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基于HTML5標準的Dicom 圖像顯示

2012-07-25 08:23:12夏申頻
微型電腦應用 2012年10期
關鍵詞:標準設備

夏申頻

0 引言

一直以來,顯示Dicom 醫學圖像都是在專業的工作站上,使用專業程序來進行的。這些設備昂貴、笨重、使用復雜、兼容性差,對移動平臺極不友好。在硬件方面,由于醫學圖像的高空間分辨率和高灰度分辨率,往往需要高性能處理器和專業顯示設備,才能達到可供臨床使用的效果,但是,從前所有的移動設備,都不具有這兩點。從軟件層面上來說,醫學圖像工作站專業系統的開發,很少顧及到跨平臺、兼容性的問題,更少想到對移動設備的支持。

這些系統,往往使用Com+/ActiveX、VCL/CLX 等基于C/C++ 語言的技術或平臺,很少使用像Java 這樣在移動設備上廣泛支持的技術,使得遷移到移動平臺上的開發代價變得相當高。

不過隨著移動終端設備的不斷發展,尤其是在FDA 批準了首款移動設備進入醫療影像行業,標志著移動設備已經完全滿足顯示、處理醫學圖像的要求,醫療應用市場已經向移動設備開發者們敞開。但是,目前的移動設備品種多樣,各大品牌的設備各自為政,彼此不互相兼容,這意味這如果使用傳統的移動設備開發平臺,需要為每一個平臺進行開發和測試,這既費時又費力。好在目前所有主要品牌的產品中,有一點是共同的,它們都具有一個支持HTML5 技術標準的現代瀏覽器。所以,如果能設計基于HTML5 平臺的Dicom顯示程序,將能覆蓋到幾乎所有的主流移動終端設備,具有極大的兼容性。

1 HTML5 技術標準下的Dicom 圖像顯示

1.1 HTML5 標準

在HTML5 標準提出以前,要在瀏覽器端處理圖像,必須依賴第3方插件(如Flash,Silverlight)。因為早期瀏覽器的JavaScript 處理引擎性能不佳,無法勝任圖形處理的要求。HTML5 中新引入的 Canvas 元素,使得可以直接使用JavaScript 腳本在Web 頁面進行繪。一般顯示 Dicom 圖像都使用像素級別的繪圖,而Canvas 標簽支持像素級別的位圖繪圖技術。已知Chrome 的V8,Firefox 的SpiderMonkey 以及Safari 的Nitro 等引擎,都已經能夠很好地進行二維繪圖。

1.2 Canvas 標簽

Canvas為HTML5標準中新制定的繪圖標簽,

定義一個Canvas 只需要進行如下的聲明:

在JavaScript 腳本中,可以使用語句來獲得這個Canvas對象,假設使用JQuery 庫的代碼如下:

但是,Canvas 標簽本身是不能直接繪圖的,就像在從前的Gui 程序開發中,窗口本身是不支持繪圖的,需要構造出繪圖上下文設備(DC),然后在DC 上使用繪圖函數。在Canvas 上的繪圖操作,也是在上下文設備上進行的。目前可以構造2D、3D 兩種上下文設備,對于Dicom 文件的顯示,使用2D 設備已經足夠了。生成2D 繪圖上下文設備的代碼如下:

2D Canvas 提供了許多繪圖函數,但是對于Dicom 圖像渲染,主要使用的是3個像素級操作:createImageData ,getImageData , 和putImageData。

2 Dicom 文件結構

為了解析Dicom 圖像,必須要了解Dicom 文件結構。

Dicom 文件由序列排布的一組元素(Element)構成,一個元素是構成Dicom 文件的基本單位。元素的結構分為元素頭和元素數據。所有元素頭的結構都是相同的,其長度為8 個Byte,包含4 個數據元素,其數據結構用C 語言的語法可以定義為:

其中group(組號),element(元素號) 構成一個tag(標簽),唯一標示了該元素的,可以通過tag 查表得到元素的實際名稱。如(7FE0, 0010) 為Pixel Data 即圖像數據。

所有的元素頭及其含義在文件miniDicom_meta.js 中定義。

VR 指明數據元素中數據的類型, 為2 字節的字符串。。數據長度VL 指明數據元素的數據域中數據的長度(字節數) 。數據域中包含了數據元素的數值。在元素頭后面的就是按VL 指定長度存放的VR 格式的元素數據。Dicom 文件就是這樣由一個個元素依次存放組成,如圖1所示:

圖1 Dicom存放格式

在解析Dicom 文件后,為了顯示圖像,必須要的元素,如表1所示:

表1 Dicom文件所需要的元素

3 簡單的瀏覽器端Dicom 圖像渲染

為了實際驗證在瀏覽器端顯示Dicom 圖像的效果,編寫了必要的服務器端腳本和一個HTML5 頁面。服務器端腳本使用Python 語言開發,基于Flask框架,主要用于幫助傳輸dicom圖像。客戶端腳本使用javascript開發。

文件“jsdicom.js”,為主要編寫的文件,

其內部包含三個功能類分別為:

