈血管炎和肝炎,并導致成年水貂的免疫系統紊亂,仔貂突發嚴重肺炎而死亡[3]。病理剖檢常見腎腫大、充血而呈紅色,后變灰褐色或淡黃褐色,有的表面可見斑點狀出血,間有灰白色壞死灶[4]。水貂AD發病率約75%,直接死亡率可達30%[5]。病貂毛皮質量下降,對水貂養殖業造成巨大的經濟損失[6-7]。

對流免疫電泳(CIEP)是現今世界公認的并且應用最為廣泛的AD檢測方法,通過CIEP檢測淘汰AD陽性貂對貂群進行凈化,是目前AD防控唯一有效的方法。雖然我國已經研制出AD的CIEP診斷抗原,但由于我國水貂養殖方式和對AD危害認識不足等原因,AD檢測凈化一直沒有得到廣泛的推廣。近年,國際毛皮市場的旺盛需求帶動了我國水貂養殖規模的逐年擴大,但由于管理上的不完善等原因導致我國水貂ADV感染率居高不下,初步統計ADV的感染率高達80%~90%。AD對我國水貂養殖業健康發展的影響越來越嚴重,加強檢測凈化工作已經逐漸被廣大養殖場(戶)所認識和接受。為了深入了解近年來我國ADV的流行情況,并利用當前的流行毒株研制新的診斷抗原,筆者從送檢水貂樣本中分離出一株ADV(命名為ADV-ZYL1),對其VP2序列進行測定,基于氨基酸的同源性繪制分析表,闡明ADV-ZYL1毒株的抗原變異情況,為進一步開展該病的診斷和防治研究奠定基礎。

1 試驗材料

病料 山東威海養殖戶送檢的疑似ADV感染致死的水貂樣本,采集其實質器官,置于-20℃保存。

試劑和細胞 蛋白酶K、PMD18-T載體購自寶生物工程(大連)有限公司;胰蛋白酶、DMEM購自Invitrogen公司;Taq DNA聚合酶、dNTP、DL2000 DNA Marker、感受態大腸桿菌DH5α、小量膠回收試劑盒均購自北京全式金生物技術有限公司;小牛血清購自內蒙古金源康生物工程有限公司;貓腎傳代細胞系(CRFK)購自中國科學院上海生命科學研究院細胞庫;ADV陽性核酸為東北林業大學野生動物資源學院動物醫學實驗室保存。

引物 檢測用的特異性引物參考Qie等[8]的研究報告。上游P1:5'-CTTGTCACGCTACTAGAATGGT-3'(2 587 ~2 609 bp);下游 P2:5'-AGCTTAAGGTTAGTTTACATGGTTTACT-3'(3 252 ~3 279 bp)。可擴增的目的DNA片段的長度為693 bp。參考GenBank中保存的標準毒株ADV-G(M20036)核苷酸序列,利用引物設計軟件Oligo 6.0分別設計合成兩對引物,用于擴增 VP2全序列。上游AD1:5'-TATTCAGCAAGCAAAAAAGAAG-3'(2 336~2 355 bp);下游 DV1:5'-TTGGTTGGTATGAGTTAAGTAG-3'(3 921~3 942 bp)。擴增的目的片段命名為part.1,長度為1 606 bp。上游 AD2:5'-TATTCAGCAAGCAAAAAAGAAG-3'(3 810~3 831 bp);下游 DV2:5'-TATTCAGCAAGCAAAAAAGAAG-3'(4 452 ~4 474 bp)。擴增的目的片段命名為part.2,長度為664 bp。以上引物均由上海生工生物工程有限公司合成。