XHRFile 可以像使用普通文件一樣來訪問通過XHR方法獲得的文件數據。主要有open,read,close等方法,方便了遷移傳統的Dicom文件解析代碼。

DicomImage 代表了一幅Dicom圖像,其構造函數為一個數據字典,里面的鍵為Dicom標準中定義的名稱。該類主要有獲取CT值,調整窗口窗位等方法。

DicomReader 從文件中讀取Dicom的功能類。主要功能是根據Dicom文件結構的標準定義,從XHRFile對象中遞歸的讀取每一個數據元素,直到文件末尾。對于具體的每一個數據元素,先讀取8個字節的頭信息,確定數據類型和長度。如果是“OB”或“OW”等變長數據,還需要根據Dicom標準的定義確定需要讀取的數據長度。如此一個一個的循環讀取全部元素。

另外由于在Dicom標準,允許數據類型VR是顯式(Explicit VR) 和隱式(Implicit VR) 兩種。在讀取數據時,取決于事先商定的數據傳輸句法(Transfer Syntax UID),其包含在標簽為(0002, 0010) 的數據元素中。數據在顯式傳輸時VR 必須存在, 而隱式傳輸時VR 為空。組號為0002 的數據元素都是顯式的。所以該類也具有根據“TransferSyntaxUID”標簽,處理數據類型為顯示和隱式兩種Dicom文件的功能。在解析Dicom文件時,首先判斷“TransferSyntaxUID”標簽,根據其數值來設置標志位,以此決定以后的元素數據的取得方式。

文件“ miniDicom_meta.js”為Dicom標準中的數據字典,是根據Dicom標準生成的Javascript字典對象,每一條記錄描述了一種數據元素。

在文件“index.js”文件中,先通過希望顯示的Dicom文件URL,獲得一個XHRFile對象,然后使用DicomReader類來解析此文件對象,得到一個DicomImage對象,通過此圖像對象來獲取渲染圖像所需要的信息,最后在Canvas標簽中,顯示圖像,如圖2所示:

圖2

主要的繪圖代碼如下:

整個頁面在Google Chrome 11 和Firefox 9 兩款瀏覽器上測試運行。由于標準遵循的問題,暫時沒有支持Internet Explorer系列瀏覽器。測試地址為http://jsdicom.sinaapp.com/.圖2為在Android2.3系統上Friefox9 瀏覽器中的顯示畫面。其中使用的Dicom文件都為不壓縮的存放格式。

4 結束語

隨著移動設備的快速發展和移動醫療需求的不斷增加,促使了醫學圖像顯示技術在移動設備上的發展。同時隨著新生的HTML5 標準的廣泛應用,大大改變了原來的應用程序開發使用方式,極大的增強了應用的兼容性。移動設備加HTML5 的組合將是今后軟件開發者關注的重點。而基于HTML5 標準的醫學圖像程序,較傳統的方式,從安裝和使用都更加簡化了,變得和普通的瀏覽網頁一樣簡單。為了進一步實現和完善瀏覽器端的Dicom 顯示應用,未來我們還將要繼續完善以下幾項內容:

(1) 探索如何解決Internet Explorer 系列瀏覽器對HTML5更好支持的方式,雖然目前為止IE 系列瀏覽器對HTML5 和移動設備的支持都不佳,但是由于其在普通PC上的極大的市場占有率,所以如何解決IE對HTML5的 支持是一個非常迫切的問題。

(2) 探索如何解決對使用JPEG Lossless 無損壓縮的Dicom 圖像的支持,越來越多的放射影像設備在傳送Dicom文件時使用了壓縮算法,雖然可以事后手動解壓,但是如果能直接支持壓縮格式的Dicom 文件將大大方便臨床的使用。

(3) 探索如何增強在瀏覽器端對Dicom 圖像的簡單處理功能,由于放射影像的特殊性,往往需要有調整窗寬窗位等功能來幫助閱片,所以為了滿足臨床的需要,需要增加像調窗這樣的簡單圖像處理能力。

[1]National Electrical Manufacturers Association,Digital Imaging and Communications in[j]Medicine Part 5: Data

[2]Structures and Encoding[S],2009

[3]National Electrical Manufacturers Association,Digital Imaging and Communications in[j]Medicine Part 14:

[4]Grayscale Standard Display Function[S],2009

[5]World Wide Web Consortium,HTML Canvas 2D Context[S],http://www.w3.org/TR/2dcontext/,2011

[6]Food and Drug Administration,[j]FDA clears first diagnostic radiology application for mobile devices[

[7]EB/OL],http://www.fda.gov/NewsEvents/Newsroom/Pres sAnnouncements/ucm242295.htm,2011

[8]佟英紅曹伯燕,無損壓縮Dicom 文件解讀的實現[J],計算機應用,2003,23

[9]林林, 使用HTML5 canvas 進行Web 繪圖[EB/OL],http://www.ibm.com/developerworks/cn/web/10 12_

[10]linlin_html5canvas/index.[s]html,2010

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