2 試驗方法

2.1 DNA的提取及PCR檢測

取水貂部分臟器,用剪刀盡量剪碎,加入600 μL 的1×TNE(消化緩沖液),40 μL 蛋白酶 K,80 μL 10%SDS,55℃消化過夜。向各試管加入720 μL的平衡酚(V(酚)∶V(氯仿)=1∶1的混合溶液),震蕩搖勻成乳濁液,放置0.5 h,4℃條件下12 000 r/min離心15 min。取700 μL上清液加入等體積的異丙醇,搖勻靜置30 min,4℃條件下12 000 r/min離心15min,棄上清。沉淀用75%預冷乙醇洗滌,12 000 r/min離心5 min,棄上清,干燥后加入10~20 μL滅菌純水。溶解后以紫外分光光度計定量為1 g/L。檢測引物P1、P2的PCR反應條件:94℃預變性 3 min,94 ℃ 0.5 min,50 ℃ 0.5 min,72 ℃ 1 min,進行40個循環,最后72℃延伸7 min。反應結束后取5 μL擴增產物用1%瓊脂糖進行電泳,觀察結果。

2.2 病毒分離

將臟器置于研缽中并在冰上研碎,按研碎組織體積占據30%的比例加入DMEM制備組織懸液,懸液以12 000 r/min離心15 min,收集上清,以0.22 μm濾膜除菌后用于病毒的細胞培養。用含10%胎牛血清的DMEM培養液在37℃二氧化碳培養箱中培養CRFK細胞,細胞長成單層后傾去培養液,加入除菌組織懸液2 mL于31.8℃吸附2 h[9],中間晃動數次,傾倒出吸附液,然后加入含10%胎牛血清的DMEM培養液,置于二氧化碳恒溫箱中31.8℃培養,以3~4 d作為標準,盲傳至出現病變后收獲各代病毒培養物。

2.3 分離病毒的PCR檢測和VP2全基因序列克隆測定

對出現病變后收獲的各代病毒培養物提取DNA,12 000 r/min 離心15 min,棄上清,加入490 μL的1×TNE(消化緩沖液),10 μL 蛋白酶K,55 ℃消化過夜,其余步驟同2.1。以引物P1、P2進行PCR擴增,反應結束后通過瓊脂糖凝膠電泳觀察結果。用兩對測序引物AD2、DV2和AD1、DV1分別對病毒分離前后的DNA進行PCR擴增。PCR采用25 μL體系。取2 μg DNA 作為模板,加入 10×Buffer 2.5 μL,上下游引物各1 μL、2.5 mmol/L 的 dNTP 2 μL、最后加0.5 μL 的 Taq 酶,用滅菌純水補足到25 μL。反應結束后分別進行電泳切膠回收,純化產物連接PMD18-T載體,轉化到感受態大腸桿菌DH5α,PCR檢測陽性單克隆菌落送英駿公司進行測序。測定結果編輯后用MEGA4.1和GenBank中國內外已發表的水貂阿留申病毒VP2蛋白氨基酸序列進行同源性比較。

3 結果與分析

3.1 病料的PCR初步檢測

提取幼貂臟器的DNA,并利用引物P1、P2進行PCR擴增。在脾臟DNA中得到了與預期擴增片段(693 bp)相符的核酸電泳帶,見圖1。

圖1 PCR檢測結果

3.2 病毒分離

將PCR檢測為陽性的脾臟碾磨過濾除菌,除菌后的組織懸浮液吸附于單層的CRFK細胞,31.8℃培養3代無明顯細胞病變,盲傳到第4代培養96 h后,細胞系出現嚴重的細胞脫落,并有大量空斑,形成CPE(cytopathic effect)。繼續在31.8℃條件下培養到第10代,仍見大量空斑和明顯的CPE(圖2),凍融收集培養液。

圖2 分離毒株感染CRFK細胞后第10代96 h的形態觀察

3.3 分離病毒的PCR檢測及VP2序列測定

細胞培養物提取DNA后PCR檢測仍為陽性(圖3),對病毒分離前后提取的DNA分別用AD1、DV1和AD2、DV2兩對引物進行擴增,得到了預期大小的擴增片段,見圖4。切膠純化后克隆測序表明,分離前后病毒序列無變化,登陸基因數據庫比對其測序結果,該結果與美國標準毒株ADV-G的VP2核苷酸同源性為94.7%,進一步證明了ADVZYL1為水貂阿留申病毒,而且此毒株可以在CRFK細胞中穩定生長。

圖3 病毒分離后培養液PCR檢測結果

3.4 ADV的VP2蛋白同源性比較

測序結果用DNAStar進行編輯。將編輯后ADVZYL1毒株的VP2基因與GenBank中的國際毒株ADV-Far East(DQ371395)、ADV-FIN(GQ336866)、ADV-G(M20036)、ADV-LN1(GU183264)、ADV-LN2(GU183265)、ADV -LN3(GU269892)、ADV -SL3(X97629)、ADV-TR(U39013)、ADV-TR2(U39014)、ADV-Utah-1(Z18276)的核苷酸序列進行同源性比較,見表1。結果顯示,ADV-ZYL1與其它亞型的毒株相比較,VP2蛋白氨基酸同源性為92.6% ~96.1%,其中與強毒力毒株ADV-Utah-1的親緣關系最近,與遠東毒株ADV-Far East的親緣關系最遠。

圖4 病毒分離前后培養液PCR檢測結果

4 結論與討論

本次試驗病料來源于斷乳前發病死亡的幼貂,通過病理學剖檢發現,其具有明顯臟器病變,表現為肺臟出血性炎癥,腎臟腫大、表面有出血點。細菌培養、犬瘟熱病毒和水貂病毒性腸炎等檢測結果均為陰性。應用已發表的特異性ADV引物進行PCR檢測呈陽性,因此認為幼貂由ADV感染致死。病料處理后在CRFK細胞連續培養10代后,獲得了穩定毒株ADV-ZYL1。利用設計的擴增VP2基因全序列的引物,分別對病料DNA提取物和病毒細胞培養物DNA進行VP2基因的測序,序列分析結果顯示,分離前后VP2同源性為100%,進一步驗證了病毒分離結果的可信度。

表1 11株ADV的VP2基因的氨基酸序列同源性分析結果

ADV的VP2蛋白由VP2基因編碼而成,在病毒衣殼中占有絕大部分的比重,是其主要抗原決定簇載體[11-12],可以引起中和抗體反應[13]。人工表達的全VP2蛋白能獨立組裝成病毒衣殼,因此VP2基因的結構決定了病毒的抗原性[14]。近幾年的研究還表明,真核、原核表達的VP2全序列或者VP2片段都可直接用于ELISA和CIEP檢驗,表現出很好的抗原性[15]。對VP2核苷酸和氨基酸的研究有助于研究ADV抗原性,因此本次試驗選擇了對ADV-ZYL1毒株的VP2全序列氨基酸進行分析,結果表明:ADV病毒雖屬于細小病毒科,但是VP2蛋白的氨基酸突變率介于0.8%到8.8%之間,核苷酸突變率介于0.3%到7.7%之間,遠遠高于同屬于細小病毒科的水貂腸炎病毒和犬細小病毒[16-17],而且突變氨基酸位點不僅集中在超變區,還廣泛存在于保守區,這與之前的報道相一致[18]。ADV-ZYL1毒株與同源性最近的毒株ADV-Utah-1有著24個氨基酸的差別,再次說明了阿留申病毒的氨基酸突變十分明顯。

盡管AD對水貂養殖業的危害巨大,但是目前國內外還未研制出有效預防本病的疫苗,只能通過CIEP檢驗血清淘汰病貂來實現對本病的控制和根除[10]。筆者的研究分析表明,ADV的核苷酸和氨基酸的突變率都很高,國內飼養水貂過程中ADV的基因在不斷突變,使用進口抗原進行AD檢測有可能會影響檢測的特異性和敏感性,使得出現假陰性的可能性增加,從而弱化了AD的凈化效果。

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